| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1867679 | 106 (1.080) | 14 (0.160) | 10/142 | NT | 12.1% | intergenic (+53/+72) | USA300HOU_RS09275/ytnP | hypothetical protein/putative quorum‑quenching lactonase YtnP |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1867699 | 110 (1.260) | intergenic (+73/+52) | USA300HOU_RS09275/ytnP | hypothetical protein/putative quorum‑quenching lactonase YtnP | |||||
Only 100 of 189 total aligned reads displayed.
CATATACTGGTGAAGTCATTAACATTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCTTTATTTTAGTTATTATCAACTA > USA300TCH1516_ALE/1867589‑1867767 | cATGTACTGGTGAAGTCATTAACATTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGGCACA < 1:3270911‑M1/91‑1 (MQ=255)cATATACTGGTGAAGTCATTAACATTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACA > 1:2043811‑M1/1‑91 (MQ=255)cATATACTGGTGAAGTCATTAACATTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACA < 1:1718992‑M1/91‑1 (MQ=255) atatACTGGTGAAGTCATTAACATTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCacac > 1:2142616/1‑91 (MQ=255) tataCTGGTGAAGTCATTAACATTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACAcc > 1:1599973/1‑91 (MQ=255) taCTGGTGAAGTCATTAACATTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCt > 1:1035068/1‑91 (MQ=255) cTGGTGAAGTCATTAACATTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTaa > 1:4068321/1‑91 (MQ=255) gTGAAGTCATTAACATTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTa < 1:284998/91‑1 (MQ=255) gTGAAGTCATTAACATTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTa > 1:1999242/1‑91 (MQ=255) gAAGTCATTAACATTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGt < 1:1358864/91‑1 (MQ=255) gTCATTAACATTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAg > 1:1333682/1‑91 (MQ=255) gTCATTAACATTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAg > 1:1707814/1‑91 (MQ=255) gTCATTAACATTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAg > 1:1237745/1‑91 (MQ=255) cATTAACATTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGTTCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGAt < 1:3598499/91‑1 (MQ=255) cATTAACATTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACAtccaatcttactaatt < 1:372203‑M1/91‑17 (MQ=255) cATTAACATTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGAt > 1:2693726/1‑91 (MQ=255) aaCATTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACAtccaatcttactaattaggg < 1:2344103‑M1/91‑21 (MQ=255) aCATTGTAGAGCGCTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGAt < 1:895515‑M2/91‑2 (MQ=255) cATTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGAtg > 1:3796178‑M2/1‑89 (MQ=255) aTTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACAtccaatcttactaattagggtgt < 1:1460460‑M1/91‑24 (MQ=255) aTTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGAtgt < 1:679535‑M2/91‑4 (MQ=255) gTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGAtgtggc < 1:4126550‑M2/91‑7 (MQ=255) gTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGAtgtggc < 1:2391636‑M2/91‑7 (MQ=255) gTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGAtgtggc > 1:2636290‑M2/1‑85 (MQ=255) gTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGAtgtggc < 1:4126536‑M2/91‑7 (MQ=255) tAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGAtgtggct > 1:3940109‑M2/1‑84 (MQ=255) agagCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAATTGAGCCACAtccaatcttactaattagggtgtggct < 1:1246447‑M1/91‑28 (MQ=255) agagCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGAtgtggctc > 1:1345683‑M2/1‑83 (MQ=255) agagCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGAtgtggctc > 1:1345705‑M2/1‑83 (MQ=255) agagCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGAtgtggctc < 1:650482‑M2/91‑9 (MQ=255) agagCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGAtgtggctc < 1:650314‑M2/91‑9 (MQ=255) agagCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGAtgtggctc < 1:650180‑M2/91‑9 (MQ=255) agCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAT‑TGAGCCACAtccaatcttactaattagggtgtggctcat < 1:2102504‑M1/91‑31 (MQ=255) agCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCaa > 1:1029186/1‑91 (MQ=255) agCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCaa > 1:909053/1‑91 (MQ=255) agCGTTAATAAGGATTTTATCCAGATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAT‑TGAGCCACAtccaatcttactaattagggtgtggctcat < 1:1794303‑M1/91‑31 (MQ=255) gCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAT‑TGAGCCACAtccaatcttactaattagggtgtggctcatt < 1:4093860‑M1/91‑32 (MQ=255) gCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAAt < 1:1372932/91‑1 (MQ=255) gTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAAttt < 1:3421118/91‑1 (MQ=255) ttAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAAtttt < 1:740284/91‑1 (MQ=255) tAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAAttttt < 1:2410757/91‑1 (MQ=255) tAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAAttttt < 1:2410826/91‑1 (MQ=255) aaTACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAAtttttt > 1:3368489/1‑91 (MQ=255) aTACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTa > 1:2229195/1‑91 (MQ=255) gAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTAtttt > 1:729992/1‑91 (MQ=255) gAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTAtttt > 1:1267862/1‑91 (MQ=255) gAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTAtttt < 1:3154652/91‑1 (MQ=255) gAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTAtttt < 1:2442132/91‑1 (MQ=255) aTTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACAtccaatcttactaattagggtgtggctcatttttaagttttac > 1:290812‑M1/1‑48 (MQ=255) aTTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATGTTTTATTTTTg > 1:3760965/1‑91 (MQ=255) aTTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATATTTTATTTTTg > 1:3761130/1‑91 (MQ=255) ttttATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGa < 1:3065284/91‑1 (MQ=255) ttttATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGa < 1:847383/91‑1 (MQ=255) ttttATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGa < 1:2703164/91‑1 (MQ=255) ttttATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGa < 1:2702951/91‑1 (MQ=255) ttttATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGa < 1:1795510/91‑1 (MQ=255) aTCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAAt > 1:3480933/1‑91 (MQ=255) aTCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAAt < 1:1665066/91‑1 (MQ=255) aTCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAAt > 1:2723668/1‑91 (MQ=255) cATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTg < 1:305202/91‑1 (MQ=255) tatTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGtt < 1:405345/91‑1 (MQ=255) atttgatttgGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGttt > 1:3016279/1‑91 (MQ=255) tgatttgGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGt < 1:4114128/91‑1 (MQ=255) atttgGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTaa > 1:3933177/1‑91 (MQ=255) atttgGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTaa > 1:3124259/1‑91 (MQ=255) tttgGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACCCCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAAt > 1:2776325/1‑91 (MQ=255) tttgGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAAt > 1:2166771/1‑91 (MQ=255) ggATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACa > 1:3224949/1‑91 (MQ=255) ggATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACa < 1:3299270/91‑1 (MQ=255) gATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACAt > 1:1933851/1‑91 (MQ=255) aTCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATc < 1:599459/91‑1 (MQ=255) gTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCttt > 1:1770366/1‑91 (MQ=255) aaCTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCTTTAttt < 1:2586559/91‑1 (MQ=255) aCTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCTTTAtttt > 1:2544368/1‑91 (MQ=255) aCTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCTTTAtttt > 1:1549522/1‑91 (MQ=255) tAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCTTTATTTTAGt < 1:185201/91‑1 (MQ=255) tAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCTTTATTTTAGt < 1:2423106/91‑1 (MQ=255) aaaaa‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCTTTATTTTAGtt > 1:3522735/1‑91 (MQ=255) aaaa‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCTTTATTTTAGtta > 1:326751/1‑91 (MQ=255) aa‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCTTTATTTTAGttatt < 1:3083634/91‑1 (MQ=255) aa‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCTTTATTTTAGttatt < 1:3083571/91‑1 (MQ=255) aa‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCTTTATTTTAGttatt > 1:417645/1‑91 (MQ=255) a‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCTTTATTTTAGttatta < 1:2742913/91‑1 (MQ=255) tGAGCCACAtcgaatcttactaattagggtgtggctcatttttaagttttacgatccaaatcaaatatggataaaattcgtattaacgctc < 1:3757262‑M1/91‑83 (MQ=255) tGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGAtgtggctcaatttttaagttttacgatccaaatcaaatatggataaaattcgtattaacgct < 1:3055764‑M2/91‑63 (MQ=255) tGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGAtgtggctcaatttttaagttttacgatccaaatcaaatatggataaaattcgtattaacgct < 1:1683420‑M2/91‑63 (MQ=255) tGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGAtgtggctcaattttaagttttacgatccaaatcaaatatggataaaattcgtattaacgctc < 1:1949008‑M2/91‑63 (MQ=255) gAGCCACAtccaatcttactaattagggtgtggctcatttttaagttttacgatccaaatcaaatatggataaaattcgtattaacgctct < 1:650180‑M1/91‑84 (MQ=255) gAGCCACAtccaatcttactaattagggtgtggctcatttttaagttttacgatccaaatcaaatatggataaaattcgtattaacgctct < 1:358576‑M1/91‑84 (MQ=255) gAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGAtgtggctcatttttaagttttacgatccaaatcaaatatggataaaattcgtattaacgctct < 1:255149‑M2/91‑64 (MQ=255) gCCACAtccaatcttactaattagggtgtggctcatttttaagttttacgatccaaatcaaatatggataaaattcgtattaacgctctac < 1:61456‑M1/91‑86 (MQ=255) gCCACAtccaatcttactaattagggtgtggctcatttttaagttttacgatccaaatcaaatatggataaaattcgtattaacgctctac > 1:1752737‑M1/1‑6 (MQ=255) gCCACAtccaatcttactaattagggtgtggctcatttttaagttttacgatccaaatcaaatatggataaaattcgtattaacgctctac < 1:2766028‑M1/91‑86 (MQ=255) gCCACAtccaatcttactaattagggtgtggctcatttttaagttttacgatccaaatcaaatatggataaaattcgtattaacgctctac < 1:1257739‑M1/91‑86 (MQ=255) gCCACAtccaatcttactaattagggtgtggctcatttttaagttttacgatccaaatcaaatatggataaaattcgtattaacgctctac < 1:1079778‑M1/91‑86 (MQ=255) gCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCTTTATTTTAGTTATTATCaa < 1:1528269/91‑1 (MQ=255) ccACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCTTTATTTTAGTTATTATCAAc > 1:1637191/1‑91 (MQ=255) ccACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCTTTATTTTAGTTATTATCAAc < 1:3898781/91‑1 (MQ=255) cacaCCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCTTTATTTTAGTTATTATCAACt < 1:2981025/91‑1 (MQ=255) acacCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCTTTATTTTAGTTATTATCAACTa < 1:3896901/91‑1 (MQ=255) | CATATACTGGTGAAGTCATTAACATTGTAGAGCGTTAATACGAATTTTATCCATATTTGATTTGGATCGTAAAACTTAAAAA‑TGAGCCACACCCTAATTAGTAAGATTGGATGTGGCTCAATTTTTTATTTTTGAAAATTTGTTTAGTAATACATCTTTATTTTAGTTATTATCAACTA > USA300TCH1516_ALE/1867589‑1867767 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |