| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1355713 = | 90 (0.920) | 10 (0.120) | 7/138 | NT | 11.7% | intergenic (+3/+51) | USA300HOU_RS06740/yclM | hypothetical protein/Aspartokinase 3 |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1355761 = | 74 (0.870) | intergenic (+51/+3) | USA300HOU_RS06740/yclM | hypothetical protein/Aspartokinase 3 | |||||
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
ATTAAGCTACTATCAATTTTTTATTTTAAAATTTGTAGTAGGTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATATTAGTTTTTATCACACAAGTTTTTTAATGCAACCCCGTG > USA300TCH1516_ALE/1355623‑1355802 | gtagatgatgctgaaaaagctgtattatctacatatgagttttgctatcacggggttgcattaaaaaacttgtgtgataaaaactaatata < 1:1807758‑M1/1‑1 (MQ=255) tagatgatgctgaaaaagctgtattatctacatatgagttttgctatcacggggttgcattaaaaaacttgtgtgataaaaactaatataa > 1:814174‑M1/90‑91 (MQ=255) tAAGCTACTATCAATTTTTTATTTTAAAATTTGTAGTAGGTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAA < 1:1185119‑M1/91‑1 (MQ=255) agatgatgctgaagaagctgtattatctacatatgagttttgcgatcacggggttgcattaaaaaacttgtgtgataaaaactaatataaa > 1:4153993‑M1/89‑91 (MQ=255) gatgatgctgaaaaagctgtattatctacatatgagttttgctatcacggggttgcattaaaaaacttgtgtgataaaaactaatataaaa < 1:3529596‑M1/4‑1 (MQ=255) aaGCTACTATCAATTTTTTATTTTAAAATTTGTAGTAGGTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAA < 1:1074516‑M1/91‑1 (MQ=255) gCTACTATCAATTTTTTATTTTAAAATTTGTAGTAGGTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGC > 1:4103918‑M1/1‑91 (MQ=255) gCTACTATCAATTTTTTATTTTAAAATTTGTAGTAGGTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGC > 1:1368391‑M1/1‑91 (MQ=255) atgctgaaaaagctgtattatctacatatgagttttgctatcacggggttgcattaaaaaacttgtgtgataaaaactaatatAAAAGCaa > 1:438459‑M1/84‑91 (MQ=255) gctgaaaaagctgtattatctacatatgagttttgctatcacggggttgcattaaaaaacttgtgtgataaaaactaatatAAAAGCAAtt < 1:2153717‑M1/10‑1 (MQ=255) gctgaaaaagctgtattatctacatatgagttttgctatcacggggttgcattaaaaaacttgtgtgataaaaactaatatAAAAGCAAtt < 1:213572‑M1/10‑1 (MQ=255) ctaTCAATTTTTTATTTTAAAATTTGTAGTAGGTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATT > 1:2220427‑M1/1‑91 (MQ=255) tCAATTTTTTATTTTAAAATTTGTAGTAGGTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCAt < 1:3899300/91‑1 (MQ=255) aaTTTTTTATTTTAAAATTTGTAGTAGGTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATaa < 1:482599/91‑1 (MQ=255) aTTTTTTATTTTAAAATTTGTAGTAGGTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAAc < 1:175100/91‑1 (MQ=255) aTTTTTTATTTTAAAATTTGTAGTAGGTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAAc > 1:1030025/1‑91 (MQ=255) ttttattttaAAATTTGTAGTAGGTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGATAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCa < 1:3502999/91‑1 (MQ=255) ttttattttaAAATTTGTAGTAGGTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCa < 1:2054793/91‑1 (MQ=255) ttttattttaAAATTTGTAGTAGGTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCa < 1:2495554/91‑1 (MQ=255) tttattttaAAATTTGTAGTAGGTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAg < 1:2645616/91‑1 (MQ=255) tttattttaAAATTTGTAGTAGGTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAg < 1:1242878/91‑1 (MQ=255) ttattttaAAATTTGTAGTAGGTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGt < 1:2815705/91‑1 (MQ=255) ttattttaAAATTTGTAGTAGGTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGt > 1:967254/1‑91 (MQ=255) ttaAAATTTGTAGTAGGTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAAt < 1:3806249/91‑1 (MQ=255) ttaAAATTTGTAGTAGGTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAAt > 1:2788844/1‑91 (MQ=255) ttaAAATTTGTAGTAGGTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAAt > 1:2788804/1‑91 (MQ=255) taAAATTTGTAGTAGGTGAGCAACGCATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATa < 1:3850229/91‑1 (MQ=255) aaaaTTTGTAGTAGGTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCgtaacacatgtattcaa < 1:1490494‑M1/91‑18 (MQ=255) aaaaTTTGTAGTAGGTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCgtaacacatgtattcaa < 1:2314902‑M1/91‑18 (MQ=255) aaaTTTGTAGTAGGTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACa > 1:38364/1‑91 (MQ=255) aTTTGTAGTAGGTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACAtg > 1:3107132/1‑91 (MQ=255) aTTTGTAGTAGGTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACAtg > 1:982637/1‑91 (MQ=255) aTTTGTAGTAGGTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACAtg > 1:982831/1‑91 (MQ=255) tttGTAGTAGGTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACAtgt < 1:1726775/91‑1 (MQ=255) gtagtaGGTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGtt < 1:1727967/91‑1 (MQ=255) gtagtaGGTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGtt > 1:1766371/1‑91 (MQ=255) gtagtaGGTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGtt < 1:195714/91‑1 (MQ=255) tagtagGTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTa < 1:734346/91‑1 (MQ=255) gagttttgctatcacggggttgcattaaaaaacttgtgtgataaaaactaatatAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTAc > 1:1578713‑M1/55‑91 (MQ=255) gTAGGTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACg < 1:1725015‑M2/91‑2 (MQ=255) aGGTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACgaa > 1:491764‑M2/1‑88 (MQ=255) ggTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACgaat > 1:1028170‑M2/1‑87 (MQ=255) ggTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACgaat > 1:1429968‑M2/1‑87 (MQ=255) ggTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGGTACgaat < 1:2075621‑M2/91‑5 (MQ=255) gTGAGCGACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACgtatt < 1:3221210‑M2/91‑6 (MQ=255) gTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCgtaacacatgtattcaactgcgttatgaatt < 1:24749‑M1/91‑32 (MQ=255) gTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACgaatt > 1:2532512‑M2/1‑86 (MQ=255) gctatcacggggttgcattaaaaaacttgtgtgataaaaactaatatAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGc > 1:1750222‑M1/48‑91 (MQ=255) ctatcacggggttgcattaaaaaacttgtgtgataaaaactaatatAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCt > 1:3355651‑M1/47‑91 (MQ=255) aGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACgaattgct > 1:196564‑M2/1‑83 (MQ=255) cacggggttgcattaaaaaacttgtgtgataaaaactaatatAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTta > 1:2258531‑M1/43‑91 (MQ=255) aCGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCgtaacacatgtattcaactgcgttatgaattgcttttt < 1:1066625‑M1/91‑39 (MQ=255) cGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTtat < 1:1279092/91‑1 (MQ=255) gTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTtata < 1:2109446/91‑1 (MQ=255) gTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTtata < 1:952248/91‑1 (MQ=255) tATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTatat < 1:2624435/91‑1 (MQ=255) aTTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCGTAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATAtt < 1:3598916/91‑1 (MQ=255) aTTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATAtt < 1:597257/91‑1 (MQ=255) aTTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATAtt > 1:2944545/1‑91 (MQ=255) aTTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATAtt < 1:2661946/91‑1 (MQ=255) aTTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATAtt > 1:1101404/1‑91 (MQ=255) ttAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATATTa > 1:1482481/1‑91 (MQ=255) ggttgcattaaaaaacttgtgtgataaaaactaatatAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATATTa > 1:2309395‑M1/38‑91 (MQ=255) ggATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCgtaacacatgtattcaactgcgttatgaattgctttttcttaattat < 1:2652836‑M1/91‑48 (MQ=255) gCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATATTAGTTTTTAt > 1:1836778/1‑91 (MQ=255) gCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATATTAGTTTTTAt > 1:1340215/1‑91 (MQ=255) aaTCCAGAGTACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATATTAGTTTTTATca > 1:2093611/1‑91 (MQ=255) aaTCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATATTAGTTTTTATca < 1:309110/91‑1 (MQ=255) aTCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATATTAGTTTTTATcac < 1:2535969/91‑1 (MQ=255) cAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATATTAGTTTTTATcacaca < 1:2030962/91‑1 (MQ=255) cAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATATTAGTTTTTATcacaca < 1:2004751/91‑1 (MQ=255) cAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATATTAGTTTTTATcacaca < 1:1478530/91‑1 (MQ=255) agagAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATATTAGTTTTTATCACACaa > 1:899838/1‑91 (MQ=255) ttgtgtgataaaaactaatatAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATATTAGTTTTTATCACACAAg > 1:3049036‑M1/22‑91 (MQ=255) gaACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATATTAGTTTTTATCACACAAGtt < 1:1030388/91‑1 (MQ=255) gaACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATATTAGTTTTTATCACACAAGtt < 1:3371393/91‑1 (MQ=255) gaACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATATTAGTTTTTATCACACAAGtt < 1:3076166/91‑1 (MQ=255) aaCAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATATTAGTTTTTATCACACAAGttt > 1:2746143/1‑91 (MQ=255) aCAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATATTAGTTTTTATCACACAAGtttt < 1:2005766/91‑1 (MQ=255) aCAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATATTAGTTTTTATCACACAAGtttt < 1:67442/91‑1 (MQ=255) ataaataaTTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATATTAGTTTTTATCACACAAGTTTTTTa < 1:1560571/91‑1 (MQ=255) taaataaTTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATATTAGTTTTTATCACACAAGTTTTTTaa > 1:1935107/1‑91 (MQ=255) taaataaTTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATATTAGTTTTTATCACACAAGTTTTTTaa > 1:2961441/1‑91 (MQ=255) aaataaTTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATATTAGTTTTTATCACACAAGTTTTTTAAt > 1:2217408/1‑91 (MQ=255) aaataaTTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATATTAGTTTTTATCACACAAGTTTTTTAAt > 1:2217527/1‑91 (MQ=255) aataatTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATATTAGTTTTTATCACACAAGTTTTTTAATg < 1:348570/91‑1 (MQ=255) aataatTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATATTAGTTTTTATCACACAAGTTTTTTAATg < 1:2129672/91‑1 (MQ=255) aataatTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATATTAGTTTTTATCACACAAGTTTTTTAATg < 1:2979490/91‑1 (MQ=255) aataatTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATATTAGTTTTTATCACACAAGTTTTTTAATg < 1:2978630/91‑1 (MQ=255) aataatTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATATTAGTTTTTATCACACAAGTTTTTTAATg < 1:2461257/91‑1 (MQ=255) ataatTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACgaattgctttttcttaattatttattgttctctggattgcatcc < 1:2652836‑M2/91‑45 (MQ=255) ataatTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATATTAGATTTTATCACACAAGTTTTTTAATGc > 1:3785903/1‑91 (MQ=255) atTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATATTAGTTTTTATCACACAAGTTTTTTAATGCAAc < 1:3673179/91‑1 (MQ=255) ttAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATATTAGTTTTTATCACACAAGTTTTTTAATGCAAcc < 1:2259451/91‑1 (MQ=255) ttAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATATTAGTTTTTATCACACAAGTTTTTTAATGCAAcc < 1:3417258/91‑1 (MQ=255) ttAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATATTAGTTTTTATCACACAAGTTTTTTAATGCAAcc < 1:3155471/91‑1 (MQ=255) aGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATATTAGTTTTTATCACACAAGTTTTTTAATGCAACCCCg > 1:2332734/1‑91 (MQ=255) aGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATATTAGTTTTTATCACACAAGTTTTTTAATGCAACCCCg > 1:843435/1‑91 (MQ=255) aaaaaGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACgaattgctttttcttaattatttattgttctctggattgcatccttaatacgt < 1:1066625‑M2/91‑54 (MQ=255) aaaaaGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATATTAGTTTTTATCACACAAGTTTTTTAATGCAACCCCGTg < 1:2903084/91‑1 (MQ=255) | ATTAAGCTACTATCAATTTTTTATTTTAAAATTTGTAGTAGGTGAGCAACGTATTAAGGATGCAATCCAGAGAACAATAAATAATTAAGAAAAAGCAATTCATAACGCAGTTGAATACATGTGTTACGAATTGCTTTTATATTAGTTTTTATCACACAAGTTTTTTAATGCAACCCCGTG > USA300TCH1516_ALE/1355623‑1355802 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |