| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2053744 = | 108 (1.100) | 16 (0.170) | 9/150 | NT | 14.7% | coding (1116/1296 nt) | purB | Adenylosuccinate lyase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2053767 = | 85 (0.920) | coding (1093/1296 nt) | purB | Adenylosuccinate lyase | |||||
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
AACACTTGTAATAGACTCATCTTGTTCGATTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCAAATGTTTTATCTATGTTATT > USA300TCH1516_ALE/2053654‑2053833 | aaCACTTGTAATAGACTCATCTTGTTCGATTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCg > 1:1490560/1‑91 (MQ=255) tgtatttgaagataatatgcgtaataacatagataaaacatttggtctgtttttctcacaacgtgtcttattagcattaattaataaagGt > 1:3595376‑M1/90‑91 (MQ=255) gtatttgaagataatatgcgtaataacatagataaaacatttggtctgattttctcacaacgtgtcttattagcattaattaataaagGTa < 1:2099799‑M1/3‑1 (MQ=255) cacTTGTAATAGACTCATCTTGTTCGATTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTa < 1:67451/91‑1 (MQ=255) acTTGTAATAGACTCATCTTGTTCGATTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTAt < 1:147702/91‑1 (MQ=255) acTTGTAATAGACTCATCTTGTTCGATTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTAt < 1:147701/91‑1 (MQ=255) cTTGTAATAGACTCATCTTGTTCGATTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATg > 1:238691/1‑91 (MQ=255) cTTGTAATAGACTCATCTTGTTCGATTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATg < 1:1968206/91‑1 (MQ=255) tgaagataatatgcgtaataacatagataaaacatttggtctgattttctcacaacgtgtcttattagcattaattaataaaggtatcgtt < 1:3342215‑M1/8‑5 (MQ=255) gTAATAGACTCATCTTGTTCGATTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATGATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGctt > 1:499883/1‑91 (MQ=255) tAATAGACTCATCTTGTTCGATTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGcttc < 1:1009129/91‑1 (MQ=255) tAATAGACTCATCTTGTTCGATTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGcttc > 1:1493685/1‑91 (MQ=255) tAATAGACTCATCTTGTTCGATTAATTCACGGAACAGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGcttc > 1:1388877/1‑91 (MQ=255) gataatatgcgtaataacatagataaaacatttggtctgattttctcacaacgtgtcttattagcattaattaataaagGTATGCttcttc > 1:424537‑M1/80‑91 (MQ=255) aGACTCATCTTGTTCGATTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCa > 1:3418183/1‑91 (MQ=255) aGACTCATCTTGTTCGATTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCa < 1:634917/91‑1 (MQ=255) gACTCATCTTGTTCGATTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTATTTTGTCGTATGCTTCTTCAc > 1:3089867/1‑91 (MQ=255) gACTCATCTTGTTCGATTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTATTTTGTCGTATGCTTCTTCAc > 1:668532/1‑91 (MQ=255) gACTCATCTTGTTCGATCAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCAc < 1:3559368/91‑1 (MQ=255) aatatgcgtaataacatagataaaacatttggtctgattttctcacaacgtgtcttattagcattaattaataaagGTATGCTTCTTCACg > 1:672004‑M1/77‑91 (MQ=255) aatatgcgtaataacatagataaaacatttggtctgattttctcacaacgtgtcttattagcattaattaataaagGTATGCTTCTTCACg > 1:1679189‑M1/77‑91 (MQ=255) aatatgcgtaataacatagataaaacatttggtctgattttctcacaacgtgtcttattagcattaattaataaagGTATGCTTCTTCACg > 1:671917‑M1/77‑91 (MQ=255) aCTCATCTTGTTCGATTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCGAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACg > 1:1928742/1‑91 (MQ=255) aCTCATCTTGTTCGATTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACg > 1:2116189/1‑91 (MQ=255) cTCATCTTGTTCGATTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGa < 1:1255874/91‑1 (MQ=255) atatgcgtaataacatagataaaacatttggtctgattttctcacaacgtgtcttattagcattaattaataaagGTATGCTTCTTCACGa > 1:2760971‑M1/76‑91 (MQ=255) atatgcgtaataacatagataaaacatttggtctgattttctcacaacgtgtcttattagcattaattaataaagGTATGCTTCTTCACGa > 1:922400‑M1/76‑91 (MQ=255) atatgcgtaataacatagataaaacatttggtctgattttctcacaacgtgtcttattagcattaattaataaagGTATGCTTCTTCACGa > 1:4041235‑M1/76‑91 (MQ=255) aTCTTGTTCGATTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAAcc > 1:3549662/1‑91 (MQ=255) aTCTTGTTCGATTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAAcc < 1:3047408/91‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |