| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1182136 = | 106 (1.080) | 12 (0.140) | 8/140 | NT | 12.5% | intergenic (‑154/‑209) | USA300TCH1516_01103/USA300HOU_RS05895 | tRNA‑Arg/Antibacterial protein 3 |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1182166 = | 76 (0.880) | intergenic (‑184/‑179) | USA300TCH1516_01103/USA300HOU_RS05895 | tRNA‑Arg/Antibacterial protein 3 | |||||
Only 100 of 145 total aligned reads displayed.
AAAATGTTTATATTTTTCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAAT > USA300TCH1516_ALE/1182046‑1182226 | tgttgttattttaaaataaatttgatacaattagtttgtttatccgcacaacatcttataatgtacttaactgtattttaaagagaaaaga < 1:2819263‑M1/1‑1 (MQ=255)tgttgttattttaaaataaatttgatacaattagtttgtttatccgcacaacatcttataatgtacttaactgtattttaaagagaaaaga > 1:2369070‑M1/91‑91 (MQ=255)aaaaTGTTTATATTTTTCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGCTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTa > 1:3287166/1‑91 (MQ=255) gttgttattttaaaataaatttgatacaattagtttgtttatccgcacaacatcttataatgtacttaactgtattttaaagagaaaagaa < 1:657462‑M1/2‑1 (MQ=255) aaaTGTTTATATTTTTCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTaa > 1:77925/1‑91 (MQ=255) aaaTGTTTATATTTTTCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTaa > 1:77677/1‑91 (MQ=255) aaaTGTTTATATTTTTCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTaa > 1:180086/1‑91 (MQ=255) tgttattttaaaataaatttgatacaattagtttgtttatccgcacaacatcttataatgtacttaactgtattttaaagagaaaagAAAt < 1:1183134‑M1/4‑1 (MQ=255) aTGTTTATATTTTTCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAAt > 1:4035721/1‑91 (MQ=255) tGTTTATATTTTTCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATa > 1:248217/1‑91 (MQ=255) tGTTTATATTTTTCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATa > 1:247239/1‑91 (MQ=255) gttattttaaaataaatttgatacaattagtttgtttatccgcacaacatcttataatgtacttaactgtattttaaagagaaaagAAATa > 1:1031534‑M1/87‑91 (MQ=255) gTTTATATTTTTCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATAc > 1:4139438/1‑91 (MQ=255) gTTTATATTTTTCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAAGAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATAc > 1:4140085/1‑91 (MQ=255) tttATATTTTTCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACa < 1:1527831/91‑1 (MQ=255) tttATATTTTTCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACa > 1:1145390/1‑91 (MQ=255) attttaaaataaatttgatacaattagtttgtctatccgcacaacatcttataatgtacttaactgtattttaaacagaaaagAAATACAg > 1:3539038‑M1/84‑91 (MQ=255) ttttaaaataaatttgatacaattagtttgtttatccgcacaacatcttataatgtacttaactgtattttaaagagaaaagAAATACAGt > 1:1955066‑M1/83‑91 (MQ=255) ttttaaaataaatttgatacaattagtttgtttatccgcacaacatcttataatgtacttaactgtattttaaagagaaaagAAATACAGt > 1:1206515‑M1/83‑91 (MQ=255) tataTTTTTCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGt < 1:2029782/91‑1 (MQ=255) tatTTTTCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGttt > 1:1598585/1‑91 (MQ=255) tatTTTTCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGttt > 1:312372/1‑91 (MQ=255) tttCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGaa > 1:2115613/1‑91 (MQ=255) tCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATg > 1:3078325/1‑91 (MQ=255) cACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGc < 1:3668592/91‑1 (MQ=255) aatttgatacaattagtttgtttatccgcacaacatcttataatgtacttaactgtattttaaagagaaaagAAATACAGTTTTGAATGcc > 1:815867‑M1/73‑91 (MQ=255) attatAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTaa < 1:374814/91‑1 (MQ=255) attatAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTaa > 1:1166504/1‑91 (MQ=255) attatAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTaa < 1:641737/91‑1 (MQ=255) attatAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACCTAAATACGAATTCCGGCAACTTAATTGCGTTAAATACAGTTTTGAATCCCTaa > 1:3863578/1‑91 (MQ=255) ataGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTg < 1:3144641/91‑1 (MQ=255) tacaattagtttgtttatccgcacaacatcttataatgtacttaactgtattttaaagagaaaagAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGt > 1:1078394‑M1/66‑91 (MQ=255) taGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGTCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGt < 1:3586067/91‑1 (MQ=255) gagCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAt > 1:219377/1‑91 (MQ=255) gagCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAt < 1:3244540/91‑1 (MQ=255) gagCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAt > 1:581270/1‑91 (MQ=255) aattagtttgtttatccgcacaacatcttataatgtacttaactgtattttaaagagaaaagAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAtt > 1:416352‑M1/63‑91 (MQ=255) attagtttgtttatccgcacaacattttataatgtacttgactgtattttaaagagaaaagAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAttt > 1:3855166‑M1/62‑91 (MQ=255) attagtttgtttatccgcacaacatcttataatgtacttaactgtattttaaagagaaaagAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAttt > 1:629098‑M1/62‑91 (MQ=255) attagtttgtttatccgcacaacatcttataatgtacttaactgtattttaaagagaaaagAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAttt > 1:1892521‑M1/62‑91 (MQ=255) attagtttgtttatccgcacaacatcttataatgtacttaactgtattttaaagagaaaagAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAttt > 1:2687683‑M1/62‑91 (MQ=255) tATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAtttct > 1:1275412/1‑91 (MQ=255) aTTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAtttctt < 1:3113714/91‑1 (MQ=255) ttATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAtttctttt < 1:2464480/91‑1 (MQ=255) tATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAtttcttttc < 1:3738201/91‑1 (MQ=255) tATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAtttcttttc < 1:3334996/91‑1 (MQ=255) aTCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAtttcttttct > 1:3783973/1‑91 (MQ=255) aTCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAtttcttttcc > 1:1305742/1‑90 (MQ=255) tCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTtctc > 1:575491/1‑91 (MQ=255) tCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTtctc > 1:3480184/1‑91 (MQ=255) tAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCtt < 1:2394153/91‑1 (MQ=255) aaaaaGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGCGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCttt > 1:3292830/1‑91 (MQ=255) aaaGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTaa > 1:20224/1‑91 (MQ=255) aaGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTaaa > 1:3777791/1‑91 (MQ=255) ggTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAAt < 1:2159431/91‑1 (MQ=255) ggTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAAt > 1:3388144/1‑91 (MQ=255) gTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATa > 1:3888087/1‑91 (MQ=255) gTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATa > 1:3887950/1‑91 (MQ=255) tCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACa > 1:2627874/1‑91 (MQ=255) tCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACa < 1:2709829/91‑1 (MQ=255) cAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAg < 1:4069148/91‑1 (MQ=255) cAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAg > 1:1909788/1‑91 (MQ=255) cAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAg > 1:835079/1‑91 (MQ=255) aaTAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGt < 1:1999655/91‑1 (MQ=255) aTAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATGGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGtt < 1:3396067/91‑1 (MQ=255) aGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAg < 1:1733302/91‑1 (MQ=255) aGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAg < 1:1188334/91‑1 (MQ=255) gACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGt > 1:2635106/1‑91 (MQ=255) aCTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTa > 1:2740849/1‑91 (MQ=255) aCTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTa > 1:639338/1‑91 (MQ=255) cTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTAc > 1:3503253/1‑91 (MQ=255) aaaTACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACAtt > 1:15787/1‑91 (MQ=255) aaaTACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACAtt > 1:1177256/1‑91 (MQ=255) aaTACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATta > 1:1517047/1‑91 (MQ=255) aTACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATtat < 1:1143641/91‑1 (MQ=255) gAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGa < 1:3114780/91‑1 (MQ=255) aaTTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGAt > 1:2879564/1‑91 (MQ=255) ttCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGAtgt > 1:2243868/1‑91 (MQ=255) ttCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGAtgt < 1:340710/91‑1 (MQ=255) ggCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTtgtg > 1:2617717/1‑91 (MQ=255) gCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGc < 1:285931/91‑1 (MQ=255) gCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGc < 1:557079/91‑1 (MQ=255) gCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGc < 1:556254/91‑1 (MQ=255) gCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGc > 1:3731264/1‑91 (MQ=255) cAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCg < 1:1025771/91‑1 (MQ=255) aaCTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCgg < 1:374215/91‑1 (MQ=255) aCTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGa > 1:3751167/1‑91 (MQ=255) ttAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATa < 1:465864/91‑1 (MQ=255) tAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaa < 1:3272425/91‑1 (MQ=255) tAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaa < 1:2403246/91‑1 (MQ=255) aTTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaaac < 1:2678536/91‑1 (MQ=255) aTTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaaac < 1:1994618/91‑1 (MQ=255) aTTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaaac < 1:3663318/91‑1 (MQ=255) ttGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaaaca > 1:399159/1‑91 (MQ=255) gaaaagAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaaacaa > 1:1714961‑M1/7‑91 (MQ=255) gtgtTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaaacaaa > 1:600875/1‑91 (MQ=255) tgtTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaaacaaac < 1:1332654/91‑1 (MQ=255) aaagAAATACAGTTAGGCATTCAAAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaaacaaac < 1:3021984‑M1/87‑1 (MQ=255) ttAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTa > 1:3339238/1‑91 (MQ=255) AAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAAt > 1:2176235‑M1/1‑91 (MQ=255) | AAAATGTTTATATTTTTCACTATTATAGAGCTATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAAT > USA300TCH1516_ALE/1182046‑1182226 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |