New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1980867 = | 59 (0.900) | 4 (0.070) | 4/238 | NT | 6.5% | intergenic (‑109/+70) | USA300HOU_RS09865/USA300HOU_RS09870 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | USA300TCH1516_ALE | 1980913 = | 61 (1.010) | intergenic (‑155/+24) | USA300HOU_RS09865/USA300HOU_RS09870 | hypothetical protein/hypothetical protein |
TCATAAATATGATAATAAATAGTGCATTCATAATTTTGACTCCTTTGTGACAACATAGTTATTCATTATACCACTATTTTTATTTTTTAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTTTTATTATTTATTAAAAGTATATAGGCCTAGATATGTACTAATTCTTCTTTAGCATTTCTGTTAAAGTATGTTTCAGCTTCTCTCATTTTAG > USA300TCH1516_ALE/1980728‑1981001 | tCATAAATATGATAATAAATAGTGCATTCATAATTTTGACTCCTTTGTGACAACATAGTTATTCATTATACCACTATTTTTATTTTTTAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACaa < 2:289745/140‑1 (MQ=255) cATAAATATGATAATAAATAGTGCATTCATAATTTTGACTCCTTTGTGACAACATAGTTATTCATTATACCACTATTTTTATTTTTTAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACaaa > 1:134659/1‑140 (MQ=255) cATAAATATGATAATAAATAGTGCATTCATAATTTTGACTCCTTTGTGACAACATAGTTATTCATTATACCACTATTTTTATTTTTTAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACaaa < 1:576143/140‑1 (MQ=255) tAAATATGATAATAAATAGTGCATTCATAATTTTGACTCCTTTGTGACAACATAGTTATTCATTATACCACTATTTTTATTTTTTAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACaaaaa > 2:383756/1‑140 (MQ=255) tAAATATGATAATAAATAGTGCATTCATAATTTTGACTCCTTTGTGACAACATAGTTATTCATTATACCACTATTTTTATTTTTTAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACaaaaa > 2:383754/1‑140 (MQ=255) atttatcgtgtattaaatccagataaccaaccaattttcggtacttctaaaatgagagaagctgaaacatactttaacagaaatgctaaagaagaattagtacatatctaggcctatatacttttaatacataatAAAAg < 1:22930‑M1/5‑1 (MQ=255) aaaTATGATAATAAATAGTGCATTCATAATTTTGACTCCTTTGTGACAACATAGTTATTCATTATACCACTATTTTTATTTTTTAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTTTTATTAGTTTACATACaacatg > 2:22930/1‑136 (MQ=255) aaTATGATAATAAATAGTGCATTCATAATTTTGACTCCTTTGTGACAACATAGTTATTCATTATACCACTATTTTTATTTTTTAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGc < 2:738908/140‑1 (MQ=255) tatcgtgtattaaatccagataaccaaccaattttcggtacttctaaaatgagagaagctgaaacatactttaacagaaatgctaaagaagaattagtacatatctaggcctatatacttttaataaataatAAAAGCGa < 1:69878‑M1/8‑1 (MQ=255) tcgtgtattaaatccagataaccaaccaattttcggtacttctaaaatgagagaagctgaaacatactttaacagaaatgctaaagaagaattagtacatatctaggcctatatacttttaataaataatAAACGCGATg < 1:255735‑M1/10‑1 (MQ=255) tcgtgtattaaatccagataaccaaccaattttcggtacttctaaaatgagagaagctgaaacatactttaacagaaatgctaaagaagaattagtacatatctaggcctatatacttttaataaataatAAAAGCGatt < 1:718883‑M1/10‑2 (MQ=255) tcgtgtattaaatccagataaccaaccaattttcggtacttctaaaatgagagaagctgaaacatactttaacagaaatgctaaagaagaattagtacatatctaggcctatatacttttaataaataatAAAAGCGATg > 1:471745‑M1/131‑140 (MQ=255) tcgtgtattaaatccagataaccaaccaattttcggtacttctaaaatgagagaagctgaaacatactttaacagaaatgctaaagaagaattagtacatatctaggcctatatacttttaataaataatAAAAGCGATg < 1:209921‑M1/10‑1 (MQ=255) tcgtgtattaaatccagataaccaaccaattttcggtacttctaaaatgagagaagctgaaacatactttaacagaaatgctaaagaagaattagtacatatctaggcctatatacttataataaataataaaagagaag < 2:126897‑M1/10‑6 (MQ=255) ataataAATAGGGCATTCATAATTTTGACTCCTTTGTGACAACATAGTTATTCATTATACCACTATTTTTATTTTTTAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGcc < 2:601654/140‑1 (MQ=255) taataaATAGTGCATTCATAATTTTGACTCCTTTGTGACAACATAGTTATTCATTATACCACTATTTTTATTTTTTAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATTTTTAGTTTACATACAACAAGCGCTGCCt > 1:412753/1‑140 (MQ=255) taagtaGTGCATTCATAATTTTGATTCCTTTGTGACAACATAGTTATTCATTATACCACTATTTTTATTTTTTAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCAc < 1:125753/140‑1 (MQ=255) aaataGTGCATTCATAATTTTGACTCCTTTGTGACAACATAGTTATTCATTATACCACTATTTTTATTTTTTAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTTAATTTTTTTTTAGTTTTCATACAAAAAGCTATTCCTCTcc > 2:548793/1‑140 (MQ=255) aGTGCATTCATAATTTTGACTCCTTTGTGACAACATAGTTATTCATTATACCACTATTTTTATTTTTTAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCtctc > 1:429531/1‑140 (MQ=255) aGTGCATTCATAATTTTGACTCCTTTGTGACAACATAGTTATTCATTATACCACTATTTTTATTTTTTAATTCATTAATCATTTCAATTTCTGTTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCtctc > 1:111037/1‑140 (MQ=255) tGCATTCATAATTTTGACTCCTTTGTGACAACATAGTTATTCATTATACCCCTATTTTTATTTTTTAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGa < 1:795891/140‑1 (MQ=255) tGCATTCATAATTTTGACTCCTTTGTGACAACATAGTTATTCATTATACCACTATTTTTATTTTTTAATTCATTAATCCATTCACTCTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGa < 2:608544/140‑1 (MQ=255) cATTCATAATTTTGACTCCTTTGTGACAACATAGTTACTCATTATCCCACTATTTTTATTTTTTAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGATCAATTTATTATTTGTTTAGATACAAACAGCAATGTCTCACctctggtcc > 2:64587/1‑135 (MQ=255) aTTCATAATTTTGACTCCTTTGTGACAACATAGTTATTCATTATACCACTATTTTTATTTTTTAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAAc < 2:547193/140‑1 (MQ=255) tAATTTTGACTCCTTTGTGACAACATAGTTATTCATTATACCACTATTTTTATTTTTTAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTCTTCTTAGTTTACATCCAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGgta > 1:285263/1‑139 (MQ=255) aaTTTTGACTCCTTTGTGACAACATAGTTATTCATTATACCACTATTTTTATTTTTTAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGACTCACCTCTCAAAACAGgtgt > 2:291972/1‑140 (MQ=255) aaTTTTGACTCCTTTGTGACAACATAGCTATTCAAAATAGTAATAAATAGTTTATTGCCTCCCAACCTGATTGGACTTTCTGCTCAATTTATTTTTAGATTACATACTAAAAGCGATGACTCACCACTCGAAGCAGgtgt > 1:187663/1‑140 (MQ=255) ttttGACTCCTTTGTGACAACATAGTTATTCATTATACCACTATTTTTATTTTTTAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGgtgtgt > 1:239660/1‑140 (MQ=255) ttGACTCCTTTGTGACAACATAGTTATTCATTATACCACTATTTTTATTTTTTAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATCCCTCCCCTCTCGAAACAGGTGTGttg > 1:126897/1‑139 (MQ=255) cTCCTTTGTGACAACATAGTTATTCATTATACCACTATTTTTATTTTTTAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATc < 1:268975/140‑1 (MQ=255) tcggtacttctaaaatgagagaagctgaaacatactttaacagaaatgctaaagaagaattagtacatatctaggcctatatacttttaataaataatAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGc > 1:713480‑M1/99‑140 (MQ=255) tacttctaaaatgagagaagctgaaacatactttaacagaaatgctaaagaagaattagtacatatctaggcctatatacttttaataaataatAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCtttt > 1:725581‑M1/95‑140 (MQ=255) cataaTAGCTATTCATTATACCACTATTTTTATTTTTTATTTCATTAATCATTTCACTTTCTCCTCAATTTATTATAAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGAGAGATAAAACGATtttattat < 2:538176/136‑1 (MQ=255) caacaTAGTTATTCATTATACCACTATTTTTATTTTTTAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTtttattat < 2:329582/140‑1 (MQ=255) aaacaTAGTTATTCATTATACCACTATTTTTATTTTTTAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATTCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTtttattat < 2:517749/139‑1 (MQ=255) aacaTTGTTATTCATTATACCACTATTTTTATTTTTTAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTCTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTtttattatt < 2:10994/140‑1 (MQ=255) acaTAGTTATTCATTATACCACTATTTTTATTTTTTAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTtttattattt < 2:281435/140‑1 (MQ=255) tAGTTATTCATTATACCACTATTTTTATTTTTTAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTtttattatttatt < 1:325981/140‑1 (MQ=255) gTTATTCATTATACCACTATTTTTATTTTTTAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGTTTTTATTTTTTATTaa > 2:384022/1‑140 (MQ=255) agaagctgaaacatactttaacagaaatgctaaagaagaattagtacatatctaggcctatatacttttaataaataatAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTTTTATTATTTATTAAAAg < 2:487759‑M1/61‑1 (MQ=255) tCATTATACTACTATTGTTATTTTTTAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTCACATCGCTTTTATTATTTATTAAAAGta < 2:237856/140‑1 (MQ=255) ttATACCACTATTTTTATTTTTTAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTTTTCTTATTTATTAAAAGtatat > 1:746491/1‑140 (MQ=255) ttATACCACTATTTTTATTTTTTAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTTTTATTATTTATTAAAAGtatat > 1:743385/1‑140 (MQ=255) ttATACCACTATTTTTATTTTTTAATTCATTAATCATTTCACTTCCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCGCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTTTTATTATTTATTAAAAGtagat < 1:179662/140‑1 (MQ=255) tataCCACTATTTTTATTTTTTAAGTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTTTTATTATTTATTAAAAGtatata < 1:364773/140‑1 (MQ=255) ataCCACTATTTTTATTTTTTAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTTTTATTATTTATTTAAAGTATATAg > 1:687462/1‑140 (MQ=255) cACTATTTTTATTTTTTAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTTTTATTATTTATTAAAAGTATATAGGCCt < 1:97797/140‑1 (MQ=255) cACTATTTCTATTTTTTAAGTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCACTTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGACGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTTTTATTATTTATTAAAAGTATATAGGCCt < 2:562985/140‑1 (MQ=255) atttttTAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTTTTATTATTTATTAAAAGTATATAGGCCTAGATATGTAc > 1:242057/1‑140 (MQ=255) atttttTAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTTTTATTATTTATTAAAAGTATATAGGCCTAGATATGTAc > 1:608258/1‑140 (MQ=255) atttttTAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTTTTATTATTTATTAAAAGTATATAGGCCTAGATATGTAc > 2:69878/1‑140 (MQ=255) ttttttAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAATCAGCGATGCCTCACCTCTCGAATCTTGTGTGTTACATCGCTTTTATTATTTTTTCATTCTTTATATGTCTATTTATGTACt > 2:598829/1‑140 (MQ=255) ttttttAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTTTTATTATTTATTAAAAGTATATAGGCCTAGATATGTACt < 1:383756/140‑1 (MQ=255) ttttttAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTTTTATTATTTATTAAAAGTATATAGGCCTAGATATGTACt < 1:383754/140‑1 (MQ=255) ttttttATCCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATCCCTTATATACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTTTTATTATTTATTAAAAGTATATAGGCCTAGATATGTACTa < 2:357935/140‑1 (MQ=255) tttttAATTCATTAATCATCTCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTTTTATTATTTATTAAAAGTATATAGGCCTAGATATGTACTa < 1:567141/140‑1 (MQ=255) aaTCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTTTTATTATTTATTAAAAGTATATAGGCCTAGATATGTACTAATTCTTCTTTAGc < 2:37874/140‑1 (MQ=255) aaTCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTTTTATTATTTATTAAAAGTATATAGGCCTAGATATGTACTAATTCTTCTTTAGc < 2:608258/140‑1 (MQ=255) tttCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTTTTATTATTTATTAAAAGTATATAGGCCTAGATATGTACTAATTCTTCTTTATCATTTc > 2:558737/1‑140 (MQ=255) ttCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTTTTATTATTTATTAAAAGTATATAGGCCTAGATATGTACTACTTCTTCTTTAGCATTTCt > 1:262714/1‑140 (MQ=255) ttCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTTTTATTATTTATTAAAAGTATATAGGCCTAGATATGTACTAATTCTTCTTTAGCATTTCt > 1:140379/1‑140 (MQ=255) ttCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTTTTATTATTTATTAAAAGTATATAGGCCTAGATATGTACTAATTCTTCTTTAGCATTTCt > 2:775731/1‑140 (MQ=255) tCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGCTACATCGCTTTTATTATTTATTAAAAGTATATAGGCCTAGATATGTACTAATTCTTCTTTAGCATTTCTg > 2:649830/1‑140 (MQ=255) aCTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTTTTATTATTTATTAAAAGTATATAGGCCTAGATATGTACTAATTCTTCTTTAGCATTTCTGtt > 2:796861/1‑140 (MQ=255) cTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTTTTATTATTTATTAAAAGTATATAGGCCTAGATATGTACTAATTCTTCTTTAGCATTTCTGTTa > 1:35155/1‑140 (MQ=255) cTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTTTTATTATTTATTAAAAGTATATAGGCCTAGATATGTACTAATTCTTCTTTAGCATTTCTGTTAAAGt > 2:415021/1‑140 (MQ=255) gCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTCAAATATATCTTTTATTATTTATTAAAAGTATATAGGCCTAGATATGTACTAATTCTTCTTTAGCATTTCTGTTAAAGTAt < 1:588073/140‑1 (MQ=255) tCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTTTTATTATTTATTAAAAGTATATAGGCCTAGATATGTACTAATTCTTCTTTAGCATTTCTGTTAAAGTATGt > 1:233964/1‑140 (MQ=255) tCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTTTTATTATTTATTAAAAGTATATAGGCCTAGATATGTACTAATTCTTCTTTAGCATTTCTGTTAAAGTATGt > 1:232938/1‑140 (MQ=255) tCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCCAAACAGCTGTGTTACCTCGCTTTTATTATTTATTAAAAGTCTATAGGCCTAGACATGTACTAATTCTTCTTTAGCACTTCTGCTCACGTATgc > 2:761945/1‑139 (MQ=255) cttttattaaataatAATATCAATGCCTCACCTCTCTATACTGGTGTGTTACATCGTTTTTATTATTTATTAAAAGTATATAGGCCTAGATATGTACTAATTCTTCTTTAGCATTTCTGTTAAAGTATGTTTCAGCTtct > 1:487759‑M1/16‑140 (MQ=255) ttaGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTTTTATTATTTATTAAAAGTATATAGGCCTAGATATGTAGTAATTCTTCTTTAGCATTTATGTTAAAGTATGTTTCAGCTtctc > 1:625386/1‑140 (MQ=255) ttaGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTTTTATTATTTATTAAAAGTATATAGGCCTAGATATGTACTAATTCTTCTTTAGCATTTCTGTTAAAGTATGTTTCAGCTtctc < 1:477530/140‑1 (MQ=255) taGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTTTTATTATTTATTAAAAGTATATAGGCCTAGATATGTACTAATTCTTCTTTAGCATTTCTGTTAAAGTATGTTTCAGCTtctct > 2:618673/1‑140 (MQ=255) taGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGGGTGTTACATCGCTTTTATTATTTATTAAAAGTATATAGGCCTAGATATGTACTAATTCTTCTTTAGCATTTCTGTTAAAGTATGTTTCAGCTtctct < 2:116189/140‑1 (MQ=255) aGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTTTTATTATTTATTAAAAGTATATAGGCCTAGATATGTACTAATTCTTCTTTAGCATTTCTGTTAAAGTATGTTTCAGCTtctctc < 2:17027/140‑1 (MQ=255) atacaAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTTTTATTATTTATTAAAAGTATATAGGCCTAGATATGTACTAATTCTTCTTTAGCATTTCTGTTAAAGTATGTTTCAGCTTCTCTCATTTTAg > 1:55496/1‑140 (MQ=255) atacaAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTTTTATTATTTATTAAAAGTATATAGGCCTAGATATGTACTAATTCTTCTTTAGCATTTCTGTTAAAGTATGTTTCAGCTTCTCTCATTTTAg > 1:712236/1‑140 (MQ=255) | TCATAAATATGATAATAAATAGTGCATTCATAATTTTGACTCCTTTGTGACAACATAGTTATTCATTATACCACTATTTTTATTTTTTAATTCATTAATCATTTCACTTTCTGCTCAATTTATTATTAGTTTACATACAAAAAGCGATGCCTCACCTCTCGAAACAGGTGTGTTACATCGCTTTTATTATTTATTAAAAGTATATAGGCCTAGATATGTACTAATTCTTCTTTAGCATTTCTGTTAAAGTATGTTTCAGCTTCTCTCATTTTAG > USA300TCH1516_ALE/1980728‑1981001 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |