New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000731 | 22032 = | 126 (0.990) | 6 (0.050) | 6/230 | NT | 5.2% | coding (489/1467 nt) | USA300HOU_pUSA300HOUMR0028 | macrolide transporter |
? | CP000731 | 22054 = | 100 (0.840) | coding (511/1467 nt) | USA300HOU_pUSA300HOUMR0028 | macrolide transporter |
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
AGATGAACCTACAAATCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGAACAACAACGTCAATATGAACAGTATATAAGTGAAAAACAAAGATTGT > CP000731/21921‑22183 | aGATTAACCTACTAATCACTTTGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTggg < 1:358663/134‑1 (MQ=255) aGATGAACCTACAAATCACTTTGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGGTAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTggg < 1:579551/134‑1 (MQ=255) tGAACCTACAAATCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATGACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGata < 1:206669/134‑1 (MQ=255) aaCCTACAAATCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTTTAGACCAAATTGCTGACA‑CAATGTGGGAtata > 2:89931/1‑134 (MQ=255) aaCCTACAAATCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGAtata > 2:534026/1‑134 (MQ=255) aaCCTACAAATCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑AAATTTAGGAtata > 2:345367/1‑134 (MQ=255) ccTACAAATCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACa < 1:277130/134‑1 (MQ=255) tACAAATCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACaag < 2:308372/134‑1 (MQ=255) tACAAATCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACaag < 2:162988/134‑1 (MQ=255) tACAAATCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTAATGATAGAGCACTTATAGACTAAATTGTCGACA‑CAATTTGGCATATACaag > 1:531185/1‑134 (MQ=255) ttcttattgacgttgttgttctatctgttcttgttcatattgatttttatactgtgtgtaattacctttaaacactcttattgtgccatcttcttgtatatcccaaattgctgacacaatttggGATATACaag < 2:264265‑M2/10‑1 (MQ=255) aaTCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAagaaga > 1:513129/1‑134 (MQ=255) aaTCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGAATATACAagaaga > 1:179106/1‑134 (MQ=255) aaTCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATATGGGATATACAagaaga > 2:160640/1‑134 (MQ=255) aTCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTTTCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGAt > 1:81304/1‑134 (MQ=255) aCTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGc > 2:23885/1‑134 (MQ=255) cTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGAca > 1:112215/1‑134 (MQ=255) cTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAAATTGAGATATACAAGAAGATggaa > 2:44079/1‑132 (MQ=255) ttGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAATTATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATGGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGcac < 1:266536/134‑1 (MQ=255) ttGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTCATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTCATAGGCCAAATTACTGACA‑CAATTTGGAATACACAAGAATATGGaac > 2:182256/1‑134 (MQ=255) tGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGcaca > 1:236968/1‑134 (MQ=255) ggATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACaa < 2:148629/134‑1 (MQ=255) aaaTTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAaga < 2:60272/134‑1 (MQ=255) aaaTTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAaga < 1:65159/134‑1 (MQ=255) ttctaactgttcttcgtcatattgattttgttcctgcttgtacttccctttaaactctcttattgtgccatcttcttgtatatcCCAATTTGCTTACA‑CTATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAagag > 1:458098‑M1/85‑134 (MQ=255) aTTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAAGTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATCAGCgt > 2:341508/1‑134 (MQ=255) ttcgTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACGATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCATATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAgtg < 2:518006/131‑1 (MQ=255) ggTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAgtgtg > 2:159810/1‑133 (MQ=255) ggTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGATGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGtt > 1:148512/1‑134 (MQ=255) gTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGttt < 2:49969/134‑1 (MQ=255) aGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTATTTATAGTAAATCATGATAGATCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAg < 1:113252/134‑1 (MQ=255) cTGAAAAATATTTTAAAATATTAATATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTa < 1:428690/134‑1 (MQ=255) aaaTATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTacacac < 2:181475/134‑1 (MQ=255) aaTATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTAcacaca > 2:69344/1‑134 (MQ=255) atagTTTAAAAGAGTACGATGGTAGTGTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGGAGTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAAGTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAg < 1:516528/134‑1 (MQ=255) tatTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAACACTTATAGACGAAATTGCTGACA‑CACTTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGt > 2:34635/1‑134 (MQ=255) atTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTa > 1:100/1‑134 (MQ=255) ttAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCa > 2:345176/1‑134 (MQ=255) ttAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGGAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAAGTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCa < 1:523020/134‑1 (MQ=255) tgatactgtgtgtaattacctttaaacactcttattgtgccatcttcttgtatatcccaaattgctgacacaatttggGATCTACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGgaattacacacaaaaaca > 2:486927‑M2/79‑128 (MQ=255) tAACATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCaa < 2:339947/134‑1 (MQ=255) tAAAATGTTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCaa < 2:448591/134‑1 (MQ=255) tAAAATATTATTATTGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAAGAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCaa < 2:148529/134‑1 (MQ=255) tAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCaa < 2:28736/134‑1 (MQ=255) tAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCaa < 2:366111/134‑1 (MQ=255) aaaTATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACAAAGTATCaaaa > 2:401672/1‑134 (MQ=255) aaTATTACTACGGTACTCTAAACAAAGTAAGTCATGATAGAGCACTTACAGCCCAGATTGCTGACA‑CAATTGGGTATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCaaact < 1:19463/134‑3 (MQ=255) atTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGCGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAAATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCaa > 1:333440/1‑134 (MQ=255) atTACTATGGTACGTTAGTGATAGTTAGGCATTATAGAGCACTTATAGACAAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATAGAAGAAGATGGCAGAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACAC‑GTATCAAAATCAat > 2:530314/1‑134 (MQ=255) gtgtgtaattacctttaaacattcttatcgtgccatcttcttgtatatcccaaattgctgacacaatttggGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCaa < 2:513244‑M2/63‑1 (MQ=255) tACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGCCA‑CAATTGGTGGTATTTTCGCAGATAGAACAAGAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCACACTCAata > 2:271435/1‑134 (MQ=255) tACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTAAAGACCAAATTGCTAAAA‑CAATTCGGCAGAGACAAGAAGATAGCACAATAAAAGCGACTAAAGGTAATTAAAAACAACATCAAAATaaaca > 2:150475/1‑132 (MQ=255) aCTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGAACAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAatat < 1:345917/134‑1 (MQ=255) gTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTAGGGATAGACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACaa > 2:243815/1‑134 (MQ=255) tACTTTAATTATAGTAAGTCATGTTAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAg < 1:47822/134‑1 (MQ=255) tACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTTTAGATCAAATTGCGGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAg < 1:47066/134‑1 (MQ=255) aCTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGa < 1:478943/134‑1 (MQ=255) aaTTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGt < 2:436418/134‑1 (MQ=255) aaTTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTGGGGATATAAAAGAATAGGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGt > 2:39301/1‑134 (MQ=255) taGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGaa < 2:81304/134‑1 (MQ=255) ctcttattgtgccatcttcttgtatatcccaaatagtgtaagcaaattggGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGAGTTTAAAGGGAAGTACAAGCAGGAACAAAATCAATATGACGAAGAACAGTTAGaa > 1:458098‑M2/51‑134 (MQ=255) aGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACATACAGTATTAAAATAAATATGAACAAGAACAGTTAGaac > 1:591899/1‑134 (MQ=255) aGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGaac < 2:112499/134‑1 (MQ=255) gTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAAAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATGAATGTGAACAAGAACAGATAGaaca > 2:393167/1‑134 (MQ=255) tAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGGTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGaacaa < 2:416240/134‑1 (MQ=255) aaGTAATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGaacaac < 1:548470/134‑1 (MQ=255) aaGACAAGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGaacaac < 1:238703/134‑1 (MQ=255) aGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGaacaaca < 2:262337/134‑1 (MQ=255) ggcATGATAGAGCACTTATAGACCAAAGTTCTGACA‑CAATTTCGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGaacaacaa < 2:545674/132‑1 (MQ=255) cATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACGCGGACGTAAAAGCAATATGAACAAGAACAGTTAGAACAACAACg > 2:587542/1‑134 (MQ=255) cATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGCGTTTAAAGGTAATTACACACAGTAACAAACTTATTATGAACAAGAACAGTTAGAACAACAACg > 2:586522/1‑134 (MQ=255) aTGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGAACAACAACGt < 1:165904/134‑1 (MQ=255) aTAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGAACAACAACGTCaa < 1:595137/134‑1 (MQ=255) gagatCACTTAAAAACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGAACAACAACGTCAat < 2:494298/133‑1 (MQ=255) agagCACTTATAGACCAAATTTCTGACA‑CATTTTGGGATATACATGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGAACAACAACGTCAata < 1:236022/134‑1 (MQ=255) agagCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGAACAACAACGTCAata < 1:565247/134‑1 (MQ=255) agCACTTATAGACTAAAGTGCTGACA‑CAATTTGGGATATAAAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGAACAACAACGTCAATATg < 2:494065/134‑1 (MQ=255) agCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGAACAACAACGTCAATATg < 1:49763/134‑1 (MQ=255) cttgtatatcCCAAATTG‑TGTCAGCAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATAAAAATCAATATGAACAAGAACAGATAGAACAACAACGTCAATAAGaa < 2:264265‑M1/124‑1 (MQ=255) cTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGAACAACAACGTCAATATGAACa < 1:146936/134‑1 (MQ=255) taGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGAACAACAACGTCAATATGAACAGtat > 2:36453/1‑134 (MQ=255) taGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAAACGGAAGAGTTAGAACAACAACGTCAACAAGAACAgaaa > 2:587144/1‑131 (MQ=255) CCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTACTTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGAACAACAAAGTCAATAAGAACAGTAAATaa < 1:179731‑M1/134‑1 (MQ=255) AAATTGCTGGAA‑CAAGTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGAACAACAACGTCAATATGAACAGTATATAAGt > 2:501399‑M1/1‑134 (MQ=255) AAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACATTATTGAAGTGAACAGCAACAAGAACAGTTAGAACAACAACGTCAATATGAACAGTATATAaga < 2:430355‑M1/134‑2 (MQ=255) AATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATAAATATGAACAAAAAAAGTTAGAACAACAACGTCCATAAGAAAAAAATATaagga < 2:514617‑M1/134‑3 (MQ=255) aattgtgtcagcaatttggGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGAATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGAACAACAACGTCAACATGAACAGTATATAAGTg > 1:473109‑M2/20‑134 (MQ=255) ATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGAACAACAACGTCAATATGAACAGTATATAAGTGa < 2:533407‑M1/134‑1 (MQ=255) TGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGAACAACAACGTCAATATGAACAGTATATAAGTGaaa < 2:107672‑M1/134‑1 (MQ=255) TGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGAACAACAACGTCAATATGAACAGTATATAAGTGaaa < 1:149672‑M1/134‑1 (MQ=255) tGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGAACAACAACGTCAATATGAACAGTATATAAGTGAAAAAc < 1:533407/134‑1 (MQ=255) tGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGAACAACAACGTCAATATGAACAGTATATAAGTGAAAAAc > 1:349007/1‑134 (MQ=255) taca‑cAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGAACAACAACGTCAATATGAACAGTATATAAGTGAAAAACa < 1:466710/133‑1 (MQ=255) gACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAACGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGAACAACAACGTAAATATGAACAGAATATAAGAGAAAAACa > 1:329835/1‑134 (MQ=255) tcagcaatttggGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGAACAACAACGTCAATATGAACAGTATATAAGTGAAAAACa > 2:194393‑M2/13‑134 (MQ=255) aattttgGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAGGTTCCAGAGAAACAAGATCAGTTAGAACAACAACGCCAATATGAACAGTATATAAGTGAAAAACAAAGAt < 1:284061‑M2/127‑1 (MQ=255) atttggGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGAACAACAACGTCAAAATGAACAGTAAATAAGTGAAAAACAAAGAtt > 2:370399‑M2/7‑134 (MQ=255) atttaagATATACAACAAGATAGCACAATAATAGTGTTTAAAAGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATAAACAAGAACAGTTAGAACAACAACGTCAATATGAACAGTATATAAGTGAAAAACAAAGAtt < 2:591899/128‑1 (MQ=255) tttgtGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGAACAACAACGTCAATATGAACAGTATATAAGTGAAAAACAAAGATTg < 1:92710‑M2/129‑1 (MQ=255) ttggGATATACACGACGGTGGCAGAAGAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGAACAACAACGTCAATATGAACAGTATATAAGTGAAAAACAAAGATTGt < 2:553953‑M2/130‑1 (MQ=255) | AGATGAACCTACAAATCACTTGGATAAAATTGGTAAAGATTATCTGAAAAATATTTTAAAATATTACTATGGTACTTTAATTATAGTAAGTCATGATAGAGCACTTATAGACCAAATTGCTGACA‑CAATTTGGGATATACAAGAAGATGGCACAATAAGAGTGTTTAAAGGTAATTACACACAGTATCAAAATCAATATGAACAAGAACAGTTAGAACAACAACGTCAATATGAACAGTATATAAGTGAAAAACAAAGATTGT > CP000731/21921‑22183 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |