| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2053744 = | 108 (1.100) | 16 (0.170) | 9/150 | NT | 14.7% | coding (1116/1296 nt) | purB | Adenylosuccinate lyase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2053767 = | 85 (0.920) | coding (1093/1296 nt) | purB | Adenylosuccinate lyase | |||||
GCGTAATAACATAGATAAAACATTTGGTCTGATTTTCTCACAACGTGTCTTATTAGCATTAATTAATAAAGGTATGGTTCGTGAAGAAGCATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < USA300TCH1516_ALE/2053837‑2053744‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑catacCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCAAATGTTTTATCTATGTTATTACGCATATTATCTTCAAATACAG > USA300TCH1516_ALE/2053767‑2053856 GCGTAATAACATAGATAAAACATTTGGTCTGATTTTCTCACAACGTGTCTTATTAGCATTAATTAATAAAGGTATGGTTCGTGAAGAAGCA < 1:4010881/91‑1GCGTAATAACATAGATAAAACATTTGGTCTGATTTTCTCACAACGTGTCTTATTAGCATTAATTAATAAAGGTATGGTTCGTGAAGAAGCA < 1:1474350/91‑1 CGTAATAACATAGATAAAACATTTGGTCTGATTTTCTCACAACGTGTCTTATTAGCATTAATTAATAAAGGTATGGTTCGTGAAGAAGCAT > 1:2010740/1‑91 CGTAATAACATAGATAAAACATTTGGTCTGATTTTCTCACAACGTGTCTTATTAGCATTAATTAATAAAGGTATGGTTCGTGAAGAAGCAT < 1:4096866/91‑1 GTAATAACATAGATAAAACATTTGGTCTGATTTTCTCACAACGTGTCTTATTAGCATTAATTAATAAAGGTATGGTTCGTGAAGAAGCATA < 1:777758/91‑1 ATAACATAGATAAAACATTTGGTCTGATTTTCTCACAACGTGTCTTATTAGCATTAATTAATAAAGGTATGCTTCTTCACGAACCATACCT < 1:2694447/91‑1 ACATAGATAAAACATTTGGTCTGATTTTCTCACAACGTGTCTTATTAGCATTAATTAATAAAGGTATGGTTCGTGAAGAAGCATACCTTTA > 1:1597112/1‑91 ACATAGATAAAACATTTGGTCTGATTTTCTCACAACGTGTCTTATTAGCATTAATTAATAAAGGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTTTA < 1:523412/91‑1 ACATAGATAAAACATTTGGTCTGATTTTCTCACAACGTGTCTTATTAGCATTAATTAATAAAGGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTTTA < 1:393133/91‑1 TCACAACGTGTCTTATTAGCATTAATTAATAAAGGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGA < 1:37579/91‑1 CTTATTAGCATTAATTAATAAAGGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGAC > 1:3769229/1‑91 CTTATTAGCATTAATTAATAAAGGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGAC > 1:3768966/1‑91 TATGGTTCGTGAAGAAGCATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCAAATGTTTTATCTATGTTATTAC > 1:3004786/1‑91 TTCGTGAAGAAGCATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCAAATGTTTTATCTATGTTATTACGCATA > 1:1910597/1‑91 TCGTGAAGAAGCATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCAAATGTTTTATCTATGTTATTGCGCATAT > 1:2075334/1‑91 TCGTGAAGAAGCATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCAAATGTTTTATCTATGTTATTACGCATAT > 1:4041235/1‑91 TCGTGAAGAAGCATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCAAATGTTTTATCTATGTTATTACGCATAT > 1:922400/1‑91 TCGTGAAGAAGCATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCAAATGTTTTATCTATGTTATTACGCATAT > 1:2760971/1‑91 CGTGAAGAAGCATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCAAATGTTTTATCTATGTTATTACGCATATT > 1:1679189/1‑91 CGTGAAGAAGCATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCAAATGTTTTATCTATGTTATTACGCATATT > 1:671917/1‑91 CGTGAAGAAGCATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCAAATGTTTTATCTATGTTATTACGCATATT > 1:671959/1‑91 CGTGAAGAAGCATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCAAATGTTTTATCTATGTTATTACGCATATT > 1:672004/1‑91 GAAGAAGCATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCAAATGTTTTATCTATGTTATTACGCATATTATC > 1:424537/1‑91 GAAGAAGCATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCAAATGTTTTATCTATGTTATTACGCATATTATC > 1:559880/1‑91 GAAGAAGCATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCAAATGTTTTATCTATGTTATTACGCATATTATC > 1:1021656/1‑91 aacgATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCAAATGTTTTATCTATGTTATTACGCATATTATCTTCA < 1:3342215/87‑1 CATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCAAATGTTTTATCTATGTTATTACGCATATTATCTTCAAAT < 1:1376889/91‑1 TACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCAAATGTTTTATCTATGTTATTACGCATATTATCTTCAAATAC < 1:2099799/91‑1 ACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCAAATGTTTTATCTATGTTATTACGCATATTATCTTCAAATACA > 1:379757/1‑91 ACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCAAATGTTTTATCTATGTTATTACGCATATTATCTTCAAATACA > 1:1789921/1‑91 ACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAAACAGACCAAATGTTTTATCTATGTTATTACGCATATTATCTTCAAATACA > 1:3595376/1‑91 CCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCAAATGTTTTATCTATGTTATTACGCATATTATCTTCAAATACAG < 1:1508/91‑1 GCGTAATAACATAGATAAAACATTTGGTCTGATTTTCTCACAACGTGTCTTATTAGCATTAATTAATAAAGGTATGGTTCGTGAAGAAGCATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < USA300TCH1516_ALE/2053837‑2053744‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑catacCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCAAATGTTTTATCTATGTTATTACGCATATTATCTTCAAATACAG > USA300TCH1516_ALE/2053767‑2053856 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |