| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1149421 = | 83 (0.840) | 6 (0.070) | 5/138 | NT | 7.6% | intergenic (+7/+164) | pheT_1/rnhC | Phenylalanine‑‑tRNA ligase beta subunit/Ribonuclease HIII |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1149475 = | 74 (0.870) | intergenic (+61/+110) | pheT_1/rnhC | Phenylalanine‑‑tRNA ligase beta subunit/Ribonuclease HIII | |||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
AACATTGACAGATGAGCGCGTTTCAAAAGTACAAGCGGAAATTGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTT > USA300TCH1516_ALE/1149333‑1149510 | atgcagttgtgcgaagcatcatctgtattccgctgttcctctttgactttttaaatgcattggaaccaaattggtgaacccaaaaataaaa > 1:3831250‑M1/89‑91 (MQ=255)atgcagttgtgcgaagcatcatctgtattccgctgttcctctttgactttttaaatgcattggaaccaaattggtgaacccaaaaataaaa > 1:1805870‑M1/89‑91 (MQ=255) tgcagttgtgcgaagcatcatctgtattccgctgttcctctttgactttttaaatgcattggaaccaaattggtgaacccaaaaataAAAc > 1:546004‑M1/88‑91 (MQ=255) aCATTGACAGATGAGCGCGTTTCAAAAGTACAAGCGGAAATTGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAAc < 1:4061046/91‑1 (MQ=255) cagttgtgcgaagcatcatctgtattccgctgttcctctttgactttttaaatgcattggaaccaaattggtgaacccaaaaataAAAccc > 1:1864774‑M1/86‑91 (MQ=255) aTTGACAGATGAGCGCGTTTCAAAAGTACAAGCGGAAATTGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAAccc < 1:353459/91‑1 (MQ=255) ttGACAGATGAGCGCGTTTCAAAAGTACAAGCGGAAATTGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAAcccc > 1:3237968/1‑91 (MQ=255) ttGACAGATGAGCGCGTTTCAAAAGTACAAGCGGAAATTGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAACGATTTAAAcccc < 1:3175812/91‑1 (MQ=255) agttgtgcgaagcatcatctgtattccgctgttcctctttgactttttaaatgcattggaaccaaattggtgaacccaaaaataAAAcccc > 1:1199977‑M1/85‑91 (MQ=255) tGACAGATGAGCGCGTTTCAAAAGTACAAGCGGAAATTGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTCAACCCCa > 1:2073845/1‑91 (MQ=255) tGACAGATGAGCGCGTTTCAAAAGTACAAGCGGAAATTGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCa < 1:2432865/91‑1 (MQ=255) tGACAGATGAGCGCGTTTCAAAAGTACAAGCGGAAATTGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCa > 1:1895644/1‑91 (MQ=255) gttgtgcgaagcatcatctgtattccgctgttcctctttgactttttaaatgcattggaaccaaattggtgaacccaaaaataAAACCCCa < 1:114691‑M1/8‑1 (MQ=255) gttgtgcgaagcatcatctgtattccgctgttcctctttgactttttaaatgcattggaaccaaattggtgaacccaaaaataAAACCCCa < 1:2176124‑M1/8‑1 (MQ=255) gttgtgcgaagcatcatctgtattccgctgttcctctttgactttttaaatgcattggaaccaaattggtgaacccaaaaataAAACCCCa < 1:149278‑M1/8‑1 (MQ=255) gttgtgcgaagcatcatctgtattccgctgttcctctttgactttttaaatgcattggaaccaaattggtgaacccaaaataAAACCCCAt > 1:1023560‑M1/83‑91 (MQ=255) gACAGATGAGCGCGTTTCAAAAGTACAAGCGGAAATTGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCAt > 1:3914981/1‑91 (MQ=255) tgtgcgaagcatcatctgtattccgctgttcctctttgactttttaaatgcattggaaccaaattggtgaacccaaaaataAAACCCCATg > 1:2990095‑M1/82‑91 (MQ=255) tgtgcgaagcatcatctgtattccgctgttcctctttgactttttaaatgcattggaaccaaattggtgaacccaaaaataAAACCCCATg > 1:3935178‑M1/82‑91 (MQ=255) cAGATGAGCGCGTTTCAAAAGTACAAGCGGAAATTGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGt > 1:381012/1‑91 (MQ=255) aGATGAGCGCGTTTCAAAAGTACAAGCGGAAATTGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGta < 1:4036043/91‑1 (MQ=255) gAGCGCGTTTCAAAAGTACAAGCGGAAATTGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAg > 1:3992357/1‑91 (MQ=255) aGCGCGTTTCAAAAGTACAAGCGGAAATTGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAgg > 1:3713395/1‑91 (MQ=255) cgcgTTTCAAAAGTACAAGCGGAAATTGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGat > 1:1599771/1‑91 (MQ=255) cgcgTTTCAAAAGTACAAGCGGAAATTGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGat > 1:359415/1‑91 (MQ=255) cgcgTTTCAAAAGTACAAGCGGAAATTGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGat > 1:3623502/1‑91 (MQ=255) cgTTTCAAAAGTACAAGCGGAAATTGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGatat < 1:3728660/91‑1 (MQ=255) cgTTTCAAAAGTACAAGCGGAAATTGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGatat > 1:3384059/1‑91 (MQ=255) tttCAAAAGTACAAGCGGAAATTGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCt > 1:2703678/1‑91 (MQ=255) tttCAAAAGTACAAGCGGAAATTGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCt > 1:2703246/1‑91 (MQ=255) tCAAAAGTACAAGCGGAAATTGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGa < 1:1233081/91‑1 (MQ=255) tCAAAAGTACAAGCGGAAATTGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGa < 1:937168/91‑1 (MQ=255) aaaaGTACAAGCGGAAATTGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAg < 1:411900/91‑1 (MQ=255) aaGTACAAGCGGAAATTGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTa < 1:2554173/91‑1 (MQ=255) aaGTACAAGCGGAAATTGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTa < 1:2554218/91‑1 (MQ=255) aGTACAAGCGGAAATTGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAg < 1:4034685/91‑1 (MQ=255) gTACAAGCGGAAATTGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGa < 1:4045946/91‑1 (MQ=255) aCAAGCGGAAATTGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGAtt > 1:3869540/1‑91 (MQ=255) aaGCGGAAATTGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGa < 1:3428145/91‑1 (MQ=255) aGCGGAAATTGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGat > 1:703437/1‑91 (MQ=255) cGGAAATTGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGatat < 1:2532628/91‑1 (MQ=255) aaTTGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCt < 1:797142/91‑1 (MQ=255) aaTTGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCt < 1:2771519/91‑1 (MQ=255) aTTGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTa < 1:4012234/91‑1 (MQ=255) ttGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTaa > 1:989284/1‑91 (MQ=255) ttGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTaa > 1:704816/1‑91 (MQ=255) ttGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTaa < 1:1571421/91‑1 (MQ=255) tGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAAc < 1:1481972/91‑1 (MQ=255) tgactttttaaatgcattggaaccaaattggtgaacccaaaaataAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACa > 1:3347491‑M1/46‑91 (MQ=255) gAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACa > 1:2774096/1‑91 (MQ=255) gAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACa > 1:1603609/1‑91 (MQ=255) gAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACa > 1:1140631/1‑91 (MQ=255) gAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACa > 1:2774098/1‑91 (MQ=255) aaGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACAt > 1:650093/1‑91 (MQ=255) agcagcATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATg > 1:1371456/1‑91 (MQ=255) cagcaTTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATggg > 1:1380631/1‑91 (MQ=255) gcactAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGt < 1:1987635/87‑1 (MQ=255) ttaaatgcattggaaccaaattggtgaacccaaaaataAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGtt > 1:3579013‑M1/39‑91 (MQ=255) ttaaatgcattggaaccaaattggtgaacccaaaaataAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGtt > 1:3578531‑M1/39‑91 (MQ=255) taaatgcattggaaccaaattggtgaacccaaaaataAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGttt > 1:812271‑M1/38‑91 (MQ=255) aTTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGttt > 1:841125/1‑91 (MQ=255) aTTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGttt < 1:3018697/91‑1 (MQ=255) aTTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGttt > 1:1332893/1‑91 (MQ=255) aTTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGttt > 1:843189/1‑91 (MQ=255) ttAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGtttt > 1:3731302/1‑91 (MQ=255) tAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTa > 1:3150122/1‑91 (MQ=255) aaTTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTAt > 1:2668328/1‑91 (MQ=255) aTTGAACAAGGTGCGGTTATTAGATAATTATTTATACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTAtt < 1:3649664/91‑1 (MQ=255) ttGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTAttt > 1:2210757/1‑91 (MQ=255) tGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTAtttt < 1:1443985/91‑1 (MQ=255) aaCAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTg > 1:4133332/1‑91 (MQ=255) ggTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTc > 1:1006559/1‑91 (MQ=255) ggTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTc < 1:3568597/91‑1 (MQ=255) gCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCAcc > 1:2262936/1‑91 (MQ=255) cTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCa > 1:3150987/1‑91 (MQ=255) cTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCa > 1:1413649/1‑91 (MQ=255) tGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCaa < 1:552815/91‑1 (MQ=255) gTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAAt < 1:868569/91‑1 (MQ=255) attcGATAATGATTTAGACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTg < 1:3345056/91‑1 (MQ=255) ttaGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTgg < 1:1904611/91‑1 (MQ=255) ttaGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTgg < 1:1904545/91‑1 (MQ=255) ttaGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTgg < 1:246133/91‑1 (MQ=255) ttaGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTgg < 1:60848/91‑1 (MQ=255) taGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGt < 1:1037827/91‑1 (MQ=255) taGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGt < 1:1747202/91‑1 (MQ=255) taGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGt > 1:712243/1‑91 (MQ=255) aGATAATGATTTCAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTAGtt > 1:3209215/1‑91 (MQ=255) aTAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTcc > 1:2103770/1‑91 (MQ=255) aTAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTcc > 1:1605706/1‑91 (MQ=255) aaTGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCaa > 1:1945885/1‑91 (MQ=255) gATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGc > 1:2638784/1‑91 (MQ=255) gATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGc < 1:3364946/91‑1 (MQ=255) gATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGAGTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCCCCAATTTGGTTCCAATGc > 1:2638978/1‑91 (MQ=255) ttAAAGCCCATGTATAAGGATATCTTAAGTAGATTGATAGCCCTAACATGGGGGTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCAtt < 1:3857567/91‑1 (MQ=255) ttAAAGCCCATGTATAAGGATATCTAAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGATTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCAtt < 1:3857637/91‑1 (MQ=255) ttAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCAtt > 1:1189165/1‑91 (MQ=255) ttAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCAtt > 1:1189324/1‑91 (MQ=255) ttAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCAtt > 1:3571881/1‑91 (MQ=255) ttAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCAtt < 1:1623241/91‑1 (MQ=255) tAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCAttt < 1:55106/91‑1 (MQ=255) | AACATTGACAGATGAGCGCGTTTCAAAAGTACAAGCGGAAATTGAAGCAGCATTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTT > USA300TCH1516_ALE/1149333‑1149510 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |