| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1693764 | 88 (0.890) | 11 (0.130) | 6/140 | NT | 11.6% | coding (1031/1158 nt) | hemN_1 | Oxygen‑independent coproporphyrinogen‑III oxidase‑like protein YqeR |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1693780 | 91 (1.060) | coding (1015/1158 nt) | hemN_1 | Oxygen‑independent coproporphyrinogen‑III oxidase‑like protein YqeR | |||||
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
CTATGACTTTCCCTCTATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACGCAACCCAAGAAACATTTCTTCTT > USA300TCH1516_ALE/1693675‑1693854 | cTATGACTTTCCCTCTATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCaaa < 1:2657439/91‑1 (MQ=255) aTGACTTTCCCTCTATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGa < 1:2291481/91‑1 (MQ=255) aTGACTTTCCCTCTATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGa < 1:2385822/91‑1 (MQ=255) tCCCTCTATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTc < 1:3867012/91‑1 (MQ=255) tCCCTCTATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTc > 1:4127182/1‑91 (MQ=255) tCCCTCTATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTc > 1:1779130/1‑91 (MQ=255) cccTCTATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCa < 1:2959387/91‑1 (MQ=255) ccTCTATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCaa < 1:1259284/91‑1 (MQ=255) ccTCTATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCaa > 1:2445265/1‑91 (MQ=255) ctctATTTGTAGGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACtttaaag < 1:3755726/91‑5 (MQ=255) ctctATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAtctattgaaagtg < 1:2165776‑M1/91‑14 (MQ=255) ctctATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAAt > 1:3748723/1‑91 (MQ=255) tATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAtctattgaaagtgtct < 1:4034464‑M1/91‑17 (MQ=255) tATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAtctattgaaagtgtct < 1:1564103‑M1/91‑17 (MQ=255) aTTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGAt > 1:917169‑M2/1‑90 (MQ=255) ttGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGAttg > 1:3694580‑M2/1‑88 (MQ=255) tGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGAttgg > 1:2642078‑M2/1‑87 (MQ=255) aaGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGAttggtca < 1:7864‑M2/91‑8 (MQ=255) aaGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGAttggtca > 1:3997154‑M2/1‑84 (MQ=255) aaGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGAttggtca > 1:885260‑M2/1‑84 (MQ=255) aaGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGAttggtca > 1:3799076‑M2/1‑84 (MQ=255) aaGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAAGTGATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAtctattgaaagtgtctttggtca < 1:3319602‑M1/91‑24 (MQ=255) tGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGAttggtcaaac > 1:4129060‑M2/1‑81 (MQ=255) gCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTACTTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAAct > 1:1052827/1‑91 (MQ=255) cAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAtctattgaaagtgtctttggtcaaacaa < 1:3332985‑M1/91‑29 (MQ=255) cAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAtctattgaaagtgtctttggtcaaacaa < 1:3332956‑M1/91‑29 (MQ=255) aTCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAActtct > 1:2871198/1‑91 (MQ=255) tCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAtctattgaaagtgtctttggtcaaacaataa < 1:243011‑M1/91‑32 (MQ=255) cacaTCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCttt < 1:662689/91‑1 (MQ=255) caTCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCttttt > 1:4107841/1‑91 (MQ=255) cGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGaa > 1:827756/1‑91 (MQ=255) gTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAAc > 1:2328733/1‑91 (MQ=255) gTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTGTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACGTTCAATAGATTGGTCAAACTTCCTTTTGAAc > 1:192680/1‑91 (MQ=255) ttCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAAcc < 1:3773106/91‑1 (MQ=255) tCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACct > 1:2042552/1‑91 (MQ=255) ttttCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACctac < 1:1266752/91‑1 (MQ=255) ttttCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACctac < 1:111618/91‑1 (MQ=255) ttttCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACctac > 1:3171053/1‑91 (MQ=255) ttCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACctacta > 1:318157/1‑91 (MQ=255) ttCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACctacta > 1:4049567/1‑91 (MQ=255) tCTACAAGTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACctactac < 1:2072192/91‑1 (MQ=255) cTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACctactact > 1:3335158/1‑91 (MQ=255) cTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACctactact > 1:2093306/1‑91 (MQ=255) cTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACctactact > 1:2594247/1‑91 (MQ=255) aCAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCtactactac < 1:499603/91‑1 (MQ=255) aattaattCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTc < 1:788470/91‑1 (MQ=255) attaattCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTca > 1:1923781/1‑91 (MQ=255) attaattCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTca > 1:1033444/1‑91 (MQ=255) ttaattCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTcac < 1:738037/91‑1 (MQ=255) ttaattCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTcac < 1:737700/91‑1 (MQ=255) ttaagtCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTcac < 1:3460350/91‑1 (MQ=255) taattCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTcaca < 1:1780524/91‑1 (MQ=255) taattCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTcaca < 1:665648/91‑1 (MQ=255) taattCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTcaca < 1:665283/91‑1 (MQ=255) attCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACAcc < 1:1434905/91‑1 (MQ=255) attCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACAcc > 1:1284254/1‑91 (MQ=255) ttCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCt > 1:3664176/1‑91 (MQ=255) ttCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCt < 1:326002/91‑1 (MQ=255) ttCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCt < 1:325897/91‑1 (MQ=255) ttCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCt > 1:3931626/1‑91 (MQ=255) tCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCtt > 1:232499/1‑91 (MQ=255) ttCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCAt < 1:918726/91‑1 (MQ=255) ctctTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCAttt < 1:1866469/91‑1 (MQ=255) tctTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTa > 1:421438/1‑91 (MQ=255) tctTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTa > 1:420984/1‑91 (MQ=255) ttAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACg < 1:2522203/91‑1 (MQ=255) tAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACGc > 1:3660114/1‑91 (MQ=255) tAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACGc < 1:2049643/91‑1 (MQ=255) aaaTTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACGCa > 1:2354360/1‑91 (MQ=255) aaaTTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCAATTAAACGCa > 1:3971479/1‑91 (MQ=255) aaTTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACGCaa > 1:2790473/1‑91 (MQ=255) atttattGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACGCAACCCa > 1:2713901/1‑91 (MQ=255) tttattGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGAttggtcaaacaataaataatttaaaagagaaggaattaattgtagaaaagaacgatgtg < 1:2813353‑M2/91‑60 (MQ=255) ttattGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACGCAACCCAAg > 1:2737243/1‑91 (MQ=255) tattGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACGCAACCCAAGa < 1:1243641/91‑1 (MQ=255) ttGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGAttggtcaaacaataaataatttaaaagagaaggaattaattgtagaaaagaacgatgtgattg < 1:3332985‑M2/91‑64 (MQ=255) ttGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACGCAACCCAAGaaa > 1:89159/1‑91 (MQ=255) tGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACGCAACCCAAGAAAc < 1:1349662/91‑1 (MQ=255) tGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACGCAACCCAAGAAAc < 1:1349434/91‑1 (MQ=255) tGTTTGACCAAAGACACTGTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACGCAACCCAAGAAAc > 1:1436520/1‑91 (MQ=255) tttGACCAAtctattgaaagtgtctttggtcaaacaataaataatttaaaagagaaggaattaattgtagaaaagaacgatgtgattgcac > 1:2667576‑M1/1‑9 (MQ=255) tttGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACGCAACCCAAGaaatgt < 1:2095779/91‑4 (MQ=255) tttGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACGCAACCCAAGAAACAt > 1:1490452/1‑91 (MQ=255) ttGACCAAtctattgaaagtgtctttggtcaaacaataaataatttaaaagagaaggaattaattgtagaaaagaacgatgtgattgcact > 1:506315‑M1/1‑8 (MQ=255) tGACCAAtctattgaaagtgtctttggtcaaacaataaataatttaaaagagaaggaattaattgtagaaaagaacgatgtgattgcactt < 1:7875‑M1/91‑85 (MQ=255) tGACCAAtctattgaaagtgtctttggtcaaacaataaataatttaaaagagaaggaattaattgtagaaaagaacgatgtgattgcactt < 1:7864‑M1/91‑85 (MQ=255) tGACCAAtctattgaaagtgtctttggtcaaacaataaataatttaaaagagaaggaattaattgtagaaaagaacgatgtgattgcactt > 1:885260‑M1/1‑7 (MQ=255) tGACCAAtctattgaaagtgtctttggtcaaacaataaataatttaaaagagaaggaattaattgtagaaaagaacgatgtgattgcactt > 1:3997154‑M1/1‑7 (MQ=255) tGACCAAtctattgaaagtgtctttggtcaaacaataaataatttaaaagagaaggaattaattgtagaaaagaacgatgtgattgcactt > 1:3799076‑M1/1‑7 (MQ=255) tGACCAAAGACACTTTCAATAGAttggtcaaacaataaataatttacaagagaaggaatcacttgtagaaaagaacgatgtgattgcactt < 1:3319269‑M2/91‑69 (MQ=255) tGACCAAAGACACTTTCAATAGAttggtcaaacaataaataatttaaaagagaaggaatcacttgtagaaaagaacgatgtgattgcactt < 1:3319602‑M2/91‑69 (MQ=255) tGACCAAAGACACTTTCAATAGAttggtcaaacaataaataatttaaaagagaaggaatcacttgtagaaaagaacgatgtgattgcactt < 1:3319616‑M2/91‑69 (MQ=255) tGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACGCAACCCAAGAAACAttt < 1:3747928/91‑1 (MQ=255) tGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACGCAACCCAAGAAACAttt > 1:2301290/1‑91 (MQ=255) ccAAtctattgaaagtgtctttggtcaaacaataaataatttaaaagagaaggaattaattgtagaaaagaacgatgtgattgcacttaca > 1:2642078‑M1/1‑4 (MQ=255) ccAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACGCAACCCAAGAAACATttctt > 1:1206817/1‑91 (MQ=255) aatctattgaaagtgtctttggtcaaacaataaataatttaaaagagaaggaattaattgtagaaaagaacgatgtgattgcacttacaaa < 1:4067304‑M1/91‑90 (MQ=255) aaaGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACGCAACCCAAGAAACATttcttct < 1:1373618/91‑1 (MQ=255) aaGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACGCAACCCAAGAAACATttcttctt > 1:3692491/1‑91 (MQ=255) aaGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACGCAACCCAAGAAACATttcttctt > 1:3443416/1‑91 (MQ=255) | CTATGACTTTCCCTCTATTTGTAAGTGCAATCACATCGTTCTTTTCTACAATTAATTCCTTCTCTTTTAAATTATTTATTGTTTGACCAAAGACACTTTCAATAGATTGGTCAAACTTCTTTTTGAACCTACTACTACTCACACCTTCATTTAAACGCAACCCAAGAAACATTTCTTCTT > USA300TCH1516_ALE/1693675‑1693854 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |