| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 1870532 = | 77 (0.780) | 14 (0.160) | 8/144 | NT | 18.1% | intergenic (‑19/+531) | srkA/dat | Stress response kinase A/D‑alanine aminotransferase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 1870584 = | 57 (0.640) | intergenic (‑71/+479) | srkA/dat | Stress response kinase A/D‑alanine aminotransferase | |||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
AGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCTAATTTATAACACCATACTGGTACAAATATTATGTCCAGATAA > USA300TCH1516_ALE/1870442‑1870621 | acgatttaaatttagtcgtgtaatgtaggcattggttgaggatttacaataattatctggacataatatttgtaccagtatggtgttataa < 1:2338665‑M1/1‑1 (MQ=255)acgatttaaatttagtcgtgtaatgtaggcattggttgaggatttacaataattatctggacataatatttgtaccagtatggtgttataa < 1:1710151‑M1/1‑1 (MQ=255) ccATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAAt > 1:2679455/1‑91 (MQ=255) atttaaatttagtcgtgtaatgtaggcattggttgaggatttacaataattatctggacataatatttgtaccagtatggtgttataAAtt > 1:446515‑M1/88‑91 (MQ=255) atttaaatttagtcgtgtaatgtaggcattggttgaggatttacaataattatctggacataatattggtaccagtatggtgttataAAtt > 1:1294503‑M1/88‑91 (MQ=255) tttaaatttagtcgtgtaatgtaggcattggttgaggatttacaataattatctggacataatatttgtaccagtatggtgttataAATTa < 1:1098310‑M1/5‑1 (MQ=255) atatctGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTa > 1:3270554/1‑91 (MQ=255) atatatGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTa < 1:1702509/91‑1 (MQ=255) atatGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGa < 1:515467/91‑1 (MQ=255) aaatttagtcgtgtaatgtaggcattggttgaggatttacaataattatctggacataatatttgtaccagtatggtgttataAATTAGaa > 1:1457413‑M1/84‑91 (MQ=255) atGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGaa‑a > 1:2610155/1‑91 (MQ=255) tGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGaa‑a‑a < 1:1363498/91‑1 (MQ=255) tGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGaa‑a‑a > 1:4037654/1‑91 (MQ=255) tCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGc > 1:1201162/1‑91 (MQ=255) tCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGc > 1:1196089/1‑91 (MQ=255) tCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGc > 1:733133/1‑91 (MQ=255) aCCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑C‑ATGGctc > 1:3943746/1‑91 (MQ=255) aCCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGctc > 1:3942895/1‑91 (MQ=255) gATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGa > 1:2313504/1‑91 (MQ=255) aTGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGaa > 1:2546461/1‑91 (MQ=255) tGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGaaa > 1:1727375/1‑91 (MQ=255) tGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGaaa > 1:1017757/1‑91 (MQ=255) tGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGaaa < 1:1547964/91‑1 (MQ=255) tGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGaaa < 1:3672087/91‑1 (MQ=255) tGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGaaa > 1:1017796/1‑91 (MQ=255) gCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAAt > 1:3940691/1‑91 (MQ=255) gCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAAt > 1:522218/1‑91 (MQ=255) gCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAAt < 1:1174056/91‑1 (MQ=255) gCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAAt < 1:3236917/91‑1 (MQ=255) gtaggcattggttgaggatttacaataattatctggacataatatttgtaccagtatggtgttataAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAg > 1:417065‑M1/67‑91 (MQ=255) accaccTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAg < 1:1634353/91‑1 (MQ=255) accaccTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAg < 1:2940179/91‑1 (MQ=255) ccaccTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAgg < 1:1598642/91‑1 (MQ=255) ccaccTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAgg > 1:3300711/1‑91 (MQ=255) ccaccTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAgg > 1:138379/1‑91 (MQ=255) ccaccTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGCCTCTAGAAATAgg > 1:4141153/1‑91 (MQ=255) caccTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGt < 1:3263076/91‑1 (MQ=255) caccTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGt > 1:3639863/1‑91 (MQ=255) ccTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACTTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGttt < 1:3507391/91‑1 (MQ=255) ttggttgaggatttacaataattatctggacataatatttgtaccagtatggtgttataAATTAGAATATATGGCTCTAGAAATAGGtttt > 1:3210758‑M1/60‑91 (MQ=255) gctgAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTc > 1:1087996/1‑91 (MQ=255) ctgAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCa > 1:1369727/1‑91 (MQ=255) tgAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTCGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCaa > 1:3837893/1‑91 (MQ=255) tgAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCaa > 1:1865699/1‑91 (MQ=255) gttgaggatttacaataattatctggacataatatttgtaccagtatggtgttataAATTAGAATATATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCa > 1:2435214‑M1/57‑91 (MQ=255) gAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAag < 1:1428328/91‑1 (MQ=255) aaTCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCgaga > 1:3214846/1‑91 (MQ=255) aaTCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAaga > 1:884133/1‑91 (MQ=255) aaTCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAaga < 1:1224692/91‑1 (MQ=255) aTCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAagag > 1:1815726/1‑91 (MQ=255) tCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGc > 1:3321266/1‑91 (MQ=255) aggatttacaataattatctggacataatatttgtaccagtatggtgttataAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGcc > 1:1105405‑M1/53‑91 (MQ=255) ggatttacaataattatctggacataatatttgtaccagtatggtgttataAATTAGAATATATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGc > 1:2682330‑M1/52‑91 (MQ=255) gtgtCGACCCTAATTGATAAAACTGTTCCAACTCGTCCAGCTCACTTTCAATTGGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCata < 1:3861359/91‑1 (MQ=255) gtgtCGACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCAGCTCACTTTCAATTGGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCata < 1:3861361/91‑1 (MQ=255) gtgtCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCata > 1:631072/1‑91 (MQ=255) gtgtCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCata > 1:426782/1‑91 (MQ=255) gtCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCatata > 1:1699570/1‑91 (MQ=255) gtCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCatata > 1:1700932/1‑91 (MQ=255) tCCACCCTATTTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCatatat > 1:2090621/1‑91 (MQ=255) tCCACCCTAGTTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCatatat > 1:2090530/1‑91 (MQ=255) tCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCatatat < 1:1783244/91‑1 (MQ=255) ccACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATAtt < 1:1976807/91‑1 (MQ=255) cACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTc > 1:2582446/1‑91 (MQ=255) aCCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAATTAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCt < 1:873761/91‑1 (MQ=255) aCCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCt < 1:1890970/91‑1 (MQ=255) aCCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCt < 1:68235/91‑1 (MQ=255) aCCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCt < 1:363498/91‑1 (MQ=255) cccTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCTa > 1:1012269/1‑91 (MQ=255) taattatctggacataatatttgtaccagtatggtgttataAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCTaa > 1:1422407‑M1/42‑91 (MQ=255) taattatctggacataatatttgtaccagtatggtgttataAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCTaa > 1:2091733‑M1/42‑91 (MQ=255) aattatctggacataatatttgtaccagtatggtgttataAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCTAAt > 1:63579‑M1/41‑91 (MQ=255) aattatctggacataatatttgtaccagtatggtgttataAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCTAAt > 1:3712414‑M1/41‑91 (MQ=255) aattatctggacataatatttgtaccagtatggtgttataAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCTAAt > 1:1431829‑M1/41‑91 (MQ=255) aattatctggacataatatttgtaccagtatggtgttataAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCTAAt > 1:1431294‑M1/41‑91 (MQ=255) tAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCTAAtt < 1:401099/91‑1 (MQ=255) attatctggacataatatttgtaccagtatggtgttataAATTAGAATATATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCTaa > 1:1228420‑M1/40‑91 (MQ=255) attatctggacataatatttgtaccagtatggtgttataAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCTAAtt > 1:2453219‑M1/40‑91 (MQ=255) aTTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCTAATTta > 1:229652/1‑91 (MQ=255) tGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCTAATTtata > 1:3573221/1‑91 (MQ=255) tggacataatatttgtaccagtatggtgttataAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCTAATTTATAac > 1:1548631‑M1/34‑91 (MQ=255) atatAACTGTTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCTAATTTATAac < 1:3727963/91‑1 (MQ=255) aTAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCTAATTTATAac < 1:1121932/91‑1 (MQ=255) aTAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCTAATTTATAac < 1:2336083/91‑1 (MQ=255) tAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCTAATTTATAaca > 1:1435787/1‑91 (MQ=255) tAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCTAATTTATAaca > 1:1681861/1‑91 (MQ=255) aaaCTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCTAATTTATAACAcc > 1:3609890/1‑91 (MQ=255) aaaCTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCTAATTTATAACAcc < 1:875205/91‑1 (MQ=255) cTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCTAATTTATAACACCATa > 1:230001/1‑91 (MQ=255) gCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCTAATTTATAACACCATACt > 1:273544/1‑91 (MQ=255) gCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCTAATTTATAACACCATACt > 1:2116073/1‑91 (MQ=255) tCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCTAATTTATAACACCATACTgg < 1:1218789/91‑1 (MQ=255) ccAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCTAATTTATAACACCATACTGGt < 1:506066/91‑1 (MQ=255) ccAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCTAATTTATAACACCATACTGGt > 1:3663915/1‑91 (MQ=255) cACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCTAATTTATAACACCATACTGGTACAAAtatta > 1:2635716/1‑91 (MQ=255) aCTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCTAATTTATAACACCATACTGGTACAAATATTATGTCCa > 1:3805444/1‑91 (MQ=255) cTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCTAATTTATAACACCATACTGGTACAAATATTATGTCCAg < 1:1050804/91‑1 (MQ=255) tttCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCTAATTTATAACACCATACTGGTACAAATATTATGTCCAGa < 1:2152793/91‑1 (MQ=255) tCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCTAATTTATAACACCATACTGGTACAAATATTATGTCCAGATa > 1:832530/1‑91 (MQ=255) cAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCTAATTTATAACACCATACTGGTACAAATATTATGTCCAGATaa > 1:1188506/1‑91 (MQ=255) | AGCCATATATGCTTCACCAGATGCACCACCTGCTGAATCAAGTGTCCACCCTAATTGATAAAACTGCTCCAACTCGTCCACCTCACTTTCAATTAGAA‑A‑ATGGCTCTAGAAATAGGTTTTTCAAGAGCCATATATTCTAATTTATAACACCATACTGGTACAAATATTATGTCCAGATAA > USA300TCH1516_ALE/1870442‑1870621 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |