| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1454597 = | 138 (1.400) | 9 (0.100) | 5/146 | NT | 7.3% | coding (964/1356 nt) | arlS | Signal transduction histidine‑protein kinase ArlS |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1454633 = | 102 (1.140) | coding (928/1356 nt) | arlS | Signal transduction histidine‑protein kinase ArlS | |||||
Only 100 of 170 total aligned reads displayed.
ATAATTGTTCGAATTGATGAGGTTTCATTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATT > USA300TCH1516_ALE/1454507‑1454686 | tgaatcgtatcataaaattagtcgaagaattacttgaattgactaaaggagatgtaaatgacatttcttctgaagcacagaccgtgcatat < 1:2140400‑M1/1‑1 (MQ=255) aatcgtatcataaaattagtcgaagaattacttgaattgactaaaggagatgtaaatgacatttcttctgaagcacagaccgtgcataTTa < 1:1936580‑M1/3‑1 (MQ=255) aatTGTTCGAATTGATGAGGTTTCATTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTa > 1:1762425/1‑91 (MQ=255) aatTGTTCGAATTGATGAGGTTTCATTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTa > 1:462172/1‑91 (MQ=255) atcgtatcataaaattagtcgaagaattacttgaattgactaaaggagatgtaaatgacatttcttctgaagcacagaccgtgcataTTaa > 1:1177478‑M1/88‑91 (MQ=255) atcgtatcataaaattagtcgaagaattacttgaattgactaaaggagatgtaaatgacatttcttctgaagcacagaccgtgcataTTaa < 1:1927652‑M1/4‑1 (MQ=255) atcgtatcataaaattagtcgaagaattacttgaattgactaaaggagatgtaaatgacatttcttctgaagcacagaccgtgcataTTaa < 1:4048628‑M1/4‑1 (MQ=255) tGTTCGAATTGATGAGGTTTCATTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATg > 1:2513597/1‑91 (MQ=255) tGTTCGAATTGATGAGGTTTCATTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATg < 1:2120384/91‑1 (MQ=255) tGTTCGAATTGATGAGGTTTCATTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATg > 1:3304553/1‑91 (MQ=255) tGTTCGAATTGATGAGGTTTCATTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATg > 1:754379/1‑91 (MQ=255) cgtatcataaaattagtcgaagaattacttgaattgactaaaggagatgtaaatgacatttcttctgaagcacagaccgtgcataTTAATg > 1:3285624‑M1/86‑91 (MQ=255) cgtatcataaaattagtcgaagaattacttgaattgactaaaggagatgtaaatgacatttcttctgaagcacagaccgtgcataTTAATg < 1:2925585‑M1/6‑1 (MQ=255) gtatcataaaattagtcgaagaattacttgaattgactaaaggagatgtaaatgacatttcttctgaagcacagaccgtgcataTTAATGa > 1:3516348‑M1/85‑91 (MQ=255) gtatcataaaattagtcgaagaattacttgaattgactaaaggagatgtaaatgacatttcttctgaagcacagaccgtgcataTTAATGa < 1:3884455‑M1/7‑1 (MQ=255) gTTCGAATTGATGAGGTTTCATTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGa > 1:2227508/1‑91 (MQ=255) gTTCGAATTGATGAGGTTTCATTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGa > 1:920672/1‑91 (MQ=255) ttCGAATTGATGAGGTTTCATTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAg < 1:2583247/91‑1 (MQ=255) tCGAATTGATGAGGTTTCATTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAgt < 1:2111928/91‑1 (MQ=255) aaTTGATGAGGTTTCATTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTa < 1:3672943/91‑1 (MQ=255) aTTGATGAGGTTTCATTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTAt < 1:1510264/91‑1 (MQ=255) ttGATGAGGTTTCATTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTAtt < 1:3916603/91‑1 (MQ=255) gatgaGGTTTCATTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTcg < 1:374988/91‑1 (MQ=255) atgaGGTTTCATTTTAATTTCTATATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGACTGTATTcgc > 1:3971346/1‑91 (MQ=255) atgaGGTTTCATTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTcgc < 1:2003555/91‑1 (MQ=255) atgaGGTTTCATATTAATATCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCACGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTcgc < 1:1373971/91‑1 (MQ=255) tgaGGTTTCATTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTcgct < 1:2797669/91‑2 (MQ=255) tgaGGTTGCATTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTcgcg < 1:2085929/91‑1 (MQ=255) gaGGTTTCATTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCGGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTcgctc < 1:826500/91‑3 (MQ=255) gaGGTTTCATTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCgcga > 1:3631026/1‑91 (MQ=255) aGGTTTCATTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTcgctcg < 1:2612896/91‑4 (MQ=255) aGGTTTCATTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTcgctcg < 1:693363/91‑4 (MQ=255) aGGTTTCATTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTcgctcg < 1:693500/91‑4 (MQ=255) aGGTTTCATTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCgcgag > 1:885633/1‑91 (MQ=255) aGGTTTCATTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCgcgag < 1:1243251/91‑1 (MQ=255) aGGTTTCATTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCgcgag > 1:1660157/1‑91 (MQ=255) ggTTTCATTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTcgctcgc < 1:2255065/91‑5 (MQ=255) ggTTTCATTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCgcgagc > 1:2326598/1‑91 (MQ=255) ggTTTCATTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCgcgagc > 1:2373256/1‑91 (MQ=255) gTTTCATTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCgcgagcg < 1:2891992/91‑1 (MQ=255) tCATTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAAt < 1:2829696/91‑1 (MQ=255) tCATTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAAt > 1:1640594/1‑91 (MQ=255) aTTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAAttt > 1:3221897/1‑91 (MQ=255) aTTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAAttt < 1:3568164/91‑1 (MQ=255) ttAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCTGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTtcat < 1:1449083/91‑1 (MQ=255) acttgaattgactaaaggagatgtaaatgacatttcttctgaagcacagaccgtgcataTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTtcatca > 1:1013886‑M1/60‑91 (MQ=255) acttgaattgactaaaggagatgtaaatgacatttcttctgaagcacagaccgtgcataTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTtcatca > 1:1011466‑M1/60‑91 (MQ=255) ttgaattgactaaaggagatgtaaatgacatttcttctgaagcacagaccgtgcataTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCAtt > 1:1223942‑M1/58‑91 (MQ=255) ttCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTa > 1:2379294/1‑91 (MQ=255) tCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTaa > 1:1571972/1‑91 (MQ=255) cTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAat > 1:2029426/1‑91 (MQ=255) cTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAat > 1:342990/1‑91 (MQ=255) cTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAat > 1:343350/1‑91 (MQ=255) tAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAata > 1:2211845/1‑91 (MQ=255) tAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAata > 1:1887201/1‑91 (MQ=255) aGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAatat > 1:4146939/1‑91 (MQ=255) aGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAatat > 1:95595/1‑91 (MQ=255) aTTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGc > 1:3188960/1‑91 (MQ=255) aTTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGc < 1:1475103/91‑1 (MQ=255) ttttAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCAc < 1:1851/91‑1 (MQ=255) tttAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACg > 1:1657041/1‑91 (MQ=255) ttAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACgg < 1:1595541/91‑1 (MQ=255) ttAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACgg < 1:2483278/91‑1 (MQ=255) ttAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACgg > 1:2198231/1‑91 (MQ=255) tAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGt > 1:3811683/1‑91 (MQ=255) gATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCt < 1:3259360/91‑1 (MQ=255) aTGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCtg < 1:2195667/91‑1 (MQ=255) tGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCtgt < 1:2742799/91‑1 (MQ=255) tCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGc < 1:1638716/91‑1 (MQ=255) gATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTc < 1:4042477/91‑1 (MQ=255) gTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCagaag > 1:3482225/1‑91 (MQ=255) tATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCagaaga < 1:39274/91‑1 (MQ=255) tATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCagaaga < 1:35806/91‑1 (MQ=255) tATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCagaaga < 1:38643/91‑1 (MQ=255) tCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGaaa > 1:987496/1‑91 (MQ=255) tCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGaaa > 1:769467/1‑91 (MQ=255) tCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTCCAGAAGaaa > 1:3967342/1‑91 (MQ=255) cAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAAt > 1:1487087/1‑91 (MQ=255) cAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAAt < 1:2017461/91‑1 (MQ=255) atttGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGt > 1:770054/3‑91 (MQ=255) aaTTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGt < 1:2101928/91‑1 (MQ=255) aaTTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGt < 1:3348939/91‑1 (MQ=255) aaTTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGt < 1:2399026/91‑1 (MQ=255) aaTTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGt < 1:211264/91‑1 (MQ=255) aTTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTc < 1:2002138/91‑1 (MQ=255) ttGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCa > 1:1710306/1‑91 (MQ=255) tGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCAt > 1:2225527/1‑91 (MQ=255) aTCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACa > 1:1032673/1‑91 (MQ=255) aTCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACa < 1:4048413/91‑1 (MQ=255) aTCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACa > 1:2706075/1‑91 (MQ=255) tCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACAt > 1:1092877/1‑91 (MQ=255) cAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACAtc < 1:264433/91‑1 (MQ=255) aGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACAtct > 1:2302230/1‑91 (MQ=255) cAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTa > 1:3239559/1‑91 (MQ=255) aaTTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAg > 1:2059832/1‑91 (MQ=255) aaTTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAg < 1:1090701/91‑1 (MQ=255) aaTTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAg > 1:3831579/1‑91 (MQ=255) aTTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGt < 1:3922401/91‑1 (MQ=255) aTTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGt < 1:3001352/91‑1 (MQ=255) tttAATGAGTGTATTAGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGCAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAAtt > 1:3533738/1‑91 (MQ=255) | ATAATTGTTCGAATTGATGAGGTTTCATTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATT > USA300TCH1516_ALE/1454507‑1454686 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |