New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 1850072 = | 103 (1.050) | 8 (0.080) | 4/154 | NT | 8.0% | coding (1531/1707 nt) | acsA_1 | Acetyl‑coenzyme A synthetase |
? | USA300TCH1516_ALE | 1850111 = | 86 (0.910) | coding (1492/1707 nt) | acsA_1 | Acetyl‑coenzyme A synthetase |
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
CATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCTTCGGCAACTGCTTCGTGTTCAACCAATTTAGACTCAACCT > USA300TCH1516_ALE/1850021‑1850200 | cATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGc < 1:1751/91‑1 (MQ=255) cATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGc < 1:456062/91‑1 (MQ=255) cATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGc < 1:1585793/91‑1 (MQ=255) aTGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGcc < 1:1906999/91‑1 (MQ=255) gcaggaattattggtaaacctgatccggttcgcggtgaaataattaaggCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCt > 1:1422444‑M1/50‑91 (MQ=255) gcaggaattattggtaaacctgatccggttcgcggtgaaataattaaggCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCt > 1:1422364‑M1/50‑91 (MQ=255) tgCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTa < 1:2103244/91‑1 (MQ=255) ggaattattggtaaacctgatccggttcgcggtgaaataattaaggCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTaa > 1:405026‑M1/47‑91 (MQ=255) ggaattattggtaaacctgatccggttcgcggtgaaataattaaggCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTaa > 1:405045‑M1/47‑91 (MQ=255) ggaattattggtaaacctgatccggttcgcggtgaaataattaaggCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTaa > 1:405120‑M1/47‑91 (MQ=255) gCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTaa < 1:647849/91‑1 (MQ=255) ccGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAat < 1:2789235/91‑1 (MQ=255) ccGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAat > 1:2305957/1‑91 (MQ=255) gACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAatta < 1:1033572/91‑1 (MQ=255) gACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAatta > 1:2030595/1‑91 (MQ=255) gACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAatta > 1:1223985/1‑91 (MQ=255) aCAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAattat < 1:1224696/91‑1 (MQ=255) aCAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAattat < 1:1223739/91‑1 (MQ=255) cAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAattatt > 1:1890491/1‑91 (MQ=255) cAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAattatt > 1:1890354/1‑91 (MQ=255) cAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAattatt > 1:3375079/1‑91 (MQ=255) cttcttTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCAcc > 1:1576988/1‑91 (MQ=255) tcttTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACcgc > 1:1674379/1‑91 (MQ=255) cttTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACcgcg > 1:2025761/1‑91 (MQ=255) tttAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGa < 1:125981/91‑1 (MQ=255) tAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAAc < 1:1933293/91‑1 (MQ=255) tAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAAc < 1:2542820/91‑1 (MQ=255) aaCAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAAcc > 1:2881778/1‑91 (MQ=255) aCAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCg < 1:778931/91‑1 (MQ=255) aCAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCg < 1:4052495/91‑1 (MQ=255) aCAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCg < 1:1348585/91‑1 (MQ=255) aaTATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGAt > 1:1935882/1‑91 (MQ=255) aaTATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGAt < 1:1740639/91‑1 (MQ=255) aaTATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGAt < 1:641022/91‑1 (MQ=255) atatACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATc < 1:3319965/91‑1 (MQ=255) atatACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATc < 1:3728103/91‑1 (MQ=255) ataCGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAg < 1:3157241/91‑1 (MQ=255) ataCGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAg > 1:4038987/1‑91 (MQ=255) ataCGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGATCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAg > 1:2998710/1‑91 (MQ=255) taCGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAgg < 1:1271560/91‑1 (MQ=255) taCGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAgg < 1:1271971/91‑1 (MQ=255) aCGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGt > 1:2448850/1‑91 (MQ=255) aCGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGt > 1:1992761/1‑91 (MQ=255) cGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGtt < 1:2054059/91‑1 (MQ=255) gAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGttt > 1:2816378/1‑91 (MQ=255) gAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGttt > 1:2816648/1‑91 (MQ=255) gAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGttt > 1:155722/1‑91 (MQ=255) gAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGttt > 1:157209/1‑91 (MQ=255) aaTTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTa > 1:3431486/1‑91 (MQ=255) aaTTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTa > 1:4092178/1‑91 (MQ=255) aTTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTAc > 1:628839/1‑91 (MQ=255) ttcttcTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCa < 1:4006967/91‑1 (MQ=255) tcttctTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCaa < 1:408847/91‑1 (MQ=255) cttcttTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCaat < 1:1056360/91‑1 (MQ=255) cttcttTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCaat < 1:1056401/91‑1 (MQ=255) cttTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCaataat > 1:2974601/1‑91 (MQ=255) tttAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTc < 1:1074314/91‑1 (MQ=255) attaaggcgtttgttgcactgagaaaaggatatgaaccaacagacgCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTc > 1:4022345‑M2/47‑91 (MQ=255) ttaaggcgtttgttgcactgagaaaaggatatgaaccaacagacgCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTcc > 1:405120‑M2/46‑91 (MQ=255) ttaaggcgtttgttgcactgagaaaaggatatgaaccaacagacgCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTcc > 1:405045‑M2/46‑91 (MQ=255) aggcgtttgttgcactgagaaaaggatatgaaccaacagacgCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGc > 1:1422364‑M2/43‑91 (MQ=255) aggcgtttgttgcactgagaaaaggatatgaaccaacagacgCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGc > 1:1422444‑M2/43‑91 (MQ=255) ttCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCt > 1:1218729/1‑91 (MQ=255) ttCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCt > 1:1218914/1‑91 (MQ=255) GTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCTTCg < 1:4050192‑M1/91‑1 (MQ=255) TCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCTTCgg < 1:2293134‑M1/91‑1 (MQ=255) cTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCTTCGGc > 1:805428/1‑91 (MQ=255) cTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCTTCGGc > 1:1091949/1‑91 (MQ=255) cTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCTTCGGc < 1:388561/91‑1 (MQ=255) ttgcactgagaaaaggatatgaaccaacagacgCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCTTCGGCAAc > 1:2988243‑M2/34‑91 (MQ=255) ggTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCTTCGGCAACTg > 1:2036665/1‑91 (MQ=255) ggTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCTTCGGCAACTg < 1:1617312/91‑1 (MQ=255) ttCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCTTCGGCAACTGCt < 1:2251708/91‑1 (MQ=255) ttCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCTTCGGCAACTGCt < 1:3473998/91‑1 (MQ=255) ttCATATCCTTTCCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCTTCGGCAACTGCt > 1:3178790/1‑91 (MQ=255) ttCATATCCTTTACTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCTTCGGCAACTGCt > 1:3178412/1‑91 (MQ=255) cATGTCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCTTCGGCAACTGCTTc < 1:3736648/91‑1 (MQ=255) cATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGGGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCTTCGGCAACTGCTTc < 1:3307075/91‑1 (MQ=255) tatCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCTTCGGCAACTGCTTCgt > 1:2537632/1‑91 (MQ=255) tCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCTTCGGCAACTGCTTCgtgt < 1:801451/91‑1 (MQ=255) cTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCTTCGGCAACTGCTTCGTGTTc > 1:3691741/1‑91 (MQ=255) cTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCTTCGGCAACTGCTTCGTGTTc > 1:3691740/1‑91 (MQ=255) cTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCTTCGGCAACTGCTTCGTGTTc > 1:3691527/1‑91 (MQ=255) ttttCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCTTCGGCAACTGCTTCGTGTTCa > 1:726388/1‑91 (MQ=255) tttCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCTTCGGCAACTGCTTCGTGTTCaa < 1:3711531/91‑1 (MQ=255) tttCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCTTCGGCAACTGCTTCGTGTTCaa < 1:3711463/91‑1 (MQ=255) tctcAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCTTCGGCAACTGCTTCGTGTTCAAcc > 1:753272/1‑91 (MQ=255) tcAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCTTCGGCAACTGCTTCGTGTTCAACCaa < 1:3109431/91‑1 (MQ=255) cAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCTTCGGCAACTGCTTCGTGTTCAACCAAt > 1:1542759/1‑91 (MQ=255) caacaaACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCTTCGGCAACTGCTTCGTGTTCAACCAATTTAGa > 1:1286554/1‑91 (MQ=255) caaACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCTTCGGCAACTGCTTCGTGTTCAACCAATTTAGACTc < 1:357062/91‑1 (MQ=255) caaACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCTTCGGCAACTGCTTCGTGTTCAACCAATTTAGACTc < 1:357158/91‑1 (MQ=255) caaACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCTTCGGCAACTGCTTCGTGTTCAACCAATTTAGACTc < 1:3913834/91‑1 (MQ=255) aaCGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCTTCGGCAACTGCTTCGTGTTCAACCAATTTAGACTCaa < 1:3275716/91‑1 (MQ=255) aaCGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCTTCGGCAACTGCTTCGTGTTCAACCAATTTAGACTCaa < 1:3275667/91‑1 (MQ=255) gCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCTTCGGCAACTGCTTCGTGTTCAACCAATTTAGACTCAACCt > 1:905010‑M2/2‑91 (MQ=255) gCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCTTCGGCAACTGCTTCGTGTTCAACCAATTTAGACTCAACCt < 1:466250‑M2/90‑1 (MQ=255) gCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCTTCGGCAACTGCTTCGTGTTCAACCAATTTAGACTCAACCt < 1:465917‑M2/90‑1 (MQ=255) gCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCTTCGGCAACTGCTTCGTGTTCAACCAATTTAGACTCAACCt < 1:1258797‑M2/90‑1 (MQ=255) gCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCTTCGGCAACTGCTTCGTGTTCAACCAATTTAGACTCAACCt < 1:2648160‑M2/90‑1 (MQ=255) | CATGTGCCGACAAACCTTCTTTAACAAATATACGAATTTCTTCTTTTAATTCGTCTGTTGGTTCATATCCTTTTCTCAGTGCAACAAACGCCTTAATTATTTCACCGCGAACCGGATCAGGTTTACCAATAATTCCTGCTTCGGCAACTGCTTCGTGTTCAACCAATTTAGACTCAACCT > USA300TCH1516_ALE/1850021‑1850200 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |