New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1383873 | 91 (0.930) | 6 (0.060) | 5/154 | NT | 6.4% | intergenic (+90/‑90) | acnA/USA300HOU_RS06875 | Aconitate hydratase A/Putative esterase |
? | USA300TCH1516_ALE | = 1383903 | 88 (0.930) | intergenic (+120/‑60) | acnA/USA300HOU_RS06875 | Aconitate hydratase A/Putative esterase |
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
AAAAATAGATATCACAGTAAAATTTTAATCGGTATTTGAGGCACTTTGATAGTGCTCAAAAATACTTCTATAAACTTTATGATATAATAGGTCGGTTCAAAACCTTTGTGTTCTTGGCCGGCCTCTTCTTGTATTTTATGTTAGAATGAGATATAAAGTTAAACTGAAAGAAGGCTTAAAA > USA300TCH1516_ALE/1383783‑1383963 | aaaaaTAGATATCACAGTAAAATTTTAATCGGTATTTGAGGCACTTTGATAGTGCTCAAAAATACTTCTATAAACTTTATGATATAATAGG < 1:2745335‑M1/91‑1 (MQ=255) aaTAGATATCACAGTAAAATTTTAATCGGTATTTGAGGCACTTTGATAGTGCTCAAAAATACTTCTATAAACTTTATGATATAATAGGTCg > 1:1473210/1‑91 (MQ=255) tAGATATCACAGTAAAATTTTAATCGGTATTTGAGGCACTTTGATAGTGCTCAAAAATACTTCTATAAACTTTATGATATAATAGGTCGGt > 1:3042904/1‑91 (MQ=255) tAGATATCACAGTAAAATTTTAATCGGTATTTGAGGCACTTTGATAGTGCTCAAAAATACTTCTATAAACTTTATGATATAATAGGTCGGt < 1:3194787/91‑1 (MQ=255) tAGATATCACAGTAAAATTTTAATCGGTATTTGAGGCACTTTGATAGTGCTCAAAAATACTTCTATAAACTTTATGATATAATAGGTCGGt > 1:1906541/1‑91 (MQ=255) tAGATATCACAGTAAAATTTTAATCGGTATTTGAGGCACTTTGATAGTGCTCAAAAATACTACTATAAACTTTATGATATAATAGGTCGGt > 1:3322976/1‑91 (MQ=255) gATATCACAGTAAAATTTTAATCGGTATTTGAGGCACTTTGATAGTGCTCAAAAATACTTCTATAAACTTTATGATATAATAGGTCGGTTc < 1:1648574/91‑1 (MQ=255) gATATCACAGTAAAATTTTAATCGGTATTTGAGGCACTTTGATAGTGCTCAAAAATACTTCTATAAACTTTATGATATAATAGGTCGGTTc < 1:2251531/91‑1 (MQ=255) gATATCACAGTAAAATTTTAATCGGTATTTGAGGCACTTTGATAGTGCTCAAAAATACTTCTATAAACTTTATGATATAATAGGTCGGTTc < 1:2251608/91‑1 (MQ=255) tatCACAGTAAAATTTTAATCGGTATTTGAGGCACTTTGATAGTGCTCAAAAATACTTCTATAAACTTTATGATATAATAGGTCGGTTCaa < 1:3755375/91‑1 (MQ=255) tatCACAGTAAAATTTTAATCGGTATTTGAGGCACTTTGATAGTGCTCAAAAATACTTCTATAAACTTTATGATATAATAGGTCGGTTCaa > 1:468771/1‑91 (MQ=255) tatCACAGTAAAATTTTAATCGGTATTTGAGGCACTTTGATAGTGCTCAAAAATACTTCTATAAACTTTATGATATAATAGGTCGGTTCaa > 1:2099740/1‑91 (MQ=255) tatCACAGTAAAATTTTAATCGGTATTTGAGGCACTTTGATAGTGCTCAAAAATACTTCTATAAACTTTATGATATAATAGGTCGGTTCaa < 1:1405060/91‑1 (MQ=255) tatCACAGTAAAATTTTAATCGGTATTTGAGGCACTTTGATAGTGCTCAAAAATACTTCTATAAACTTTATGATATAATAGGTCGGTTCaa > 1:3434475/1‑91 (MQ=255) 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tttAATCGGTATTTGAGGCACTTTGATAGTGCTCAAAAATACTTCTATAAACTTTATGATATAATAGGTCGGTTCAAAACCTTTGTGTTCt < 1:3053951/91‑1 (MQ=255) ttAATCGGTATTTGAGGCACTTTGATAGTGCTCAAAAATACTTCTATAAACTTTATGATATAATAGGccggccaagaacacaaaggttttg < 1:893101‑M1/91‑25 (MQ=255) ttAATCGGTATTTGAGGCACTTTGATAGTGCTCAAAAATACTTCTATAAACTTTATGATATAATAGGTCGGTTCAAAACCTTTGTGTTCtt > 1:2826120/1‑91 (MQ=255) ttAATCGGTATTTGAGGCACTTTGATAGTGCTCAAAAATACTTCTATAAACTTTATGATATAATAGGTCGGTTCAAAACCTTTGTGTTCtt > 1:4048967/1‑91 (MQ=255) aaTCGGTATTTGAGGCACTTTGATAGTGCTCAAAAATACTTCTATAAACTTTATGATATAATAGGTCGGTTCAAAACCTTTGTGTTCTTgg > 1:2866761/1‑91 (MQ=255) aaTCGGTATTTGAGGCACTTTGATAGTGCTCAAAAATACTTCTATAAACTTTATGATATAATAGGTCGGTTCAAAACCTTTGTGTTCTTgg > 1:3920238/1‑91 (MQ=255) aaTCGGTATTTGAGGCACTTTGATAGTGCTCAAAAATACTTCTATAAACTTTATGATATAATAGGTCGGTTCAAAACCTTTGTGTTCTTgg > 1:1528566/1‑91 (MQ=255) aaTCGGTATTTGAGGCACTTTGATAGTGCTCAAAAATACTTCTATAAACTTTATGATATAATAGGTCGGTTCAAAACCTTTGTGTTCTTgg > 1:3565919/1‑91 (MQ=255) aTCGGTATTTGAGGCACTTTGATAGTGCTCAAAAATACTTCTATAAACTTTATGATATAATAGGTCGGTTCAAAACCTTTGTGTTCTTggc < 1:1248211/91‑1 (MQ=255) tCGGTATTTGAGGCACTTTGATAGTGCTCAAAAATACTTCTATAAACTTTATGATATAATAGGTCGGTTCAAAACCTTTGTGTTCTTggcc < 1:1040235/91‑1 (MQ=255) tCGGTATTTGAGGCACTTTGATAGTGCTCAAAAATACTTCTATAAACTTTATGATATAATAGGTCGGTTCAAAACCTTTGTGTTCTTggcc > 1:2483840/1‑91 (MQ=255) cGGTATTTGAGGCACTTTGATAGTGCTCAAAAATACTTCTATAAACTTTATGATATAATAGGTCGGTTCAAAACCTTTGTGTTCTTggccg < 1:1545961/91‑1 (MQ=255) gTATTTGAGGCACTTTGATAGTGCTCAAAAATACTTCTATAAACTTTATGATATAATAGGccggccaagaacacaaaggttttgaaccgac < 1:548352‑M1/91‑32 (MQ=255) gTATTTGAGGCACTTTGATAGTGCTCAAAAATACTTCTATAAACTTTATGATATAATAGGTCGGTTCAAAACCTTTGTGTTCTTGGCCGGc < 1:2361689‑M2/91‑2 (MQ=255) tATTTGAGGCACTTTGATAGTGCTCAAAAATACTTCTATAAACTTTATGATATAATAGGccggccaagaacacaaaggttttgaaccgacc < 1:3965778‑M1/91‑33 (MQ=255) tATTTGAGGCACTTTGATAGTGCTCAAAAATACTTCTATAAACTTTATGATATAATAGGccggccaagaacacaaaggttttgaaccgacc < 1:3965532‑M1/91‑33 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |