| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1759667 = | 91 (0.930) | 6 (0.070) | 4/132 | NT | 8.0% | intergenic (‑374/+100) | USA300HOU_RS08780/USA300HOU_RS08785 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1759723 = | 62 (0.760) | intergenic (‑430/+44) | USA300HOU_RS08780/USA300HOU_RS08785 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
AAGGTTTAATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGATACTACTTGATGAAC > USA300TCH1516_ALE/1759577‑1759757 | aaGGTTTAATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACA < 1:458399‑M1/91‑1 (MQ=255) tacgcgctgatacgatttttatctaacgcatttgggcgtaagtaatagtaatctgttcatcaagtagtatccgtgcttgaaaacaaactaa < 1:3261937‑M1/2‑1 (MQ=255) aGGTTTAATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAA < 1:1885470‑M1/91‑1 (MQ=255) ggTTTAATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAA < 1:618811‑M1/91‑1 (MQ=255) gTTTAATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAA > 1:2304700‑M1/1‑91 (MQ=255) tttAATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAAC < 1:2830190‑M1/91‑1 (MQ=255) ttAATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACT > 1:2180965‑M1/1‑91 (MQ=255) cgctgatacgatttttatctaacgcatttgggcgtaagtaatagtaatctgttcatcacgtagtatccgtgcttgaaaacaaactAAAACt < 1:3532258‑M1/6‑1 (MQ=255) cgctgatacgatttttatctaacgcatttgggcgtaagtaatagtaatctgttcatcaagtagtatccgtgcttgaaaacaaactAAAACt < 1:1111794‑M1/6‑1 (MQ=255) cgctgatacgatttttatctaacgcatttgggcgtaagtaatagtaatctgttcatcaagtagtatccgtgcttgaaaacaaactAAAACt < 1:1255143‑M1/6‑1 (MQ=255) gctgatacgatttttatctaacgcatttgggcgtaagtaatagtaatctgttcatcaagtagtatccgtgcttgaaaacaaactAAAACTc < 1:2736926‑M1/7‑1 (MQ=255) aaTTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCC > 1:721768‑M1/1‑91 (MQ=255) tgatacgatttttatctaacgcatttgggcgtaagtaatagtaatctgttcatcaagtagtatccgtgcttgaaaacaaactAAAACTCCt > 1:3782182‑M1/83‑91 (MQ=255) aTTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCT < 1:4003124‑M1/91‑1 (MQ=255) atacgatttttatctaacgcatttgggcgtaagtaattgtaatctgttcatcaagtagtatccgtgcttgaaaacaaactAAAACTCCTaa < 1:2661655‑M1/11‑1 (MQ=255) atacgatttttatctaacgcatttgggcgtaagtaatagtaatctgttcatcaagtagtatccgtgcttgaaaacaaactAAAACTCCTaa < 1:475989‑M1/11‑1 (MQ=255) tacgatttttatctaacgcatttgggcgtaagtaatagtaatctgttcatcaagtagtatccgtgcttgaaaacaaactAAAACTCCTAAt < 1:1996068‑M1/12‑1 (MQ=255) ggTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATG < 1:2317782‑M1/91‑1 (MQ=255) gTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGT > 1:2159326‑M1/1‑91 (MQ=255) gTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGT > 1:1349788‑M1/1‑91 (MQ=255) gTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGT < 1:2025520‑M1/91‑1 (MQ=255) gTTGCTCGATTATTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGT < 1:3756899‑M1/91‑1 (MQ=255) tGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTAc > 1:2272265/1‑91 (MQ=255) tGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTAc > 1:1744417/1‑91 (MQ=255) gCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACt < 1:2832138/91‑1 (MQ=255) tCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAg > 1:4097683/1‑91 (MQ=255) cGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGGTTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGt > 1:65820/1‑91 (MQ=255) cGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGt < 1:2401803/91‑1 (MQ=255) cGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGt < 1:205526/91‑1 (MQ=255) gATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGtt < 1:2535156/91‑1 (MQ=255) aTTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAATTTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGttt < 1:3495900/91‑1 (MQ=255) tttttttCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTa > 1:2721666/1‑91 (MQ=255) ttttttCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAAAGTACTAGTTTAg < 1:3173372/91‑1 (MQ=255) tttttCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGa > 1:1928056/1‑91 (MQ=255) tttttCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACGTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGa < 1:3534374/91‑1 (MQ=255) ttttCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGaa < 1:748574/91‑1 (MQ=255) ttCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAAtt > 1:356962/1‑91 (MQ=255) ttCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAAtt > 1:324426/1‑91 (MQ=255) ttCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAAtt > 1:1285402/1‑91 (MQ=255) tCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAAttt > 1:2480441/1‑91 (MQ=255) tCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAAttt < 1:750784/91‑1 (MQ=255) tCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAAttt < 1:749595/91‑1 (MQ=255) tCAAATAAATAGTGGATTTTTACCACACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAAttt < 1:4077128/91‑1 (MQ=255) cAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAAtttt < 1:1776363/91‑1 (MQ=255) aaataaatAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAAttttt < 1:3127969/91‑1 (MQ=255) aaataGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAAc < 1:159336/91‑1 (MQ=255) aataGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACt < 1:2242578/91‑1 (MQ=255) ataGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTactagttaaaaaattctaaacta < 1:2989455‑M1/91‑24 (MQ=255) taGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTactagttaaaaaattctaaactag < 1:1944909‑M1/91‑25 (MQ=255) taGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAg > 1:83359/1‑91 (MQ=255) taGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAg < 1:1995632/91‑1 (MQ=255) taGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAg < 1:1631880/91‑1 (MQ=255) aGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGt < 1:3632169/91‑1 (MQ=255) gTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGtt > 1:3755441/1‑91 (MQ=255) tGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTc < 1:385996/91‑1 (MQ=255) tGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTc > 1:1849559/1‑91 (MQ=255) ggATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTggaactagttaaaaaattctaaactagt < 1:2702679‑M1/91‑29 (MQ=255) ggATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTcc < 1:2576174/91‑1 (MQ=255) agtaatagtaatctgttcatcaagtagtatccgtgcttgaaaacaaactAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTcc > 1:481390‑M1/50‑91 (MQ=255) agtaatagtaatctgttcatcaagtagtatccgtgcttgaaaacaaactAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTcc > 1:2862392‑M1/50‑91 (MQ=255) ttttACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTggaactagttaaaaaattctaaactagtacat < 1:3077771‑M1/91‑33 (MQ=255) atagtaatctgttcatcaagtagtatccgtgcttgaaaacaaactAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACAt > 1:2255385‑M1/46‑91 (MQ=255) tttACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCacatt > 1:1837471‑M2/1‑86 (MQ=255) tACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCacattag < 1:534230‑M2/91‑8 (MQ=255) tACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCacattag < 1:534016‑M2/91‑8 (MQ=255) ccGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTggaactagttaaaaaattctaaactagtacattagga < 1:1179500‑M1/91‑38 (MQ=255) cGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCacattaggag < 1:571031‑M2/91‑11 (MQ=255) gCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCacattaggagt < 1:1525577‑M2/91‑12 (MQ=255) aCTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCacattaggagttt < 1:3776155‑M2/91‑14 (MQ=255) cTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCacattaggagtttt > 1:228056‑M2/1‑77 (MQ=255) tttCGATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTa < 1:3457802/91‑1 (MQ=255) tttCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTa < 1:1726204/91‑1 (MQ=255) ttCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAg < 1:1486450/91‑1 (MQ=255) ttCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAg < 1:1486360/91‑1 (MQ=255) ttCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAg < 1:2726682/91‑1 (MQ=255) tCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAgt < 1:1808779/91‑1 (MQ=255) aaTTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAgttt < 1:440319/91‑1 (MQ=255) tttAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAgtttgt < 1:2767205/91‑1 (MQ=255) ttAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAgtttgtt < 1:3201433/91‑1 (MQ=255) ttAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAgtttgtt < 1:3513143/91‑1 (MQ=255) aCAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTc < 1:766895/91‑1 (MQ=255) aCAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTc > 1:335157/1‑91 (MQ=255) cAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCa > 1:2959510/1‑91 (MQ=255) cAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCa > 1:1514902/1‑91 (MQ=255) aaTTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCaa < 1:337484/91‑1 (MQ=255) tAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCa < 1:1676880/91‑1 (MQ=255) aTTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACgg < 1:2771311/91‑1 (MQ=255) tttATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGa < 1:2626135/91‑1 (MQ=255) ttATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGAt < 1:3410646/91‑1 (MQ=255) aTTCTGCATAACAATACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTTGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGAtac < 1:3742773/91‑1 (MQ=255) aTTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGTAtac > 1:489927/1‑91 (MQ=255) aTTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGAtac > 1:490604/1‑91 (MQ=255) aTTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGAtac < 1:1249285/91‑1 (MQ=255) ttCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGAtact < 1:3103219/91‑1 (MQ=255) cTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGAtactac < 1:620163/91‑1 (MQ=255) tGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGATactact > 1:2027442/1‑91 (MQ=255) gCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGATACTACtt < 1:2045077/91‑1 (MQ=255) tAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGATACTACTtgat < 1:3650379/91‑1 (MQ=255) aaaaCTCCTAATGTggaactagttaaaaaattctaaactagtacattaggagttttgttatgcagaataaatttaattgttaaattgaaag > 1:228056‑M1/1‑14 (MQ=255) AAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGATACTACTTGATGAAc > 1:2320663‑M1/1‑91 (MQ=255) | AAGGTTTAATTTGGTTGCTCGATTTTTTTCAAATAAATAGTGGATTTTTACCGCACTTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGATACTACTTGATGAAC > USA300TCH1516_ALE/1759577‑1759757 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |