| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000731 | = 21325 | 275 (0.780) | 14 (0.050) | 8/138 | NT | 5.1% | intergenic (‑255/‑219) | USA300HOU_pUSA300HOUMR0027/USA300HOU_pUSA300HOUMR0028 | IS431mec transposase/macrolide transporter |
| ? | CP000731 | = 21339 | 279 (0.920) | intergenic (‑269/‑205) | USA300HOU_pUSA300HOUMR0027/USA300HOU_pUSA300HOUMR0028 | IS431mec transposase/macrolide transporter | |||||
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
TGTAAAAAAACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTTTGAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP000731/21225‑21325‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cctttttgaatTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAGTAATGTTAAT < CP000731/21339‑21250 TGTAAAAAAACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAAC > 1:1615512/1‑91TGTAAAAAAACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAAC > 1:1615129/1‑91TGTAAAAAAACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAAC < 1:3627054/91‑1TGTAAAAAAACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAAC < 1:647495/91‑1 GTAAAAAAACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACC > 1:2468269/1‑91 GTAAAAAAACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACC < 1:2174046/91‑1 GTAAAAAAACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACC > 1:3844456/1‑91 GTAAAAAAACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACC < 1:1238266/91‑1 GTAAAAAAACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACC < 1:1238141/91‑1 GTAAAAAAACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACC > 1:2345794/1‑91 GTAAAAAAACCAACAAAATGTTATACTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACC < 1:3855663/91‑1 TAAAAAAACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCT < 1:1333881/91‑1 AAAAAAACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTT > 1:1885701/1‑91 AAAAAAACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTT > 1:2779493/1‑91 AAAAAAACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTT > 1:2820754/1‑91 AAAAAAACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTT > 1:1122975/1‑91 AAAAAACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACGTTT > 1:3733972/1‑91 AAAAAACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTT < 1:1471484/91‑1 AAAAACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTT < 1:2811496/91‑1 AAAAACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTT < 1:1692299/91‑1 AAAAACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTT < 1:2885847/91‑1 AAAAACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTT < 1:2885968/91‑1 AAAACCAACAATATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTTT < 1:3760809/91‑1 AAAACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTTT < 1:2993044/91‑1 AAAACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTTT > 1:713201/1‑91 AAACCAACAAAGTGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTTTG < 1:3761194/91‑1 AAACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTTTG < 1:1877908/91‑1 AAACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTTTG > 1:3494873/1‑91 AAACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTTTG < 1:2646388/91‑1 AAACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTTTG < 1:2649979/91‑1 AAACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTTTG < 1:1973648/91‑1 AAACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATAGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTTTG > 1:3495633/1‑91 AACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTTTGA > 1:374861/1‑91 AACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTTTGA > 1:2105678/1‑91 AACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTTTGA < 1:2127955/91‑1 AACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTTTGA > 1:1710460/1‑91 AACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTTTGA > 1:3163450/1‑91 AACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTTTGA < 1:1178630/91‑1 AACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTTTGA > 1:1796159/1‑91 ACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTTTGAA < 1:1592700/91‑1 ACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTTTGAA > 1:2198356/1‑91 ACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTTTGAA > 1:1230154/1‑91 ACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTTTGAA > 1:2702179/1‑91 ACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTTTGAA > 1:3045786/1‑91 ACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAAACTTTTTGAA > 1:4044394/1‑91 CCAACAAAATGTTATATTCACATTACTATTTTATCGCTGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACGCAACTAAACCTTTTTGAAT > 1:985286/1‑91 CCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCGAATAAACCTTTTTGAAT > 1:3547354/1‑91 CCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTTTGAAT < 1:2399270/91‑1 CCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTTTGAAT < 1:2399100/91‑1 CCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTTTGAAT > 1:40153/1‑91 TGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTTTGAATTAATTTAGT < 1:3941805/91‑1 TGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTTTGAATTAATTTAGT < 1:2991789/91‑1 TAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAGCCTTTTTGAATTAATTTAGTTTTGTATT < 1:1008056/91‑1 TAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAGCCTTTTTGAATTAATTTAGTTTTGTATT < 1:730144/91‑1 ATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTTTGAATTAATTTAGTTTTGTATTCAAA < 1:2728277/91‑1 TTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTTTGAATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAA < 1:3129872/91‑1 TACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTTTGAATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAA < 1:2550561/91‑1 TACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTTTGAATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAA < 1:2550487/91‑1 ACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTTTGAATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAG < 1:1862810/91‑1 ACTATTTGATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTTTGAATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAG < 1:1862809/91‑1 TTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAGCCTTTTTGAATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTT < 1:3692713/91‑1 AAACCTTTTTGAATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAA < 1:2672901/91‑1 CCTTTTTGAATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAG < 1:2438290/91‑1 CCTTTTTGAATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAG < 1:2438989/91‑1 CTTTTTGTATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAGT < 1:2070622/91‑1 CTTTTTGAATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAGT < 1:1438137/91‑1 CTTTTTGAATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAGT < 1:623475/91‑1 CTTTTTGAATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAGT > 1:1274454/1‑91 CTTTTTGAATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAGT > 1:1274252/1‑91 CTTTTTGAATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAGT < 1:1707151/91‑1 CTTTTTGAATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAGT > 1:3887712/1‑91 CTTTTTGAATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAGT > 1:2662790/1‑91 CTTTTTGAATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAGT < 1:1437535/91‑1 CTTTTTGAATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAGT > 1:3011559/1‑91 TTTTTGAATCAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAGTA > 1:2093370/1‑91 TTTTGAATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAGTAA > 1:3660488/1‑91 TTTGAATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAGTAAT < 1:2793071/91‑1 TTGAATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAGTAATG < 1:591333/91‑1 TTGAATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAGTAATG < 1:1024415/91‑1 TGAATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAGTAATGT < 1:3739146/91‑1 TGAATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAGTAATGT > 1:1708119/1‑91 TGAATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAGTAATGT < 1:353530/91‑1 AATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAGTAATGTTA > 1:2246096/1‑91 AATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAGTAATGTTA > 1:2948032/1‑91 AATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAGTAATGTTA > 1:3814608/1‑91 AATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAGTAATGTTA > 1:1280287/1‑91 AATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAGTAATGTTA > 1:815676/1‑91 AATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAGTAATGTTA > 1:815696/1‑91 ATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAGTAATGTTAA > 1:1912567/1‑91 ATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAGTAATGTTAA > 1:1492942/1‑91 ATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAGTAATGTTAA > 1:2331381/1‑91 ATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAGTAATGTTAA > 1:2436638/1‑91 ATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAGTAATGTTAA > 1:3626712/1‑91 ATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAGTAATGTTAA > 1:256391/1‑91 ATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAGTAATGTTAA > 1:2703813/1‑91 ATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAGTAATGTTAA > 1:3003953/1‑91 ATTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAGTAATGATAA > 1:3730232/1‑91 TTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAGTAATGTTAAT > 1:3899575/1‑91 TTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAGTAATGTTAAT > 1:3899544/1‑91 TTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAGTAATGTTAAT > 1:3834166/1‑91 TGTAAAAAAACCAACAAAATGTTATATTAACATTACTATTTTATCGATGAAGGAGGATTAAAATGACAGCTTCTATGAGACTCAAATAAACCTTTTTGAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP000731/21225‑21325‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cctttttgaatTAATTTAGTTTTGTATTCAAAAAGGTTTATTTGAGTCTCATAGAAGCTGTCATTTTAATCCTCCTTCATCGATAAAATAGTAATGTTAAT < CP000731/21339‑21250 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |