| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1850072 = | 103 (1.050) | 8 (0.080) | 4/154 | NT | 8.0% | coding (1531/1707 nt) | acsA_1 | Acetyl‑coenzyme A synthetase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1850111 = | 86 (0.910) | coding (1492/1707 nt) | acsA_1 | Acetyl‑coenzyme A synthetase | |||||
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
TAGGTAATTTATCTTTAAATTCGATTTCACGTGGTGCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCT > USA300TCH1516_ALE/1849982‑1850160 | tAGGTAATTTATCTTTAAATTCGATTTCACGTGGTGCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTc < 1:1346964/91‑1 (MQ=255)aggttgagtctaaattggttgaacacgaagcagttgccgaagcaggaattattggtaaacctgatccggttcgcggtgaaataattaaggc > 1:905010‑M1/91‑91 (MQ=255)aggttgagtctaaattggttgaacacgaagcagttgccgaagcaggaattattggtaaacctgatccggttcgcggtgaaataattaaggc < 1:466250‑M1/1‑1 (MQ=255)aggttgagtctaaattggttgaacacgaagcagttgccgaagcaggaattattggtaaacctgatccggttcgcggtgaaataattaaggc < 1:465917‑M1/1‑1 (MQ=255)aggttgagtctaaattggttgaacacgaagcagttgccgaagcaggaattattggtaaacctgatccggttcgcggtgaaataattaaggc < 1:2648160‑M1/1‑1 (MQ=255)aggttgagtctaaattggttgaacacgaagcagttgccgaagcaggaattattggtaaacctgatccggttcgcggtgaaataattaaggc < 1:1258797‑M1/1‑1 (MQ=255) aGGTAATTTATCTTTAAATTCGATTTCACGTGGTGCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCg < 1:431367/91‑1 (MQ=255) aGGTAATTTATCTTTAAATTCGATTTCACGTGGTGCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCg < 1:354806/91‑1 (MQ=255) aGGTAATTTATCTTTAAATTCGATTTCACGTGGTGCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCg < 1:3416300/91‑1 (MQ=255) aGGTAATTTATCTTTAAATTCGATTTCACGTGGTGCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCg < 1:1761976/91‑1 (MQ=255) aGGTAATTTATCTTTAAATTCGATTTCACGTGGTGCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCg < 1:1467459/91‑1 (MQ=255) ggTAATTTATCTTTAAATTCGATTTCACGTGGTGCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGt < 1:440683/91‑1 (MQ=255) ggTAATTTATCTTTAAATTCGATTTCACGTGGTGCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGt > 1:1797278/1‑91 (MQ=255) gTAATTTATCTTTAAATTCGATTTCACGTGGTGCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTc < 1:877084/91‑1 (MQ=255) gTAATTTATCTTTAAATTCGATTTCACGTGGTGCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTc < 1:2136975/91‑1 (MQ=255) tAATTTATCTTTAAATTCGATTTCACGTGGTGCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCt < 1:2618426/91‑1 (MQ=255) aaTTTATCTTTAAATTCGATTTCACGTGGTGCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTg < 1:2301814/91‑1 (MQ=255) aTTTATCTTTAAATTCGATTTCACGTGGTGCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGt > 1:3848864/1‑91 (MQ=255) ttATCTTTAAATTCGATTTCACGTGGTGCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTg > 1:2055948/1‑91 (MQ=255) tATCTTTAAATTCGATTTCACGTGGTGCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTgg < 1:3782143/91‑1 (MQ=255) tATCTTTAAATTCGATTTCACGTGGTGCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTgg > 1:2119112/1‑91 (MQ=255) tATCTTTAAATTCGATTTCACGTGGTGCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTgg > 1:2119131/1‑91 (MQ=255) tCTTTAAATTCGATTTCACGTGGTGCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGtt < 1:1372298/91‑1 (MQ=255) cTTTAAATTCGATTTCACGTGGTGCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTc > 1:1914277/1‑91 (MQ=255) tttAAATTCGATTTCACGTGGTGCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCa < 1:2414994/91‑1 (MQ=255) ttAAATTCGATTTCACGTGGTGCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCat < 1:1163664/91‑1 (MQ=255) ttAAATTCGATTTCACGTGGTGCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCat > 1:2686726/1‑91 (MQ=255) tAAATTCGATTTCACGTGGTGCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCata < 1:1149111/91‑1 (MQ=255) aaTTCGATTTCACGTGGTGCTGAATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATc < 1:2744499/91‑1 (MQ=255) ttCGATTTCACGTGGTGCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCt > 1:3438367/1‑91 (MQ=255) tCGATTTCACGTGGTGCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCtt < 1:2600982/91‑1 (MQ=255) tCGATTTCACGTGGTGCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCtt < 1:747491/91‑1 (MQ=255) cGATTTCACGTGGTGCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCttt < 1:2630414/91‑1 (MQ=255) cGATTTCACGTGGTGCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCttt < 1:2247499/91‑1 (MQ=255) tttCACGTGGTGCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTtct < 1:1991163/91‑1 (MQ=255) tCACGTGGTGCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCa < 1:3450777/91‑1 (MQ=255) tCACGTGGTGCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCa > 1:744845/1‑91 (MQ=255) tCACGTGGTGCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCa < 1:782495/91‑1 (MQ=255) tCACGTGGTGCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAACTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCa > 1:746159/1‑91 (MQ=255) cACGTGGTGCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAg < 1:862049/91‑1 (MQ=255) gtggtgCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGc < 1:3125298/91‑1 (MQ=255) gttgccgaagcaggaattattggtaaacctgatccggttcgcggtgaaataattaaggCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGcaa > 1:2988627‑M1/59‑91 (MQ=255) gttgccgaagcaggaattattggtaaacctgatccggttcgcggtgaaataattaaggCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGcaa > 1:2988243‑M1/59‑91 (MQ=255) ggtgCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGcaa > 1:4024733/1‑91 (MQ=255) ggtgCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGcaa > 1:4024873/1‑91 (MQ=255) gctgcATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGcaacaa < 1:2401142/91‑1 (MQ=255) ctgcATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACaaa < 1:2195657/91‑1 (MQ=255) gcATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACg > 1:3464080/1‑91 (MQ=255) cATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGc < 1:1751/91‑1 (MQ=255) cATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGc < 1:1585793/91‑1 (MQ=255) cATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGc < 1:1585792/91‑1 (MQ=255) gcaggaattattggtaaacctgatccggttcgcggtgaaataattaaggCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCt > 1:1422364‑M1/50‑91 (MQ=255) ggaattattggtaaacctgatccggttcgcggtgaaataattaaggCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTaa > 1:405120‑M1/47‑91 (MQ=255) ggaattattggtaaacctgatccggttcgcggtgaaataattaaggCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTaa > 1:405045‑M1/47‑91 (MQ=255) gCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTaa < 1:647849/91‑1 (MQ=255) ccGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAat > 1:2305957/1‑91 (MQ=255) gACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAatta > 1:1223985/1‑91 (MQ=255) gACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAatta < 1:1033572/91‑1 (MQ=255) gACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAatta > 1:2066285/1‑91 (MQ=255) aCAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAattat < 1:1224696/91‑1 (MQ=255) aCAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAattat < 1:1223739/91‑1 (MQ=255) cAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAattatt > 1:1890354/1‑91 (MQ=255) cAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAattatt > 1:3375079/1‑91 (MQ=255) cAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAattatt > 1:1890491/1‑91 (MQ=255) aaCCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTc > 1:1830793/1‑91 (MQ=255) cttcttTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCAcc > 1:1576988/1‑91 (MQ=255) cttTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACcgcg > 1:2025761/1‑91 (MQ=255) tttAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGa < 1:125981/91‑1 (MQ=255) tAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAAc < 1:1933293/91‑1 (MQ=255) aaCAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAAcc > 1:2881778/1‑91 (MQ=255) aCAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCg < 1:1348585/91‑1 (MQ=255) aCAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCg < 1:4052495/91‑1 (MQ=255) aCAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCg < 1:778931/91‑1 (MQ=255) aaTATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGAt > 1:1935882/1‑91 (MQ=255) aaTATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGAt < 1:1740639/91‑1 (MQ=255) atatACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATc < 1:3319965/91‑1 (MQ=255) atatACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATc < 1:3728103/91‑1 (MQ=255) atatACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATc < 1:3727731/91‑1 (MQ=255) ataCGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAg > 1:4038987/1‑91 (MQ=255) ataCGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAg < 1:3157241/91‑1 (MQ=255) ataCGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGATCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAg > 1:2998710/1‑91 (MQ=255) taCGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAgg < 1:1271560/91‑1 (MQ=255) aCGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGt > 1:2448850/1‑91 (MQ=255) aCGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGt > 1:3344742/1‑91 (MQ=255) aCGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGt > 1:1992761/1‑91 (MQ=255) cGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGtt < 1:2054059/91‑1 (MQ=255) gAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGttt > 1:155722/1‑91 (MQ=255) gAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGttt > 1:2816648/1‑91 (MQ=255) gAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGttt > 1:2816378/1‑91 (MQ=255) aaTTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTa < 1:1478257/91‑1 (MQ=255) aaTTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTa > 1:4092178/1‑91 (MQ=255) aTTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTAc > 1:628839/1‑91 (MQ=255) ttcttcTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCa < 1:4006967/91‑1 (MQ=255) ttcttcTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCa < 1:367423/91‑1 (MQ=255) tcttctTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCaa < 1:408847/91‑1 (MQ=255) cttcttTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCaat < 1:1056401/91‑1 (MQ=255) cttcttTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCaat < 1:1056360/91‑1 (MQ=255) cttTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCaataat < 1:2795896/91‑1 (MQ=255) tttAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTc < 1:1074314/91‑1 (MQ=255) ttCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCt > 1:1218729/1‑91 (MQ=255) | TAGGTAATTTATCTTTAAATTCGATTTCACGTGGTGCTGCATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCT > USA300TCH1516_ALE/1849982‑1850160 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |