New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 2772633 = | 408 (1.140) | 21 (0.070) | 7/134 | NT | 6.7% | intergenic (+7/+53) | phoB/USA300TCH1516_02632 | Alkaline phosphatase 3/hypothetical protein |
? | USA300TCH1516_ALE | 2772676 = | 240 (0.800) | intergenic (+50/+10) | phoB/USA300TCH1516_02632 | Alkaline phosphatase 3/hypothetical protein |
Only 100 of 469 total aligned reads displayed.
ATACAGAAAGCGCAAAAATAATATTTGATATATTCAAGTAAAGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTATTTTTTAAATGCGAAGTATAAACCGCCAACTAATGTTAA > USA300TCH1516_ALE/2772586‑2772766 | aTACAGAAAGCGCAAAGATAAGATTTGATATATTCAAGTAAAGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAGCAAGGTGTTCGGGAATTTTTTa < 1:4898772/91‑1 (MQ=255) aTACAGAAAGCGCAAAAATAATATTTGATATATTCAAGTAAAGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTa > 1:978970/1‑91 (MQ=255) tACAGAAAGCGCAAAAATAATATTTGATATATTCAAGTAAAGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTAt < 1:2028930/91‑1 (MQ=255) tACAGAAAGCGCAAAAATAATATTTGATATATTCAAGTAAAGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTAt < 2:3839635/91‑1 (MQ=255) aCAGAAAGCGGAAAAATAATATTTGATATATTCGAGTAAAGCATAAAAAAATTCCCGAGTACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATg < 1:6392512/91‑1 (MQ=255) cAGAAGGCGCAAAGATAATATTTGGTATATTCAAGTAAAGCATAATTAAATTCCCGTGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATgg < 1:4428067/91‑1 (MQ=255) cAGAAAGCGCAAAAATAATATTTGATATATTCAAGTAAAGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATgg > 1:1544488/1‑91 (MQ=255) aGAAAGCGCAAAAATAATATTTGATATATTCAAGTAAAGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGt > 1:3937194/1‑91 (MQ=255) aGAAAGCGCAAAAATAATATTTGATATATTCAAGTAAAGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGt < 1:4215508/91‑1 (MQ=255) aGAAAGCGCAAAAATAATATTTGATATATTCAAGTAAAGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGt < 2:1828099/91‑1 (MQ=255) aGAAAGCGCAAAAATAATATTTGATATATTCAAGTAAAGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGt < 1:2692420/91‑1 (MQ=255) gAAAGCGCAAAAATAATATTTGATATATTCAAGTAAAGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGtt > 1:3772631/1‑91 (MQ=255) gAAAGCGCAAAAATAATATTTGATATATTCAAGTAAAGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGtt > 1:2909386/1‑91 (MQ=255) gAAAGCGCAAAAATAATATTTGATATATTCAAGTAAAGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGtt > 1:2115838/1‑91 (MQ=255) aGCGCAAAAATAATATTTGATATATTCAAGTAAAGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTaa < 1:2322942/91‑1 (MQ=255) aaaaaTAATATTTGATATATTCGAGTAAAGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAg > 2:5341991/1‑91 (MQ=255) aaaaaTAATATTTGATATATTCAAGTAAAGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAg > 2:3333184/1‑91 (MQ=255) aaaaTAATATTTGATATATTCAAGTAAAGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGt < 2:4839178/91‑1 (MQ=255) aaaTAATATTTGATATATTCAAGTAAAGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTa > 1:501940/1‑91 (MQ=255) taataTTTGATATATTCAAGTAAAGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTc < 2:340266/91‑1 (MQ=255) atatTTGATATATTCAAGTAAAGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCaa > 2:2668781/1‑91 (MQ=255) ttGATATATTCAAGTAAAGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGtt < 1:5498824/91‑1 (MQ=255) tGATATATTCAAGTAAAGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTa < 1:3052809/91‑1 (MQ=255) tGATATATTCAAGTAAAGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTa < 1:1704026/91‑1 (MQ=255) gATATATTCAAGTAAAGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAg < 2:2506311/91‑1 (MQ=255) gATATATTCAAGTAAAGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAg < 2:6901006/91‑1 (MQ=255) atatatTCAAGTAAAGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAgg < 1:3715973/91‑1 (MQ=255) atatatTCAAGTAAAGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAgg < 2:112214/91‑1 (MQ=255) atatTCAAGTAAAGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTg < 1:2932834/91‑1 (MQ=255) atatTCAAGTAAAGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTg < 2:5026075/91‑1 (MQ=255) tatTCAAGTAAAGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGc < 2:1299152/91‑1 (MQ=255) ttCAAGTAAAGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCtt > 1:1328753/1‑91 (MQ=255) tCAAGTAAAGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTg < 2:4165738/91‑1 (MQ=255) tCAAGTAAAGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTg < 1:1609890/91‑1 (MQ=255) aGTAAAGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGtt > 2:4535204/1‑91 (MQ=255) gTAAAGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTa < 2:4946559/91‑1 (MQ=255) aaaGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGTAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAac < 2:2861976/91‑1 (MQ=255) aaGCATAAAAAAATTCCCGAGCCCTATAACAAGGGGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAAATTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAaca > 2:562434/1‑91 (MQ=255) aaGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAaca > 1:756486/1‑91 (MQ=255) aaGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAaca > 1:679902/1‑91 (MQ=255) aGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAacac > 1:5315797/1‑91 (MQ=255) aTAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGtt > 1:4628773/1‑91 (MQ=255) aTAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGtt < 2:2403278/91‑1 (MQ=255) tAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTc < 2:2224565/91‑1 (MQ=255) aaaaaaaTTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCt > 2:5413352/1‑91 (MQ=255) AAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCtt < 2:5798995‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTg < 1:3521218‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTgg > 2:1705310‑M1/1‑91 (MQ=255) AAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGt > 1:2565772‑M1/1‑91 (MQ=255) ATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTAt > 2:6048501‑M1/1‑91 (MQ=255) ATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTAt < 2:118584‑M1/91‑1 (MQ=255) TTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTCGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTAtt > 2:6489538‑M1/1‑91 (MQ=255) TTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTAtt < 1:1221852‑M1/91‑1 (MQ=255) TTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTAtt < 2:4586909‑M1/91‑1 (MQ=255) TCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTAttt < 1:2792268‑M1/91‑1 (MQ=255) TCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTAttt > 2:312573‑M1/1‑91 (MQ=255) TCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTAttt > 1:210535‑M1/1‑91 (MQ=255) TCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTAttt > 2:6388045‑M1/1‑91 (MQ=255) TCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTAttt > 2:5884257‑M1/1‑91 (MQ=255) CCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTAtttt < 1:573948‑M1/91‑1 (MQ=255) CCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTAttttt < 1:3131093‑M1/91‑1 (MQ=255) CCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTCAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTAttttt > 2:6770523‑M1/1‑91 (MQ=255) CGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTg > 1:32865‑M1/1‑82 (MQ=255) CGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTAtttttt > 2:810729‑M1/1‑91 (MQ=255) CGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTAtttttt > 2:1579779‑M1/1‑91 (MQ=255) CGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTAtttttt > 1:4368395‑M1/1‑91 (MQ=255) GAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTATTTTTTa < 2:2164582‑M1/91‑1 (MQ=255) GAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTATTTTTTa < 2:3242776‑M1/91‑1 (MQ=255) GAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTATTTTTTa > 2:2940269‑M1/1‑91 (MQ=255) GAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTATTTTTTa > 1:4461117‑M1/1‑91 (MQ=255) GAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTATTGGTATTTTTTa < 2:6844119‑M1/91‑1 (MQ=255) AGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTATTTTTTaa > 2:6142318‑M1/1‑91 (MQ=255) AGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTATTTTTTaa < 1:4152557‑M1/91‑1 (MQ=255) ccttgttatagtgctcgggaattttttATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTATTTTTTAAATGc > 2:4705580‑M2/28‑91 (MQ=255) cTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTATTTTTTAAATGc > 1:6596563/1‑91 (MQ=255) ataACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTATTTTTTAAATGCGa < 2:6545200/91‑1 (MQ=255) ataACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTATTTTTTAAATGCGa > 2:4015782/1‑91 (MQ=255) ataACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTATTTTTTAAATGCGa < 2:426900/91‑1 (MQ=255) aaCAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTATTTTTTAAATGCGAAg < 1:1031728/91‑1 (MQ=255) aCAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTATTTTTTAAATGCGAAGt > 2:4326716/1‑91 (MQ=255) aCAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTATTTTTTAAATGCGAAGt > 2:1424918/1‑91 (MQ=255) cAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTATTTTTTAAATGCGAAGta > 2:5259636/1‑91 (MQ=255) aaGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTATTTTTTAAATGCGAAGtat > 1:6329996/1‑91 (MQ=255) ggTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTATTTTTTAAATGCGAAGTATaa < 1:6041395/91‑1 (MQ=255) ggTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTATTTTTTAAATGCGAAGTATaa > 1:3891629/1‑91 (MQ=255) ggTGTTCCGGAATATTTTATGGTTTAATTTAGTACTCACTGTCAGGTGCTTGGTTAACACATTCTTGGTATTTTTTATATGCGAAGTATaa < 1:5561532/91‑1 (MQ=255) gtgtTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTATTTTTTAAATGCGAAGTATaaa > 2:3751469/1‑91 (MQ=255) gtgtTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTATTTTTTAAATGCGAAGTATaaa > 2:5743716/1‑91 (MQ=255) gtgtTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTATTTTTTAAATGCGAAGTATaaa > 1:916601/1‑91 (MQ=255) gtTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTATTTTTTAAATGCGAAGTATAAAcc > 1:178493/1‑91 (MQ=255) ttCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTATTTTTTAAATGCGAAGTATAAACCg > 1:4101952/1‑91 (MQ=255) cgggaattttttATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTATTTTTTAAATGCGAAGTATAAACCGcc > 2:20341‑M2/13‑91 (MQ=255) cgggaattttttATGGTTTAATTTAGTACGCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTATTTTTTAAATGCGAAGTATAAACCGcc < 1:6181300‑M2/79‑1 (MQ=255) gggaattttttATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTATTTTTTAAATGCGAAGTATAAACCGCCa < 1:1166942‑M2/80‑1 (MQ=255) ggaattttttATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTATTTTTTAAATGCGAAGTATAAACCGCCaa < 1:2177493‑M2/81‑1 (MQ=255) ggaattttttATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTATTTTTTAAATGCGAAGTATAAACCGCCaa < 2:3490684‑M2/81‑1 (MQ=255) attttttATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTATTTTTTAAATGCGAAGTATAAACCGCCAACTa > 1:3421148‑M2/8‑91 (MQ=255) tttttATGTTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTATCATGTTCTTGGTATTTTTTAAATGCGAAGTATAAACCGCCAACTAAt > 2:5124037‑M2/6‑91 (MQ=255) tttATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTATTTTTTAAATGCGAAGTATAAACCGCCAACTAATGt < 2:6290406‑M2/88‑1 (MQ=255) ttATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTATTTTTTAAATGCGAAGTATAAACCGCCAACTAATGtt > 1:5175655‑M2/3‑91 (MQ=255) | ATACAGAAAGCGCAAAAATAATATTTGATATATTCAAGTAAAGCATAAAAAAATTCCCGAGCACTATAACAAGGTGTTCGGGAATTTTTTATGGTTTAATTTAGTACTCAATGTTAGGTGCTTGGTTAACACGTTCTTGGTATTTTTTAAATGCGAAGTATAAACCGCCAACTAATGTTAA > USA300TCH1516_ALE/2772586‑2772766 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |