| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2525575 = | 131 (1.050) | 3 (0.030) | 3/228 | NT | 2.8% | intergenic (‑147/+83) | sirB/ytmI | Sirohydrochlorin ferrochelatase/putative N‑acetyltransferase YtmI |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2525640 = | 95 (0.860) | intergenic (‑212/+18) | sirB/ytmI | Sirohydrochlorin ferrochelatase/putative N‑acetyltransferase YtmI | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
TAAAATCAGGGAATTCCCTGATGCCTGTAGTCATGCATATTCCTTATACATTTTCCCTTTTTGTTAAATCAAAAAAAGCGACCGATATATGAATCCCTACTCAACATTTATTTGAGCAAGCATTAATATATCGGTCGCTTGTAGTGTATATTATTATCTTAAAATGGTGGTTGGCCTAATATTGTTTCGTCAAAGCGCTCGGGTATCAATACTTTGCGCATGATCACACCTAAATCGCCATCATCATTTTCATGTTCGCTGTATATTTCATAACCTCTTTT > USA300TCH1516_ALE/2525500‑2525780 | tAAAAGCAGGGAATTCCCTGATGCCTGTAGTCATGCATATTCCTTATACATTTTCCCTTTTTGTTAAATCAAAAAAAGCGACCGATATATGAATCCCTACTCAACATTTATTTGAGCAAGCATTAATATATCGGTCGCTTg < 3:180209/141‑1 (MQ=255) aaaaTCAGGGAATTCCCTGATGCATGTAGTCATGCATATTCCTTATACATTTTCCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAGCGACCGATATATGAATCCCTACTCAACATTTATTTGAGCAAGCATTAATATATCGGTCGCTTGt < 2:233055/141‑1 (MQ=255) aaaTCAGGGAATTCCCTGATGCCTGTAGTCATGCATATTCCTTATACATTTTCCCTTTTTGTTAAATCAAAAAAAGCGACCGATATATGAATCCCTACTCAACATTTATTTGAGCAAGCATTAATATATCGGTCGCTTGTa < 1:67455/141‑1 (MQ=255) aaaTCAGGGAATTCCCTGATGCCTGTAGTCATGCATATTCCTTATACATTTTCCCTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAGCGACCGATATATGAATCCCTACTCAACATTTATTTGAGCAAGCATTAATATATCGGTCGCTTGTa < 2:684510/141‑1 (MQ=255) aaTCAGGGAATTCCCTGATGCCTGTAGTCATGCATATTCCTTATACATTTTCCCTTTTTGTTAAATCAAAAAAAGCGACCGATATATGAATCCCTACTCAACATTTATTTGAGCAAGCATTAATATATCGGTCGCTTGTAg < 1:784228/141‑1 (MQ=255) aaTCAGGGAATTCCCTGATGCCTGTAGTCATGCATATTCCTTATACATTTTCCCTTTTTGTTAAATCAAAAAAAGCGACCGATATATGAATCCCTACTCAACATTTATTTGAGCAAGCATTAATATATCGGTCGCTTGTAg < 1:149880/141‑1 (MQ=255) tCAGGGAATTCCCTGATGCCTGTAGTCATGCATATTCCTTATACATCTTCCCTTTTTGTTAAATCAAAAAAAGCGACCGATATATGAATCCCTACTCAACATTTATTTGAGCAAGCATTAATATATCGGTCGCTTGTAgtg > 3:377972/1‑141 (MQ=255) aGGGAATTCCCTGATGCCTGTAGTCATGCATATTCCTTATACATTTTCCCTTTTTGTTAAATCAAAAAAAGCGACCGATATATGAATCCCTACTCAACATTTATTTGAGCAAGCATTAATATATCGGTCGCTTGTAGTGta < 3:142536/141‑1 (MQ=255) aGGGAATTCCCTGATGCCTGTAGTCATGCATATTCCTTATACATTTTCCCTTTTTGTTAAATCAAAAAAAGCGACCGATATATGAATCCCTACTCAACATTTATTTGAGCAAGCATTAATATATCGGTCGCTTGTAGTGta < 2:580697/141‑1 (MQ=255) gggAATTCCCTGATGCCTGTAGTCATGCATATTCCTTATACATTTTCCCTTTTTGTTAAATCAAAAAAAGCGACCGATATATGAATCCCTACTCAACATTTATTTGAGCAAGCATTAATATATCGGTCGCTTGTAGTGtat < 4:215775/141‑1 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3:13873/1‑141 (MQ=255) aaTATATCGGTCGCTTGTAGTGTATATTATTATCTTAAAATGGTGGTTGGCCTAATATTGTTTCGTCAAAGCGCTCGGGTATCAATACTTTGCGCATGATCACACCTAAATCGCCATCATCATTTTCATGTTCGCTGtata < 4:299301/141‑1 (MQ=255) aaTATATCGGTCGCTTGTAGTGTATATTATTATCTTAAAATGGTGGTTGGCCTAATATTGTTTCGTCAAAGCGCTCGGGTATCAATACTTTGCGCATGATCACACCTAAATCGCCATCATCATTTTCATGTTCGCTGtata > 2:336463/1‑141 (MQ=255) atatatcggtcgcttGTAGTGTATATTATTATCTTAAAATGGTGGTTGGCCTAATATTGTTTCGTCAAAGCGCTCGGGTATCAATACTTTGCGCATGATCACACCTAAATCGCCATCATCATTTTCATGTTCGCTGTatat > 1:774780‑M2/16‑141 (MQ=255) atatatcggtcgcttGTAGTGTATATTATTATCTTAAAATGGTGGTTGGCCTAATATTGTTTCGTCAAAGCGCTCGGGTATCAATACTTTGCGCATGATCACACCTAAATCGCCATCATCATTTTCATGTTCGCTGTatat > 2:449450‑M2/16‑141 (MQ=255) atatatcggtcgcttGTAGGGTATATTATTATCTTAAAATGGTGGTTGGCCTAATATTGTTTCGTCAAAGCGCTCGGGTATCAATACTTTGCGCATGATCACACCTAAATCGCCATCATCATTTTCATGTTCGCTGTatat > 2:449430‑M2/16‑141 (MQ=255) 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TAAAATCAGGGAATTCCCTGATGCCTGTAGTCATGCATATTCCTTATACATTTTCCCTTTTTGTTAAATCAAAAAAAGCGACCGATATATGAATCCCTACTCAACATTTATTTGAGCAAGCATTAATATATCGGTCGCTTGTAGTGTATATTATTATCTTAAAATGGTGGTTGGCCTAATATTGTTTCGTCAAAGCGCTCGGGTATCAATACTTTGCGCATGATCACACCTAAATCGCCATCATCATTTTCATGTTCGCTGTATATTTCATAACCTCTTTT > USA300TCH1516_ALE/2525500‑2525780 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |