| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2090954 | 100 (1.020) | 8 (0.090) | 6/142 | NT | 7.9% | intergenic (‑188/+350) | USA300HOU_RS10575/USA300HOU_RS10590 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2090971 | 99 (1.130) | intergenic (‑205/+333) | USA300HOU_RS10575/USA300HOU_RS10590 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
AACATGCGCAAACATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATAAACCA > USA300TCH1516_ALE/2090864‑2091044 | aaCATGCGCAAACATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCG < 1:1917021‑M1/91‑1 (MQ=255)aaCATGCGCAAACATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCG > 1:2776024‑M1/1‑91 (MQ=255) aCATGCGCAAACATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGa > 1:762999/1‑91 (MQ=255) aCATGCGCAAACATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAAACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGa > 1:1605037/1‑91 (MQ=255) cATGCGCAAACAAGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGaa > 1:3193160/1‑91 (MQ=255) tGCGCAAACATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAAc < 1:56416/91‑1 (MQ=255) gcgcAAACATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAAcc > 1:1439070/1‑91 (MQ=255) cgcATACATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCa > 1:3278507/1‑91 (MQ=255) cgcAAACATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCa > 1:1893599/1‑91 (MQ=255) cgcAAACATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCa > 1:1787774/1‑91 (MQ=255) tgcgcATGTTGCCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGc > 1:4121934/5‑91 (MQ=255) cAAACATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGc < 1:3962293/91‑1 (MQ=255) cAAACATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGc < 1:330772/91‑1 (MQ=255) aaaCATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGcc < 1:1394076/91‑1 (MQ=255) aaaCATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGcc < 1:4018202/91‑1 (MQ=255) aaCATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCa > 1:3709890/1‑91 (MQ=255) cATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCaaa > 1:2488778/1‑91 (MQ=255) tGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGctaactttggctgg < 1:3041705‑M1/91‑15 (MQ=255) tGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGt > 1:46606/1‑91 (MQ=255) ttACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTa > 1:1514387/1‑91 (MQ=255) aCCCTAATGAGCTCGTTAAAAAGACGGTGGCTCTTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGcttactttggctggtttc < 1:3539094‑M1/91‑19 (MQ=255) cccTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGctaactttggctggtttcg < 1:223641‑M1/91‑20 (MQ=255) ccTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGctaactttggctggtttcga < 1:137032‑M1/91‑21 (MQ=255) cTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGctaactttggctggtttcgat < 1:3130778‑M1/91‑22 (MQ=255) cTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgat > 1:1598466‑M2/1‑87 (MQ=255) cTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgat > 1:1597756‑M2/1‑87 (MQ=255) tAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGctaactttggctggtttcgatg < 1:991771‑M1/91‑23 (MQ=255) tAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGctaactttggctggtttcgatg < 1:837358‑M1/91‑23 (MQ=255) aaTGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatgg < 1:2822591‑M2/91‑7 (MQ=255) aaTGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatgg > 1:2653007‑M2/1‑85 (MQ=255) tGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatggtt < 1:2464638‑M2/91‑9 (MQ=255) gAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatggtta > 1:2858686‑M2/1‑82 (MQ=255) gAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatggtta > 1:1699564‑M2/1‑82 (MQ=255) gAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatggtta > 1:4017689‑M2/1‑82 (MQ=255) gAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatggtta > 1:1323970‑M2/1‑82 (MQ=255) aGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTAt < 1:3961777/91‑1 (MQ=255) gCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTAtt > 1:1786735/1‑91 (MQ=255) cccGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTAttt < 1:608342/91‑1 (MQ=255) cccGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTAttt < 1:2929757/91‑1 (MQ=255) cccGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTAttt > 1:3446401/1‑91 (MQ=255) cccGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTAttt > 1:3681295/1‑91 (MQ=255) aaaaaGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTAtt < 1:2653211/91‑1 (MQ=255) aaaGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGc > 1:4131215/1‑91 (MQ=255) aaaGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGc < 1:2831626/91‑1 (MQ=255) aaGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCt < 1:2578607/91‑1 (MQ=255) gACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTa > 1:1188177/1‑91 (MQ=255) gACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTa < 1:2147456/91‑1 (MQ=255) ggTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAAtt < 1:1687811/91‑1 (MQ=255) gTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTc < 1:980526/91‑1 (MQ=255) tGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCa > 1:1979957/1‑91 (MQ=255) ggCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCaa < 1:3103837/91‑1 (MQ=255) ggCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCaa > 1:1104865/1‑91 (MQ=255) ggCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCaa > 1:1104707/1‑91 (MQ=255) ggCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCaa < 1:1969221/91‑1 (MQ=255) ggCTATTTTAGATCAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATAGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCaa < 1:4150716/91‑1 (MQ=255) gCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAAt > 1:2856958/1‑91 (MQ=255) cTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATa > 1:3473073/1‑91 (MQ=255) ttttAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCTAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGc < 1:3590094/91‑1 (MQ=255) ttttAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCTAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGc < 1:3590001/91‑1 (MQ=255) ttttAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGc < 1:2058095/91‑1 (MQ=255) tttAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCt < 1:369210/91‑1 (MQ=255) tttAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCt < 1:2446186/91‑1 (MQ=255) agattaaagattaaATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGa < 1:2974346/91‑1 (MQ=255) agattaaagattaaATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGa > 1:1667416/1‑91 (MQ=255) agattaaagattaaATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGa < 1:2848036/91‑1 (MQ=255) agattaaagattaaATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGa < 1:2502972/91‑1 (MQ=255) attaaagattaaaTTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGAtt < 1:3891122/91‑1 (MQ=255) taaagattaaaTTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTAc < 1:650939/91‑1 (MQ=255) aaagattaaaTTAGTAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACt < 1:4152503/91‑1 (MQ=255) attaaattaaTAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGAc < 1:53218/91‑1 (MQ=255) attaaattaaTAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGAc < 1:1216915/91‑1 (MQ=255) attaaattaaTAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGAc < 1:1216848/91‑1 (MQ=255) attaaattaaTAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATCGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGAc < 1:70497/91‑1 (MQ=255) ttaaattaaTAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGAcc < 1:391049/91‑1 (MQ=255) ttaaattaaTAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGAcc < 1:1861316/91‑1 (MQ=255) taaattaaTAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCt > 1:3136767/1‑91 (MQ=255) aaattaaTAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTa < 1:227219/91‑1 (MQ=255) aataaCCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAAt < 1:3141071/91‑1 (MQ=255) ataaCCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATg > 1:2916446/1‑91 (MQ=255) ataaCCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATg < 1:568780/91‑1 (MQ=255) ccATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAAt < 1:2313680/91‑1 (MQ=255) ccATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAAt < 1:1165316/91‑1 (MQ=255) cATTTAACCGTCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATa < 1:3978473/91‑1 (MQ=255) cATTTAACCCTCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATa < 1:3978426/91‑1 (MQ=255) cATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATa < 1:916071/91‑1 (MQ=255) ttAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAgg > 1:681220/1‑91 (MQ=255) tAACCATCGctaactttggctggtttcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctc > 1:1323970‑M1/1‑9 (MQ=255) tAACCATCGctaactttggctggtttcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctc > 1:2858686‑M1/1‑9 (MQ=255) tAACCATCGctaactttggctggtttcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctc > 1:1699564‑M1/1‑9 (MQ=255) tAACCATCGctaactttggctggtttcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctc < 1:2453028‑M1/91‑83 (MQ=255) aaCCATCGctaactttggctggtttcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctca < 1:2464638‑M1/91‑84 (MQ=255) aCCATCGctaactttggctggtttcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctcat > 1:1590565‑M1/1‑7 (MQ=255) ccATCGctaactttggctggtttcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctcatt < 1:2822591‑M1/91‑86 (MQ=255) aTCGctaactttggctggtttcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctcattag > 1:1597756‑M1/1‑4 (MQ=255) aTCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctcattag < 1:2550295‑M2/91‑71 (MQ=255) aTCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATaaa < 1:3233415/91‑1 (MQ=255) tCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctcattagg < 1:137032‑M2/91‑72 (MQ=255) cGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctcattaggg < 1:223641‑M2/91‑73 (MQ=255) gctaactttggctggtttcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctcattagggt < 1:277995‑M1/91‑91 (MQ=255) gAAACCAGCCAAAGTAAGcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaagagccaccgtctttttaacgagctcattagggt < 1:3539094‑M2/91‑74 (MQ=255) | AACATGCGCAAACATGTTACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATAAACCA > USA300TCH1516_ALE/2090864‑2091044 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |