New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1265497 = | 98 (1.000) | 15 (0.190) | 8/130 | NT | 15.1% | intergenic (+5/‑168) | femA_1/dprA | Aminoacyltransferase FemA/DNA processing protein DprA |
? | USA300TCH1516_ALE | 1265543 = | 89 (1.110) | intergenic (+51/‑122) | femA_1/dprA | Aminoacyltransferase FemA/DNA processing protein DprA |
Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
AATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAATATGA > USA300TCH1516_ALE/1265453‑1265633 | aaTTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACtttt > 1:3227603/1‑91 (MQ=255) aTTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTc > 1:1402383/1‑91 (MQ=255) tCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCAc < 1:3647496/91‑1 (MQ=255) atataAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACttt < 1:3810992/91‑1 (MQ=255) tataAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACtttt < 1:775592/91‑1 (MQ=255) aaaTTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTaa > 1:2042007/1‑91 (MQ=255) aTTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTatta < 1:2262354/91‑4 (MQ=255) aTTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGt < 1:2377431/91‑1 (MQ=255) aTTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGt < 1:158816/91‑1 (MQ=255) ttGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCa > 1:404115/1‑91 (MQ=255) tGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAg < 1:2313492/91‑1 (MQ=255) tGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAg < 1:1392245/91‑1 (MQ=255) gCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGt > 1:495605/1‑91 (MQ=255) aaaCTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTAtt > 1:1282651/1‑91 (MQ=255) aaCTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAGTTTTAAATTCTTTCCAACATACATTTCACTTTTTAAGTCAGTAttt < 1:3285827/91‑1 (MQ=255) aCTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTAtttt > 1:3165297/1‑91 (MQ=255) aCTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTAtttt < 1:3824410/91‑1 (MQ=255) aCTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTAtttt > 1:3193908/1‑91 (MQ=255) cTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTAttttt < 1:2138681/91‑1 (MQ=255) ttatttatAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTa > 1:138660/1‑91 (MQ=255) tttatAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTc > 1:1844948/1‑91 (MQ=255) ttatAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTcc > 1:3839403/1‑91 (MQ=255) ttatAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTcc < 1:2041895/91‑1 (MQ=255) tataAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCt > 1:3901575/1‑91 (MQ=255) ataAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCtt > 1:1190464/1‑91 (MQ=255) taAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTa > 1:2348274/1‑91 (MQ=255) aaGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTaa < 1:1698824/91‑1 (MQ=255) aaGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTaa > 1:536352/1‑91 (MQ=255) ggTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTaaaa > 1:2575165/1‑91 (MQ=255) ggTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTaaaa < 1:1092447/91‑1 (MQ=255) gTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAAt > 1:3122792/1‑91 (MQ=255) ttAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATaa > 1:432840/1‑91 (MQ=255) ttAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATaa < 1:1506215/91‑1 (MQ=255) ttAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATaa > 1:1352859/1‑91 (MQ=255) aaTTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACa < 1:1010903/91‑1 (MQ=255) aaTTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACa < 1:1010883/91‑1 (MQ=255) aaTTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACa > 1:1946260/1‑91 (MQ=255) aTTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATTACAt > 1:3616668/1‑91 (MQ=255) aTTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACAt > 1:3388121/1‑91 (MQ=255) aTTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACAt > 1:3388524/1‑91 (MQ=255) ataAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTAc > 1:447167/1‑91 (MQ=255) AAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACAt < 1:4079746‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACAt < 1:3954371‑M1/91‑1 (MQ=255) AAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACAt > 1:432151‑M1/1‑91 (MQ=255) GTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGa < 1:2673459‑M1/91‑1 (MQ=255) atgttggaaagaatttaaaatttcaatttccaacatactttTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACa > 1:2947314‑M2/42‑91 (MQ=255) ATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACa < 1:2163515‑M1/91‑1 (MQ=255) TGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACaa < 1:2427741‑M1/91‑1 (MQ=255) TGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACaa < 1:1461164‑M1/91‑1 (MQ=255) TGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACaa > 1:1572538‑M1/1‑91 (MQ=255) TGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACaa > 1:259415‑M1/1‑91 (MQ=255) TGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACaa < 1:2173720‑M1/91‑1 (MQ=255) gttggaaagaatttaaaatttcaatttccaacatactttTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAAt > 1:1276840‑M2/40‑91 (MQ=255) TTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATg < 1:3682934‑M1/91‑1 (MQ=255) TTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATg < 1:1537075‑M1/91‑1 (MQ=255) TTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATg < 1:3006980‑M1/91‑1 (MQ=255) TTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATg < 1:3006561‑M1/91‑1 (MQ=255) TTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATg > 1:4093285‑M1/1‑91 (MQ=255) TGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGt < 1:3635345‑M1/91‑1 (MQ=255) ggaaagaatttaaaatttcaatttccaacatactttTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGtt > 1:963710‑M2/37‑91 (MQ=255) GGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGtt > 1:3248361‑M1/1‑91 (MQ=255) AAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTGAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGtttt > 1:4139154‑M1/1‑91 (MQ=255) aagaatttaaaatttcaatttccaacatactttTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGttttt > 1:745913‑M2/34‑91 (MQ=255) aagaatttaaaatttcaatttccaacatactttTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGttttt > 1:745272‑M2/34‑91 (MQ=255) AATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGttttt > 1:372453‑M1/1‑91 (MQ=255) gaatttaaaatttcaatttccaacatactttTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGt > 1:3145447‑M2/32‑91 (MQ=255) gaatttaaaatttcaatttccaacatactttTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGt > 1:3145473‑M2/32‑91 (MQ=255) aaattTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTAtt > 1:3146988/1‑91 (MQ=255) aattTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTa > 1:1186202/1‑91 (MQ=255) aattTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTa > 1:670076/1‑91 (MQ=255) ttttAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGa < 1:315949/91‑1 (MQ=255) ttttAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGa < 1:3582394/91‑1 (MQ=255) ttttAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGa < 1:2628039/91‑1 (MQ=255) tttAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGaa > 1:366600/1‑91 (MQ=255) tttAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGaa < 1:1610873/91‑1 (MQ=255) ttAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGaaa > 1:587825/1‑91 (MQ=255) ttAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGaaa > 1:562715/1‑91 (MQ=255) aaaTTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATg > 1:191098/1‑91 (MQ=255) aaaTTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATg > 1:3990006/1‑91 (MQ=255) aaaTTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATg > 1:2833529/1‑91 (MQ=255) aTTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTa > 1:2520591/1‑91 (MQ=255) tCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTaaa < 1:282609/91‑1 (MQ=255) tCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGCATTCTTACTCCTCAAAATAACATTAGATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTaaa > 1:3316307/1‑91 (MQ=255) ttccaacatactttTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACa < 1:3512100‑M2/77‑1 (MQ=255) tccaacatactttTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACaa < 1:1264331‑M2/78‑1 (MQ=255) ccaacatactttTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACaaa > 1:2269967‑M2/13‑91 (MQ=255) aacatactttTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACaaaaa > 1:590479‑M2/11‑91 (MQ=255) acatactttTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAAt > 1:533128‑M2/10‑91 (MQ=255) atactttTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAg < 1:3084027‑M2/84‑1 (MQ=255) tactttTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATagc > 1:479920‑M2/7‑90 (MQ=255) tactttTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGa > 1:3869827‑M2/7‑91 (MQ=255) tactttTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGa > 1:1232290‑M2/7‑91 (MQ=255) actttTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGaa < 1:2345014‑M2/86‑1 (MQ=255) actttTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGaa < 1:1508996‑M2/86‑1 (MQ=255) ctttTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAat > 1:3635836‑M2/5‑91 (MQ=255) tttTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCTACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAata < 1:3594684‑M2/88‑1 (MQ=255) tttTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAGTGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAata < 1:3497042‑M2/88‑1 (MQ=255) tttTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAata > 1:3787978‑M2/4‑91 (MQ=255) tTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAATATg < 1:2000081‑M2/90‑1 (MQ=255) tCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAATATGa < 1:2865112/91‑1 (MQ=255) | AATTCTATATAAATTTGCAAAACTTATTTATAAGGTTTAATTATAAAGTATGTTGGAAATTGAAATTTTAAATTCTTTCCAACATACTTTTCACTTTTTAAGTCAGTATTTTTACTCCTTAAAATAACATTACATCGACAATGTTTTTGTATTAGAAATGTAAAACAAAAATAGAATATGA > USA300TCH1516_ALE/1265453‑1265633 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |