New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1182136 = | 106 (1.080) | 12 (0.140) | 8/140 | NT | 12.5% | intergenic (‑154/‑209) | USA300TCH1516_01103/USA300HOU_RS05895 | tRNA‑Arg/Antibacterial protein 3 |
? | USA300TCH1516_ALE | 1182166 = | 76 (0.880) | intergenic (‑184/‑179) | USA300TCH1516_01103/USA300HOU_RS05895 | tRNA‑Arg/Antibacterial protein 3 |
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
TATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAA > USA300TCH1516_ALE/1182077‑1182256 | tATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAtttct > 1:1275412/1‑91 (MQ=255) aTTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAtttctt < 1:3113714/91‑1 (MQ=255) tttATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAtttcttt > 1:3757037/1‑91 (MQ=255) tttATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAtttcttt < 1:2347106/91‑1 (MQ=255) gtttgtttatccgcacaacatcttataatgtacttaactgtattttaaagagaaaagaaatacagttttgaatgcctaactgtatttcttt < 1:3021984‑M2/4‑1 (MQ=255) ttATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAtttctttt < 1:2464480/91‑1 (MQ=255) ttgtttatccgcacaacatcttataatgtacttaactgtattttaaagagaaaagaaatacagttaggcattcaaaactgtatttcttttc > 1:1714961‑M2/86‑91 (MQ=255) tATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAtttcttttc < 1:3334996/91‑1 (MQ=255) tATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTAtttcttttc < 1:3738201/91‑1 (MQ=255) tCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTtctc > 1:3480184/1‑91 (MQ=255) tCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTtctc > 1:575491/1‑91 (MQ=255) tAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCtt < 1:2394153/91‑1 (MQ=255) aaaaaGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGCGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCttt > 1:3292830/1‑91 (MQ=255) aaaGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTaa > 1:20224/1‑91 (MQ=255) aaGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTaaa > 1:3777791/1‑91 (MQ=255) ggTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAAt > 1:3388144/1‑91 (MQ=255) ggTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAAt < 1:2159431/91‑1 (MQ=255) ggTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAAt > 1:2101470/1‑91 (MQ=255) ggTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAAt < 1:131176/91‑1 (MQ=255) gTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATa > 1:3887950/1‑91 (MQ=255) gTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATa > 1:3888087/1‑91 (MQ=255) tCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACa > 1:2627916/1‑91 (MQ=255) tCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACa < 1:2709829/91‑1 (MQ=255) cAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAg > 1:1909788/1‑91 (MQ=255) cAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAg < 1:4069148/91‑1 (MQ=255) aaTAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGt < 1:1999655/91‑1 (MQ=255) cttataatgtacttaactgtattttaaagagaaaagAAATACAGTTAGGCATTCAAAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAg < 1:2162978‑M1/55‑1 (MQ=255) aGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAg < 1:1188964/91‑1 (MQ=255) gACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGt > 1:2635106/1‑91 (MQ=255) aCTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTa > 1:2741439/1‑91 (MQ=255) aCTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTa > 1:2740849/1‑91 (MQ=255) aCTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTa > 1:639338/1‑91 (MQ=255) cTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTAc > 1:3503253/1‑91 (MQ=255) tAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTACTCTTTAAAATACAGTTAAGTACAt > 1:3854465/1‑91 (MQ=255) aaaTACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACAtt > 1:15787/1‑91 (MQ=255) aaaTACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACAtt > 1:1177256/1‑91 (MQ=255) aaTACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATta > 1:1517047/1‑91 (MQ=255) aTACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATtat < 1:1143641/91‑1 (MQ=255) aaTTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGAt > 1:2879564/1‑91 (MQ=255) ttCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGAtgt < 1:340710/91‑1 (MQ=255) ttCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGAtgt > 1:2243868/1‑91 (MQ=255) cAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGAtgttg < 1:1718385/91‑1 (MQ=255) ggCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTtgtg > 1:2617717/1‑91 (MQ=255) gCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGc > 1:3731264/1‑91 (MQ=255) gCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGc < 1:556254/91‑1 (MQ=255) gCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGc < 1:285931/91‑1 (MQ=255) gCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGc < 1:557079/91‑1 (MQ=255) cAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCg < 1:1025771/91‑1 (MQ=255) aCTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGa > 1:3751167/1‑91 (MQ=255) cTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGAt > 1:1819093/1‑91 (MQ=255) ttAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATa < 1:465864/91‑1 (MQ=255) tAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaa < 1:2403246/91‑1 (MQ=255) tAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaa < 1:1985692/91‑1 (MQ=255) tAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaa < 1:3272425/91‑1 (MQ=255) aaTTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaaa > 1:70995/1‑91 (MQ=255) aTTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaaac < 1:3663318/91‑1 (MQ=255) aTTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaaac < 1:2678536/91‑1 (MQ=255) aTTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaaac < 1:1994618/91‑1 (MQ=255) ttGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaaaca > 1:399159/1‑91 (MQ=255) gaaaagAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaaacaa > 1:1714961‑M1/7‑91 (MQ=255) gtgtTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaaacaaa > 1:600875/1‑91 (MQ=255) tgtTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATaaacaaac < 1:1332654/91‑1 (MQ=255) ttAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTa > 1:3339238/1‑91 (MQ=255) ttAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACACTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAGCTa > 1:3339488/1‑91 (MQ=255) aaatacagttaggcattcaaaactgtatttCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAAt > 1:628964‑M2/31‑91 (MQ=255) aaatacagttaggcattcaaaactgtatttCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAAt > 1:1892521‑M2/31‑91 (MQ=255) aaatacagttaggcattcaaaactgtatttCTTTTCTCTTTAAAATACAGTCAAGTACATTATAAAATGTTGTGCGGATAAACAAACTAAt > 1:3855166‑M2/31‑91 (MQ=255) AAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAAt > 1:2176235‑M1/1‑91 (MQ=255) AATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAAtt > 1:449862‑M1/1‑91 (MQ=255) TACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGt < 1:992743‑M1/91‑1 (MQ=255) acagttaggcattcaaaactgtatttCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATCAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTa > 1:2581653‑M2/27‑91 (MQ=255) CAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTAt < 1:309889‑M1/91‑1 (MQ=255) CAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTAt < 1:2237879‑M1/91‑1 (MQ=255) agttaggcattcaaaactgtatttCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATc > 1:2875379‑M2/25‑91 (MQ=255) GTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCa > 1:3258130‑M1/1‑91 (MQ=255) TTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCaa < 1:2189536‑M1/91‑1 (MQ=255) TTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGTATAAACAAACTAATTGTATCaaa < 1:2398146‑M1/91‑1 (MQ=255) TTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCaaa > 1:1073928‑M1/1‑91 (MQ=255) TTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCaaa > 1:1074194‑M1/1‑91 (MQ=255) ttGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAat < 1:3149623/91‑1 (MQ=255) ttGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAat > 1:577782/1‑91 (MQ=255) ggcattcaaaactgtatttCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAatt > 1:815867‑M2/20‑91 (MQ=255) gAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAattt < 1:3658696/91‑1 (MQ=255) gAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAattt > 1:1256011/1‑91 (MQ=255) aTGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAatttat < 1:2673371/91‑1 (MQ=255) tGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAatttatt < 1:3113759/91‑1 (MQ=255) tGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAatttatt < 1:1407360/91‑1 (MQ=255) tGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAatttatt < 1:877295/91‑1 (MQ=255) ccTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTAtttt < 1:1854796/91‑1 (MQ=255) actgtatttCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTaaaa > 1:1206515‑M2/10‑91 (MQ=255) ctgtatttCTTTTCTGTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAGACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAAt > 1:3539038‑M2/9‑91 (MQ=255) ctgtatttCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAAt > 1:1161389‑M2/9‑91 (MQ=255) tatttCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATaac > 1:1031534‑M2/6‑91 (MQ=255) atttCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATaaca < 1:1183134‑M2/87‑1 (MQ=255) tttCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATaacaa > 1:880324‑M2/4‑91 (MQ=255) ttCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATaacaac < 1:657462‑M2/89‑1 (MQ=255) ttCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCCGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATATTAAAATaacaac > 1:4151668‑M2/3‑91 (MQ=255) tCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAacaaca < 1:2819263‑M2/90‑1 (MQ=255) tCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAacaaca > 1:2369070‑M2/2‑91 (MQ=255) cttttctCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATaacaacaa < 1:4004835/91‑1 (MQ=255) | TATTTATCTAAAAAGGTTCAATAAGACTTAAATACGAATTCAGGCAACTTAATTGTGTTAAATACAGTTTTGAATGCCTAACTGTATTTCTTTTCTCTTTAAAATACAGTTAAGTACATTATAAGATGTTGTGCGGATAAACAAACTAATTGTATCAAATTTATTTTAAAATAACAACAA > USA300TCH1516_ALE/1182077‑1182256 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |