| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000731 | 22032 = | 126 (0.990) | 6 (0.050) | 6/230 | NT | 5.2% | coding (489/1467 nt) | USA300HOU_pUSA300HOUMR0028 | macrolide transporter |
| ? | CP000731 | 22054 = | 100 (0.840) | coding (511/1467 nt) | USA300HOU_pUSA300HOUMR0028 | macrolide transporter | |||||
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
TTATAGTCCGATATTACTTTTAGATGAACCTACAAATCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGAACAACAACGTCAATATGAACAGTATATAA > CP000731/21900‑22165 | tataGTGTGATATTACTTGTAGGCGAACCTACAAAGCACTTGGAGAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCa < 1:418876/134‑1 (MQ=255) tataGTCCGATATTACTTTTAGATGAACCTACAAATCACTTGGATAAAATTGGGAAAGATTATCAGAAAAAGATTGTAAAATATGACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCa < 1:333891/134‑1 (MQ=255) ataGTCCGATATTACTTTTAGATGAACCTACAAATCACTTGGATAAAATTGGTAAAGCTTATCTGAAAAATATTTTAAAATCTTACTATGCTACTTTAAATATAATAAGTCAAAATAGAGCAATTATAGACGaa > 1:17414/1‑134 (MQ=255) acaatctttgtttttcacttatatactgttcatattgacgttgttgttctaactgttcttgttcatattgattttgatactgtgtgtaattacctttaaacactcttcttctgccaccgtcgtgtatatcCCaa < 2:553953‑M1/4‑1 (MQ=255) caatctttgtttttcacttatatactgttcatattgacgttgttgttctaactgttcttgttcatattgattttgatactgtgtgtaattacctttaaacactcttattgtgccatcttcttgtatatcACaaa < 1:92710‑M1/5‑1 (MQ=255) aatctttgtttttcacttatttactgttcattttgacgttgttgttctaactgttcttgttcatattgattttgatactgtgtgtaattacctttaaacactcttattgtgccatcttcttgtatatcCCAAAt > 2:370399‑M1/129‑134 (MQ=255) atctttgtttttcacttatatactgttcatattggcgttgttgttctaactgatcttgtttctctggaacctgatactgtgtgtaattacctttaaacactcttattgtgccatcttcttgtatatcCAAAAtt < 1:284061‑M1/7‑1 (MQ=255) atctttgtttttcacttatatactgttcatattgacgttgttgttctaactgttcttgttcatattgattttgatactgtgtgtaattacctttaaacactcttattgtgccatcttcttgtatatcCCAAAtt < 1:290146‑M1/7‑1 (MQ=255) atatTACTTTTAGATGAACCTACAAATCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGa > 1:566216/1‑134 (MQ=255) atatTACTTTTAGATGAACCTACAAATCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGa > 2:106493/1‑134 (MQ=255) atatTACTTTTAGATGAACCTACAAATCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGa < 2:260190/134‑1 (MQ=255) atatTACTTTTAGATGAACCTACAAATCACTTGGATAAAATTATTAAAGATTATTTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATATACCAAATTGCtaa > 2:129276/1‑132 (MQ=255) tattatTTTTAGATGAACCTACAAATCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGac < 2:312178/134‑1 (MQ=255) tatTACTTTTAGATGAACCTACAAATCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAACATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGac > 1:443701/1‑134 (MQ=255) tatTACTTTTAGATGAACCTACAAATCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCACATTGCTGac < 2:137148/134‑1 (MQ=255) atTACTTTTAGATGAACCTACAAATCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAACATCTTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGaca > 1:501399/1‑134 (MQ=255) ttACTTTTAGATGAACCTACAAATCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGATATATATTGTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGaca‑c < 2:70568/134‑1 (MQ=255) ttACTTTTAGATGAACCTACAAATCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGaca‑c < 2:106544/134‑1 (MQ=255) tACTTTTAGATGAACCTACAAATCACTTGGATCAAATTGGTAAAGATTCTCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGAca‑ca > 1:168643/1‑134 (MQ=255) tACTTTTAGATGAACCTACAAATCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGAca‑ca > 2:165904/1‑134 (MQ=255) aCTTTTAGATGAACCTACAAATCACTTGGATACAATTGGTAAAGATTATCTGATAAATCTTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTCTAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGCCA‑Caa > 1:26709/1‑134 (MQ=255) aCTTTTAGATGAACCTACAAATCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTCCTTTAATTATAGTAAGTAATGATAGAGAAATTATAGATCAAATTGATAACa‑aaa > 1:531218/1‑134 (MQ=255) aCTTTTAGATGAACCTACAAATCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCCTGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑Caa > 1:141951/1‑134 (MQ=255) aCTTTTAGATGAACCTACAAATCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGATA‑Caa > 1:427529/1‑134 (MQ=255) aCTTTTAGATGAACCTACAAATCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAATCATGATAGAGCACATATAGACCAAATTACTGACA‑Caa > 1:161934/1‑134 (MQ=255) cacttatatactgttcatgttgacgttgttgttctaactgttcttgttcatattgattttgattctgtgtgtaattacctttaaacactcttattgtgccatcttcttgtatatcCCAAATTGCTGACA‑CAAtt > 1:473109‑M1/116‑134 (MQ=255) aGATTAACCTACTAATCACTTTGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTggg < 1:358663/134‑1 (MQ=255) aGATGAACCTACAAATCACTTTGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGGTAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTggg < 1:579551/134‑1 (MQ=255) aGATGAACCTACAAATCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACAAAATTGCTGACA‑CAATTTgag > 1:238201/1‑132 (MQ=255) tGAACCTACAAATCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATGACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGata < 1:206669/134‑1 (MQ=255) aaCCTACAAATCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTTTAGACCAAATTGCTGACA‑CAATGTGGGAtata > 2:89931/1‑134 (MQ=255) aaCCTACAAATCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGAtata > 2:534026/1‑134 (MQ=255) ccTACAAATCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATAATAGAGCACTTATAGCCCACATTGCTGACA‑AACTTTGGTAcataaa > 2:204891/1‑132 (MQ=255) tACAAATCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACaag < 2:162988/134‑1 (MQ=255) tACAAATCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACaag < 2:308372/134‑1 (MQ=255) cAAATCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CCATTTGGGATATACaagaa > 2:49763/1‑134 (MQ=255) aaTCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAagaaga > 1:513129/1‑134 (MQ=255) aaTCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACCTTAATTATACTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAagaaga < 1:604612/134‑1 (MQ=255) aTCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTTTCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGAt > 1:81304/1‑134 (MQ=255) aCTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGc > 2:23885/1‑134 (MQ=255) cTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGca > 2:356195/1‑134 (MQ=255) cTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGAca > 1:112215/1‑134 (MQ=255) cTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAAATTGAGATATACAAGAAGATggaa > 2:44079/1‑132 (MQ=255) ttGGATAAATTTAGTAAAGAATATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGcac < 2:539133/134‑1 (MQ=255) ttGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAATTATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATGGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGcac < 1:266536/134‑1 (MQ=255) ttGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTCATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTCATAGGCCAAATTACTGACA‑CAATTTGGAATACACAAGAATATGGaac > 2:182256/1‑134 (MQ=255) ggATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACaa < 2:148629/134‑1 (MQ=255) aaaTTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAaga < 1:65159/134‑1 (MQ=255) ttctaactgttcttcgtcatattgattttgttcctgcttgtacttccctttaaactctcttattgtgccatcttcttgtatatcCCAATTTGCTTACA‑CTATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAagag > 1:458098‑M1/85‑134 (MQ=255) ttcgTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACGATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCATATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAgtg < 2:518006/131‑1 (MQ=255) ggTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAACTTTTAATGTGGGGGCTGAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGtt > 1:545674/1‑134 (MQ=255) ggTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAgtgtg > 2:159810/1‑133 (MQ=255) ggTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATACACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGtt > 2:342849/1‑134 (MQ=255) gTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGttt < 2:49969/134‑1 (MQ=255) aGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTATTTATAGTAAATCATGATAGATCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAg < 1:113252/134‑1 (MQ=255) tATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTaa < 2:1514/134‑1 (MQ=255) aTCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAAt < 1:181579/134‑1 (MQ=255) aaaTATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTacacac < 2:181475/134‑1 (MQ=255) aaTATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTAcacaca > 2:69344/1‑134 (MQ=255) tatTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAACACTTATAGACGAAATTGCTGACA‑CACTTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGt > 2:34635/1‑134 (MQ=255) atTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTa > 1:100/1‑134 (MQ=255) ttAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCa > 2:345176/1‑134 (MQ=255) ttAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGGAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAAGTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCa < 1:523020/134‑1 (MQ=255) tgtttttgtgtgtaattccctttaaacactcttattgtgccatcttcttgtagatcCCAAATTG‑TGTCAGCAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCa > 2:486927‑M1/57‑134 (MQ=255) tAACATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCaa < 2:339947/134‑1 (MQ=255) tAAAATGTTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCaa < 2:448591/134‑1 (MQ=255) tAAAATATTATTATTGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAAGAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCaa < 2:148529/134‑1 (MQ=255) tAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCaa < 2:366111/134‑1 (MQ=255) aaaTATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACAAAGTATCaaaa > 2:401672/1‑134 (MQ=255) aaTATTACTACGGTACTCTAAACAAAGTAAGTCATGATAGAGCACTTACAGCCCAGATTGCTGACA‑CAATTGGGTATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCaaact < 1:19463/134‑3 (MQ=255) atatTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATc < 2:329522/134‑1 (MQ=255) atTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGCGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAAATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCaa > 1:333440/1‑134 (MQ=255) tACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGCCA‑CAATTGGTGGTATTTTCGCAGATAGAACAAGAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCACACTCAata > 2:271435/1‑134 (MQ=255) aCTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGAACAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAatat < 1:345917/134‑1 (MQ=255) tGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAAc < 1:160640/134‑1 (MQ=255) gTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTAGGGATAGACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACaa > 2:243815/1‑134 (MQ=255) tACTTTAATTATAGTAAGTCATGTTAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAg < 1:47822/134‑1 (MQ=255) tACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTTTAGATCAAATTGCGGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAg < 1:47066/134‑1 (MQ=255) aCTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTTGTTTATACATGAAGATTGCATAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGa < 1:213955/134‑1 (MQ=255) aCTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGa < 1:478943/134‑1 (MQ=255) aaTTATAGTAAGTCTTGATATAGCAATTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGt < 2:521555/134‑1 (MQ=255) aaTTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAAAAAGAACAGt > 1:522167/1‑134 (MQ=255) aaTTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTGGGGATATAAAAGAATAGGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGt > 2:39301/1‑134 (MQ=255) taGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAATAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGaa < 1:3742/134‑1 (MQ=255) taGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGaa < 2:81304/134‑1 (MQ=255) aGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACATACAGTATTAAAATAAATATGAACAAGAACAGTTAGaac > 1:591899/1‑134 (MQ=255) tAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGGTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGaacaa < 2:416240/134‑1 (MQ=255) aaGACAAGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGaacaac < 1:238703/134‑1 (MQ=255) aGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAAAGAGTTATAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGaacaaca < 2:560054/134‑1 (MQ=255) cATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACGCGGACGTAAAAGCAATATGAACAAGAACAGTTAGAACAACAACg > 2:587542/1‑134 (MQ=255) aTAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGAACAACAACGTCaa > 2:123793/1‑134 (MQ=255) aTAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGAACAACAACGTCaa > 2:393695/1‑134 (MQ=255) agagCACTTATAGACCAAATTTCTGACA‑CATTTTGGGATATACATGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGAACAACAACGTCAata < 1:236022/134‑1 (MQ=255) agagCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGAACAACAACGTCAata < 1:565247/134‑1 (MQ=255) agCACTTATAGACTAAAGTGCTGACA‑CAATTTGGGATATAAAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGAACAACAACGTCAATATg < 2:494065/134‑1 (MQ=255) cttgtatatcCCAAATTG‑TGTCAGCAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATAAAAATCAATATGAACAAGAACAGATAGAACAACAACGTCAATAAGaa < 2:264265‑M1/124‑1 (MQ=255) cTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGAACAACAACGTCAATATGAACa < 1:146936/134‑1 (MQ=255) tataGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGAACAACAACGTCAATATGAACAGt > 2:435546/1‑134 (MQ=255) taGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAAACGGAAGAGTTAGAACAACAACGTCAACAAGAACAgaaa > 2:587144/1‑131 (MQ=255) CCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTACTTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGAACAACAAAGTCAATAAGAACAGTAAATaa < 1:179731‑M1/134‑1 (MQ=255) | TTATAGTCCGATATTACTTTTAGATGAACCTACAAATCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGAACAACAACGTCAATATGAACAGTATATAA > CP000731/21900‑22165 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |