| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
TTTTTGTTGGGTTTTTGAACACATAATTCTATGTAATACTTACTTATTTAGACAAAAAACAAGAGTGTACAGAAAATGGTTATTTTCTGGACACTCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP000731/11189‑11093‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑acactctTGTTTTTTGTCTAAATAAGTAAGTATTACATAGAATTATGTGTTCAAAAACCCAACAAAAAATCTATGTTCACAAAAGACCTCGTAATCA > CP000731/11129‑11218 TTTTTGTTGGGTTTTTGAACACATAATTCTATGTAATACTTACTTATTTAGACAAAAAACAAGAGTGTACAGAAAATGGTTATTTTCTGGA < 1:2405076/91‑1TTTTTGTTGGGTTTTTGAACACATAATTCTATGTAATACTTACTTATTTAGACAAAAAACAAGAGTGTACAGAAAATGGTTATTTTCTGGA > 1:2336324/1‑91TTTTTGTTGGGTTTTTGAACACATAATTCTATGTAATACTTACTTATTTAGACAAAAAACAAGAGTGTACAGAAAATGGTTATTTTCTGGA > 1:531775/1‑91TTTTTGTTGGGTTTTTGAACACATAATTCTATGTAATACTTACTTATTTAGACAAAAAACAAGAGTGTACAGAAAATGGTTATTTTCTGGA > 1:2367144/1‑91 TTTTGTTGGGTTTTTGAACACATAATTCTATGTAATACTTACTTATTTAGACAAAAAACAAGAGTGTACAGAAAATGGTTATTTTCTGGAC < 1:3538219/91‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |