New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1830989 = | 89 (0.910) | 5 (0.050) | 5/150 | NT | 5.8% | coding (131/1695 nt) | ezrA | Septation ring formation regulator EzrA |
? | USA300TCH1516_ALE | 1831014 = | 79 (0.860) | coding (106/1695 nt) | ezrA | Septation ring formation regulator EzrA |
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
ACGTTGTCCTTTTTCATTGCATCGTATTTCGTTTTTGTTTCACCTTTTAAATTCAACTTAGATAATTGTGCAAGGTTTTGATCAAAAGGTAACGTCTCAATTTCATTTTTACGTTCGATTGCTTTTTCAATAATTTGTCGTTTATTTGAACGTAAATAGAATAATACACCTACAGCAATCA > USA300TCH1516_ALE/1830899‑1831079 | aCGTTGTCCTTTTTCATTGCATCGTATTTCGTTTTTGTTTCACCTTTTAAATTCAACTTAGATAATTGTGCAAGGTTTTGATCAAAAGGTa > 1:1928643/1‑91 (MQ=255) tttggcaataattgtgattatattgattgctgtaggtgtattattctatttacgttcaaataaacgacaaattattgaaaaagcaatcgaa > 1:3715547‑M1/90‑91 (MQ=255) cGTTGTCCTTTTTCATTGCATCGTATTTCGTTTTTGTTTCACCTTTTAAATTCAACTTAGATAATTGTGCAAGGTTTTGATCAAAAGGTaa > 1:985272/1‑91 (MQ=255) cGTTCTCCTTTTTCATTGCATCGTATTTCGTTTTTGTTTCACCTTTTAAATTCAACTTAGATAATTGTGCAAGGTTTTGATCAAAAGGTaa < 1:2605438/91‑1 (MQ=255) ttggcaataattgtgattatattgattgctgtaggtgtattattctatttacgttcaaataaacgacaaattattgaaaaagcaatcgAAc > 1:1593252‑M1/89‑91 (MQ=255) gTTGTCCTTTTTCATTGCATCGTATTTCGTTTTTGTTTCACCTTTTAAATTCAACTTAGATAATTGTGCAAGGTTTTGATCAAAAGGTAAc > 1:1292136/1‑91 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |