| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1507967 = | 79 (0.800) | 9 (0.110) | 8/128 | NT | 11.6% | intergenic (‑392/+83) | ald1/ypcP | Alanine dehydrogenase 1/5'‑3' exonuclease |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1508010 = | 74 (0.940) | intergenic (‑435/+40) | ald1/ypcP | Alanine dehydrogenase 1/5'‑3' exonuclease | |||||
Only 100 of 204 total aligned reads displayed.
GAAATATAATTCTTTATACTCTATTGATTAATCAAATATGTATCTATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTGGTTTAATTTTTCATAAAATCTTATACTTTTTAAAAAT > USA300TCH1516_ALE/1507877‑1508057 | cgaacatgaattacatgtttcaggaaaatatatttcatcccatttttaaaaagtataagattttatgaaaaattaaaccaattaagtataa < 1:2851080‑M1/2‑1 (MQ=255) cgaacatgaattacatgtttcaggaaaatatatttcatcccatttttaaaaagtataagattttatgaaaaattaaaccaattaagtataa < 1:3679729‑M1/2‑1 (MQ=255) aaaTATAATTCTTTATACTCTATTGATTAATCAAATATGTATCTATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAA > 1:3784727‑M1/1‑91 (MQ=255) gaacatgaattacatgtttcaggaaaatatatttcatcccatttttaaaaagtataagattttatgaaaaattaaaccaattaagtataaa > 1:4113869‑M1/89‑91 (MQ=255) gaacatgaattacatgtttcaggaaaatatatttcatcccatttttaaaaagtataagattttatgaaaaattaaaccaattaagtataaa > 1:4066507‑M1/89‑91 (MQ=255) atatAATTCTTTATACTCTATTGATTAATCAAATATGTATCTATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAA < 1:1331705‑M1/91‑1 (MQ=255) tataATTCTTTATACTCTATTGATTAATCAAATATGTATCTATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAA < 1:3248761‑M1/91‑1 (MQ=255) catgaattacatgtttcaggaaaatatatttcatcccatttttaaaaagtataagattttatgaaaaattaaaccaattaagtatAAAAAg < 1:2302957‑M1/6‑1 (MQ=255) catgaattacatgtttcaggaaaatatatttcatcccatttttaaaaagtataagattttatgaaaaattaaaccaattaagtatAAAAAg > 1:1701159‑M1/86‑91 (MQ=255) atgaattacatgtttcaggaaaatatatttcatcccatttttaaaaagtataagattttatgaaaaattaaaccaattaagtatAAAAAGa > 1:3925373‑M1/85‑91 (MQ=255) tgaattacatgtttcaggaaaatatatttcatcccatttttaaaaagtataagattttatgaaaaattaaaccaattaagtatAAAAAGAc < 1:4015369‑M1/8‑1 (MQ=255) tgaattacatgtttcaggaaaatatatttcatcccatttttaaaaagtataagattttatgaaaaattaaaccaattaagtatAAAAAGAc > 1:1796088‑M1/84‑91 (MQ=255) aaTTCTTTATACTCTATTGATTAATCAAATATGTATCTATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGAC < 1:1850518‑M1/91‑1 (MQ=255) aaTTCTTTATACTCTATTGATTAATCAAATATGTATCTATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGAC > 1:108178‑M1/1‑91 (MQ=255) tCTTTATACTCTATTGATTAATCAAATATGTATCTATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTAT < 1:80776‑M1/91‑1 (MQ=255) attacatgtttcaggaaaatatatttcatcccatttttaaaaagtataagattttatgaaaaattaaaccaattaagtatAAAAAGACTAt < 1:3567780‑M1/11‑1 (MQ=255) attacatgtttcaggaaaatatatttcatcccatttttaaaaagtataagattttatgaaaaattaaaccaattaagtatAAAAAGACTAt < 1:840112‑M1/11‑1 (MQ=255) cTTTATACTCTATTGATTAATCAAATATGTATCTATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATT > 1:68567‑M1/1‑91 (MQ=255) ttATACTCTATTGATTAATCAAATATGTATCTATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTC > 1:1613968‑M1/1‑91 (MQ=255) acatgtttcaggaaaatatatttcatcccatttttaaaaagtataagattttatgaaaaattaaaccaattaagtatAAAAAGACTATTTc < 1:482018‑M1/14‑1 (MQ=255) tataCTCTATTGATTAATCAAATATGTATCTATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCT < 1:4056402‑M1/91‑1 (MQ=255) tataCTCTATTGATTAATCAAATATGTATCTATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCT < 1:2889420‑M1/91‑1 (MQ=255) atgtttcaggaaaatatatttcatcccatttttaaaaagtataagattttatgaaaaattaaaccaattaagtatAAAAAGACTATTTCTa > 1:2466646‑M1/76‑91 (MQ=255) aCTCTATTGATTAATCAAATATGTATCTATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTAcc < 1:2656890/91‑1 (MQ=255) ctATTGATTAATCAAATATGTATCTATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTg > 1:3446981/1‑91 (MQ=255) aTTGATTAATCAAATATGTATCTATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTa > 1:1024573/1‑91 (MQ=255) ttGATTAATCAAATATGTATCTATCAAAATTCGTCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAAGACGCAAAAAGACTATTTCTACCGTGTAt < 1:1664011/91‑1 (MQ=255) ttGATTAATCAAATATGTATCTATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTAt < 1:2356744/91‑1 (MQ=255) ttGATTAATCAAATATGTATCTATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTAt < 1:1057535/91‑1 (MQ=255) ttGATTAATCAAATATGTATCTATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTAt < 1:1458182/91‑1 (MQ=255) tGATTAATCAAATATGTATCTATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATc > 1:54701/1‑91 (MQ=255) aTTAATCAAATATGTATCTATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGa > 1:1909829/1‑91 (MQ=255) ttAATCAAATATGTATCTATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGAt < 1:3260737‑M2/91‑2 (MQ=255) aatatatttcatcccatttttaaaaagtataagattttatgaaaaattaaaccaattaagtatAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGAt > 1:3488713‑M1/64‑91 (MQ=255) tatttcatcccatttttaaaaagtataagattttatgaaaaattaaaccaattaagtatAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGaa > 1:2072821‑M1/60‑91 (MQ=255) tCAAATATGTATCTATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTAtcgatacaaggtagaa < 1:2915887‑M1/91‑17 (MQ=255) tCAAATATGTATCTATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGAtagaa < 1:1190304‑M2/91‑6 (MQ=255) cAAATATGTATCTATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTAtcgatacaaggtagaaa < 1:2558767‑M1/91‑18 (MQ=255) cAAATATGTATCTATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTTTATCGAtagaaa > 1:3184251‑M2/1‑85 (MQ=255) cAAATATGTATCTATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGAtagaaa > 1:1567410‑M2/1‑85 (MQ=255) aaaTATGTATCTATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTAtcgatacaaggtagaaat < 1:2229‑M1/91‑19 (MQ=255) aaTATGTATCTATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCACAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGAtagaaata < 1:3398402‑M2/91‑9 (MQ=255) aaTATGTATCTATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTAtcgatacaaggtagaaata < 1:3416239‑M1/91‑20 (MQ=255) aaTATGTATCTATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTAtcgatacaaggtagaaata < 1:1604909‑M1/91‑20 (MQ=255) aaTATGTATCTATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTAtcgatacaaggtagaaata < 1:1157313‑M1/91‑20 (MQ=255) aaTATGTATCTATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTAtcgatacaaggtagaaata < 1:3641510‑M1/91‑20 (MQ=255) tcatcccatttttaaaaagtataagattttatgaaaaattaaaccaattaagtatAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAg > 1:2645486‑M1/56‑91 (MQ=255) atatGTATCTATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTAtcgatacaaggtagaaatag < 1:233913‑M1/91‑21 (MQ=255) atatGTATCTATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGAtagaaatag > 1:2472490‑M2/1‑82 (MQ=255) tatGTATCTATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTAtcgatacaaggtagaaatagt < 1:3037262‑M1/91‑22 (MQ=255) atGTATCTATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTAtcgatacaaggtagaaatagtc < 1:2924716‑M1/91‑23 (MQ=255) tcccatttttaaaaagtataagattttatgaaaaattaaaccaattaagtatAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCt > 1:1199386‑M1/53‑91 (MQ=255) tGTATCTATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGAtagaaatagtct > 1:3750719‑M2/1‑79 (MQ=255) tGTATCTATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGAtagaaatagtct > 1:1986590‑M2/1‑79 (MQ=255) gTATCTATCAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTAtcgatacaaggtagaaatagtctt < 1:3331203‑M1/91‑25 (MQ=255) tatctatcAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTAtcgatacaaggtagaaatagtcttt < 1:2620508‑M1/91‑26 (MQ=255) catttttaaaaagtataagattttatgaaaaattaaaccaattaagtatAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCtttt > 1:2527732‑M1/50‑91 (MQ=255) tctatcAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGAtagaaatagtcttttt < 1:1796265‑M2/91‑17 (MQ=255) ctatcAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTta < 1:391938/91‑1 (MQ=255) tatcAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTtat > 1:3798523/1‑91 (MQ=255) tatcAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTtat > 1:3798246/1‑91 (MQ=255) tatcAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTtat < 1:448004/91‑1 (MQ=255) tatcAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTtat < 1:2107154/91‑1 (MQ=255) tatcAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTtat < 1:817875/91‑1 (MQ=255) tatcAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTtat < 1:2549418/91‑1 (MQ=255) atcAAAATTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTtata < 1:3802319/91‑1 (MQ=255) aaTTCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTaa > 1:3093731/1‑91 (MQ=255) ttCGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAAtt > 1:3049808/1‑91 (MQ=255) cGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTgg > 1:1098714/1‑91 (MQ=255) cGGCTTATTTATTCACTCTGACATATCCAAATACGCAAAAAGACTATTTCTACCTTGTATCGATAGAAATAGTCTTTTTATACTTAATTgg > 1:2437185/1‑91 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |