| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2628271 = | 123 (0.990) | 4 (0.030) | 4/242 | NT | 3.5% | intergenic (+141/+70) | sarU/gtaB | HTH‑type transcriptional regulator SarU/UTP‑‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2628335 = | 103 (0.880) | intergenic (+205/+6) | sarU/gtaB | HTH‑type transcriptional regulator SarU/UTP‑‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
TTTAAACAGATTTACCTCTTGATAAAATAAATAAGCAATCATACTACTTCTCAATTTAGTATAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCT > USA300TCH1516_ALE/2628132‑2628410 | catatgacttcgaaggcgaacgttatgacgttggagaaaaattaggcttcgttaaaactaccatagaatatgcattgaaagatgacagtatgcgagaagaattaacacgatttattaaagcattaggtttataacattaaa < 2:25465‑M1/1‑1 (MQ=255) taaaCAGATTTACCTCTTGATAAAATAAATAAGCAATCATACTACTTCTCAATTTAGTATAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGc > 1:915860/1‑141 (MQ=255) taaaCAGATTTACCTCTTGATAAAATAAATAAGCAATCATACTACTTCTCAATTTAGTATAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGc < 1:404642/141‑1 (MQ=255) aaaCAGATTTACCTCTTGATAAAATAAATAAGCAATCATACTACTTCTCAATTTAGTATAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCa < 1:523826/141‑1 (MQ=255) aaaCAGATTTACCTCTTGATAAAATAAATAAGCAATCATACTACTTCTCAATTTAGTATAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATAATCTACTATTTATCACAACACATAAATTAAACa > 4:142151/1‑141 (MQ=255) gacttcgaaggcgaacgttatgacgttggagaaaaattaggcttcgttaaaactaccatagaatatgcattgaaagatgacagtatgcgagaagaattaacacgatttattaaagcattaggtttataacattaaAAGCAt < 2:370755‑M1/6‑1 (MQ=255) aCAGATTTACCTCTTGATAAAATAAATAAGCAATCATACTACTTCTCAATTTAGTATAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATg < 4:93888/141‑1 (MQ=255) aCAGATTTACCTCTTGATAAAATAAATAAGCAATCATACTACTTCTCAATTTAGTATAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATAGATCACAACACATAAATTAAGCATg < 1:1034811/141‑1 (MQ=255) ataTTTACCTTTTGATAAAATAAATAAGCAATCATACTACTTCTCAATTTAGTATAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGac < 4:219247/139‑1 (MQ=255) aTTTACCTCTTGATAAAATAAATAAGCAATCATACTACTTCTCAATTTAGTATAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGacac > 4:20686/1‑141 (MQ=255) tttACCTCTTGATAAAATAAATAAGCAATCATACTACTTCTCAATTTAGTATAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACt < 2:922095/141‑1 (MQ=255) tttACCTCTTGATAAAATAAATAAGCAATCATACTACTTCTCAATTTAGTATAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACt < 2:52420/141‑1 (MQ=255) tttACCTCTTGATAAAATAAATAAGCAATCATACTACTTCTCAATTTAGTATAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACt < 1:642479/141‑1 (MQ=255) tACCTCTTGATAAAATAAATAAGCAATCATACTACTTCTCAATTTAGTATAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCa > 2:978869/1‑141 (MQ=255) tACCTCTTAATAAAATAAATAAGCAATCATACTACTTCTCAATTTAGTATAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCa < 2:9454/141‑1 (MQ=255) tcgttcaaataaaaAAGCCATTATTCTCGTTCTTACTTTAGTAAAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAAt < 4:109730/135‑1 (MQ=255) tGATAAAATAAATAAGCAATCATACTACTTCTCAATTTAGTATAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAAtt < 4:197609/141‑1 (MQ=255) taaaataaaTAAGCAATCATACTACTTCTCAATTTAGTATAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAg > 1:449605/1‑141 (MQ=255) aaaataaaTAAGCAATCATACTACTTCTCAATTTAGTATAAATAAAAATACATAATTAACATTCTTTTGTTTTTTATATTATTTCAATAACCTACTATCTATCACAACCCATAAATTAAGCATGACACGCACACACTTTac > 2:897522/1‑140 (MQ=255) aaataaatAAGCAATCATACTACTTCTCAATTTAGTATAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTCCTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGtt > 4:455828/1‑141 (MQ=255) aaataaatAAGCAATCATACTACTTCTCAATTTAGTATAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGtt < 1:499036/141‑1 (MQ=255) aaataaatAAGCAATCATACTACTTCTCAATTTAGTATAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGtt > 3:58319/1‑141 (MQ=255) aataaataCGCAATCATACTACTTCTCAATTTAGTATAGATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACACCACCTAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTc > 2:657852/1‑141 (MQ=255) aataaataAGCAATCATACTACTTCTCAATTTAGTATAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTc > 1:864876/1‑141 (MQ=255) ataaataaGCAATCATACTACTTCTCAATTTAGTATAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCa > 4:413994/1‑141 (MQ=255) taaataaGCAATCATACTACTTCTCAATTTAGTATAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCAc < 2:283845/141‑1 (MQ=255) aaataaGCAATCATACTACTTCTCAATTTAGTATAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCAcc < 1:38/141‑1 (MQ=255) actaaGCAATCATACTACTTCTCAATTTAGTATCAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTGTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACGTAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCa > 4:376462/3‑141 (MQ=255) ataaGCAATCATACTACTTCTCAATTTAGTATAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACGTAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCAt > 4:406086/1‑141 (MQ=255) ataaGCAATCATACTACTTCTCAATTTAGTATAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCAt < 1:180514/141‑1 (MQ=255) ataaGCAATCATACTACTTCTCAATTTAGTATAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCAt < 4:329049/141‑1 (MQ=255) aGCAATCATACTACTTCTCAATTTAGTATAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTc < 3:103321/141‑1 (MQ=255) aGCAATCATACTACTTCTCAATTTAGTATAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTc > 2:783716/1‑141 (MQ=255) aaTCATACTACTTCTCAATTTAGTATAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCgtg > 2:849529/1‑141 (MQ=255) aTACTACTTCTCAATTTAGTATAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTcc > 4:90998/1‑141 (MQ=255) actactTCTCAATTTAGTATAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCaa < 1:673666/141‑1 (MQ=255) ctactTCTCAATTTAGTATAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAAt < 2:355634/141‑1 (MQ=255) tcAATTTAGTATAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTg < 2:796423/141‑1 (MQ=255) tcAATTTAGTATAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTg < 2:871883/141‑1 (MQ=255) cAATTTAGTATAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGa < 1:237044/141‑1 (MQ=255) aaTTTAGTATAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAg < 4:436711/141‑1 (MQ=255) tAGTATAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATc > 1:911381/1‑141 (MQ=255) atataAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCAt < 4:269343/140‑1 (MQ=255) atataAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCAt < 2:457250/140‑1 (MQ=255) tataAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATg < 1:833396/141‑1 (MQ=255) tataAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATg < 2:180665/141‑1 (MQ=255) accatagaatatgcattgaaagatgacagtatgcgagaagaattaacacgatttattaaagcattaggtttataacattaaAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCAt > 1:968702‑M1/82‑141 (MQ=255) catagaatatgcattgaaagatgacagtatgcgagaagaattaacacgatttattaaagcattaggtttataacattaaAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGc > 1:717757‑M1/80‑141 (MQ=255) aataaaAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCttt < 1:981631/141‑1 (MQ=255) aataaaAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCttt > 1:15893/1‑141 (MQ=255) aaaaTACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAAt < 2:868487/141‑1 (MQ=255) aaaaTACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAAt > 2:646060/1‑141 (MQ=255) aaaTACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATg > 2:854712/1‑141 (MQ=255) aaTACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTATTGAGTATCATGCTTTTAAtat < 3:328369/141‑3 (MQ=255) aTTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAAcc < 2:938537/141‑1 (MQ=255) ttAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCt < 4:367199/141‑1 (MQ=255) aCTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAAt > 2:847292/1‑141 (MQ=255) ctttctttTG‑TTTTTTTTTTTTTTTAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTTCTGTGTATCATGTTTTTAATGTTATAAACCTAAta > 2:308716/1‑140 (MQ=255) tttctttTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGCTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGc > 2:1085133/1‑141 (MQ=255) ttttG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTta < 2:1006795/141‑1 (MQ=255) tG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTtaata < 3:326632/141‑1 (MQ=255) tG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTtaata < 2:600521/141‑1 (MQ=255) tttttATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATaaa < 3:424434/141‑1 (MQ=255) tttttATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATaaa > 3:242502/1‑141 (MQ=255) tttttATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGAAACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCTAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATaaa > 1:795843/1‑141 (MQ=255) tttttATATTATTTAAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCCATTTTATTGAGCATCCTGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGATTTCATaaa > 2:516792/1‑141 (MQ=255) tttATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACGGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCGTTAATaaagc < 2:372165/141‑3 (MQ=255) tataTTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTta < 2:987143/116‑1 (MQ=255) atatTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCgtg > 1:746576/1‑141 (MQ=255) atatTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCgtg > 1:212758/1‑141 (MQ=255) tattatTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCgtgt < 1:255373/141‑1 (MQ=255) tattatTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCgtgt < 4:316515/141‑1 (MQ=255) tattatTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCgtgt < 3:90998/141‑1 (MQ=255) ttattTCAATACCCTACTATATATCACAACACATTAATTAATCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTa < 4:341271/141‑1 (MQ=255) ttattTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTa < 2:1043399/141‑1 (MQ=255) attTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAAt < 2:600762/141‑1 (MQ=255) tttCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAAtt > 3:437901/1‑141 (MQ=255) tCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCCTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAAttct > 1:394381/1‑141 (MQ=255) cAATACCCTACTATATNTCACAACACATANATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAAttctt > 1:684931/1‑141 (MQ=255) aaTACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAAttcttc > 1:289630/1‑141 (MQ=255) aTACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATtcttct < 2:854125/141‑1 (MQ=255) aTACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATacttct > 3:281018/1‑141 (MQ=255) cccTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGc > 2:422211/1‑141 (MQ=255) cccTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGc > 2:72012/1‑141 (MQ=255) ccTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCa > 1:447653/1‑141 (MQ=255) ctaTATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACt < 2:839065/141‑1 (MQ=255) ctaTATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACt < 2:145559/141‑1 (MQ=255) tatataTCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTg < 2:458151/141‑1 (MQ=255) tatatCACTACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTc < 2:603781/141‑1 (MQ=255) tatatCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCAATCAAGTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCGTTTAATGTTATAACCCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCCGCTCGCATCCTGTc < 2:790403/141‑1 (MQ=255) atatCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCa < 1:693672/141‑1 (MQ=255) tatCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCAt > 3:93364/1‑141 (MQ=255) tatCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCAt > 3:325356/1‑141 (MQ=255) cacaACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCtt > 1:840277/1‑141 (MQ=255) acacATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTTTAAACCTAATGCTTTAATAAATCTTTTTAATTCTTCTCGTATACTGTCATTTTTCaa > 2:161465/1‑141 (MQ=255) aTAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCa < 2:287549/141‑1 (MQ=255) tAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCat > 1:1045860/1‑141 (MQ=255) aTTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATAtt > 1:957855/1‑141 (MQ=255) tAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCt < 2:220739/141‑1 (MQ=255) tAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCt < 1:1069370/141‑1 (MQ=255) | TTTAAACAGATTTACCTCTTGATAAAATAAATAAGCAATCATACTACTTCTCAATTTAGTATAAATAAAAATACATAATTAACTTTCTTTTG‑TTTTTATATTATTTCAATACCCTACTATATATCACAACACATAAATTAAGCATGACACTCATTCAATTTAGTTCACCATTTCGTGTTCCAATTTTACTGAGTATCATGCTTTTAATGTTATAAACCTAATGCTTTAATAAATCGTGTTAATTCTTCTCGCATACTGTCATCTTTCAATGCATATTCT > USA300TCH1516_ALE/2628132‑2628410 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |