| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2021642 | 74 (0.750) | 4 (0.050) | 4/134 | NT | 5.4% | intergenic (+201/+59) | queE_2/USA300HOU_RS10190 | 7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase/putative acyl‑CoA thioester hydrolase |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2021681 | 79 (0.960) | intergenic (+240/+20) | queE_2/USA300HOU_RS10190 | 7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase/putative acyl‑CoA thioester hydrolase | |||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
TAAAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAAT > USA300TCH1516_ALE/2021552‑2021732 | taaAGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAACAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGTATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGT < 1:3683183‑M1/91‑1 (MQ=255) aaaGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTa < 1:3434565/91‑1 (MQ=255) aGGGCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAgg < 1:3324651/91‑1 (MQ=255) gCATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTgg < 1:1579290/91‑1 (MQ=255) cATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGCCAGATTGTAGGTGGa < 1:2383735/91‑1 (MQ=255) cATTTAATAGGACTAATAGTCTATAATAAAAGGGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGa > 1:1021956/1‑91 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |