New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1759667 = | 91 (0.930) | 6 (0.070) | 4/132 | NT | 8.0% | intergenic (‑374/+100) | USA300HOU_RS08780/USA300HOU_RS08785 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | USA300TCH1516_ALE | 1759723 = | 62 (0.760) | intergenic (‑430/+44) | USA300HOU_RS08780/USA300HOU_RS08785 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
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aTTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACgg < 1:2771311/91‑1 (MQ=255) tttATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGa < 1:2626135/91‑1 (MQ=255) ttATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGAt < 1:3410646/91‑1 (MQ=255) tATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGAta < 1:1409391/91‑1 (MQ=255) aTTCTGCATAACAATACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTTGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGAtac < 1:3742773/91‑1 (MQ=255) aTTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGTAtac > 1:489927/1‑91 (MQ=255) aTTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGAtac < 1:1249285/91‑1 (MQ=255) aTTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGAtac > 1:490604/1‑91 (MQ=255) 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agttttAGTTTGTTTTCAAGCACGGATACTACTTGATGAACAGATTACTATTACTTACGCCCAAATGCGTTAGATAAAAATCGTATCAgcg < 1:2522375‑M2/85‑1 (MQ=255) agttttAGTTTGTTTTCAAGCACGGATACTACTTGATGAACAGATTACTATTACTTACGCCCAAATGCGTTAGATAAAAATCGTATCAgcg > 1:865176‑M2/7‑91 (MQ=255) agttttAGTTTGTTTTCAAGCACGGATACTACTTGATGAACAGATTACTATTACTTACGCCCAAATGCGTTAGATAAAAATCGTATCAgcg < 1:1111794‑M2/85‑1 (MQ=255) agttttAGTTTGTTTTCAAGCACGGATACTACGTGATGAACAGATTACTATTACTTACGCCCAAATGCGTTAGATAAAAATCGTATCAgcg < 1:3532258‑M2/85‑1 (MQ=255) ttAGTTTGTTTTCAAGCACGGATACTACTTGATGAACAGATTACTATTACTTACGCCCAAATGCGTTAGATAAAAATCGTATCAGCGCGTa < 1:3261937‑M2/89‑1 (MQ=255) aGTTTGTTTTCAAGCACGGATACTACTTGATGAACAGATTACTATTACTTACGCCCAAATGCGTTAGATAAAAATCGTATCAGCGCGTAGc < 1:3283295/91‑1 (MQ=255) | TTTCAATTTAACAATTAAATTTATTCTGCATAACAAAACTCCTAATGTACTAGTTTAGAATTTTTTAACTAGTTCCACATTAGGAGTTTTAGTTTGTTTTCAAGCACGGATACTACTTGATGAACAGATTACTATTACTTACGCCCAAATGCGTTAGATAAAAATCGTATCAGCGCGTAGC > USA300TCH1516_ALE/1759633‑1759813 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |