| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1283482 = | 136 (1.380) | 10 (0.120) | 7/138 | NT | 8.4% | coding (47/4317 nt) | polC_1 | DNA polymerase III PolC‑type |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1283518 = | 101 (1.190) | coding (83/4317 nt) | polC_1 | DNA polymerase III PolC‑type | |||||
Only 100 of 181 total aligned reads displayed.
GTTCGAACACGTAAAAGTAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACAAAAACAGAACATGGGAATT > USA300TCH1516_ALE/1283392‑1283572 | gTTCGAACACGTAAAAGTAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAAt > 1:1678009/1‑91 (MQ=255)gTTCGAACACGTAAAAGTAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAAt < 1:3891846/91‑1 (MQ=255)gTTCGAACACGTAAAAGTAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAAt > 1:3166775/1‑91 (MQ=255)gTTCGAACACGTAAAAGTAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAAt > 1:3166934/1‑91 (MQ=255)cttcatgagctaagaattgtggtaatgtaatatgaaattcccatgttctgtttttgttagaaacatctatacgtgtcagttcacctgaatt > 1:2482247‑M1/91‑91 (MQ=255) ttCGAACACGTAAAAGTAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAAtt > 1:1047033/1‑91 (MQ=255) catgagctaagaattgtggtaatgtaatatgaaattcccatgttctgtttttgttagaaacatctatacgtgtcagttcacctgaatTTaa > 1:3157078‑M1/88‑91 (MQ=255) gAACACGTAAAAGTATTTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTaaa > 1:3540979/1‑91 (MQ=255) aaCACGTAAAAGTAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGATCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTaaaa < 1:3505475/91‑1 (MQ=255) aaCACGTAAAAGTAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTaaaa < 1:3721099/91‑1 (MQ=255) aaCACGTAAAAGTAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTaaaa > 1:2866165/1‑91 (MQ=255) gagctaagaattgtggtaatgtaatatgaaattcccatgttctgtttttgttagaaacatctatacgtgtcagttcacctgaatTTAAAAt > 1:1418913‑M1/85‑91 (MQ=255) acacGTAAAAGTAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAAt < 1:1273013/91‑1 (MQ=255) gctaagaattgtggtaatgtaatatgaaattcccatgttctgtttttgttagaaacatctatacgtgtcagttcacctgaatTTAAAAttt > 1:2666188‑M1/83‑91 (MQ=255) gTAAAAGTAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCa > 1:2966219/1‑91 (MQ=255) gTAAAAGTAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCa > 1:272358/1‑91 (MQ=255) gTAAAAGTAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCa > 1:2662969/1‑91 (MQ=255) tAAAAGTAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCaa < 1:1264118/91‑1 (MQ=255) aaaGTAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAAt > 1:701709/1‑91 (MQ=255) aaGTAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATc > 1:1021972/1‑91 (MQ=255) tAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAAt < 1:767318/91‑1 (MQ=255) aTTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTa > 1:57885/1‑91 (MQ=255) tCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGAt < 1:713956/91‑1 (MQ=255) cTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATg < 1:3017497/91‑1 (MQ=255) cTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATg < 1:1583871/91‑1 (MQ=255) tATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGc < 1:4089761/91‑1 (MQ=255) tATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGc > 1:1862937/1‑91 (MQ=255) aTTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCt < 1:2103894/91‑1 (MQ=255) aTTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCt < 1:3764609/91‑1 (MQ=255) atatgaaattcccatgttctgtttttgttagaaacatctatacgtgtcagttcacctgaatTTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGaaa > 1:2615670‑M1/62‑91 (MQ=255) aaGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGaaa < 1:2198833/91‑1 (MQ=255) tatgaaattcccatgttctgtttttgttagaaacatctatacgtgtcagttcacctgaatTTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAAt > 1:1521897‑M1/61‑91 (MQ=255) aGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAAt < 1:3291417/91‑1 (MQ=255) atgacattcccatgttctgtttttgttagaaacatctatacgtgtcagttcacctgaatTTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAAtt > 1:1919654‑M1/60‑91 (MQ=255) atgaaattcccatgttctgtttttgttagaaacatctatacgtgtcagttcacctgaatTTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAAtt > 1:3415114‑M1/60‑91 (MQ=255) tgaaattcccatgttctgtttttgttagaaacatctatacgtgtcagttcacctgaatTTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCCGAAAttt > 1:2413185‑M1/59‑91 (MQ=255) tggtAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAAtttt > 1:1311907/1‑91 (MQ=255) gaaattcccatgttctgtttttgttagaaacatctatacgtgtcagttcacctgaatTTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAAtttt > 1:1450819‑M1/58‑91 (MQ=255) ggtAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTa < 1:1407222/91‑1 (MQ=255) ggtAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTa < 1:3042365/91‑1 (MQ=255) ggtAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTa < 1:1478392/91‑1 (MQ=255) aTTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAAtt < 1:3929487/91‑1 (MQ=255) aTTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAAtt < 1:966886/91‑1 (MQ=255) aTTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAAtt > 1:3604367/1‑91 (MQ=255) aTTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAAtt < 1:2365277/91‑1 (MQ=255) ttGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTc > 1:4049577/1‑91 (MQ=255) ttGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTc < 1:2975160/91‑1 (MQ=255) tGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCa > 1:748319/1‑91 (MQ=255) tGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCa > 1:748209/1‑91 (MQ=255) catgttctgtttttgttagaaacatctatacgtgtcagttcacctgaaaTTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAg > 1:166587‑M1/50‑91 (MQ=255) cTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGt < 1:2970734/91‑1 (MQ=255) cTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGt < 1:533224/91‑1 (MQ=255) ttGGCAATGAGAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTg < 1:2540874/91‑1 (MQ=255) ttGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTg < 1:797780/91‑1 (MQ=255) tGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGa < 1:4077459/91‑1 (MQ=255) ggCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTGAATTCAGGTGaa > 1:1360558/1‑91 (MQ=255) gCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAAc < 1:715707/91‑1 (MQ=255) gCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAAc < 1:1805046/91‑1 (MQ=255) aaTGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTg < 1:2268841/91‑1 (MQ=255) aTGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCACGTGAACTGa > 1:3969192/1‑91 (MQ=255) gagCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGta < 1:3922956/91‑1 (MQ=255) gagCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGta > 1:24479/1‑91 (MQ=255) agCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGtat > 1:3375006/1‑91 (MQ=255) agCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGtat > 1:562576/1‑91 (MQ=255) acaaAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGAt < 1:3220158/91‑1 (MQ=255) caaAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATg < 1:2024926/91‑1 (MQ=255) caaAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATg < 1:2325984/91‑1 (MQ=255) aaaaTTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGtt > 1:949479/1‑91 (MQ=255) aaaaTTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGtt < 1:2601803/91‑1 (MQ=255) aaTTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTc < 1:3035039/91‑1 (MQ=255) aaTTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTc > 1:1875207/1‑91 (MQ=255) tttAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTa > 1:255721/1‑91 (MQ=255) ttAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAACTTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTaa > 1:3397851/1‑91 (MQ=255) ttAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTaa > 1:497216/1‑91 (MQ=255) tAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAAc < 1:3359606/91‑1 (MQ=255) tAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAAc > 1:593556/1‑91 (MQ=255) aaaGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGCTGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACa > 1:1353782/1‑91 (MQ=255) aaaGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACa < 1:2132267/91‑1 (MQ=255) aaaGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACa < 1:2132567/91‑1 (MQ=255) aaGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACaa > 1:2004352/1‑91 (MQ=255) aGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACaaa > 1:2803488/1‑91 (MQ=255) aGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACaaa > 1:2518361/1‑91 (MQ=255) aGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACaaa > 1:2928001/1‑91 (MQ=255) tgcttgctGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACaaaaa < 1:3235292/91‑1 (MQ=255) tgcttgctGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACaaaaa < 1:1132153/91‑1 (MQ=255) gcttgctGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACAAAAAc < 1:283898/91‑1 (MQ=255) gcttgctGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACAAAAAc < 1:2863279/91‑1 (MQ=255) gcttgctGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACAAAAAc > 1:1872928/1‑91 (MQ=255) ttgctGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACAAAAACAg > 1:1720659/1‑91 (MQ=255) tgctGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACAAAAACAGa < 1:3155173/91‑1 (MQ=255) aTCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACAAAAACAGAACATg > 1:1476227/1‑91 (MQ=255) aTCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACAAAAACAGAACATg < 1:1584280/91‑1 (MQ=255) tCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACAAAAACAGAACATgg < 1:1558615/91‑1 (MQ=255) cAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACAAAAACAGAACATggg > 1:2321724/1‑91 (MQ=255) aaaTTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACAAAAACAGAACATGGGa < 1:1162038/91‑1 (MQ=255) aaaTTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACAAAAACAGAACATGGGa < 1:1112798/91‑1 (MQ=255) aaaTTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATACAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACAAAAACAGAACATGGGa > 1:3592525/1‑91 (MQ=255) TTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACAAAAACAGAACATGGGAAtt > 1:1159398‑M1/1‑91 (MQ=255) TTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACAAAAACAGAACATGGGAAtt > 1:3888216‑M1/1‑91 (MQ=255) TTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACAAAAACAGAACATGGGAAtt > 1:101794‑M1/1‑91 (MQ=255) | GTTCGAACACGTAAAAGTAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACAAAAACAGAACATGGGAATT > USA300TCH1516_ALE/1283392‑1283572 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |