| New junction evidence | |||||||||||
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| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
ACCTCACTCATTGGTGATAACAATGGTAAAGATCGGTCTGGTAACTGCACAGTCTCATATGCAATACTAATTACTTTTCTATCTATCAAAGCTTGTGTTAATTTTTCTTCATTTGCTAAATGAAGATAAGTGAATAATACAAGCCCTTCTTTAAAATATGGATATTCAGATTCAAGTGGTTCTTTAACTTTAATAACCATATCCACATCCCAAACTTTTGCTTGTTCAGCAACAATCTCAGCACCTGCTTCTTTGTAATCTACATCTTCAAAGAATG > USA300TCH1516_ALE/1821635‑1821911 | ccTCGCTCATTGGTGATAACAATGGTAAAGATCGGGCTGGTAACTGCCCAGTCTCATATGCAATGCTAATTACTGTTCTATCTATCAAAGCTTGTGTTAATTTCTCTTCATTTGCTAAATGAAGATAAGTGAATAATACaa > 2:183608/1‑141 (MQ=255) ctcaTTGGTGATAACAATGGTAAAGATCGGTCTGGTAACTGCACAGTCTCATATGCAATACTAATTACTTTTCTATCTATCAAAGCTTGTGTTAATTTTTCTTCATTTGCTAAATGAAGATAAGTGAATAATACAAGCCct < 2:85119/141‑1 (MQ=255) ctcaTTGGTGATAACAATGGTAAAGATCGGTCTGGTAACTGCACAGTCTCATATGCAATACTAATTACTTTTCTATCTATCAAAGCTTGTGTTAATTTTTCTTCATTTGCTAAATGAAGATAAGTGAATAATACAAGCCct < 1:302570/141‑1 (MQ=255) aTTGGTGATAACAATGGTAAAGATCGGTCTGGTAACTGCACAGTCTCATATGCAATACTAATTACTTTTCTATCTATCAAAGCTTGTGTTAATTTTTCTTCATTTGCTAAATGAAGATAAGTGAATAATACAAGCCcttct < 2:658199/141‑1 (MQ=255) 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4:150021/141‑1 (MQ=255) tGAATAATACAAGCCCTTCTTTAAAATATGGATATTCAGATTCAAGTGGTTCTTTAACTTTAATAACCATATCCACATCCCAAACTTTTGCTTGTTCAGCAACAATCTCAGCACCTGCTTCTTTGTAATCTACATCTTCaa < 2:751934/141‑1 (MQ=255) tGAATAATACAAGCCCTTCTTTAAAATATGGATATTCAGATTCAAGTGGTTCTTTAACTTTAATAACCATATCCACATCCCAAACTTTTGCTTGTTCAGCAACAATCTCAGCACCTGCTTCTTTGTAATCTACATCTTCaa < 3:117088/141‑1 (MQ=255) aataatACAAGCCCTTCTTTAAAATATGGATATTCAGATTCAAGTGGTTCTTTAACTTTAATAACCATATCCACATCCCAAACTTTTGCTTGTTCAGCAACAATCTCAGCACCTGCTTCTTTGTAATCTACATCTTCAAAg < 2:608085/141‑1 (MQ=255) aataatACAAGCCCTTCTTTAAAATATGGATATTCAGATTCAAGTGGTTCTTTAACTTTAATAACCATATCCACATCCCAAACTTTTGCTTGTTCAGCAACAATCTCAGCACCTGCTTCTTTGTAATCTACATCTTCAAAg < 1:242847/141‑1 (MQ=255) ataataCAAGCCCTTCTTTAAAATATGGATATTCAGATTCAAGTGGTTctttaact < 4:233266/56‑1 (MQ=255) ataataCAAGCCCTTCTTTAAAATATGGATATTCAGATTCAAGTGGTTctttaact > 3:233266/1‑56 (MQ=255) ataataCAAGCCCTTCTTTAAAATATGGATATTCAGATTCAAGTGGTTCTTTAACTTTAATAACCATATCCACATCCCAAACTTTTGCTTGTTCAGCAACAATCTCAGCACCTGCTTCTTTGTAATCTACATCTTCAAAGa > 1:18848/1‑141 (MQ=255) ataCAAGCCCTTCTTTAAAATATGGATATTCAGATTCAAGTGGTTCTTTAACTTTAATAACCATATCCACATCCCAAACTTTTGCTTGTTCAGCAACAATCTCAGCACCTGCTTCTTTGTAATCTACATCTTCAAAGAATg > 3:207141/1‑141 (MQ=255) | ACCTCACTCATTGGTGATAACAATGGTAAAGATCGGTCTGGTAACTGCACAGTCTCATATGCAATACTAATTACTTTTCTATCTATCAAAGCTTGTGTTAATTTTTCTTCATTTGCTAAATGAAGATAAGTGAATAATACAAGCCCTTCTTTAAAATATGGATATTCAGATTCAAGTGGTTCTTTAACTTTAATAACCATATCCACATCCCAAACTTTTGCTTGTTCAGCAACAATCTCAGCACCTGCTTCTTTGTAATCTACATCTTCAAAGAATG > USA300TCH1516_ALE/1821635‑1821911 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |