New junction evidence | |||||||||||
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? | USA300TCH1516_ALE | = 1227672 | 85 (0.930) | coding (141/489 nt) | def1 | Peptide deformylase 1 |
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
CTATTTTAACGAAAAAAGCGCAAGCAGTTAAAACATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTATGTGCACCTCAAATTAATCAGTCATTGCAAGTGGCAATTATTGATATGGAAATGGAAGGATTATTACAACTTG > USA300TCH1516_ALE/1227566‑1227745 | cTATTTTAACGAAAAAAGCGCAAGCAGTTAAAACATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACA > 1:894523‑M1/1‑91 (MQ=255) cTATTTTAACGAAAAAAGCGCAAGCAGTTAAAACATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACA > 1:2306772‑M1/1‑91 (MQ=255) tATTTTAACGAAAAAAGCGCAAGCAGTTAAAACATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACaa < 1:4037335/91‑1 (MQ=255) tATTTTAACGAAAAAAGCGCAAGCAGTTAAAACATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACaa < 1:1881918/91‑1 (MQ=255) tATTTTAACGAAAAAAGCGCAAGCAGTTAAAACATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACaa < 1:663010/91‑1 (MQ=255) tATTTTAACGAAAAAAGCGCAAGCAGTTAAAACATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACaa < 1:144176/91‑1 (MQ=255) 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aaaGCGCAAGCAGTTAAAACATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCt < 1:3323068/91‑1 (MQ=255) aaGCGCAAGCAGTTAAAACATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAtaagccagcagcttc < 1:2934131‑M1/91‑16 (MQ=255) cgcAAGCAGTTAAAACATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTAtg < 1:2175879‑M2/91‑3 (MQ=255) cgcAAGCAGTTAAAACATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTAtg < 1:883125‑M2/91‑3 (MQ=255) cgcAAGCAGTTAAAACATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTAtg < 1:584033‑M2/91‑3 (MQ=255) gcAAGCAGTTAAAACATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTAtgt < 1:240231‑M2/91‑4 (MQ=255) gcAAGCAGTTAAAACATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTAtgt < 1:2813916‑M2/91‑4 (MQ=255) gcAAGCAGTGAAAACATTTGATGATTCGTTAAAAAGATTATTACAAGATTTAGAAGATACAATGTATGCACAAGAAGCTGCTGGCTTAtgt > 1:3979408‑M2/1‑88 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |