| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2014149 | 107 (1.090) | 9 (0.100) | 7/148 | NT | 7.6% | intergenic (+49/+212) | USA300HOU_RS10140/USA300HOU_RS10150 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2014182 | 119 (1.310) | intergenic (+82/+179) | USA300HOU_RS10140/USA300HOU_RS10150 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
TTACAGAAGATAAGTTACAACGTAAACTGTATGCTAAATAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAACTATGAATGCTTTTACAAAATCTAAAATTTATATTGTT > USA300TCH1516_ALE/2014060‑2014239 | ttACAGAAGATAAGTTACAACGTAAACTGTATGCTAAATAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCggg < 1:795047/91‑1 (MQ=255) aCAGAAGATAAGTTACAACGTAAACTGTATGCTAAATAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCa > 1:2203952/1‑91 (MQ=255) cAGAAGATAAGTTACAACGTAAACTGTATGCTAAATAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAg < 1:2199995/91‑1 (MQ=255) cAGAAGATAAGTTACAACGTAAACTGTATGCTAAATAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAg > 1:3631016/1‑91 (MQ=255) agaagaTAAGTTACAACGTAAACTGTATGCTAAATAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGa < 1:3056122/91‑1 (MQ=255) gaagaTAAGTTACAACGTAAACTGTATGCTAAATAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAgca > 1:461343/1‑89 (MQ=255) gaagaTAAGTTACAACGTAAACTGTATGCTAAATAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGaa > 1:1106912/1‑91 (MQ=255) agaTAAGTTACAACGTAAACTGTATGCTAAATAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATg > 1:2910675/1‑91 (MQ=255) agaTAAGTTACAACGTAAACTGTATGCTAAATAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATg < 1:1402299/91‑1 (MQ=255) gaTAAGTTACAACGTAAACTGTATGCTAAATAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGa < 1:2185332/91‑1 (MQ=255) tAAGTTACAACGTAAACTGTATGCTAAATAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGaaa > 1:150562/1‑91 (MQ=255) aaGTTACAACGTAAACTGTATGCTAAATAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGaaaa > 1:2376530/1‑91 (MQ=255) aaGTTACAACGTAAACTGTATGCTAAATAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGaaaa > 1:2942674/1‑91 (MQ=255) aaGTTACAACGTAAACTGTATGCTAAATAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGaaaa > 1:3901749/1‑91 (MQ=255) ttACAACGTAAACTGTATGCTAAATAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCa > 1:225325/1‑91 (MQ=255) ttACAACGTAAACTGTATGCTAAATAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCa > 1:4122421/1‑91 (MQ=255) tACAACGTAAACTGTATGCTAAATATTTTCAAGTTATTACTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCaa < 1:3853120/91‑1 (MQ=255) tACAACGTAAACTGTATGCTAAATAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCaa > 1:3023204/1‑91 (MQ=255) cAACGTAAACTGTATGCTAAATAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCaaaa < 1:1916059/91‑1 (MQ=255) cAACGTAAACTGTATGCTAAATAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCaaaa < 1:2995180/91‑1 (MQ=255) aaCGTAAACTGTATGCTAAATAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAAc > 1:2578825/1‑91 (MQ=255) aaCGTAAACTGTATGCTAAATAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAAc < 1:1416884/91‑1 (MQ=255) aaCGTAAACTGTATGCTAAATAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAAc > 1:2349838/1‑91 (MQ=255) cGTAAACTGTATGCTAAATAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGa > 1:2864534/1‑91 (MQ=255) cGTAAACTGTATGCTAAATAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGa < 1:1321163/91‑1 (MQ=255) aaaCTGTATGCTAAATAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGAttt > 1:2933476/1‑91 (MQ=255) aaaCTGTATGCTAAATAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGAttt > 1:4032465/1‑91 (MQ=255) aaaCTGTATGCTAAATAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGAttt > 1:1803266/1‑91 (MQ=255) aaCTGTATGCTAAATAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGAtttt < 1:3392722/91‑1 (MQ=255) aCTGTATGCTAAATAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGacagagtaaaaatcgttttgattttc < 1:93083‑M1/91‑27 (MQ=255) cTGTATGCTAAATAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTa > 1:711790/1‑91 (MQ=255) tGTATGCTAAATAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGacagagtaaaaatcgttttgattttcat < 1:1863499‑M1/91‑29 (MQ=255) tATGCTAAATAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTActc > 1:1065673/1‑91 (MQ=255) gCTAAATAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGt < 1:2385376/91‑1 (MQ=255) tAAATAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGacagagtaaaaatcgttttgattttcattctgccc < 1:278581‑M1/91‑36 (MQ=255) tAAATAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGacagagtaaaaatcgttttgattttcattctgccc < 1:4019462‑M1/91‑36 (MQ=255) aaaatAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTcc > 1:886585‑M2/2‑89 (MQ=255) aaaTAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTccg < 1:2717393‑M2/91‑4 (MQ=255) aataatTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGacagagtaaaaatcgttttgattttcattctgcccgg < 1:2515845‑M1/91‑38 (MQ=255) aataatTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGacagagtaaaaatcgttttgattttcattctgcccgg < 1:2516170‑M1/91‑38 (MQ=255) atTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGtttt < 1:2745732/91‑1 (MQ=255) tttCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGttttt > 1:595379/1‑91 (MQ=255) ttCAAGTTATTGTTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGtttttt < 1:3766844/91‑1 (MQ=255) ttCAAGTTATTGTTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGtttttt < 1:3766757/91‑1 (MQ=255) ttCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGtttttt > 1:2649729/1‑91 (MQ=255) ttCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGtttttt < 1:252010/91‑1 (MQ=255) ttCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGtttttt < 1:251950/91‑1 (MQ=255) ttCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGtttttt > 1:209024/1‑91 (MQ=255) tCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGacagagtaaaaatcgttttgattttcattctgcccggttgttca < 1:3414279‑M1/91‑45 (MQ=255) aGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATg < 1:937395/91‑1 (MQ=255) aGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATg < 1:1167220/91‑1 (MQ=255) gTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGt > 1:853081/1‑91 (MQ=255) gTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTGTTTTAATGt > 1:3969872/1‑91 (MQ=255) attattCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTaaa < 1:400301/91‑1 (MQ=255) tattCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAAc > 1:190152/1‑91 (MQ=255) ttCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGacagagtaaaaatcgttttgattttcattctgcccggttgttcattttttataga < 1:2921381‑M1/91‑56 (MQ=255) tCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAACTAt < 1:4108419/91‑1 (MQ=255) tCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAACTAt < 1:3678373/91‑1 (MQ=255) cACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAACTATg < 1:1581207/91‑1 (MQ=255) aCTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAACTATGa > 1:1397208/1‑91 (MQ=255) tAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAACTATGAAt > 1:671929/1‑91 (MQ=255) aaaGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAACTATGAATg < 1:3660774/91‑1 (MQ=255) aGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAACTATGAATGCt > 1:1650616/1‑91 (MQ=255) aGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAACTATGAATGCt < 1:1062580/91‑1 (MQ=255) aGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAACTATGAATGCt > 1:2366740/1‑91 (MQ=255) gTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCGAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAACTATGAATGCtt > 1:3926934/1‑91 (MQ=255) gTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAACTATGAATGCtt > 1:350025/1‑91 (MQ=255) gTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAACTATGAATGCtt > 1:1284269/1‑91 (MQ=255) gTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAACTATGAATGCtt > 1:3429402/1‑91 (MQ=255) ttAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAACTATGAATGCttt < 1:1985295/91‑1 (MQ=255) ttAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAACTATGAATGCttt < 1:1985187/91‑1 (MQ=255) aaTCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAACTATGAATGCTTTTa < 1:2489180/91‑1 (MQ=255) aaTCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAACTATGAATGCTTTTa > 1:915605/1‑91 (MQ=255) aaTCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTACGGTTTTTTAATGTAAAACTATGAATGCTTTTa > 1:3675993/1‑91 (MQ=255) aTCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAACTATGAATGCTTTTAc < 1:2432839/91‑1 (MQ=255) tCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAACTATGAATGCTTTTACa > 1:3166255/1‑91 (MQ=255) tCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAACTATGAATGCTTTTACa > 1:1653530/1‑91 (MQ=255) tCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAACTATGAATGCTTTTACa > 1:433515/1‑91 (MQ=255) cTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAACTATGAATGCTTTTACaa > 1:262815/1‑91 (MQ=255) taAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAACTATGAATGCTTTTACAAAAt > 1:1619348/1‑91 (MQ=255) taAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAACTATGAATGCTGTTACAAAAt > 1:3962784/1‑91 (MQ=255) aaaaaaTGACCAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAACTATGAATGCTTTTGCAAAATc > 1:2080936/1‑91 (MQ=255) tGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTccggttgttcattttttatagattaactttagtgaataataacttga < 1:3414279‑M2/91‑48 (MQ=255) gAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAACTATGAATGCTTTTACAAAATCTAAAAtt > 1:3657615/1‑91 (MQ=255) gAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAACTATGAATGCTTTTACAAAATCTAAAAtt > 1:934938/1‑91 (MQ=255) gAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAACTATGAATGCTTTTACAAAATCTAAAAtt < 1:646122/91‑1 (MQ=255) aacaacCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAACTATGAATGCTTTTACAAAATCTAAAAttt > 1:3344447/1‑91 (MQ=255) aacaacCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAACTATGAATGCTTTTACAAAATCTAAAAttt < 1:3358514/91‑1 (MQ=255) aacaacCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAACTATGAATGCTTTTACAAAATCTAAAAttt > 1:3345195/1‑91 (MQ=255) acaacCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAACTATGAATGCTTTTACAAAATCTAAAATTta > 1:1230845/1‑91 (MQ=255) acaacCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAACTATGAATGCTTTTACAAAATCTAAAATTta < 1:1150499/91‑1 (MQ=255) caacCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAACTATGAATGCTTTTACAAAATCTAAAATTtat > 1:655491/1‑91 (MQ=255) aacCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAACTATGAATGCTTTTACAAAATCTAAAATTtata > 1:479114/1‑91 (MQ=255) acCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAACTATGAATGCTTTTACAAAATCTAAAATTTatat > 1:222613/1‑91 (MQ=255) ccGGacagagtaaaaatcgttttgattttcattttgcccggttgttcattttttatagattaactttagtgaataataacttgaaattatt > 1:2934590‑M1/1‑4 (MQ=255) ccGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTccggttgttcattttttatagattaactttagtgaataataacttgaaattatt < 1:2515845‑M2/91‑55 (MQ=255) cGGacagagtaaaaatcgttttgattttcattctgcccggttgttcattttttatagattaactttagtgaataataacttgaaattattt < 1:2717393‑M1/91‑89 (MQ=255) gggCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTccggttgttcattttttatagattaactttagtgaataataacttgaaattattta < 1:278581‑M2/91‑57 (MQ=255) gggCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTccggttgttcattttttatagattaactttagtgaataataacttgaaattattta < 1:4019462‑M2/91‑57 (MQ=255) ggCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTccggttgttcattttttatagattaactttagtgaataataacttgaaattatttag < 1:1658452‑M2/91‑58 (MQ=255) | TTACAGAAGATAAGTTACAACGTAAACTGTATGCTAAATAATTTCAAGTTATTATTCACTAAAGTTAATCTATAAAAAATGAACAACCGGGCAGAATGAAAATCAAAACGATTTTTACTCTGTCCGGTTTTTTAATGTAAAACTATGAATGCTTTTACAAAATCTAAAATTTATATTGTT > USA300TCH1516_ALE/2014060‑2014239 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |