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1:405481/141‑1 (MQ=255) aaaaCAGCGAGATAAATCGCGTGATTGGCTAATATCTTTATGATTTAAGATATTACGACGCTCATTTTATCTCGCTTTATGTAAAGTATTACTTATTCTTTTTTAAATTTGAAAAGTAATGTAAACCATATGCAAATacac < 2:975462/141‑1 (MQ=255) aaaaCAGCGAGATAAATCGCGTGATTGGCTAATATCTTTATGATTTAAGATATTACGACGCTCATTTTATCTCGCTTTATGTAAAGTATTACTTATTCTTTTTTAAATTTGAAAAGTAATGTAAACCATATGCAAATacac < 1:60234/141‑1 (MQ=255) aaCAGCGAGATAAATCGCGTGATTGGCTAATATCTTTATGATTTAAGATATTACGACGCTCATTTTATCTCGCTTTATGTAAAGTATTACTTATTCTTTTTTAAATTTGAAAAGTAATGTAAACCATATGCAAATACACTg > 2:168978/1‑141 (MQ=255) aaCAGCGAGATAAATCGCGTGATTGGCTAATATATTTATGATTTAAGATATTACGACGCTCATTTTATCTCGCTTTATGTAAAGTATTACTTATTCTTTTTTAAATTTGAAAAGTAATGTAAACCACATGCCAATACACTg > 1:412865/1‑141 (MQ=255) aCAGCGAGATAAATCGCGTGATTGGCTAATATCTTTATGATTTAAGATATTACGACGCTCATTTTATCTCGCTTTATGTAAAGTATTACTTATTCTTTTTTAAATTTGGAAAGTAATGTAAACCATATGCAAATACACTGt < 1:253662/141‑1 (MQ=255) | TATCACAGTACTTCCCCCATTTACTTTGATCAAATAAAATTTACTTTCTAATTATATTAGTAAATCAATGTAATTGATAGATTAAATTTCAGAAAAATCTTTTTATTCTCTCGAAAATGTAGTTTTCTTTCATAAAAACAGCGAGATAAATCGCGTGATTGGCTAATATCTTTATGATTTAAGATATTACGACGCTCATTTTATCTCGCTTTATGTAAAGTATTACTTATTCTTTTTTAAATTTGAAAAGTAATGTAAACCATATGCAAATACACTGTAA > USA300TCH1516_ALE/2527246‑2527525 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |