New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2021642 | 74 (0.750) | 4 (0.050) | 4/134 | NT | 5.4% | intergenic (+201/+59) | queE_2/USA300HOU_RS10190 | 7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase/putative acyl‑CoA thioester hydrolase |
? | USA300TCH1516_ALE | = 2021681 | 79 (0.960) | intergenic (+240/+20) | queE_2/USA300HOU_RS10190 | 7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase/putative acyl‑CoA thioester hydrolase |
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
GGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGCTTTT > USA300TCH1516_ALE/2021591‑2021770 | gggTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTa > 1:2373532/1‑91 (MQ=255) gggTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTa < 1:884724/91‑1 (MQ=255) ggTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAa > 1:2607316‑M2/1‑90 (MQ=255) ggTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAa > 1:3064370‑M2/1‑90 (MQ=255) ggTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAa > 1:289510‑M2/1‑90 (MQ=255) gTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAac < 1:2812913‑M2/91‑3 (MQ=255) gTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAac > 1:2808520‑M2/1‑89 (MQ=255) aaaTTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAacaa > 1:2669376‑M2/1‑87 (MQ=255) aaTTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAacaat > 1:2018506‑M2/1‑86 (MQ=255) aaTTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAacaat < 1:282195‑M2/91‑6 (MQ=255) ttAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAacaatctgt > 1:3076078‑M2/1‑82 (MQ=255) ttAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAacaatctgt < 1:1000665‑M2/91‑10 (MQ=255) tAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGGTTGTAGGTAGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAacaatctgtc > 1:1503798‑M2/1‑81 (MQ=255) aaCTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAacaatctgtct < 1:3113168‑M2/91‑12 (MQ=255) aCTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAacaatctgtctt < 1:4150347‑M2/91‑13 (MQ=255) aaaaGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTtat < 1:2661307/91‑1 (MQ=255) aaaaGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTtat > 1:493547/1‑91 (MQ=255) aaaGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTtata > 1:2620665/1‑91 (MQ=255) aaaGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTtata > 1:398313/1‑91 (MQ=255) aaGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTatat < 1:376112/91‑1 (MQ=255) aaGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTatat < 1:376142/91‑1 (MQ=255) gCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATAttt < 1:204758/91‑1 (MQ=255) tAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTa < 1:1942174/91‑1 (MQ=255) tAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTa < 1:1153212/91‑1 (MQ=255) aaaCGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAg > 1:3073864/1‑91 (MQ=255) aaCGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGt < 1:1420955/91‑1 (MQ=255) aCGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGtc > 1:730214/1‑91 (MQ=255) cGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGtct < 1:2547651/91‑1 (MQ=255) gTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGtctc < 1:243257/91‑1 (MQ=255) tGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTctct < 1:2842591/91‑1 (MQ=255) tGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTctct < 1:2072867/91‑1 (MQ=255) tGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAACTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTCGTctct > 1:2215743/1‑91 (MQ=255) tGCATAAGCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTctct < 1:2072777/91‑1 (MQ=255) aTCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATg > 1:1291250/1‑91 (MQ=255) tCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGt < 1:365983/91‑1 (MQ=255) aaaGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCa > 1:1557687/1‑91 (MQ=255) aaGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCAc < 1:3047159/91‑1 (MQ=255) aaGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCAc < 1:2638279/91‑1 (MQ=255) aaGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCAc < 1:989148/91‑1 (MQ=255) aaGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCAc > 1:3111188/1‑91 (MQ=255) aGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACt < 1:3632536/91‑1 (MQ=255) aCAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTg < 1:321867/91‑1 (MQ=255) cAGATTATAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACATGa > 1:3222268/1‑91 (MQ=255) aGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAacaatctgtctttttgattatgcacgtttatgcttttagttaaaa < 1:3207261‑M2/91‑46 (MQ=255) gATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAacaatctgtctttttgattatgcacgtttatgcttttagttaaaat < 1:2914350‑M2/91‑47 (MQ=255) gATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTCATATGTTGCACTTGAGc > 1:3557742/1‑91 (MQ=255) gATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGc > 1:1493747/1‑91 (MQ=255) aTTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCt > 1:2620010/1‑91 (MQ=255) ttGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAacaatctgtctttttgattatgcacgtttatgcttttagttaaaattt < 1:1033881‑M2/91‑49 (MQ=255) gTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTaaa < 1:999559/91‑1 (MQ=255) tAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAacaatctgtctttttgattatgcacgtttatgcttttagttaaaatttacc < 1:1321237‑M2/91‑52 (MQ=255) tAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAat > 1:2592089/1‑91 (MQ=255) aGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCATTTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAata > 1:3756089/1‑91 (MQ=255) aGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAata > 1:3756153/1‑91 (MQ=255) gTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATAtt < 1:3987809/91‑1 (MQ=255) ggAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCa > 1:2943588/1‑91 (MQ=255) ggAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCa > 1:2656790/1‑91 (MQ=255) ggAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCa > 1:2879383/1‑91 (MQ=255) gAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCaa < 1:1311743/91‑1 (MQ=255) gAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCaa < 1:190551/91‑1 (MQ=255) aaTATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAAt < 1:1515605/91‑1 (MQ=255) aaTATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAAt < 1:2043106/91‑1 (MQ=255) atatTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAAtt > 1:837555/1‑91 (MQ=255) tatTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAAttg > 1:3987724/1‑91 (MQ=255) tatTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAAttg > 1:1742337/1‑91 (MQ=255) atTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAAttgt > 1:2893615/1‑91 (MQ=255) tCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAAttgttt < 1:1721919/91‑1 (MQ=255) tCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTCGAGCTAAATATTCAAttgttt > 1:3901130/1‑91 (MQ=255) cGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAAttgtttg < 1:2773807/91‑1 (MQ=255) gAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAAttgtttgt < 1:2400092/91‑1 (MQ=255) aaCATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATtgtttgtt > 1:1025485/1‑91 (MQ=255) aaCATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATtgtttgtt < 1:2407324/91‑1 (MQ=255) aCATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTgtttgttt < 1:1224743/91‑1 (MQ=255) aCATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTgtttgttt < 1:1820697/91‑1 (MQ=255) aTAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTAc < 1:3440305/91‑1 (MQ=255) tAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACt > 1:467715/1‑91 (MQ=255) tAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACt > 1:466203/1‑91 (MQ=255) aaCAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACtt < 1:2672883/91‑1 (MQ=255) aGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCa > 1:3151085/1‑91 (MQ=255) aGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCa > 1:1703391/1‑91 (MQ=255) aGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCa < 1:1509919/91‑1 (MQ=255) aGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCa > 1:2355339/1‑91 (MQ=255) gTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCaa < 1:1531193/91‑1 (MQ=255) ttCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAAt > 1:715752/1‑91 (MQ=255) cAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGc < 1:2759472/91‑1 (MQ=255) aTTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGa < 1:1729532/91‑1 (MQ=255) tCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACg < 1:3064986/91‑1 (MQ=255) tCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACg < 1:3064882/91‑1 (MQ=255) aTCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTg > 1:966410/1‑91 (MQ=255) aTCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAAGATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTg < 1:2697922/91‑1 (MQ=255) tCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGc < 1:2140759/91‑1 (MQ=255) tCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGc > 1:1398599/1‑91 (MQ=255) tCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGc < 1:3802908/91‑1 (MQ=255) tCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGc < 1:2579010/91‑1 (MQ=255) ccTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGCt < 1:1122168/91‑1 (MQ=255) cTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGCtt < 1:443939/91‑1 (MQ=255) cTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGCtt < 1:2171917/91‑1 (MQ=255) cTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGCtt < 1:3625254/91‑1 (MQ=255) ttAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGCttt < 1:2638496/91‑1 (MQ=255) tAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGCtttt > 1:2583833/1‑91 (MQ=255) | GGGTAAATTTTAACTAAAAGCATAAACGTGCATAATCAAAAAGACAGATTGTAGGTGGAATATTCGAACATAACAGTTCAATTCATCCTTAACAATCTGTCTTTATATTTTTAGTCTCTAATATGTTGCACTTGAGCTAAATATTCAATTGTTTGTTTACTTTCAATGCGACGTGCTTTT > USA300TCH1516_ALE/2021591‑2021770 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |