New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1454597 = | 138 (1.400) | 9 (0.100) | 5/146 | NT | 7.3% | coding (964/1356 nt) | arlS | Signal transduction histidine‑protein kinase ArlS |
? | USA300TCH1516_ALE | 1454633 = | 102 (1.140) | coding (928/1356 nt) | arlS | Signal transduction histidine‑protein kinase ArlS |
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
CTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGTAATTCTTCGACTAATTTTATGATACGATTCAT > USA300TCH1516_ALE/1454543‑1454723 | cTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAat > 1:342990/1‑91 (MQ=255) cTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAat > 1:1535096/1‑91 (MQ=255) tAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAata > 1:2211845/1‑91 (MQ=255) aGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAatat > 1:95595/1‑91 (MQ=255) aGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAatat > 1:4146939/1‑91 (MQ=255) aTTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGc > 1:3188960/1‑91 (MQ=255) aTTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGc < 1:1475103/91‑1 (MQ=255) tttttAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCa < 1:1657761/91‑1 (MQ=255) ttttAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCAc < 1:1851/91‑1 (MQ=255) tttAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACg > 1:1657041/1‑91 (MQ=255) ttAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACgg < 1:3807927/91‑1 (MQ=255) ttAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACgg < 1:758240/91‑1 (MQ=255) ttAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACgg > 1:2198231/1‑91 (MQ=255) tAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGt > 1:3811683/1‑91 (MQ=255) aGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTc > 1:1948181/1‑91 (MQ=255) aGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTc > 1:1490533/1‑91 (MQ=255) aGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTc < 1:2933689/91‑1 (MQ=255) gATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCt < 1:3259360/91‑1 (MQ=255) tGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCtgt < 1:2742799/91‑1 (MQ=255) tCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGc < 1:1638716/91‑1 (MQ=255) cAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCt < 1:2044182/91‑1 (MQ=255) gATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTc < 1:4042477/91‑1 (MQ=255) gTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCagaag > 1:3482225/1‑91 (MQ=255) tATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCagaaga < 1:35775/91‑1 (MQ=255) tATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCagaaga < 1:38643/91‑1 (MQ=255) tATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCagaaga < 1:39274/91‑1 (MQ=255) tCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGaaa > 1:769467/1‑91 (MQ=255) tCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGaaa > 1:987496/1‑91 (MQ=255) tCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTCCAGAAGaaa > 1:3967342/1‑91 (MQ=255) cAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAAt < 1:1366495/91‑1 (MQ=255) cAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAAt < 1:2017461/91‑1 (MQ=255) aaTTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGt < 1:2101928/91‑1 (MQ=255) aaTTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGt < 1:2399026/91‑1 (MQ=255) aTTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTc < 1:2002138/91‑1 (MQ=255) ttGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCa > 1:1710306/1‑91 (MQ=255) tGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCAt > 1:2225395/1‑91 (MQ=255) tAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTa > 1:1032322/1‑91 (MQ=255) aTCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACa > 1:1910849/1‑91 (MQ=255) aTCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACa > 1:2706075/1‑91 (MQ=255) aTCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACa > 1:1032673/1‑91 (MQ=255) tCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACAt > 1:1092877/1‑91 (MQ=255) cAGGATGCTATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACAtc < 1:3395830/91‑1 (MQ=255) cAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACAtc < 1:264433/91‑1 (MQ=255) cAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACAtc > 1:3250106/1‑91 (MQ=255) cAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACAtc < 1:162094/91‑1 (MQ=255) aGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACAtct > 1:2302230/1‑91 (MQ=255) aGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACAtct > 1:2301796/1‑91 (MQ=255) aTGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCt > 1:3611109/1‑91 (MQ=255) gCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCttt > 1:2137710/1‑91 (MQ=255) cAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTa > 1:3239559/1‑91 (MQ=255) aaTTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAg < 1:1090701/91‑1 (MQ=255) aaTTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAg > 1:2059832/1‑91 (MQ=255) aaTTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATACACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAg > 1:3311871/1‑91 (MQ=255) aTTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGt < 1:4042953/91‑1 (MQ=255) aTTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGt < 1:3001352/91‑1 (MQ=255) ttGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCACCTTTAGTc > 1:3974670/1‑91 (MQ=255) tttAATGAGTGTATTAGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGCAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAAtt > 1:3533738/1‑91 (MQ=255) taatgatgaaattcgctcgcgaatacactcattaaTATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCa > 1:807401‑M2/36‑91 (MQ=255) AATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCaa < 1:2080247‑M1/91‑1 (MQ=255) atgatgaaattcgctcgcgaatacactcattaaTATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTGAAg > 1:3212736‑M2/34‑91 (MQ=255) atgatgaaattcgctcgcgaatacactcattaaTATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAg > 1:2575405‑M2/34‑91 (MQ=255) ATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAg > 1:3609056‑M1/1‑91 (MQ=255) ATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAg < 1:2009776‑M1/91‑1 (MQ=255) tgatgaaattcgctcgcgaatacactcattaaTATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGt > 1:1473851‑M2/33‑91 (MQ=255) tgatgaaattcgctcgcgaatacactcattaaTATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGt > 1:1011466‑M2/33‑91 (MQ=255) TGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGt > 1:1007721‑M1/1‑91 (MQ=255) gtgtATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGTAAt > 1:3195196/1‑91 (MQ=255) gtgtATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGTAAt > 1:2636075/1‑91 (MQ=255) aTTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGTAAttctt > 1:953846/1‑91 (MQ=255) aTTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGTAAttctt > 1:77265/1‑91 (MQ=255) ttCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGTAAttcttc < 1:2160619/91‑1 (MQ=255) ttCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGTAAttcttc < 1:2403755/91‑1 (MQ=255) ttCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGTAAttcttc > 1:1820027/1‑91 (MQ=255) ttCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGTAAttcttc > 1:3905020/1‑91 (MQ=255) tcgctcgcgaatacactcattaaTATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGTAATTCTTCg > 1:449183‑M2/24‑91 (MQ=255) tCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGTAATTCTTCg < 1:220382/91‑1 (MQ=255) cgcgAGCGAATTTCATTATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGTAATTCTTCGa < 1:3211335/91‑1 (MQ=255) gcgagcgaATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGTAATTCTTCGAc < 1:2694135/91‑1 (MQ=255) cgagcgaATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGTAATTCTTCGACt > 1:3252171/1‑91 (MQ=255) cgagcgaATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGTAATTCTTCGACt < 1:2789238/91‑1 (MQ=255) gcgaATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGTAATTCTTCGACTAAt > 1:3337594/1‑91 (MQ=255) gcgaATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGTAATTCTTCGACTAAt > 1:3477639/1‑91 (MQ=255) cgaATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGTAATTCTTCGACTAAtt > 1:4055003/1‑91 (MQ=255) gaATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGTAATTCTTCGACTAAttt < 1:1607538/91‑1 (MQ=255) aaTTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGTAATTCTTCGACTAAtttt < 1:1702549/91‑1 (MQ=255) tttCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGTAATTCTTCGACTAATTTTAt > 1:3580425/1‑91 (MQ=255) tttCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGTAATTCTTCGACTAATTTTAt > 1:3160778/1‑91 (MQ=255) tcattaaTATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGTAATTCTTCGACTAATTTTATGATAc < 1:3884455‑M2/84‑1 (MQ=255) tcattaaTATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGTAATTCTTCGACTAATTTTATGATAc > 1:3516348‑M2/8‑91 (MQ=255) tcattaaTATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGTAATTCTTCGACTAATTTTATGATAc < 1:2610567‑M2/84‑1 (MQ=255) cattaaTATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGTAATTCTTCGACTAATTTTATGATACg < 1:2925585‑M2/85‑1 (MQ=255) cattaaTATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGTAATTCTTCGACTAATTTTATGATACg > 1:3285624‑M2/7‑91 (MQ=255) ttaaTATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGTAATTCTTCGACTAATTTTATGATACGAt < 1:4048628‑M2/87‑1 (MQ=255) ttaaTATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGTAATTCTTCGACTAATTTTATGATACGAt < 1:1927652‑M2/87‑1 (MQ=255) ttaaTATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGTAATTCTTCGACTAATTTTATGATACGAt > 1:1177478‑M2/5‑91 (MQ=255) ttaaTATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGTAATTCTTCGACTAATTTTATGATACGAt < 1:1189906‑M2/87‑1 (MQ=255) taaTATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGTAATTCTTCGACTAATTTTATGATACGAtt > 1:2807161‑M2/4‑91 (MQ=255) taaTATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGTAATTCTTCGACTAATTTTATGATACGAtt > 1:3839429‑M2/4‑91 (MQ=255) aTATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGTAATTCTTCGACTAATTTTATGATACGATTCa < 1:2141788‑M2/90‑1 (MQ=255) tatGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGTAATTCTTCGACTAATTTTATGATACGATTCAt < 1:1370566/91‑1 (MQ=255) | CTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATGCAATTGTTTTAATGAGTGTATTCGCGAGCGAATTTCATCATTAATATGCACGGTCTGTGCTTCAGAAGAAATGTCATTTACATCTCCTTTAGTCAATTCAAGTAATTCTTCGACTAATTTTATGATACGATTCAT > USA300TCH1516_ALE/1454543‑1454723 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |