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tctcgctTTATGTAAAGTATTACTTATTCTTTTTTAAATTTGAAAAGTAATGTAAACCATATGCAAATACACTGTAACCAATTGCAGTACGTAAAATAAACCTTATAACTTTATTAGGTACACATTTTGACGTTACTGaaa < 2:1048253‑M2/134‑1 (MQ=255) tctcgctTTATGTAAAGTATTACTTATTCTTTTTTAAATTTGAAAAGTAATGTAAACCATATGCAAATACACTGTAACCAATTGCAGTACGTAAAATAAACCTTATAACTTTATTAGGTACACATTTTGACGTTACTGaaa < 4:363982‑M2/134‑1 (MQ=255) ttttttTTATGTAAAGTATTACTTATTCTTTTTTAAATTTGAAAAGTAATGTAAACCATATGCAAATACACTGTAACCCATTGCAGTACGTAAAATAAACCTTATAACTTTATTAGGTACACACTTTGACGTTACTGAAAt > 2:317148‑M2/7‑141 (MQ=255) ttcgctTTATGTAAAGTATTACTTATTCTTTTTTAAATTTGAAAAGTAATGTAAACCATATGCAAATACACTGTAACCAATTGCAGTACGTAAAATAAACCTTATAACTTTATTAGGTACACATTTTGACGTTACTGAAAt < 4:274666‑M2/135‑1 (MQ=255) ctcgctTTATGTAAAGTATTACTTATTCTTTTTTAAATTTGAAAAGTAATGTAAACCATATGCAAATACACTGTAACCAATTGCAGTACGTAAAATAAACCTTATAACTTTCTTAGGTACACATTTCTACGTTACTGAAAt > 4:374077‑M2/7‑141 (MQ=255) cgctTTATGTAAAGTATTACTTATTCTTTTTTAAATTTGAAAAGTAATGTAAACCATATGCAAATACACTGTAACCAATTGCAGTACGTAAAATAAACCTTATAACTTTATTAGGTACACATTTTGACGTTACGGAAATag < 1:860003‑M2/137‑1 (MQ=255) | AATTGATAGATTAAATTTCAGAAAAATCTTTTTATTCTCTCGAAAATGTAGTTTTCTTTCATAAAAACAGCGAGATAAATCGCGTGATTGGCTAATATCTTTATGATTTAAGATATTACGACGCTCATTTTATCTCGCTTTATGTAAAGTATTACTTATTCTTTTTTAAATTTGAAAAGTAATGTAAACCATATGCAAATACACTGTAACCAATTGCAGTACGTAAAATAAACCTTATAACTTTATTAGGTACACATTTTGACGTTACTGAAATAG > USA300TCH1516_ALE/2527317‑2527592 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |