New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2090954 | 100 (1.020) | 8 (0.090) | 6/142 | NT | 7.9% | intergenic (‑188/+350) | USA300HOU_RS10575/USA300HOU_RS10590 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | USA300TCH1516_ALE | = 2090971 | 99 (1.130) | intergenic (‑205/+333) | USA300HOU_RS10575/USA300HOU_RS10590 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
ACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATAAACCAAACTGCAACATGGTACT > USA300TCH1516_ALE/2090882‑2091061 | aCCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGc < 1:277995‑M2/91‑2 (MQ=255) cTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgat > 1:1598466‑M2/1‑87 (MQ=255) aaTGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatgg > 1:2653007‑M2/1‑85 (MQ=255) aTGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatggt > 1:1590565‑M2/1‑84 (MQ=255) tGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatggtt < 1:2464638‑M2/91‑9 (MQ=255) gAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatggtta > 1:4017689‑M2/1‑82 (MQ=255) gAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatggtta > 1:2858686‑M2/1‑82 (MQ=255) aGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTAt < 1:1149771/91‑1 (MQ=255) gCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTAtt > 1:1786735/1‑91 (MQ=255) cccGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTAttt < 1:608342/91‑1 (MQ=255) cccGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTAttt > 1:3681295/1‑91 (MQ=255) cccGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTAttt > 1:3446401/1‑91 (MQ=255) ccGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTAtttt < 1:555832/91‑1 (MQ=255) ccGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTAtttt < 1:1641693/91‑1 (MQ=255) ttAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTa > 1:2217980/1‑91 (MQ=255) aaaGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGc < 1:2831626/91‑1 (MQ=255) aaaGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGc > 1:4131215/1‑91 (MQ=255) aaGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCt < 1:2578607/91‑1 (MQ=255) aaGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCt < 1:2972182/91‑1 (MQ=255) aGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCtt < 1:1864745/91‑1 (MQ=255) gACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTa > 1:1188177/1‑91 (MQ=255) cGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAAt < 1:989049/91‑1 (MQ=255) ggTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAAtt < 1:1687811/91‑1 (MQ=255) gTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTc < 1:980526/91‑1 (MQ=255) gTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATAGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTCTTATTGCTTAATTc > 1:717927/1‑91 (MQ=255) tGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCa > 1:1979957/1‑91 (MQ=255) tGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCa > 1:4150280/1‑91 (MQ=255) ggCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCaa < 1:1969221/91‑1 (MQ=255) ggCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCaa > 1:1104707/1‑91 (MQ=255) ggCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCaa > 1:1104865/1‑91 (MQ=255) ggCTATTTTAGATCAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATAGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCaa < 1:4150716/91‑1 (MQ=255) gCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAAt > 1:2856958/1‑91 (MQ=255) cTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATa > 1:3473073/1‑91 (MQ=255) aTTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAg < 1:3950314/91‑1 (MQ=255) ttttAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCTAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGc < 1:3590001/91‑1 (MQ=255) ttttAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCTAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGc < 1:3590094/91‑1 (MQ=255) ttttAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTATCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGc < 1:2057918/91‑1 (MQ=255) ttttAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGc < 1:2058095/91‑1 (MQ=255) tttAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCt < 1:2900078/91‑1 (MQ=255) tttAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCt < 1:2446186/91‑1 (MQ=255) tttAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCt < 1:369210/91‑1 (MQ=255) agattaaagattaaATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGa < 1:2974346/91‑1 (MQ=255) agattaaagattaaATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGa < 1:2502972/91‑1 (MQ=255) agattaaagattaaATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGa < 1:2848036/91‑1 (MQ=255) agattaaagattaaATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGa < 1:1216092/91‑1 (MQ=255) agattaaagattaaATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGa > 1:1667416/1‑91 (MQ=255) agattaaagattaaATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGa < 1:445314/91‑1 (MQ=255) attaaagattaaaTTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGAtt < 1:3891122/91‑1 (MQ=255) taaagattaaaTTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTAc < 1:650939/91‑1 (MQ=255) attaaattaaTAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGAc < 1:1216915/91‑1 (MQ=255) attaaattaaTAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATCGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGAc < 1:70497/91‑1 (MQ=255) ttaaattaaTAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGAcc < 1:391049/91‑1 (MQ=255) ttaaattaaTAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGAcc < 1:3553670/91‑1 (MQ=255) ttaaattaaTAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGAcc < 1:1861316/91‑1 (MQ=255) ttaaattaaTAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGAcc < 1:2823431/91‑1 (MQ=255) taaattaaTAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCt > 1:3136767/1‑91 (MQ=255) aaattaaTAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTa < 1:227219/91‑1 (MQ=255) aaattaaTAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTa > 1:1343989/1‑91 (MQ=255) attaaTAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATc < 1:1372673/91‑1 (MQ=255) aataaCCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAAt < 1:3141071/91‑1 (MQ=255) ataaCCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTATACCTATCAATg > 1:3768491/1‑91 (MQ=255) ataaCCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATg > 1:2916446/1‑91 (MQ=255) ataaCCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATg < 1:568780/91‑1 (MQ=255) aaCCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCa < 1:2367781/91‑1 (MQ=255) ccATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAAt < 1:2313680/91‑1 (MQ=255) ccATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAAt < 1:3083266/91‑1 (MQ=255) ccATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAAt > 1:1699767/1‑91 (MQ=255) cATTTAACCCTCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATa < 1:3978426/91‑1 (MQ=255) ttAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAgg > 1:681220/1‑91 (MQ=255) cATCGAAACTAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATaa < 1:3963808/91‑1 (MQ=255) cATCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctcatta < 1:837358‑M2/91‑70 (MQ=255) aTCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctcattag < 1:3130778‑M2/91‑71 (MQ=255) aTCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctcattag < 1:2550295‑M2/91‑71 (MQ=255) aTCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATaaa < 1:3233415/91‑1 (MQ=255) tCGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctcattagg < 1:137032‑M2/91‑72 (MQ=255) cGAAACCAGCCAAAGTTAGcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctcattaggg < 1:223641‑M2/91‑73 (MQ=255) cGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATAAAcc < 1:1308847/91‑1 (MQ=255) aaCCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGGATAAACCaaa < 1:1477586/91‑1 (MQ=255) aaCCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATAAACCaaa > 1:2467393/1‑91 (MQ=255) aCCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATAAACCAAAc < 1:1521415/91‑1 (MQ=255) ccAGCCAAAGTTAGcgatggttaaatggttattaatttaatctttaatctaaaatagccaccgtctttttaacgggctcattagggtaaca < 1:3041705‑M2/91‑78 (MQ=255) ccAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATAAACCAAACt > 1:1625013/1‑91 (MQ=255) cAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATACACCAAACTg > 1:3982402/1‑91 (MQ=255) cAGCAAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATAAACCAAACTg > 1:3275019/1‑91 (MQ=255) gCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATAAACCAAACTGCa > 1:740671/1‑91 (MQ=255) gCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATAAACCAAACTGCa > 1:738848/1‑91 (MQ=255) ccAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATAAACCAAACTGCaa > 1:2298514/1‑91 (MQ=255) aaaGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATAAACCAAACTGCAACa > 1:2656698/1‑91 (MQ=255) aaaGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATAAACCAAACTGCAACa > 1:2657255/1‑91 (MQ=255) aaaGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATAAACCAAACTGCAACa < 1:873163/91‑1 (MQ=255) aaGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATAAACCAAACTGCAACAt > 1:2144989/1‑91 (MQ=255) gTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATAAACCAAACTGCAACATgg > 1:459121/1‑91 (MQ=255) ttAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATAAACCAAACTGCAACATGGt > 1:1495497/1‑91 (MQ=255) ttAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATAAACCAAACTGCAACATGGt < 1:2703758/91‑1 (MQ=255) tAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATAAACCAAACTGCAACATGGTa < 1:3275401/91‑1 (MQ=255) tAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATAAACCAAACTGCAACATGGTa < 1:2821653/91‑1 (MQ=255) aGCTATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATAAACCAAACTGCAACATGGTAc < 1:3217898/91‑1 (MQ=255) aGCGATGGTTATTTTTTGTTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATAAACCAAACTGCAACATGGTAc < 1:3559006/91‑1 (MQ=255) aGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGAAATAAGGAATAAACCAAACTGCAACATGGTAc > 1:3540035/1‑91 (MQ=255) gCGATGGTTATTTTGTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATAAACCAAACTGCAACATGGTACt < 1:3743043/91‑1 (MQ=255) | ACCCTAATGAGCCCGTTAAAAAGACGGTGGCTATTTTAGATTAAAGATTAAATTAATAACCATTTAACCATCGAAACCAGCCAAAGTTAGCGATGGTTATTTTTTATTGCTTAATTCAATAAGCTTGATTACTAGACCTATCAATGCAATAAGGAATAAACCAAACTGCAACATGGTACT > USA300TCH1516_ALE/2090882‑2091061 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |