| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1303447 | 103 (1.050) | 8 (0.090) | 5/138 | NT | 8.0% | coding (61/1266 nt) | USA300HOU_RS06440 | putative zinc protease |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1303460 | 96 (1.130) | coding (74/1266 nt) | USA300HOU_RS06440 | putative zinc protease | |||||
Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
ATGTAAGAAGATATAGAGGAGGCTATATATTTGAGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGACACAATAACAGCTAGATCATTATTAAGCAAATTATTAGTTCGAGCA > USA300TCH1516_ALE/1303357‑1303536 | tGTAAGAAGATATAGAGGAGGCTATATATTTGAGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAaac < 1:3955134/91‑1 (MQ=255) tGTAAGAAGATATAGAGGAGGCTATATATTTGAGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAaac < 1:3166157/91‑1 (MQ=255) tGTAAGAAGATATAGAGGAGGCTATATATTTGAGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAaac > 1:1614067/1‑91 (MQ=255) agaagaTATAGAGGAGGCTATATATTTGAGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑act < 1:3016826/91‑1 (MQ=255) aagaTATAGAGGAGGCTATATATTTGAGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑actac > 1:1354303/1‑91 (MQ=255) gaTATAGAGGAGGCTATATATTTGAGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑Actacta > 1:2963728/1‑91 (MQ=255) gaTATAGAGGAGGCTATATATTTGAGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑Actacta > 1:969054/1‑91 (MQ=255) gaTATAGAGGAGGCTATATATTTGAGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑Actacta > 1:333038/1‑91 (MQ=255) atatAGAGGAGGCTATATATTTGAGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACtat < 1:2305295/91‑1 (MQ=255) atacAGAGGTGGCTATATATTTGAGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACtat < 1:3734602/91‑1 (MQ=255) tataGAGGAGGCTATATATTTGAGTTGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACtata < 1:3853114/91‑1 (MQ=255) tataGAGGAGGCTATATATTTGAGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACtata > 1:2592859/1‑91 (MQ=255) ataGAGGAGGCTATATATTTGAGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAg > 1:803712/1‑91 (MQ=255) ataGAGGAGGCTATATATTTGAGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAg < 1:4101665/91‑1 (MQ=255) taGAGGAGGCTATATATTTGAGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGt < 1:3231246/91‑1 (MQ=255) taGAGGAGGCTATATATTTGAGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGt > 1:612935/1‑91 (MQ=255) agagGAGGCTATATATTTGAGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTt < 1:2869006‑M2/91‑2 (MQ=255) agagGAGGCTATATATTTGAGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTt < 1:2868848‑M2/91‑2 (MQ=255) aggaggCTATATATTTGAGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTttt > 1:592126‑M2/1‑88 (MQ=255) aggaggCTATATATTTGAGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTttt > 1:3258154‑M2/1‑88 (MQ=255) aggaggCTATATATTTGAGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTttt < 1:2943915‑M2/91‑4 (MQ=255) gaggCTATATATTTGAGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTtttta < 1:458411‑M2/91‑6 (MQ=255) gaggCTATATATTTGAGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTtttta > 1:3319254‑M2/1‑86 (MQ=255) aggCTATATATTTGAGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAAactatagtagttgttttaa < 1:3878659‑M1/91‑20 (MQ=255) aggCTATATATTTGAGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAAactatagtagttgttttaa < 1:1601866‑M1/91‑20 (MQ=255) gCTATATATTTGAGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAAactatagtagttgttttaaat < 1:2267300‑M1/91‑22 (MQ=255) gCTATATATTTGAGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTttttaaat > 1:1064237‑M2/1‑83 (MQ=255) cTATATATTTGAGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAAactatagtagttgttttaaatt < 1:1231444‑M1/91‑23 (MQ=255) atatatTTGAGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTGTCACCAACAACTAAATTTAAAAactatagtagttgttttaaattta < 1:3291282‑M1/91‑25 (MQ=255) tatTTGAGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAAactatagtagttgttttaaatttagtt < 1:2017145‑M1/91‑28 (MQ=255) tatTTGAGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATgg < 1:1838167/91‑1 (MQ=255) tatTTGAGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATgg > 1:767712/1‑91 (MQ=255) tatTTGAGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATAAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATgg < 1:3816043/91‑1 (MQ=255) ttGAGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCAc < 1:960377/91‑1 (MQ=255) ttGAGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCAc < 1:1251377/91‑1 (MQ=255) tGAGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCAcc > 1:1197674/1‑91 (MQ=255) aGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCtt < 1:577664/91‑1 (MQ=255) aGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCtt < 1:546114/91‑1 (MQ=255) gTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCttt < 1:2356675/91‑1 (MQ=255) gTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCttt < 1:275232/91‑1 (MQ=255) aGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAg > 1:2758373/1‑91 (MQ=255) aGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAg > 1:4065968/1‑91 (MQ=255) cAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAat > 1:3613006/1‑91 (MQ=255) aaTCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAata < 1:3798793/91‑1 (MQ=255) aaTCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAata < 1:2025269/91‑1 (MQ=255) aTCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAatat > 1:3254857/1‑91 (MQ=255) tcAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGac < 1:1426371/91‑1 (MQ=255) tcAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGac < 1:1426372/91‑1 (MQ=255) tcAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGac > 1:2296028/1‑91 (MQ=255) tcAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGac > 1:837818/1‑91 (MQ=255) tcAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGac < 1:2031143/91‑1 (MQ=255) tcAACCAAATATACACAACACAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTATTTAAATTTCTGGCACCTATAGAATATGac > 1:1233940/1‑91 (MQ=255) aaCCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGacac > 1:2815444/1‑91 (MQ=255) aaCCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGacac < 1:2142072/91‑1 (MQ=255) aCCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGAcaca < 1:765931/91‑1 (MQ=255) aCCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGAcaca < 1:1180692/91‑1 (MQ=255) cAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGACTCAAt > 1:3450489/1‑91 (MQ=255) tataCATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGACACAATAACa > 1:3748859/1‑91 (MQ=255) aCATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGACACAATAACAGCt > 1:2257/1‑91 (MQ=255) aCATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGACACAATAACAGCt < 1:1967779/91‑1 (MQ=255) aCATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGACACAATAACAGCt < 1:1967397/91‑1 (MQ=255) atatCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGACACAATAACAGCTAg < 1:518921/91‑1 (MQ=255) tatCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGACACAATAACAGCTAGa < 1:2291427/91‑1 (MQ=255) tCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGACACAATAACAGCTAGATc > 1:1366457/1‑91 (MQ=255) tCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGACACAATAACAGCTAGATc > 1:1366656/1‑91 (MQ=255) tCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGACACAATAACAGCTAGATc < 1:3687463/91‑1 (MQ=255) aaGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAACTTTATGGCACCTTTAGCATATGACACAATAACAGCTAGATCatt > 1:1718903/1‑91 (MQ=255) aaGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGACACAATAACAGCTAGATCatt > 1:1718419/1‑91 (MQ=255) aGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACAACTACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGACACAATAACAGCTAGATCa > 1:581947/1‑91 (MQ=255) tCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGACACAATAACAGCTAGATCATTATTaa < 1:359871/91‑1 (MQ=255) tCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGACACAATAACAGCTAGATCATTATTaa > 1:4033638/1‑91 (MQ=255) tCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGACACAATAACAGCTAGATCATTATTaa > 1:4033779/1‑91 (MQ=255) cACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGACACAATAACAGCTAGATCATTATTAAg < 1:1810611/91‑1 (MQ=255) cACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGACACAATAACAGCTAGATCATTATTAAg > 1:1333863/1‑91 (MQ=255) cACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGACACAATAACAGCTAGATCATTATTAAg > 1:237825/1‑91 (MQ=255) cACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGACACAATAACAGCTAGATCATTATTAAg > 1:1154220/1‑91 (MQ=255) aCCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGACACAATAACAGCTAGATCATTATTAAGc > 1:3993417/1‑91 (MQ=255) ccAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGACACAATAACAGCTAGATCATTATTAAGCa > 1:1522503/1‑91 (MQ=255) ccAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGACACAATAACAGCTAGATCATTATTAAGCa > 1:2325501/1‑91 (MQ=255) caacaaCTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGACACAATAACAGCTAGATCATTATTAAGCaa > 1:2143263/1‑91 (MQ=255) aacTAAATTTAACACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGACACAATAACAGCTAGATCATTATTAAGCAAatta > 1:3187958/1‑91 (MQ=255) aacTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTttttaaatttagttgttggtgaaactttgatatgtatatttggttgagattgtctactcaaata < 1:2017145‑M2/91‑65 (MQ=255) cTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGACACAATTACAGCTAGATCATTATTAAGCAAattatt > 1:3303012/1‑91 (MQ=255) cTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGACACAATAACAGCTAGATCATTATTAAGCAAattatt < 1:3432688/91‑1 (MQ=255) tAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTttttaaatttagttgttggtgacactttgatatgtatatttggttgagattgtctactcaaatatat < 1:3291282‑M2/91‑68 (MQ=255) tAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTttttaaatttagttgttggtgacactttgatatgtatatttggttgagattgtctactcaaatatat < 1:3292966‑M2/91‑68 (MQ=255) aaTTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGACACAATAACAGCTAGATCATTATTAAGCAAATTATTAGt > 1:3708724/1‑91 (MQ=255) aTTTAAAAactatagtagttgttttaaatttagttgttggtgaaactttgatatgtatatttggttgagattgtctactcaaatatatagc < 1:3742586‑M1/91‑84 (MQ=255) aTTTAAAAactatagtagttgttttaaatttagttgttggtgaaactttgatatgtatatttggttgagattgtctactcaaatatatagc > 1:1064237‑M1/1‑8 (MQ=255) aTTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGACACAATAACAGCTAGATCATTATTAAGCAAATTATTAGtt < 1:824070/91‑1 (MQ=255) tttAAAAactatagtagttgttttaaatttagttgttggtgaaactttgatatgtatatttggttgagattgtctactcaaatatatagcc > 1:2897174‑M1/1‑7 (MQ=255) ttAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTttttaaatttagttgttggtgaaactttgatatgtatatttggttgagattgtctactcaaatatatagcct < 1:3878659‑M2/91‑73 (MQ=255) ttAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTttttaaatttagttgttggtgaaactttgatatgtatatttggttgagattgtctactcaaatatatagcct < 1:1601867‑M2/91‑73 (MQ=255) ttAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTttttaaatttagttgttggtgaaactttgatatgtatatttggttgagattgtctactcaaatatatagcct < 1:1601866‑M2/91‑73 (MQ=255) tAAAAactatagtagttgttttaaatttagttgttggtgaaactttgatatgtatatttggttgagattgtctactcaaatatatagcctc < 1:458411‑M1/91‑87 (MQ=255) tAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGACACAATAACAGCTAGATCATTATTAAGCAAATTATTAGTTCGa < 1:911539/91‑1 (MQ=255) aaaactatagtagttgttttaaatttagttgttggtgaaactttgatatgtatatttggttgagattgtctactcaaatatatagcctcct < 1:2943915‑M1/91‑89 (MQ=255) aaaactatagtagttgttttaaatttagttgttggtgaaactttgatatgtatatttggttgagattgtctactcaaatatatagcctcct > 1:3258154‑M1/1‑3 (MQ=255) aaca‑‑‑acTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGACACAATAACAGCTAGATCATTATTAAGCAAATTATTAGTTCGAGCa < 1:1533815/91‑1 (MQ=255) aactatagtagttgttttaaatttagttgttggtgaaactttgatatgtatatttggttgagattgtctactcaaatatatagcctcctct < 1:2868848‑M1/91‑91 (MQ=255) | ATGTAAGAAGATATAGAGGAGGCTATATATTTGAGTAGACAATCTCAACCAAATATACATATCAAAGTTTCACCAACAACTAAATTTAAAACA‑‑‑ACTACTATAGTTTTTAAATTTATGGCACCTTTAGAATATGACACAATAACAGCTAGATCATTATTAAGCAAATTATTAGTTCGAGCA > USA300TCH1516_ALE/1303357‑1303536 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |