New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1149421 = | 83 (0.840) | 6 (0.070) | 5/138 | NT | 7.6% | intergenic (+7/+164) | pheT_1/rnhC | Phenylalanine‑‑tRNA ligase beta subunit/Ribonuclease HIII |
? | USA300TCH1516_ALE | 1149475 = | 74 (0.870) | intergenic (+61/+110) | pheT_1/rnhC | Phenylalanine‑‑tRNA ligase beta subunit/Ribonuclease HIII |
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
TTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCAT > USA300TCH1516_ALE/1149385‑1149562 | tAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTa > 1:3150122/1‑91 (MQ=255) aaTTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTAt > 1:2668328/1‑91 (MQ=255) aTTGAACAAGGTGCGGTTATTAGATAATTATTTATACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTAtt < 1:3649664/91‑1 (MQ=255) ttGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTAttt > 1:2210757/1‑91 (MQ=255) tGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTAtttt < 1:1443985/91‑1 (MQ=255) aaCAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTg > 1:4133332/1‑91 (MQ=255) ggTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTc > 1:1006559/1‑91 (MQ=255) ggTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTc < 1:3568597/91‑1 (MQ=255) gCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCAcc > 1:2836168/1‑91 (MQ=255) gCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCAcc > 1:2262936/1‑91 (MQ=255) cTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCa > 1:3150987/1‑91 (MQ=255) cTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCa > 1:1413649/1‑91 (MQ=255) tGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCaa < 1:552815/91‑1 (MQ=255) gTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAAt < 1:868569/91‑1 (MQ=255) ttaGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTgg < 1:246133/91‑1 (MQ=255) ttaGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTgg < 1:60848/91‑1 (MQ=255) ttaGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTgg < 1:1904545/91‑1 (MQ=255) ttaGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTgg < 1:1904611/91‑1 (MQ=255) taGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGt > 1:712243/1‑91 (MQ=255) taGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGt < 1:1747202/91‑1 (MQ=255) taGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGt < 1:1037827/91‑1 (MQ=255) aGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGtt > 1:1886175/1‑91 (MQ=255) gATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTc < 1:3944387/91‑1 (MQ=255) aTAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTcc > 1:1605706/1‑91 (MQ=255) aTAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTcc > 1:2103770/1‑91 (MQ=255) aaTGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCaa > 1:1945885/1‑91 (MQ=255) gATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGc < 1:3364946/91‑1 (MQ=255) gATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGc > 1:2638784/1‑91 (MQ=255) gATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGAGTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCCCCAATTTGGTTCCAATGc > 1:2638978/1‑91 (MQ=255) ttAAAGCCCATGTATAAGGATATCTAAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGATTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCAtt < 1:3857637/91‑1 (MQ=255) ttAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCAtt > 1:3572177/1‑91 (MQ=255) ttAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCAtt > 1:1189165/1‑91 (MQ=255) ttAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCAtt > 1:1189324/1‑91 (MQ=255) ttAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCAtt < 1:1623241/91‑1 (MQ=255) tAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCAttt < 1:55106/91‑1 (MQ=255) tACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTaa > 1:4130753‑M1/2‑91 (MQ=255) aaccccatgttagggatatcaatctacttcagatatccttatacatggggtttTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTaa > 1:3579013‑M2/54‑91 (MQ=255) aaccccatgttagggatatcaatctacttcagatatccttatacatggggtttTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTaa > 1:3578531‑M2/54‑91 (MQ=255) AACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTaa < 1:2423517‑M1/91‑1 (MQ=255) AACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTaa > 1:2292858‑M1/1‑91 (MQ=255) ACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTaaa < 1:415483‑M1/91‑1 (MQ=255) CCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTaaaaa > 1:2342593‑M1/1‑91 (MQ=255) CCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTaaaaa < 1:1079691‑M1/91‑1 (MQ=255) CCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAg < 1:467664‑M1/91‑1 (MQ=255) CATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGt < 1:948363‑M1/91‑1 (MQ=255) CATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGt < 1:450995‑M1/91‑1 (MQ=255) CATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGt < 1:1650518‑M1/91‑1 (MQ=255) catgttagggatatcaatctacttcagatatccctaacatggggtttTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTc > 1:1538709‑M2/48‑91 (MQ=255) ATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTc < 1:2803300‑M1/91‑1 (MQ=255) tgttagggatatcaatctacttcagatatccttatacatggggtttTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCa > 1:3347491‑M2/47‑91 (MQ=255) TGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCa > 1:3630019‑M1/1‑91 (MQ=255) ttagggatatcaatctacttcagatatccttatacatggggtttTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCaaa > 1:3787058‑M2/45‑91 (MQ=255) TATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCaaa < 1:2686869‑M1/91‑1 (MQ=255) TATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCaaa < 1:3470394‑M1/91‑1 (MQ=255) taAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAaga < 1:4083332/91‑1 (MQ=255) taAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAaga > 1:2648876/1‑91 (MQ=255) aaGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAagag < 1:313983/91‑1 (MQ=255) aaGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAagag > 1:401345/1‑91 (MQ=255) aGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAgg < 1:2382065/91‑1 (MQ=255) ggATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGa > 1:1362347/1‑91 (MQ=255) ggATATCTGAAGCAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGa > 1:3201669/1‑91 (MQ=255) atatCTGAAGTAGATTGATATCCTTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAAc < 1:2565249/91‑1 (MQ=255) atCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAg < 1:2892347/91‑1 (MQ=255) atCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAg < 1:2891426/91‑1 (MQ=255) tCTGATGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGc > 1:3056060/1‑91 (MQ=255) tCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGc < 1:2684864/91‑1 (MQ=255) tGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCgg > 1:3991749/1‑91 (MQ=255) tGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCgg > 1:2637720/1‑91 (MQ=255) tGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCgg > 1:1528531/1‑91 (MQ=255) aaGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGaa < 1:3050176/91‑1 (MQ=255) aaGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGaa > 1:3750523/1‑91 (MQ=255) gTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATa < 1:710072/91‑1 (MQ=255) gTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATa < 1:711278/91‑1 (MQ=255) aGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACa > 1:683619/1‑91 (MQ=255) aTTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAga < 1:106370/91‑1 (MQ=255) ttGATATCCTTAACATGGGGTTTTATTTTTGGAATCAACAATTAGGCTTCGATTGGTTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAgat > 1:3305682/1‑91 (MQ=255) ttGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAgat > 1:3820807/1‑91 (MQ=255) ttGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAgat > 1:321181/1‑91 (MQ=255) ttGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAgat > 1:1850500/1‑91 (MQ=255) gATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCGATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGTAACAGCGGAATACAgatga < 1:1203243/91‑1 (MQ=255) gATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAgatga > 1:3815638/1‑91 (MQ=255) gATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAgatga < 1:1307894/91‑1 (MQ=255) atCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCGAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGc < 1:3310846/91‑1 (MQ=255) tCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTGACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCt < 1:3329165/91‑1 (MQ=255) cccTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCtt > 1:268270/1‑91 (MQ=255) cccTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCtt > 1:926338/1‑91 (MQ=255) cTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCg < 1:1773195/91‑1 (MQ=255) tAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGc < 1:851273/91‑1 (MQ=255) tAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGc < 1:260721/91‑1 (MQ=255) aaCATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTACAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGca > 1:3497224/1‑91 (MQ=255) catggggtttTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGcaca > 1:3935178‑M2/11‑91 (MQ=255) catggggtttTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGcaca > 1:2990095‑M2/11‑91 (MQ=255) atggggtttTA‑TTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAAc > 1:1023560‑M2/10‑91 (MQ=255) tggggtttTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAAc < 1:149278‑M2/83‑1 (MQ=255) tggggtttTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAAc < 1:2176124‑M2/83‑1 (MQ=255) tggggtttTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAAc < 1:114691‑M2/83‑1 (MQ=255) ggggtttTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACt > 1:1199977‑M2/8‑91 (MQ=255) gtttTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCa > 1:546004‑M2/5‑91 (MQ=255) tttTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCAt > 1:1805870‑M2/4‑91 (MQ=255) tttTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCAt > 1:3831250‑M2/4‑91 (MQ=255) | TTAATTGAACAAGGTGCTGTTATTAGATAATGATTTAAACCCCATGTATAAGGATATCTGAAGTAGATTGATATCCCTAACATGGGGTTTTATTTTTGGGTTCACCAATTTGGTTCCAATGCATTTAAAAAGTCAAAGAGGAACAGCGGAATACAGATGATGCTTCGCACAACTGCAT > USA300TCH1516_ALE/1149385‑1149562 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |