| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 1965743 | 66 (0.670) | 5 (0.060) | 4/146 | NT | 7.4% | coding (65/924 nt) | hemH | Ferrochelatase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 1965774 | 65 (0.720) | coding (34/924 nt) | hemH | Ferrochelatase | |||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
AAACCACCTATAAATTCATATCTATCTTTCAAATCTTGAAGTTCTTCTTCAGATGGACGTTTACCATGTCTAATATCTGTATAATATGGCTCTATGTCACTTTCTTTATAAGGTGTGCCATAAGCCATAACTAATAATCCCATTTTTTTAGTCATTGATAATACCTTCCTTTAAATGAAT > USA300TCH1516_ALE/1965653‑1965832 | atcatagttttacattgaagcacatgaaagataattcatttaaaggaaggtattatcaatgactaaaaaaatgggattattagtTATGGct < 1:2036934‑M1/7‑1 (MQ=255)atcatagttttacattgaagcacatgaaagataattcatttaaaggaaggtattatcaatgactaaaaaaatgggattattagtTATGGct < 1:2225827‑M1/7‑1 (MQ=255) ccaccTATAAATTCATATCTATCTTTCAAATCTTGAAGTTCTTCTTCAGATGGACGTTTACCATGTCTAATATCTGTATAATATGGCTCTa > 1:322783/1‑91 (MQ=255) caccTATAAATGCATATCTATCTTTCAAATCTTGAAGTTCTTCTTCAGATGGACGTTTACCATGTCTAATATCTGTATAATATGGCTCTAt < 1:3759206/91‑1 (MQ=255) ccTATAAATTCATATCTATCTTTCAAATCTTGAAGTTCTTCTTCAGATGGACGTTTACCATGTCTAATATCTGTATAATATGGCTCTATGt > 1:3571469/1‑91 (MQ=255) cTATAAATTCATATCTATCTTTCAAATCTTGAAGTTCTTCTTCAGATGGACGTTTACCATGTCTAATATCTGTATAATATGGCTCTATGTc < 1:3807469/91‑1 (MQ=255) cTATAAATTCATATCTATCTTTCAAATCTTGAAGTTCTTCTTCAGATGGACGTTTACCATGTCTAATATCTGTATAATATGGCTCTATGTc > 1:1203987/1‑91 (MQ=255) tataAATTCATATCTATCTTTCAAATCTTGAAGTTCTTCTTCAGATGGACGTTTACCATGTCTAATATCTGTATAATATGGCTCTATGTCa < 1:3923203/91‑1 (MQ=255) ataAATTCATATCTATCTTTCAAATCTTGAAGTTCTTCTTCAGATGGACGTTTACCATGTCTAATATCTGTATAATATGGCTCTATGTCAc < 1:523153/91‑1 (MQ=255) ataAATTCATATCTATCTTTCAAATCTTGAAGTTCTTCTTCAGATGGACGTTTACCATGTCTAATATCTGTATAATATGGCTCTATGTCAc > 1:1608901/1‑91 (MQ=255) aaaTTCATATCTATCTTTCAAATCTTGAAGTTCTTCTTCAGATGGACGTTTACCATGTCTAATATCTGTATAATATGGCTCTATGTCActt < 1:947031/91‑1 (MQ=255) tCATATCTATCTTTCAAATCTTGAAGTTCTTCTTCAGATGGACGTTTACCATGTCTAATATCTGTATAATATGGCTCTATGTCActttctt < 1:2540430/91‑1 (MQ=255) atatCTATCTTTCAAATCTTGAAGTTCTTCTTCAGATGGACGTTTACCATGTCTAATATCTGTATAATATGGCTCTATGTCACTTTCTTta > 1:4132388/1‑91 (MQ=255) gaaagataattcatttaaaggaaggtattatcaatgactaaaaaaatgggattattagtTATGGCTCTATGTCACTTTCTTTATAAGgtgt > 1:1422586‑M1/60‑91 (MQ=255) ctTTCAAATCTTGAAGTTCTTCTTCAGATGGACGTTTACCATGTCTAATATCTGTATAATATGGCTCTATGTCACTTTCTTTATAAGgtgt < 1:2274145/91‑1 (MQ=255) ctTTCAAATCTTGAAGTTCTTCTTCAGATGGACGTTTACCATGTCTAATATCTGTATAATATGGCTCTATGTCACTTTCTTTATAAGgtgt < 1:1918511/91‑1 (MQ=255) tttCAAATCTTGAAGTTCTTCTTCAGATGGACGTTTACCATGTCTAATATCTGTATAATATGGCTCTATGTCACTTTCTTTATAAGGtgtg > 1:1256993/1‑91 (MQ=255) ttCAAATCTTGAAGTTCTTCTTCAGATGGACGTTTACCATGTCTAATATCTGTATAATATGGCTCTATGTCACTTTCTTTATAAGGTGTgc < 1:69316/91‑1 (MQ=255) tCAAATCTTGAAGTTCTTCTTCAGATGGACGTTTACCATGTCTAATATCTGTATAATATGGCTCTATGTCACTTTCTTTATAAGGTGTgcc > 1:2574821/1‑91 (MQ=255) tCAAATCTTGAAGTTCTTCTTCAGATGGACGTTTACCATGTCTAATATCTGTATAATATGGCTCTATGTCACTTTCTTTATAAGGTGTgcc > 1:2576097/1‑91 (MQ=255) cAAATCTTGAAGTTCTTCTTCAGATGGACGTTTACCATGTCTAATATCTGTATAATATGGCTCTATGTCACTTTCTTTATAAGGTGTgcca > 1:2689236/1‑91 (MQ=255) aaaTCTTGAAGTTCTTCTTCAGATGGACGTTTACCATGTCTAATATCTGTATAATATGGCTCTATGTCACTTTCTTTATAAGGTGTgccat < 1:954266/91‑1 (MQ=255) taattcatttaaaggaaggtattatcaatgactaaaaaaatgggattattagtTATGGCTCTATGTCACTTTCTTTATAAGGTGTgccata > 1:1330651‑M1/54‑91 (MQ=255) aaTCTTGAAGTTCTTCTTCAGATGGACGTTTACCATGTCTAATATCTGTATAATATGGCTCTATGTCACTTTCTTTATAAGGTGTgccata < 1:3451706/91‑1 (MQ=255) aaTCTTGAAGTTCTTCTTCAGATGGACGTTTACCATGTCTAATATCTGTATAATATGGCTCTATGTCACTTTCTTTATAAGGTGTgccata > 1:3252862/1‑91 (MQ=255) aattcatctaaaggaaggtattatcaatgactaaaaaaatgggattattagtTATGGCTCTATGTCACTTTCTTTATAAGGTGTgccataa > 1:2076152‑M1/53‑91 (MQ=255) cTTGAAGTTCTTCTTCAGATGGACGTTTACCATGTCTAATATCTGTATAATATGGCTCTATGTCACTTTCTTTATAAGGTGTGCCATAagc > 1:3027821‑M2/1‑88 (MQ=255) cTTGAAGTTCTTCTTCAGATGGACGTTTACCATGTCTAATATCTGTATAATATGGCTCTATGTCACTTTCTTTATAAGGTGTGCCATAagc > 1:314953‑M2/1‑88 (MQ=255) cTTGAAGTTCTTCTTCAGATGGACGTTTACCATGTCTAATATCTGTATAATATGGCTCTATGTCACTTTCTTTATAAGGTGTGCCATAagc > 1:316478‑M2/1‑88 (MQ=255) tGAAGTTCTTCTTCAGATGGACGTTTACCATGTCTAATATCTGTATAATATGGCTCTATGTCACTTTCTTTATAAGGTGTGCCATAagcca < 1:1557457‑M2/91‑6 (MQ=255) gAAGTTCTTCTTCAGATGGACGTTTACCATGTCTAATATCTGTATAATATGGCTCTATGTCACTTTCTTTATAAGGTGTGCCATAagccat < 1:3989068‑M2/91‑7 (MQ=255) aaGTTCTTCTTCAGATGGACGTTTACCATGTCTAATATCTGTATAATATGGCTtatggcacaccttataaagaaagtgacatagagccata < 1:1524983‑M1/91‑39 (MQ=255) aaGTTCTTCTTCAGATGGACGTTTACCATGTCTAATATCTGTATAATATGGCTCTATGTCACTTTCTTTATAAGGTGTGCCATAagccata < 1:3771871‑M2/91‑8 (MQ=255) aaGTTCTTCTTCAGATGGACGTTTACCATGTCTAATATCTGTATAATATGGCTCTATGTCACTTTCTTTATAAGGTGTGCCATAagccata < 1:2824859‑M2/91‑8 (MQ=255) aGTTCTTCTTCAGATGGACGTTTACCATGTCTAATATCTGTATAATATGGCTtatggcacaccttataaagaaagtgacatagagccatat < 1:2378381‑M1/91‑40 (MQ=255) aGTTCTTCTTCAGATGGACGTTTACCATGTCTAATATCTGTATAATATGGCTtatggcacaccttataaagaaagtgacatagagccatat < 1:2379398‑M1/91‑40 (MQ=255) aGTTCTTCTTCAGATGGACGTTTACCATGTCTAATATCTGTATAATATGGCTCTATGTCACTTTCTTTATAAGGTGTgccataagccataa > 1:1545856/1‑91 (MQ=255) aGTTCTTCTTCAGATGGACGTTTACCATGTCTAATATCTGTATAATATGGCTCTATGTCACTTTCTTTATAAGGTGTgccataagccataa > 1:173186/1‑91 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |