| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1660020 = | 99 (1.010) | 18 (0.210) | 7/138 | NT | 17.0% | coding (1289/1464 nt) | gluP | Rhomboid protease GluP |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1660066 = | 90 (1.060) | coding (1243/1464 nt) | gluP | Rhomboid protease GluP | |||||
Only 100 of 192 total aligned reads displayed.
ACGCACATATTTTAATGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTGATCAT > USA300TCH1516_ALE/1659932‑1660110 | gctcaaaatattgtgaagcagacaataaataaaaattatgccgatgatcaaacatattatttaagtggtatgattatggctactatcaAtt < 1:3543078‑M1/3‑1 (MQ=255)aCGCACATATTTTAATGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATT < 1:2454921‑M1/91‑1 (MQ=255) cGCACATATTTTAATGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTC > 1:2248756‑M1/1‑91 (MQ=255) tcaaaatattgtgaagcagacaataaataaaaattatcccgatgatcaaacatattattcacgtggtatgattatggctactatcaATTCt < 1:3318010‑M1/5‑1 (MQ=255) cacaTATTTTAATGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTA > 1:3823646‑M1/1‑91 (MQ=255) cacaTATTTTAATGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTA < 1:1890982‑M1/91‑1 (MQ=255) aaaatattgtgaagcagacaataaataaaaattatgccgatgatcaaacatattatttaagtggtatgattatggctactatcaATTCTaa > 1:216213‑M1/85‑91 (MQ=255) tatTTTAATGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTC < 1:1316899‑M1/91‑1 (MQ=255) atattgtgaagcagacaataaataaaaattatgccgatgatcaaacatattatttaagtggtatgattatggctactatcaATTCTAAGTc > 1:495341‑M1/82‑91 (MQ=255) ttAATGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATGAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCg > 1:308985/1‑91 (MQ=255) aaTGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCt > 1:1587181/1‑91 (MQ=255) aTGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTc > 1:3966191/1‑91 (MQ=255) gCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTccc < 1:2021421/91‑1 (MQ=255) gCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTccc < 1:525117/91‑1 (MQ=255) tttttCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTGTCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCAt > 1:3684877/1‑91 (MQ=255) tttttCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCAt > 1:3593624/1‑91 (MQ=255) ttttCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCAtt < 1:1363395/91‑1 (MQ=255) tcatcatcaTTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTg < 1:2343468/91‑1 (MQ=255) tcatcatcaTTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTg > 1:831909/1‑91 (MQ=255) catcatcatTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGt < 1:1000818/91‑1 (MQ=255) atcatcatTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTc < 1:1558940/91‑1 (MQ=255) tcatcatTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCa > 1:1861386/1‑91 (MQ=255) tcatcatTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCa > 1:2869408/1‑91 (MQ=255) atcatTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATa > 1:1451584/1‑91 (MQ=255) tcatTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCgaaggtatgacagaatggga < 1:2754940‑M1/91‑21 (MQ=255) tcatTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATAc > 1:483838/1‑91 (MQ=255) atTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCt < 1:2534895/91‑1 (MQ=255) aaaaattatgtcgatgatcaaacatattatttaagtggtatgattatggctactatcaATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCt > 1:515479‑M1/59‑91 (MQ=255) aaaattatgccgatgatcaaacatattatttaagtggtatgattatggctactatcaATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCtt > 1:738780‑M1/58‑91 (MQ=255) aaaattatgccgatgatcaaacatattatttaagtggtatgattatggctactatcaATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCtt > 1:3840493‑M1/58‑91 (MQ=255) aaaattatgccgatgatcaaacatattatttaagtggtatgattatggctactatcaATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCtt > 1:738639‑M1/58‑91 (MQ=255) tAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCgaaggtatgacagaatgggagcgag < 1:1010300‑M1/91‑26 (MQ=255) aattatgccgatgatcaaacatattatttaagtggtatgattatggctactatcaATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCg > 1:1746127‑M1/56‑91 (MQ=255) aattatgccgatgatcaaacatattatttaagtggtatgattatggctactatcaATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCg > 1:2743933‑M1/56‑91 (MQ=255) aattatgccgatgatcaaacatattatttaagtggtatgattatggctactatcaATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCg > 1:32782‑M1/56‑91 (MQ=255) aattatgccgatgatcaaacatattatttaagtggtatgattatggctactatcaATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCg > 1:1498817‑M1/56‑91 (MQ=255) attatgccgatgatcaaacatattatttaagtggtatgattatggctactatcaATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCgg > 1:2364669‑M1/55‑91 (MQ=255) aaTGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCgaaggtatgacagaatgggagcgagg < 1:3100972‑M1/91‑27 (MQ=255) aaTGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCgg > 1:2632786‑M2/1‑89 (MQ=255) aTGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCgga > 1:4037022‑M2/1‑88 (MQ=255) gAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCggact > 1:3084705‑M2/1‑86 (MQ=255) gAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCggact > 1:3888601‑M2/1‑86 (MQ=255) atgccgatgatcaaacatattatttaagtggtatgattatggctactatcaATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACt > 1:1487227‑M1/52‑91 (MQ=255) aCGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCggactta > 1:2407224‑M2/1‑84 (MQ=255) aCGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCggactta > 1:3024164‑M2/1‑84 (MQ=255) aCGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCggactta < 1:1712564‑M2/91‑8 (MQ=255) tttGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCggacttagaat > 1:2385365‑M2/1‑80 (MQ=255) tttGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCggacttagaat > 1:1505742‑M2/1‑80 (MQ=255) tttGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCggacttagaat > 1:2305762‑M2/1‑80 (MQ=255) tttGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCggacttagaat > 1:2305697‑M2/1‑80 (MQ=255) ttGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAAtt < 1:372799/91‑1 (MQ=255) tGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTg > 1:2279918/1‑91 (MQ=255) tATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGAta > 1:2735189/1‑91 (MQ=255) tATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGAta > 1:3363668/1‑91 (MQ=255) cGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGAtagta < 1:1535482/91‑1 (MQ=255) cTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGc < 1:1173234/91‑1 (MQ=255) aaCTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCa > 1:1500349/1‑91 (MQ=255) aaCTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCa < 1:4122393/91‑1 (MQ=255) aaCTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCa > 1:757397/1‑91 (MQ=255) aaCTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCa < 1:1020982/91‑1 (MQ=255) cAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAAt > 1:1611686/1‑91 (MQ=255) aaaaTTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATc < 1:2135953/91‑1 (MQ=255) aaaaTTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATc > 1:1671013/1‑91 (MQ=255) aaaaTTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATc < 1:599550/91‑1 (MQ=255) aaTTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCAt > 1:3787683/1‑91 (MQ=255) aTTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATa < 1:1125138/91‑1 (MQ=255) tttAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATAc < 1:2753271/91‑1 (MQ=255) ttAATATACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATAcc > 1:3223036/1‑91 (MQ=255) taataaACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCa < 1:2922241/91‑1 (MQ=255) aataaACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCAc > 1:3742158/1‑91 (MQ=255) aataaACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCAc < 1:2254122/91‑1 (MQ=255) aataaACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCAc > 1:1706477/1‑91 (MQ=255) aataaACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCAc > 1:24775/1‑91 (MQ=255) ataaACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATACTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACt > 1:3589862/1‑91 (MQ=255) taaACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCCCtt > 1:3397172/1‑91 (MQ=255) aaaCCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTa < 1:2284899/91‑1 (MQ=255) aaaCCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTa < 1:2057502/91‑1 (MQ=255) ccTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAaat < 1:859426/91‑1 (MQ=255) ccTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAaat < 1:2189142/91‑1 (MQ=255) cTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAaata > 1:2220062/1‑91 (MQ=255) tGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAaataa < 1:931451/91‑1 (MQ=255) aTTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAataata > 1:1287239/1‑91 (MQ=255) tttAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACCTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAatat > 1:2015408/1‑91 (MQ=255) ttAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATg < 1:1259113/91‑1 (MQ=255) ttAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATg < 1:4015991/91‑1 (MQ=255) ttAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATg < 1:42999/91‑1 (MQ=255) ttAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATg > 1:3909398/1‑91 (MQ=255) tAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGt > 1:1358454/1‑91 (MQ=255) aGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGtt < 1:2722672/91‑1 (MQ=255) aGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGtt < 1:2682236/91‑1 (MQ=255) aGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGtt < 1:2836386/91‑1 (MQ=255) ggAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGttt > 1:401625/1‑91 (MQ=255) gAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTg > 1:2153790/1‑91 (MQ=255) aaaCATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTGa > 1:3621682/1‑91 (MQ=255) aCATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTGatc > 1:1961172/1‑91 (MQ=255) aTTCTAAGTCCgaaggtatgacagaatgggagcgaggacttagaatgtttcctaaatcaggtttattaaattttgagttagcgatagcaaa > 1:2987281‑M1/1‑11 (MQ=255) aTTCTAAGTCCgaaggtatgacagaatgggagcgaggacttagaatgtttcctaaatcaggtttattaaattttgagttagcgatagcaaa > 1:2247489‑M1/1‑11 (MQ=255) aTTCTAAGTCCgaaggtatgacagaatgggagcgaggacttagaatgtttcctaaatcaggtttattaaattttgagttagcgatagcaaa > 1:2987592‑M1/1‑11 (MQ=255) aTTCTAAGTCCgaaggtatgacagaatgggagcgaggacttagaatgtttcctaaatcaggtttattaaattttgagttagcgatagcaaa < 1:818911‑M1/91‑81 (MQ=255) aTTCTAAGTCCgaaggtatgacagaatgggagcgaggacttagaatgtttcctaaatcaggtttattaaattttgagttagcgatagcaaa > 1:2987916‑M1/1‑11 (MQ=255) | ACGCACATATTTTAATGCTTTTTCATCATCATTTAATGAACGATTTGCTATCGCTAACTCAAAATTTAATAAACCTGATTTAGGAAACATTCTAAGTCCTCGCTCCCATTCTGTCATACCTTCGGACTTAGAATTGATAGTAGCCATAATCATACCACTTAAATAATATGTTTGATCAT > USA300TCH1516_ALE/1659932‑1660110 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |