| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1265497 = | 98 (1.000) | 15 (0.190) | 8/130 | NT | 15.1% | intergenic (+5/‑168) | femA_1/dprA | Aminoacyltransferase FemA/DNA processing protein DprA |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1265543 = | 89 (1.110) | intergenic (+51/‑122) | femA_1/dprA | Aminoacyltransferase FemA/DNA processing protein DprA | |||||
Only 100 of 234 total aligned reads displayed.
CACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACAT > USA300TCH1516_ALE/1265407‑1265587 | catattctatttttgttttacatttctaatacaaaaacattgtcgatgtaatgttattttaaggagtaaaaatactgacttaaaaagtgaa < 1:2000081‑M1/1‑1 (MQ=255)cacaTGTTGAAGAATTATTTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATA < 1:353872‑M1/91‑1 (MQ=255) acaTGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAANGTTTAATTATAA > 1:451829‑M1/1‑91 (MQ=255) tattctatttttgttttacatttctaatacaaaaacactgtcgatgtaatgttattttaaggagtaaaaatactgacttaaaaagtgaaaa < 1:3497058‑M1/3‑1 (MQ=255) caTGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAA > 1:3254413‑M1/1‑91 (MQ=255) caTGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAA < 1:2061174‑M1/91‑1 (MQ=255) ttctatttttgttttacatttctaatacaaaaacattgtcgatgtaatgttattttaaggagtaaaaatactgacttaaaaagtgaAAAGt < 1:2009219‑M1/5‑1 (MQ=255) ttctatttttgttttacatttctaatacaaaaacattgtcgatgtaatgttattttaaggagtaaaaatactgacttaaaaagtgaAAAGt < 1:2345014‑M1/5‑1 (MQ=255) tctatttttgttttacatttctaatacaaaaacattgtcgatgtaatgttattttaaggagtaaaaatactgacttaaaaagtgaAAAGTa > 1:3869827‑M1/86‑91 (MQ=255) gTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTA > 1:1411067‑M1/1‑91 (MQ=255) tGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATG > 1:3793476‑M1/1‑91 (MQ=255) gaagaaTTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGT < 1:1294877‑M1/91‑1 (MQ=255) atttttgttttacatttctaatacaaaaacattgtcgatgtaatgttattttaaggagtaaaaatactgacttaaaaagtgaAAAGTATGt > 1:533128‑M1/83‑91 (MQ=255) tttttgttttacatttctaatacaaaaacattgtcgatgtaatgttattttaaggagtaaaaatactgacttaaaaagtgaAAAGTATGtt > 1:590479‑M1/82‑91 (MQ=255) aagaaTTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTT > 1:1437973‑M1/1‑91 (MQ=255) tttgttttacatttctaatacaaaaacattgtcgatgtaatgttattttaaggagtaaaaatactgacttaaaaagtgaAAAGTATGTTgg > 1:2269967‑M1/80‑91 (MQ=255) gaaTTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGG > 1:1518973‑M1/1‑91 (MQ=255) ttgttttacatttctaatacaaaaacattgtcgatgtaatgttattttaaggagtaaaaatactgacttaaaaagtgaAAAGTATGTTGga < 1:1264331‑M1/13‑1 (MQ=255) aattaattGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGA < 1:3088499‑M1/91‑1 (MQ=255) ttaattGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAA < 1:2141300‑M1/91‑1 (MQ=255) ttaattGGTGATTTCAACAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAA < 1:2141673‑M1/91‑1 (MQ=255) taattGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGgaaat > 1:2435997/1‑91 (MQ=255) taattGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGgaaat > 1:1062493/1‑91 (MQ=255) attGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGgaaattg > 1:4027167/1‑91 (MQ=255) tGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGgaaattgaa > 1:3173728/1‑91 (MQ=255) ggTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGgaaattgaaa > 1:596514/1‑91 (MQ=255) gTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGgaaattgaaat < 1:217458/91‑1 (MQ=255) gATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAAttt > 1:3424307/1‑91 (MQ=255) tttCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTa < 1:589388/91‑1 (MQ=255) catcaAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAAgaatttaaaatttc < 1:2922958‑M1/91‑15 (MQ=255) acaaaaacattgtcgatgtaatgttattttaaggagtaaaaatactgacttaaaaagtgaAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTc > 1:3145473‑M1/61‑91 (MQ=255) caAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAAggatttaaaatttcaat < 1:1147856‑M1/91‑18 (MQ=255) aaaaacattgtcgatgtaatgttattttaaggagtaaaaatactgacttaaaaagtgaAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtt > 1:745272‑M1/59‑91 (MQ=255) aaaaacattgtcgatgtaatgttattttaaggagtaaaaatactgacttaaaaagtgaAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtt > 1:484614‑M1/59‑91 (MQ=255) aaaCCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAAgaatttaaaatttcaatt < 1:2786212‑M1/91‑19 (MQ=255) aaaCCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTATAAATTCtt < 1:3984170‑M2/91‑3 (MQ=255) aaCCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCttt < 1:1875906‑M2/91‑4 (MQ=255) aaCCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCttt < 1:3718687‑M2/91‑4 (MQ=255) ccAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAAgaatttaaaatttcaatttcc < 1:2545083‑M1/91‑22 (MQ=255) ccAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttcc > 1:1860362‑M2/1‑86 (MQ=255) aacattgtcgatgtaatgttattttaaggagtaaaaatactgacttaaaaagtgaAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTcc > 1:963710‑M1/56‑91 (MQ=255) cattgtcgatgtaatgttattttaaggagtaaaaatactgacttaaaaagtgaAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCaa > 1:1381765‑M1/54‑91 (MQ=255) aGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTGAATTCtttccaa > 1:3199756‑M2/1‑84 (MQ=255) aGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaa < 1:38224‑M2/91‑8 (MQ=255) gTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaac < 1:2460121‑M2/91‑9 (MQ=255) gTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaac < 1:3922396‑M2/91‑9 (MQ=255) gTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaac < 1:181609‑M2/91‑9 (MQ=255) attgtcgatgtaatgttattttaaggagtaaaaatactgacttaaaaagtgaAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAAc > 1:1276840‑M1/53‑91 (MQ=255) ttgtcgatgtaatgttattttaaggagtaaaaatactgacttaaaaagtgaAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACa > 1:1606226‑M1/52‑91 (MQ=255) tAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaaca < 1:3355219‑M2/91‑10 (MQ=255) aaGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAAgaatttaaaatttcaatttccaacat < 1:3098858‑M1/91‑27 (MQ=255) aGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAAgaatttaaaatttcaatttccaacata < 1:2134046‑M1/91‑28 (MQ=255) aGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacata < 1:1293472‑M2/91‑12 (MQ=255) aGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTCATAAGGTTTAATCATAAAGTATGTTAGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacata < 1:3307659‑M2/91‑12 (MQ=255) gACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacatac < 1:2263209‑M2/91‑13 (MQ=255) gACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacatac < 1:2261627‑M2/91‑13 (MQ=255) aCCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacatact < 1:1231197‑M2/91‑14 (MQ=255) ccAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacatactt > 1:753694‑M2/1‑77 (MQ=255) ccAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacatactt > 1:710409‑M2/1‑77 (MQ=255) cAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacatacttt > 1:3212572‑M2/1‑76 (MQ=255) cAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacatacttt < 1:3436223‑M2/91‑16 (MQ=255) cAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacatacttt > 1:3026625‑M2/1‑76 (MQ=255) cAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacatacttt > 1:17523‑M2/1‑76 (MQ=255) cAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCtttccaacatacttt > 1:174625‑M2/1‑76 (MQ=255) aaTTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACtttt > 1:3227603/1‑91 (MQ=255) aaTTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACtttt > 1:285399/1‑91 (MQ=255) aTTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTc > 1:3157501/1‑91 (MQ=255) tCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCAc < 1:3653605/91‑1 (MQ=255) atataAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACttt < 1:3810992/91‑1 (MQ=255) tataAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACtttt > 1:301785/1‑91 (MQ=255) tataAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACtttt < 1:775592/91‑1 (MQ=255) taAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAGTTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTa < 1:3598691/91‑1 (MQ=255) aTTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGt < 1:2377431/91‑1 (MQ=255) ttGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCa > 1:404115/1‑91 (MQ=255) tGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAg < 1:1392245/91‑1 (MQ=255) aaCTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATCCTTTTCACTTTTTAAGTCAGTAttt > 1:3860390/1‑91 (MQ=255) tttatAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTc > 1:1844948/1‑91 (MQ=255) ttatAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTcc < 1:2041895/91‑1 (MQ=255) ttatAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTcc > 1:3839403/1‑91 (MQ=255) ttatAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTcc > 1:3894040/1‑91 (MQ=255) ttatAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTcc < 1:2652024/91‑1 (MQ=255) ataAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCtt > 1:1190464/1‑91 (MQ=255) taAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTa > 1:2348274/1‑91 (MQ=255) aaGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTaa > 1:536352/1‑91 (MQ=255) aGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTaaa > 1:1639958/1‑91 (MQ=255) ggTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTaaaa < 1:1092447/91‑1 (MQ=255) gTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAAt > 1:3122792/1‑91 (MQ=255) ttAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATaa > 1:432840/1‑91 (MQ=255) ttAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATaa < 1:1506215/91‑1 (MQ=255) tAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAAc < 1:2591854/91‑1 (MQ=255) aaTTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACa > 1:1946260/1‑91 (MQ=255) aaTTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACa > 1:2509306/1‑91 (MQ=255) aaTTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACa < 1:1010883/91‑1 (MQ=255) aTTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACAt > 1:3783675/1‑91 (MQ=255) aTTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACAt > 1:3388121/1‑91 (MQ=255) ataAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTAc > 1:447167/1‑91 (MQ=255) taAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACa > 1:3641696/1‑91 (MQ=255) aaaGTATGTTGGAAAgaatttaaaatttcaatttccaacatactttataattaaaccttataaataagttttgcaaatttatatagaattg > 1:3998629‑M1/1‑15 (MQ=255) AAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACAt < 1:4079746‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACAt < 1:3954371‑M1/91‑1 (MQ=255) | CACATGTTGAAGAATTAATTGGTGATTTCATCAAACCAGTAAGACCAATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACAT > USA300TCH1516_ALE/1265407‑1265587 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |