New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2375690 | 104 (1.060) | 7 (0.080) | 5/146 | NT | 6.7% | coding (334/2136 nt) | topB | DNA topoisomerase 3 |
? | USA300TCH1516_ALE | = 2375715 | 101 (1.130) | coding (309/2136 nt) | topB | DNA topoisomerase 3 |
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
CTTGTTGAATAGCTTTTTTAGTAACTGAGCTAATCCATAATCGACGGATTGGCTTTTTGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGCATCTGTTGCAATAATAATATCTTTCACTTTATTATCTAAAATTAACGCTTTTACTGTTTTAAATTGTTT > USA300TCH1516_ALE/2375600‑2375780 | cTTGTTGAATAGCTTTTTTAGTAACTGAGCTAATCCATAATCGACGGATTGGCTTTTTGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAAC < 1:1504336‑M1/91‑1 (MQ=255) tgttgAATAGCTTTTTTAGTAACTGAGCTAATCCATAATCGACGGATTGGCTTTTTGTTACCAACTTTATCCGAAATCAATCTTGCAACTa < 1:1158107/91‑1 (MQ=255) tgAATAGCTTTTTTAGTAACTGAGCTAATCCATAATCGACGGATTGGCTTTTTGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGtt < 1:2217590/91‑1 (MQ=255) tgAATAGCTTTTTTAGTAACTGAGCTAATCCATAATCGACGGATTGGCTTTTTGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGtt < 1:3176857/91‑1 (MQ=255) gAATAGCTTTTTTAGTAACTGAGCTAATCCATAATCGACGGATTGGCTTTTTGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGTTc < 1:2744813/91‑1 (MQ=255) tAGCTTTTTTAGTAACTGAGCTAATCCATAATCGACGGATTGGCTTTTTGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGTTCAcc < 1:2410150/91‑1 (MQ=255) 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tttAGTAACTGAGCTAATCCATAATCGACGGATTGGCTTTTTGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGt > 1:166812/1‑91 (MQ=255) tttAGTAACTGAGCTAATCCATAATCGACGGATTGGCTTTTTGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGt > 1:2223388/1‑91 (MQ=255) tAGTAACTGAGCTAATCCATAATCGACGGATTGGCTTTTTGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTcc > 1:2655432/1‑91 (MQ=255) gTAACTGAGCTAATCCATAATCGACGGATTGGCTTTTTGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAg < 1:345944/91‑1 (MQ=255) gTAACTGAGCTAATCCATAATCGACGGATTGGCTTTTTGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAg < 1:2805482/91‑1 (MQ=255) tAACTGAGCTAATCCATAATCGACGGATTGGCTTTTTGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGc > 1:4123151/1‑91 (MQ=255) aCTGAGCTAATCCATAATCGACGGATTGGCTTTTTGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACagatgctggacgagaaggtgaac < 1:3706483‑M1/91‑24 (MQ=255) aCTGAGCTAATCCATAATCGACGGATTGGCTTTTTGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGcct > 1:1401357/1‑89 (MQ=255) aCTGAGCTAATCCATAATCGACGGATTGGCTTTTTGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGCAt > 1:3051007/1‑91 (MQ=255) aCTGAGCTAATCCATAATCGACGGATTGGCTTTTTGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGCAt > 1:368229/1‑91 (MQ=255) aCTGAGCTAATCCATAATCGACGGATTGGCTTTTTGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGCAt > 1:3050970/1‑91 (MQ=255) aCTGAGCTAATCCATAATCGACGGATTGGCTTTTTGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGTTCACCTTATCGTCCAGCAt > 1:3767249/1‑91 (MQ=255) tGAGCTAATCCATAATCGACGGATTGGCTTTTTGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGCATCt < 1:1894000/91‑1 (MQ=255) gAGCTAATCCATAATCGACGGATTGGCTTTTTGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGCATCTg < 1:766067‑M2/91‑2 (MQ=255) aGCTAATCCATAATCGACGGATTGGCTTTTTGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACagatgctggacgagaaggtgaactagt < 1:1999318‑M1/91‑28 (MQ=255) tataaTCCATAATCGACGGATTGGCTTTTTGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGCATCTgtt < 1:3621057‑M2/89‑4 (MQ=255) gCTAATCCATAATCGACGGATTGGCTTTTTGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACagatgctggacgagaaggtgaactagtt < 1:2260846‑M1/91‑29 (MQ=255) gCTAATCCATAATCGACGGATTGGCTTTTTGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACagatgctggacgagaaggtgaactagtt < 1:2263030‑M1/91‑29 (MQ=255) cTAATCCATAATCGACGGATTGGCTTTTTGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGCATCTgttg > 1:919241‑M2/1‑87 (MQ=255) aTCCATAATCGACGGATTGGCTTTTTGTTACCAACTTCATCCAAAAGCAATCTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGCATCTgttgcaa < 1:3304268‑M2/91‑8 (MQ=255) tCCATAATCGACGGATTGGCTTTTTGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGCATCTGTTGCaat < 1:2249398/91‑1 (MQ=255) ccATAATCGACGGATTGGCTTTTTGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGCATCTGTTGCaata > 1:433302/1‑91 (MQ=255) aaTCGACGGATTGGCTTTTTGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGCATCTGTTGCaataataa < 1:553229/91‑1 (MQ=255) aTCGACGGATTGGCTTTTTGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGCATCTGTTGCaataataat > 1:1681117/1‑91 (MQ=255) tCGACGGATTGGCTTTTTGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGCATCTGTTGCAataataata > 1:270576/1‑91 (MQ=255) tCGACGGATTGGCTTTTTGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGCATCTGTTGCAataataata > 1:269301/1‑91 (MQ=255) gACGGATTGGCTTTTTGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGCATCTGTTGCAATAATAATATc < 1:1056845/91‑1 (MQ=255) cGGATTGGCTTTTTGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGCATCTGTTGCAATAATAATATCtt < 1:1554050/91‑1 (MQ=255) ggATTGGCTTTTTGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGCATCTGTTGCAATAATAATATCttt < 1:3384040/91‑1 (MQ=255) ttGGCTTTTTGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGCATCTGTTGCAATAATAATATCTTTCAc < 1:4076842/91‑1 (MQ=255) ttGGCTTTTTGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGCATCTGTTGCAATAATAATATCTTTCAc < 1:2013514/91‑1 (MQ=255) tGGCTTTTTGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGCATCTGTTGCAATAATAATATCTTTCACt > 1:1238785/1‑91 (MQ=255) tttttGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGCATCTGTTGCAATAATAATATCTTTCACTttat < 1:2440066/91‑1 (MQ=255) tttttGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGCATCTGTTGCAATAATAATATCTTTCACTttat < 1:2366266/91‑1 (MQ=255) tttttGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGCATCTGTTGCAATAATAATATCTTTCACTttat < 1:3382032/91‑1 (MQ=255) tttttGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGCATCTGTTGCAATAATAATATCTTTCACTttat < 1:2168309/91‑1 (MQ=255) tttGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGCATCTGTTGCAATAATAATATCTTTCACTttatta > 1:1796406/1‑91 (MQ=255) ttGTTACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGCATCTGTTGCAATAATAATATCTTTCACTTtattat < 1:634075/91‑1 (MQ=255) tACCAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGCATCTGTTGCAATAATAATATCTTTCACTTTATTATCTaa > 1:955259/1‑91 (MQ=255) ccAACTTTATCCAAAATCAATCTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGCATCTGTTGCAATAATAATATCTTTCACTTTATTATCTaaaa > 1:2558947/1‑91 (MQ=255) 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aatcTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGCATCTGTTGCAATAATAATATCTTTCACTTTATTATCTAAAATTAACGCTTTTACTGttt < 1:961201/91‑1 (MQ=255) aatcTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGCATCTGTTGCAATAATAATATCTTTCACTTTATTATCTAAAATTAACGCTTTTACTGttt < 1:3952266/91‑1 (MQ=255) atcTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGCATCTGTTGCAATAATAATATCTTTCACTTTATTATCTAAAATTAACGCTTTTACTGtttt < 1:2656047/91‑1 (MQ=255) tcTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGCATCTGTTGCAATAATAATATCTTTCACTTTATTATCTAAAATTAACGCTTTTACTGTTTTa < 1:224965/91‑1 (MQ=255) tcTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGCATCTGTTGCAATAATAATATCTTTCACTTTATTATCTAAAATTAACGCTTTTACTGTTTTa > 1:898518/1‑91 (MQ=255) tcTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGCATCTGTTGCAATAATAATATCTTTCACTTTATTATCTAAAATTAACGCTTTTACTGTTTTa > 1:2622385/1‑91 (MQ=255) tcTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGCATCTGTTGCAATAATAATATCTTTCACTTTATTATCTAAAATTAACGCTTTTACTGTTTTa < 1:3333497/91‑1 (MQ=255) tcTTGCAACTAGTTCACCTTCTCGTCCAGCATCTGTTGCAATAATAATATCTTTCACTTTATTATCTAAAATTAACGCTTTTACTGTTTTa > 1:3112690/1‑91 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |