New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | USA300TCH1516_ALE | 2053744 = | 108 (1.100) | 16 (0.170) | 9/150 | NT | 14.7% | coding (1116/1296 nt) | purB | Adenylosuccinate lyase |
? | USA300TCH1516_ALE | 2053767 = | 85 (0.920) | coding (1093/1296 nt) | purB | Adenylosuccinate lyase |
Only 100 of 149 total aligned reads displayed.
GTTCGATTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCAAATGTTTTATCTATGTTATTACGCATATTATCTTCAAATACAGT > USA300TCH1516_ALE/2053677‑2053857 | gTTCGATTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATAcc < 1:3498061/91‑1 (MQ=255) gTTCGATTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATAcc < 1:121805/91‑1 (MQ=255) gATTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTtta > 1:2484085/1‑91 (MQ=255) gATTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTtta < 1:535269/91‑1 (MQ=255) gATTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTtta > 1:614422/1‑91 (MQ=255) acatagataaaacatttggtctgattttctcacaacgtgtcttattagcattaattaataaaggtatgcttcttcacgaaccatacCTtta < 1:523412‑M2/5‑1 (MQ=255) acatagataaaacatttggtctgattttctcacaacgtgtcttattagcattaattaataaaggtatgcttcttcacgaaccatacCTtta < 1:393133‑M2/5‑1 (MQ=255) aTTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTttat < 1:2995532/91‑1 (MQ=255) aTTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTttat < 1:223509/91‑1 (MQ=255) aTTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTTTattaat < 1:3570522/91‑1 (MQ=255) tCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTTTattaatta < 1:2785034/91‑1 (MQ=255) cACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTTTAttaattaa < 1:3724139/91‑1 (MQ=255) cACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTTTAttaattaa > 1:1953987/1‑91 (MQ=255) cACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTTTAttaattaa > 1:1953533/1‑91 (MQ=255) cACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTTTAttaattaa < 1:1790835/91‑1 (MQ=255) cGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTTTATTAATTAATg > 1:1395780/1‑91 (MQ=255) aCGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTTTATTAATTAATGCtaa < 1:1899827/91‑1 (MQ=255) cGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTTTATTAATTAATGCtaat > 1:3615721/1‑91 (MQ=255) cGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTTTATTAATTAATGCtaat > 1:1073129/1‑91 (MQ=255) ggTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTTTATTAATTAATGCtaata > 1:1016135/1‑91 (MQ=255) gtgtTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTTTATTAATTAATGCtaataa > 1:2649843/1‑91 (MQ=255) gtgtTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTTTATTAATTAATGCtaataa > 1:2198153/1‑91 (MQ=255) 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atcGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGAc > 1:3119575/1‑91 (MQ=255) atcGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGAc > 1:2536889/1‑91 (MQ=255) cGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCa < 1:1512794/91‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCaa < 1:1962273/91‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCaa > 1:303429/1‑91 (MQ=255) cTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCaaa < 1:1897008/91‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCAAATg < 1:4026827/91‑1 (MQ=255) tttGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCAAATg > 1:2369632/1‑91 (MQ=255) 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acCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCAAATGTTTTATCTATGTTATTACGCATATTATCTTCAAATACa > 1:1789921‑M2/3‑91 (MQ=255) acCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAAACAGACCAAATGTTTTATCTATGTTATTACGCATATTATCTTCAAATACa > 1:3595376‑M2/3‑91 (MQ=255) cCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCAAATGTTTTATCTATGTTATTACGCATATTATCTTCAAATACAg < 1:1508‑M2/90‑1 (MQ=255) cTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCAAATGTTTTATCTATGTTATTACGCATATTATCTTCAAATACAGt > 1:512412/1‑91 (MQ=255) cTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCAAATGTTTTATCTATGTTATTACGCATATTATCTTCAAATACAGt < 1:3256970/91‑1 (MQ=255) cTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCAAATGTTTTATCTATGTTATTACGCATATTATCTTCAAATACAGt > 1:2062875/1‑91 (MQ=255) | GTTCGATTAATTCACGGAACGGTGTTTTCGTTTCCCAAGATATCATCGCTTTTGGTTGTACTTTGTCGTATGCTTCTTCACGAACCATACCTTTATTAATTAATGCTAATAAGACACGTTGTGAGAAAATCAGACCAAATGTTTTATCTATGTTATTACGCATATTATCTTCAAATACAGT > USA300TCH1516_ALE/2053677‑2053857 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |