| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1330548 | 89 (0.910) | 6 (0.070) | 5/148 | NT | 7.2% | intergenic (+23/‑124) | glpD/USA300HOU_RS06555 | Aerobic glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase/Monoacylglycerol lipase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1330568 | 72 (0.790) | intergenic (+43/‑104) | glpD/USA300HOU_RS06555 | Aerobic glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase/Monoacylglycerol lipase | |||||
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
CTGAAGAAGTTGAGCAAGCAATTAAAGAAGCGCAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATACATTAGTCAATTGAAACTATGCATCACTAAATGTATGATAATAATAAAAG > USA300TCH1516_ALE/1330458‑1330638 | cTGAAGAAGTTGAGCAAGCAATTAAAGAAGCGCAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTG > 1:377899‑M1/1‑91 (MQ=255)cTGAAGAAGTTGAGCAAGCAATTAAAGAAGCGCAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTG < 1:1417720‑M1/91‑1 (MQ=255) gaagaaGTTGAGCAAGCAATTAAAGAAGCGCAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGgt < 1:2685010/91‑1 (MQ=255) aagTTGAGCAAGCAATTAAAGAAGCGCAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTcc > 1:623612/1‑91 (MQ=255) agTTGAGCAAGCAATTAAAGAAGCGCAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCt < 1:804643/91‑1 (MQ=255) gTTGAGCAAGCAATTAAAGAAGCGCAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTg > 1:2879765/1‑91 (MQ=255) tGAGCAAGCAATTAAAGAAGCGCAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGtt > 1:3485342/1‑91 (MQ=255) tGAGCAAGCAATTAAAGAAGCGCAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGtt > 1:689538/1‑91 (MQ=255) tGAGCAAGCAATTAAAGAAGCGCAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGtt > 1:807783/1‑91 (MQ=255) gAGCAAGCAATTAAAGAAGCGCAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGttt > 1:1189766/1‑91 (MQ=255) aagcaaTTAAAGAAGCGCAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGatgcccttaaaacag < 1:70917‑M1/91‑16 (MQ=255) aagcaaTTAAAGAAGCGCAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGatgcccttaaaacag < 1:705897‑M1/91‑16 (MQ=255) aagcaaTTAAAGAAGCGCAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAg > 1:742736/1‑91 (MQ=255) aagcaaTTAAAGAAGCGCAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAg > 1:742300/1‑91 (MQ=255) agcaaTTAAAGAAGCGCAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAgg > 1:2878775/1‑91 (MQ=255) gcaaTTAAAGAAGCGCAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAggg > 1:402321/1‑91 (MQ=255) gcaaTTAAAGAAGCGCAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAggg > 1:4079688/1‑91 (MQ=255) gcaaTTAAAGAAGCGCAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAggg < 1:655021/91‑1 (MQ=255) caaTTAAAGAAGCGCAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGc < 1:2569205/91‑1 (MQ=255) caaTTAAAGAAGCGCAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGc < 1:1902942/91‑1 (MQ=255) aaTTAAAGAAGCGCAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGatgcccttaaaacaggaca < 1:589911‑M1/91‑20 (MQ=255) aaTTAAAGAAGCGCAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCa < 1:3717201/91‑1 (MQ=255) aaTTAAAGAAGCGCAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCa < 1:772642/91‑1 (MQ=255) aaTTAAAGAAGCGCAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCa > 1:580861/1‑91 (MQ=255) aaTTAAAGAAGCGCAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCa < 1:3464819/91‑1 (MQ=255) aTTAAAGAAGCGCAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTATGGGCAt < 1:3226753/91‑1 (MQ=255) aTTAAAGAAGCGCAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCAt < 1:1997832/91‑1 (MQ=255) aTTAAAGAAGCGCAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCAt > 1:3639986/1‑91 (MQ=255) ttAAAGAAGCGCAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATc < 1:4110881‑M2/91‑2 (MQ=255) ttAAAGAAGCGCAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATc < 1:3661434‑M2/91‑2 (MQ=255) tAAAGAAGCGCAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGGTTTAAGGGCATca < 1:1316646‑M2/91‑3 (MQ=255) aagaagCGCAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGatgcccttaaaacaggacaccagt < 1:3383502‑M1/91‑25 (MQ=255) aagaagCGCAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATcagt < 1:490811‑M2/91‑5 (MQ=255) agaagCGCAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATcagtt < 1:2851427‑M2/91‑6 (MQ=255) gaagCGCAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATcagttt < 1:3776674‑M2/91‑7 (MQ=255) agCGCAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGttttt < 1:1359559/91‑1 (MQ=255) gcgcAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGtttttt < 1:2220897/91‑1 (MQ=255) cAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTtat < 1:3143138/91‑1 (MQ=255) cAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTtag > 1:3816288/1‑90 (MQ=255) aaCATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTtata < 1:3015184/91‑1 (MQ=255) aCATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGatgcccttaaaacaggacaccagtttatgattgt < 1:3064218‑M1/91‑35 (MQ=255) aCATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATAc < 1:1807320/91‑1 (MQ=255) aCATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATAc < 1:2152814/91‑1 (MQ=255) cATGGAAATAATCAACCATCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTATAAAGGGCATCAGTTGTTTTATACg > 1:3384810/1‑91 (MQ=255) aTGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACga > 1:1986379/1‑91 (MQ=255) ggAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTTAGGGCATCAGTTTTTTTATACgaga > 1:3871363/1‑91 (MQ=255) ggAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTGAGGGCATCAGTTTTTTTATACgaga > 1:3871335/1‑91 (MQ=255) ggAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACgaga > 1:1989264/1‑91 (MQ=255) ggAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACgaga > 1:3871228/1‑91 (MQ=255) ggAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACgaga > 1:4004447/1‑91 (MQ=255) gAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGATTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGAt > 1:462240/1‑91 (MQ=255) aaaTAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATa > 1:1711225/1‑91 (MQ=255) ataatCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATACa > 1:888268/1‑91 (MQ=255) aatCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATACAtt > 1:3411678/1‑91 (MQ=255) aaCCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATACATTAGTc > 1:65957/1‑91 (MQ=255) aCCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATACATTAGTCa > 1:3114549/1‑91 (MQ=255) aCCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATACATTAGTCa > 1:413896/1‑91 (MQ=255) aCCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATACATTAGTCa > 1:2985073/1‑91 (MQ=255) cagcagTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATACATTAGTCAAt < 1:1157557/91‑1 (MQ=255) gcagTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATACATTAGTCAATTg < 1:133857/91‑1 (MQ=255) agTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATACATTAGTCAATTGaa < 1:2717762/91‑1 (MQ=255) ttAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATACATTAGTCAATTGAAAc < 1:3711359/91‑1 (MQ=255) tAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATACATTAGTCAATTGAAACt > 1:1967746/1‑91 (MQ=255) tAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATACATTAGTCAATTGAAACt < 1:4027791/91‑1 (MQ=255) aGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATACATTAGTCACTTGAAACTATg > 1:3760622/1‑91 (MQ=255) gAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATACATTAGTCAATTGAAACTATGc < 1:1511231/91‑1 (MQ=255) aataatTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATACATTAGTCAATTGAAACTATGCa < 1:355056/91‑1 (MQ=255) aataatTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATACATTAGTCAATTGAAACTATGCa < 1:344201/91‑1 (MQ=255) taattaatTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATACATTAGTCAATTGAAACTATGCATc < 1:1907694/91‑1 (MQ=255) attaattTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATACATTAGTCAATTGAAACTATGCATCAc < 1:4055343/91‑1 (MQ=255) ttaattTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATACATTAGTCAATTGAAACTATGCATCAca > 1:1542748/1‑90 (MQ=255) ttaattTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATACATTAGTCAATTGAAACTATGCATCACt > 1:2743488/1‑91 (MQ=255) aattTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATACATTAGTCAATTGAAACTATGCATCACTaa > 1:45790/1‑91 (MQ=255) attTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATACATTAGTCAATTGAAACTATGCATCACTaaa > 1:281896/1‑91 (MQ=255) tttGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATACATTAGTCAATTGAAACTATGCATCACTAAAt > 1:2420203/1‑91 (MQ=255) tGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATACATTAGTCAATTGAAACTATGCATCACTAAATGt < 1:4064543/91‑1 (MQ=255) aCAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATcagtttatgattgtacaaattaattattctttaactgctggttgattatttccatgt < 1:3064218‑M2/91‑58 (MQ=255) cAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATACATTAGTCAATTGAAACTATGCATCACTAAATGTATGa < 1:473709/91‑1 (MQ=255) aaTCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATACATTAGTCAATTGAAACTATGCATCACTAAATGTATGat < 1:1029769/91‑1 (MQ=255) tCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATACATTAGTCAATTGAAACTATGCATCACTAAATGTATGataa < 1:530118/91‑1 (MQ=255) cATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATACATTAGTCAATTGAAACTATGCATCACTAAATGTATGataat < 1:1575960/91‑1 (MQ=255) tAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATACATTAGTCAATTGAAACTATGCATCACTAAATGTATGataataa > 1:4091939/1‑91 (MQ=255) aaaCTGatgcccttaaaacaggacaccagtttatgattgtacaaattaattattctttaactgctggttgattatttccatgttgcgcttc < 1:2789207‑M1/91‑86 (MQ=255) aaaCTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATACATTAGTCAATTGAAACTATGCATCACTAAATGTATGataataat < 1:1728249/91‑1 (MQ=255) aaaCTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATACATTAGTCAATTGAAACTATGCATCACTAAATGTATGataataat < 1:1191554/91‑1 (MQ=255) aaaCTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATACATTAGTCAATTGAAACTATGCATCACTAAATGTATGataataat < 1:638429/91‑1 (MQ=255) aaCTGatgcccttaaaacaggacaccagtttatgattgtacaaattaattattctttaactgctggttgattatttccatgttgcgcttct < 1:2851427‑M1/91‑87 (MQ=255) aaCTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATACATTAGTCGATTGAAACTATGCATCACTAAATGTATGataataata < 1:3504128/91‑1 (MQ=255) aaCTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATACATTAGTCAATTGAAACTATGCATCACTAAATGTATGataataata > 1:2964973/1‑91 (MQ=255) aaCTGGTGTACTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATACATTAGTCAATTGAAACTATGCATCACTAAATGTATGataataata > 1:2087430/1‑91 (MQ=255) aCTGatgcccttaaaacaggacaccagtttatgattgtacaaattaattattctttaactgctggttgattatttccatgttgcgcttctt < 1:490811‑M1/91‑88 (MQ=255) aCTGatgcccttaaaacaggacaccagtttatgattgtacaaattaattattctttaactgctggttgattatttccatgttgcgcttctt < 1:3557081‑M1/91‑88 (MQ=255) aCTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATcagtttatgattgtacaaattaattattctttaactgctggttgattatttccatgttgcgcttctt < 1:3383502‑M2/91‑68 (MQ=255) cTGatgcccttaaaacaggacaccagtttatgattgtacaaattaattattctttaactgctggttgattatttccatgttgcgcttcttt < 1:30022‑M1/91‑89 (MQ=255) cTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATcagtttatgattgtacaaattaattattctttaactgctggttgattatttccatgttgcgcttcttt < 1:287587‑M2/91‑69 (MQ=255) cTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATACATTAGTCAATTGAAACTATGCATCACTAAATGTATGATAATAATaaa > 1:2389446/1‑91 (MQ=255) tGatgcccttaaaccaggacaccagtttatgattgtacaaattaattattctttaactgctggttgattatttccatgttgcgcttcttta < 1:1316646‑M1/91‑90 (MQ=255) gatgcccttaaaacaggacaccagtttatgattgtacaaattaattattctttaactgctggttgattatttccatgttgcgcttctttaa < 1:3661434‑M1/91‑91 (MQ=255) gatgcccttaaaacaggacaccagtttatgattgtacaaattaattattctttaactgctggttgattatttccatgttgcgcttctttaa > 1:1674735‑M1/1‑1 (MQ=255) gatgcccttaaaacaggacaccagtttatgattgtacaaattaattattctttaactgctggttgattatttccatgttgcgcttctttaa < 1:4110881‑M1/91‑91 (MQ=255) | CTGAAGAAGTTGAGCAAGCAATTAAAGAAGCGCAACATGGAAATAATCAACCAGCAGTTAAAGAATAATTAATTTGTACAATCATAAACTGGTGTCCTGTTTTAAGGGCATCAGTTTTTTTATACGAGATACATTAGTCAATTGAAACTATGCATCACTAAATGTATGATAATAATAAAAG > USA300TCH1516_ALE/1330458‑1330638 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |