| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2368218 | 73 (0.740) | 7 (0.080) | 6/146 | NT | 9.3% | coding (123/354 nt) | rplV | 50S ribosomal protein L22 |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2368244 | 70 (0.780) | coding (97/354 nt) | rplV | 50S ribosomal protein L22 | |||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
ACTACTAATTCATCTGTGTTCATGTCATAGTTATGTTCAGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTAAGTCAAGAACTAGTCTTACTTTACGAGGTGCGAT > USA300TCH1516_ALE/2368129‑2368307 | actactAATTCATCTGTGTTCATGTCATAGTTATGTTCAGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCtt > 1:840572/1‑91 (MQ=255) ctactaATTCATCTGTGTTCATGTCATAGTTATGTTCAGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCttt < 1:2584964/91‑1 (MQ=255) ctactaATTCATCTGTGTTCATGTCATAGTTATGTTCAGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCttt < 1:3114279/91‑1 (MQ=255) tactaATTCATCTGTGTTCATGTCATAGTTATGTTCAGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCtttg < 1:3689394/91‑1 (MQ=255) actaATTCATCTGTGTTCATGTCATAGTTATGTTCAGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCtttgt < 1:95697/91‑1 (MQ=255) aTCTGTGTTCATGTCATAGTTATGTTCAGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAAt < 1:421725/91‑1 (MQ=255) tCTGTGTTCATGTCATAGTTATGTTCAGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAAtt < 1:1995149/91‑1 (MQ=255) tCTGTGTTCATGTCATAGTTATGTTCAGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAAtt > 1:3047267/1‑91 (MQ=255) tCTGTGTTCATGTCATAGTTATGTTCAGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAAtt > 1:3047592/1‑91 (MQ=255) cTGTGTTCATGTCATAGTTATGTTCAGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAAttt > 1:2255816/1‑91 (MQ=255) tgtgTTCATGTCATAGTTATGTTCAGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAAtttt < 1:1039748/91‑1 (MQ=255) tgtgTTCATGTCATAGTTATGTTCAGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAAtttt > 1:1267257/1‑91 (MQ=255) tgtTCATGTCATAGTTATGTTCAGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTaa > 1:3503515/1‑91 (MQ=255) tgtTCATGTCATAGTTATGTTCAGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTaa > 1:219117/1‑91 (MQ=255) gtTCATGTCATAGTTATGTTCAGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTaaa > 1:2542241/1‑91 (MQ=255) ttCATGTCATAGTTATGTTCAGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTaaaa < 1:951076/91‑1 (MQ=255) ttCATGTCATAGTTATGTTCAGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTaaaa < 1:950980/91‑1 (MQ=255) ttCATGTCATAGTTATGTTCAGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTaaaa < 1:3659749/91‑1 (MQ=255) ttCATGTCATAGTTATGTTCAGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTaaaa < 1:1097668/91‑1 (MQ=255) cATGTCATAGTTATGTTCAGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTattgcaattttaaaattaaca < 1:258084‑M1/91‑22 (MQ=255) tGTCATAGTTATGTTCAGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTattgcaattttaaaattaacaaa < 1:3002136‑M1/91‑24 (MQ=255) gTCATAGTTATGTTCAGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCa > 1:3716857/1‑91 (MQ=255) tCATAGTTATGTTCAGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCaa < 1:3556065/91‑1 (MQ=255) cATAGTTATGTTCAGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGCTGAAGCTattgcaattttaaaattaacaaacaa < 1:3248088‑M1/91‑27 (MQ=255) tAGTTATGTTCAGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTattgcaattttaaaattaacaaacaaag < 1:1395639‑M1/91‑29 (MQ=255) tAGTTATGTTCAGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATag < 1:2345333‑M2/91‑3 (MQ=255) gTTATGTTCAGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATagct < 1:3147125‑M2/91‑5 (MQ=255) tATGTTCAGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATagcttc > 1:3188419‑M2/1‑85 (MQ=255) aTGTTCAGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGCTGAAGCTattgcaattttaaaattaacaaacaaagcttca < 1:1437393‑M1/91‑34 (MQ=255) aTGTTCAGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGCTGAAGCTattgcaattttaaaattaacaaacaaagcttca < 1:2732182‑M1/91‑34 (MQ=255) tGTTCAGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTcag < 1:2466756/91‑1 (MQ=255) gTTCATCATTAGCTAAAGCGGACATCAATACTTTTTCAAGTACTGGTGATGAAGCTattgcaattttaaaattaacaaacaaagcttcatc < 1:3860126‑M1/91‑36 (MQ=255) gTTCAGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAATCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTcagc < 1:3506256/91‑1 (MQ=255) ttCAGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTcagca > 1:2541391/1‑91 (MQ=255) tCAGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTcagcag < 1:778429/91‑1 (MQ=255) cAGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCagcagc < 1:2702437/91‑1 (MQ=255) cAGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCagcagc < 1:1620817/91‑1 (MQ=255) aGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAgcagca < 1:4044006/91‑1 (MQ=255) aGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAgcagca < 1:372077/91‑1 (MQ=255) aTTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCAttt > 1:3053946/1‑91 (MQ=255) tAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCAttttt > 1:1632968/1‑91 (MQ=255) aGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTa > 1:3503786/1‑91 (MQ=255) aGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTa > 1:924553/1‑91 (MQ=255) aGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTa > 1:3504199/1‑91 (MQ=255) aGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTa < 1:1595708/91‑1 (MQ=255) aGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTa > 1:925673/1‑91 (MQ=255) cTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTAcc < 1:1604041/91‑1 (MQ=255) cTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTAcc < 1:3423528/91‑1 (MQ=255) aaaGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACctc > 1:1917377/1‑91 (MQ=255) aaGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACctct < 1:1363642/91‑1 (MQ=255) gCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGa > 1:1189880/1‑91 (MQ=255) gCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGa > 1:2297359/1‑91 (MQ=255) cGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGAt < 1:733821/91‑1 (MQ=255) cGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGAt < 1:1423189/91‑1 (MQ=255) cGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGAt < 1:734588/91‑1 (MQ=255) aCATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTaa > 1:3530579/1‑91 (MQ=255) cATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTAAg > 1:1468238/1‑91 (MQ=255) cATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTAAg > 1:1944842/1‑91 (MQ=255) cATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTAAg > 1:1944941/1‑91 (MQ=255) aTTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTAAGt < 1:657180/91‑1 (MQ=255) ttAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTAAGTc < 1:1460883/91‑1 (MQ=255) tAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTAAGTCa < 1:2133562/91‑1 (MQ=255) aTACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTAAGTCAAg < 1:1389200/91‑1 (MQ=255) aTACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTAAGTCAAg < 1:1389507/91‑1 (MQ=255) aTACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTAAGTCAAg < 1:1391033/91‑1 (MQ=255) aCTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTAAGTCAAGaa > 1:3152904/1‑91 (MQ=255) aCTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTAAGTCAAGaa > 1:3152887/1‑91 (MQ=255) aCTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTAAGTCAAGaa > 1:1615415/1‑91 (MQ=255) ttttCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTAAGTCAAGAACTa > 1:3372236/1‑91 (MQ=255) tttCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTAAGTCAAGAACTAg < 1:3928649/91‑1 (MQ=255) ttCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTAAGTCAAGAACTAGt > 1:3236937/1‑91 (MQ=255) tCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTAAGTCAAGAACTAGTc > 1:1025448/1‑91 (MQ=255) cAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTAAGTCAAGAACTAGTCt < 1:1722616/91‑1 (MQ=255) cAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTAAGTCAAGAACTAGTCt < 1:3912040/91‑1 (MQ=255) aTTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTAAGTCAAGAACTAGTCTTa > 1:3430506/1‑91 (MQ=255) ttACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTAAGTCAAGAACTAGTCTTAc > 1:478311/1‑91 (MQ=255) ttACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTAAGTCAAGAACTAGTCTTAc > 1:478463/1‑91 (MQ=255) ttACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTAAGTCAAGAACTAGTCTTAc > 1:2931768/1‑91 (MQ=255) cTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTAAGTCAAGAACTAGTCTTACttt > 1:781587/1‑91 (MQ=255) cTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTAAGTCAAGAACTAGTCTTACttt > 1:148871/1‑91 (MQ=255) cTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTAAGTCAAGAACTAGTCTTACttt > 1:1145297/1‑91 (MQ=255) ggTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTAAGTCAAGAACTAGTCTTACTTTAc < 1:446912/91‑1 (MQ=255) ggTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTAAGTCAAGAACTAGTCTTACTTTAc > 1:1034644/1‑91 (MQ=255) tgatgaAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTAAGTCAAGAACTAGTCTTACTTTACGa > 1:494594/1‑91 (MQ=255) tgatgaAGCTTTGTTTGTTAATATTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTAAGTCAAGAACTAGTCTTACTTTACGa > 1:188203/1‑91 (MQ=255) gatgaAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATagcttcatcaccagtacttgaaaaagtattgatgtccgctttagctaatgatgaac < 1:3860126‑M2/91‑57 (MQ=255) atctaaGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTAAGTCAAGAACTAGTCTTACTTTACGAg < 1:282325/87‑1 (MQ=255) atgaAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATCGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTAAGTCAAGAACTAGTCTTACTTTACGAgg > 1:1216266/1‑91 (MQ=255) tgaAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATagcttcagcaccagtaattgaaaaagtattaatgtccgctttagctaatgctgaacat < 1:2732182‑M2/91‑59 (MQ=255) tgaAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATagcttcagcaccagtaattgaaaaagtattaatgtccgctttagctaatgctgaacat < 1:1437393‑M2/91‑59 (MQ=255) gaAGCTattgcaattttaaaattaacaaacaaagcttcatcaccagtaattgaaaaagtattaatgtccgctttagctaatgctgaacata > 1:3188419‑M1/1‑6 (MQ=255) gaAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTAAGTCAAGAACTAGTCTTACTTTACGAGGTg < 1:3584081/91‑1 (MQ=255) aGCTattgcaattttaaaattaacaaacaaagcttcatcaccagtaattgaaaaagtattaatgtccgctttagctaatgctgaacataac < 1:3147125‑M1/91‑88 (MQ=255) aGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTAAGTCAAGAACTAGTCTTACTTTACGAGGTgtg < 1:1700148/91‑3 (MQ=255) aGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTAAGTCAAGAACTAGTCTTACTTTACGAGGTGCg > 1:1541054/1‑91 (MQ=255) gCTattgcaattttaaaattaacaaacaaagcttcatcaccagtaattgaaaaagtattaatgtccgctttagctaatgctgaacataact > 1:2961953‑M1/1‑3 (MQ=255) gCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTAAGTCAAGAACTAGTCTTACTTTACGAGGTGCGa > 1:2996061/1‑91 (MQ=255) gCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTAAGTCAAGAACTAGTCTTACTTTACGAGGTGCGa > 1:2995798/1‑91 (MQ=255) cTattgcaattttaaaattaacaaacaaagcttcatcaccagtaattgaaaaagtattaatgtccgctttagctaatgctgaacataacta < 1:2345333‑M1/91‑90 (MQ=255) cTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATagcttcatcaccagtaattgaaaaagtattaatgtccgctttagctaatgctgaacataacta < 1:1395639‑M2/91‑64 (MQ=255) | ACTACTAATTCATCTGTGTTCATGTCATAGTTATGTTCAGCATTAGCTAAAGCGGACATTAATACTTTTTCAATTACTGGTGATGAAGCTTTGTTTGTTAATTTTAAAATTGCAATAGCTTCAGCAGCATTTTTACCTCTGATTAAGTCAAGAACTAGTCTTACTTTACGAGGTGCGAT > USA300TCH1516_ALE/2368129‑2368307 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |