| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2661788 = | 121 (0.970) | 6 (0.050) | 6/226 | NT | 5.9% | intergenic (‑181/‑140) | ybiV/yydI | Sugar phosphatase YbiV/putative peptide export ATP‑binding protein YydI |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2661832 = | 85 (0.780) | intergenic (‑225/‑96) | ybiV/yydI | Sugar phosphatase YbiV/putative peptide export ATP‑binding protein YydI | |||||
Only 100 of 154 total aligned reads displayed.
TCCATCTCATGACAAGCAATGAAGTTTGTCATACCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCA‑TTTAGACAAAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTAAAAATACAATTAAATATCGGTGTAATAAATCCCTTTATACATAGGAGTTGTA > USA300TCH1516_ALE/2661648‑2661924 | tCCATCTCATGACAAGCAATGAAGTTTGTCATACCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGTACATAAATTTCAGAATATTGTaaaaa > 2:858163/1‑141 (MQ=255)tCCATCTCATGACAAGCAATGAAGTTTGTCATACCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTaaaaa > 2:645926/1‑141 (MQ=255) tttgtttttaacttttaaagaatagttatttagtttcatgtatacaactcctatgtataaagggatttattacaccgatatttaattgtatttttaaaaattctttcacattatgtatagatgttataaattagtATATca < 1:615036‑M1/6‑1 (MQ=255) tttgtttttaacttttaaagaatagttatttagtttcatgtatacaactcctatgtataaagggatttattacaccgatatttaattgtatttttaaaaattctttcacattatgtatagatgttataaattagtATATca < 2:504555‑M1/6‑1 (MQ=255) tttgtttttaacttttaaagaatagttatttagtttcatgtatacaactcctatgtataaagggatttattacaccgatatttaattgtatttttaaaaattctttcacattatgtatagatgttataaattagtATATca < 2:588892‑M1/6‑1 (MQ=255) tatgtttttaacttttaaagaatagtaatatagtttcatgtatacaactcctatgtataaagggatttattacaccgatatttaattgtatttataataattctttcacatgatgaatcgatgttataaattactATATca < 2:952977‑M1/6‑1 (MQ=255) tgtttttaacttttaaagaatagttatttagtttcatgtatacaactcctatgtataaagggatttattacaccgatatttaattgtatttttaaaaattctttcacattatgtatagatgttataaattagtATATcaca < 4:135160‑M1/8‑1 (MQ=255) cATGACAAGCAATGAAGTTTGTCATACCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATAGCTTTAATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATcaca > 2:185842/1‑141 (MQ=255) aTGACAAGCAATGAAGTTTGTCATACCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCacac < 2:545296/141‑1 (MQ=255) tttttaacttttaaagaatagttatttagtttcatgtatacaactcctatgtataaagggatttattacaccgatatttaattgtatttttaaaaattctttcacattatgtatagatgttataaattagtATATCACACt > 3:178128‑M1/132‑141 (MQ=255) tGACAAGCAATTAAGATCGTCATACCACAATAAGCCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTACATATATCCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACt > 4:423378/1‑141 (MQ=255) gACAAGCAATGAAGTTTGTCATACCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACta > 4:355614/1‑141 (MQ=255) tttaacttttaaagaatagttatttcgtttcatgtatacaactcctatgtataaagggatttattacaccgatatttaattgtatttttaaaaattctttcacattatgtatagatgttataaattagtATATCACACtat > 1:945347‑M1/130‑141 (MQ=255) tttaacttttaaagaatagttatttagtttcatgtatacaactcctatgtataaagggatttattacaccgatatttaattgtatttttaaaaattctttcacattatgtatagatgttataaattagtATATCACACtat > 4:100132‑M1/130‑141 (MQ=255) tttaacttttaaagaatagttatttagtttcatgtatacaactcctatgtataaagggatttattacaccgatatttaattgtatttttaaaaattctttcacattatgtatagatgttataaattagtATATCACACtat > 2:507739‑M1/130‑141 (MQ=255) tttaacttttaaagaatagttatttagtttcatgtatacaactcctatgtataaagggatttattacaccgatatttaattgtatttttaaaaattctttcacattatgtatagatgttataaattagtATATCACACtat < 1:653186‑M1/12‑1 (MQ=255) cAAGCAATGAAGTTTGTCATACCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACtata < 2:265228/141‑1 (MQ=255) cAAGCAATGAAGTTTGTCATACCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACtata < 1:447211/141‑1 (MQ=255) aacttttaaagaatagttatttagtttcatgtatacaactcctatgtataaagggatttattacaccgatatttaattgtatttttaaaaattctttcacattatgtatagatgttataaattagtATATCACACTATAtt < 3:366942‑M1/15‑1 (MQ=255) aacttttaaagaatagttatttagtttcatgtatacaactcctatgtataaagggatttattacaccgatatttaattgtatttttaaaaattctttcacattatgtatagatgttataaattagtATATCACACTATAtt < 2:478431‑M1/15‑1 (MQ=255) aacttttaaagaatagttatttagtttcatgtatacaactcctatgtataaagggatttattacaccgatatttaattgtatttttaaaaattctttcacattatgtatagatgttataaattagtATATAACACTATAtt < 2:293878‑M1/15‑1 (MQ=255) aacttttaaagaatagttatttagtttcatgtatacaactcctatgtataaagggatttattacacagatatttaattgtatttttaaaaattctttcacattatgtatagatgttataaattagtATATCACAATATAtt < 2:902037‑M1/15‑1 (MQ=255) aGCAATGAAGTTTGTCATACCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTCAACATATCACACTATAtt < 2:496076/141‑1 (MQ=255) gCAATGAAGTTTGTCATACCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATAttt > 1:151586/1‑141 (MQ=255) aaGTTTGTCATACCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCA‑tt < 1:355844/141‑1 (MQ=255) tttGTCATACCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCA‑TTTAg > 1:1026862/1‑141 (MQ=255) ttGTCATACCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCA‑TTTAGa > 3:220382/1‑141 (MQ=255) ttGTCATACCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCA‑TTTAGa > 1:502504/1‑141 (MQ=255) cATACCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCA‑TTTAGACaaa < 3:352429/141‑1 (MQ=255) tccccACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCA‑TTTAGACaaaa < 1:163686/138‑1 (MQ=255) aTACCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCA‑TTTAGACaaaa > 1:94907/1‑141 (MQ=255) aCCACATTGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCA‑TTTAGACAAAata < 2:404083/141‑1 (MQ=255) agtttcatgtatacaactcctatgtataaagggatttattacaccgatatttaattgtatttttaaaaattctttcacattatgtatagatgttataaattagtATATCACACTATATTTATCA‑TTTAGACAAAATATAgt > 1:687767‑M1/105‑141 (MQ=255) tGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCA‑TTTAGACAAAATATAGtgtg > 2:936789/1‑141 (MQ=255) gAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCA‑TTTAGACAAAATATAGTGTGa > 2:206690/1‑141 (MQ=255) aaCCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCA‑TTTAGACAAAATATAGTGTGat > 3:455195/1‑141 (MQ=255) aCCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTTTAAAAATATCACACTATATTTATCA‑TTTAGATAAAATATAGTGTGata > 1:289215/1‑141 (MQ=255) 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aTTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCA‑TTTAGACAAAATATAGTGTGATATACTAATTtata < 1:942137/141‑1 (MQ=255) aTTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCA‑TTTAGACAAAATATAGTGTGATATACTAATTtata > 3:69128/1‑141 (MQ=255) tttGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAAAATATTGTAAAAATAGCACACTATATTTATCA‑TTTAGACAAAATATAGTGTGATATACTAATTTATAAc > 3:42228/1‑141 (MQ=255) aaaTTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCA‑TTTAGACAAAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCt > 1:464786/1‑141 (MQ=255) aaTTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCA‑TTTAGACAAAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCta > 2:293657/1‑141 (MQ=255) aTTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCA‑TTTAGACAAAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCtat < 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3:77834/1‑141 (MQ=255) cATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCA‑TTTAGACAAAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTAAAAATACAATTAAATATCGGTGTAATAAATca > 2:771358/1‑140 (MQ=255) aaTTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCA‑TTTAGACAAAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTAAAAATACAATTAAATATCGGTGTGATAAATCCCttt > 3:267797/1‑141 (MQ=255) aaTTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCA‑TTTAGACAAAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTAAAAATACAATTAAATATCGGTGTAATAAATCCCttt > 4:31354/1‑141 (MQ=255) atagatgttataaattattATATCACACTATATTTATCA‑TTTAGACAAAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATCTTTAAAAATACAATTAAATATCGGTGTAATAAATCCCTTta > 1:14781‑M1/20‑141 (MQ=255) atagatgttataaattagtATATCACACTATATTTTGTC‑TAAATGATAAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTAAAAATACAATTAAATATCGGTGTAATAAATCCCTTta > 2:14781‑M1/20‑141 (MQ=255) 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2:1026862/141‑1 (MQ=255) tAAAAATATAACGATATATTTATCA‑TTTGGACAAAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAAAATTTTT‑AAAATACAATTAAATATCGGTGTAATAAATCCCTTTATACATAGGAGTTGta < 2:461078/141‑1 (MQ=255) aaaaaTATCACACTATATTTATCA‑TTTAGACAAAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTAAAAATACAATTAAATATCGGTGTAATAAATCCCTTTATACATAGGAGTTGta > 1:1069746/1‑141 (MQ=255) | TCCATCTCATGACAAGCAATGAAGTTTGTCATACCACAATGAACCTATATTCACATTTTGAAATTGCTTTCATATATGCAAAACACATTACACTGGATATAGCATTCAGAGGCGAACATAAATTTCAGAATATTGTAAAAATATCACACTATATTTATCA‑TTTAGACAAAATATAGTGTGATATACTAATTTATAACATCTATACATAATGTGAAAGAATTTTTAAAAATACAATTAAATATCGGTGTAATAAATCCCTTTATACATAGGAGTTGTA > USA300TCH1516_ALE/2661648‑2661924 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |