| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | 2442806 = | 67 (0.680) | 6 (0.080) | 6/128 | NT | 9.0% | intergenic (+3/+55) | glvR/USA300HOU_RS12585 | HTH‑type transcriptional regulator GlvR/hypothetical protein |
| ? | USA300TCH1516_ALE | 2442855 = | 67 (0.850) | intergenic (+52/+6) | glvR/USA300HOU_RS12585 | HTH‑type transcriptional regulator GlvR/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 177 total aligned reads displayed.
TTCTAGCTTCATCAGTTATCATATATTCTTTGAAACACTTGTAAGAAAATATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTATTGTTGTGTTGATGTTTCGATAACGTGGTACAT > USA300TCH1516_ALE/2442716‑2442896 | ttCTAGCTTCATCAGTTATCATATATTCTTTGAAACACTTGTAAGAAAATATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAA < 1:3502500‑M1/91‑1 (MQ=255)ttCTAGCTTCATCAGTTATCATATATTCTTTGAAACACTTGTAAGAAAATATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAA > 1:2647996‑M1/1‑91 (MQ=255) tCTAGCTTCATCAGTTATCATATATTCTTTGAAACACTTGTAAGAAAATATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAA > 1:2223863‑M1/1‑91 (MQ=255) aatatcatgatgccatggtgcatggtttcgaattgatgtttgataagatgtaccacgttatcgaaacatcaacacaacaataaaatgataa < 1:2284785‑M1/2‑1 (MQ=255) cTAGCTTCATCAGTTATCATATATTCTTTGAAACACTTGTAAGAAAATATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAA < 1:3520582‑M1/91‑1 (MQ=255) atcatgatgccatggtgcatggtttcgaattgatgtttgataagatgtaccacgttatcgaaacatcaacacaacaataaaatgatAAAAg > 1:1693683‑M1/87‑91 (MQ=255) tcatgatgccatggtgcatggtttcgaattgatgtttgataagatgtaccacgttatcgaaacatcaacacaacaataaaatgatAAAAgg < 1:1481506‑M1/6‑1 (MQ=255) gCTTCATCAGTTATCATATATTCTTTGAAACACTTGTAAGAAAATATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGG > 1:3006703‑M1/1‑91 (MQ=255) catgatgccatggtgcatggtttcgaattgatgtttgataagatgtaccacgttatcgaaacatcaacacaacaataaaatgatAAAAGGa < 1:3627961‑M1/7‑1 (MQ=255) ttCATCAGTTATCATATATTCTTTGAAACACTTGTAAGAAAATATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAA < 1:3061093‑M1/91‑1 (MQ=255) gatgccatggtgcatggtttcgaattgatgtttgataagatgtaccacgttatcgaaacatcaacacaacaataaaatgatAAAAGGAAGt > 1:3157398‑M1/82‑91 (MQ=255) gatgccatggtgcatggtttcgaattgatgtttgataagatgtaccacgttatcgaaacatcaacacaacaataaaatgatAAAAGGAAGt > 1:3156661‑M1/82‑91 (MQ=255) catcaGTTATCATATATTCTTTGAAACACTTGTAAGAAAATATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGT > 1:3843570‑M1/1‑91 (MQ=255) tcaGTTATCATATATTCTTTGAAACACTTGTAAGAAAATATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTA > 1:3277895‑M1/1‑91 (MQ=255) gccatggtgcatggtttcgaattgatgtttgataagatgtaccacgttatcgaaacatcaacacaacaataaaatgatAAAAGGAAGTTAt > 1:2199815‑M1/79‑91 (MQ=255) gccatggtgcatggtttcgaattgatgtttgataagatgtaccacgttatcgaaacatcaacacaacaataaaatgatAAAAGGAAGTTAt > 1:2199961‑M1/79‑91 (MQ=255) caGTTATCATATATTCTTTGAAACACTTGTAAGAAAATATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTGGAAAAAAGGAAGTTAT < 1:3062309‑M1/91‑1 (MQ=255) aGTTATCATATATTCTTTGAAACACTTGTAAGAAAATATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATG < 1:676205‑M1/91‑1 (MQ=255) gTTATCATATATTCTTTGAAACACTTGTAAGAAAATATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGA < 1:1519739‑M1/91‑1 (MQ=255) gTTATCATATATTCTTTGAAACACTTGTAAGAAAATATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGA < 1:3136941‑M1/91‑1 (MQ=255) catggtgcatggtttcgaattgatgtttgataagatgtaccacgttatcgaaacatcaacacaacaataaaatgatAAAAGGAAGTTATGa < 1:559864‑M1/15‑1 (MQ=255) catggtgcatggtttcgaattgatgtttgataagatgtaccacgttatcgaaacatcaacacaacaataaaatgatAAAAGGAAGTTATGa < 1:88517‑M1/15‑1 (MQ=255) catggtgcatggtttcgaattgatgtttgataagatgtaccacgttatcgaaacatcaacacaacaataaaatgatAAAAGGAAGTTATGa < 1:224207‑M1/15‑1 (MQ=255) tATCATATATTCTTTGAAACACTTGTAAGAAAATATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGAtt < 1:1612629/91‑1 (MQ=255) aTCATATATTCTTTGAAACACTTGTAAGAAAATATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGAttt < 1:1194912/91‑1 (MQ=255) tCATATATTCTTTGAAACACTTGTAAGAAAATATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTa > 1:869255/1‑91 (MQ=255) atatTCTTTGAAACACTTGTAAGAAAATATAATGAGTCTTTACTACCTAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATgg > 1:3312610/1‑91 (MQ=255) tatTCTTTGAAACACTTGTAAGAAAATATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGc > 1:864552/1‑91 (MQ=255) cTTTGAAACACTTGTAAGAAAATATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTg > 1:705995/1‑91 (MQ=255) tGAAACACTTGTAAGAAAATATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGc > 1:1714767/1‑91 (MQ=255) tGAAACACTTGTAAGAAAATATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGc < 1:1440693/91‑1 (MQ=255) tGAAACACTTGTAAGAAAATATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGc < 1:1317763/91‑1 (MQ=255) gAAACACTTGTAAGAAAATATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGcc < 1:277039/91‑1 (MQ=255) gAAACACTTGTAAGAAAATATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGcc < 1:3920889/91‑1 (MQ=255) aaCACTTGTAAGAAAATATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTa < 1:528070‑M2/91‑2 (MQ=255) cacTTGTAAGAAAATATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATaggctcaaggccattaaatc < 1:1924004‑M1/91‑21 (MQ=255) atgtttgataagatgtaccacgttatcgaaacatcaacacaacaataaaatgatAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCa > 1:642589‑M1/55‑91 (MQ=255) acTTGTAAGAAAATATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTatca > 1:3436731‑M2/1‑87 (MQ=255) acTTGTAAGAAAATATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTatca > 1:3946030‑M2/1‑87 (MQ=255) cTTGTAAGAAAATATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTatcat < 1:791243‑M2/91‑6 (MQ=255) cTTGTAAGAAAATATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTatcat > 1:2077256‑M2/1‑86 (MQ=255) tGTAAGAAAATATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTatcataa < 1:1015126‑M2/91‑8 (MQ=255) gTAAGAAAATATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTatcataac > 1:1796166‑M2/1‑83 (MQ=255) tgataagatgtaccacgttatcgaaacatcaacacaacaataaaatgatAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACt > 1:3657423‑M1/50‑91 (MQ=255) tAAGAAAATATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTatcataact < 1:1006125‑M2/91‑10 (MQ=255) tAAGAAAATATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTatcataact > 1:1139676‑M2/1‑82 (MQ=255) tAAGAAAATATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTatcataact > 1:2562866‑M2/1‑82 (MQ=255) aaGAAAATATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATaggctcaaggccattaaatcataactt < 1:500870‑M1/91‑28 (MQ=255) aaGAAAATATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTatcataactt < 1:74098‑M2/91‑11 (MQ=255) aGAAAATATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTatcataacttc < 1:1055873‑M2/91‑12 (MQ=255) aaaaTATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTatcataacttcct < 1:1268342‑M2/91‑14 (MQ=255) aaaaTATAAGGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTatcataacttcct > 1:3980132‑M2/1‑78 (MQ=255) aaaTATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATaggctcaaggccattaaatcataacttcctt < 1:3805586‑M1/91‑32 (MQ=255) aaaTATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTatcataacttcctt > 1:471644‑M2/1‑77 (MQ=255) atatAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTatcataacttcctttt < 1:4076692‑M2/91‑17 (MQ=255) atatAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTatcataacttcctttt > 1:3477870‑M2/1‑75 (MQ=255) tataATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTa > 1:1437161/1‑91 (MQ=255) taATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATc > 1:1866136/1‑91 (MQ=255) aaTGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCa > 1:2694342/1‑91 (MQ=255) aTGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCAt > 1:4714/1‑91 (MQ=255) tGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCAtt > 1:2486719/1‑91 (MQ=255) gTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTa < 1:4076414/91‑1 (MQ=255) gTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTa < 1:3005357/91‑1 (MQ=255) ttACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTAttgt > 1:1391917/1‑91 (MQ=255) tacATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTATtgttgtg < 1:694931/91‑1 (MQ=255) tacATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTATtgttgtg > 1:2873661/1‑91 (MQ=255) tacATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTATtgttgtg < 1:3734236/91‑1 (MQ=255) tacATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTATtgttgtg < 1:396081/91‑1 (MQ=255) acATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTATtgttgtgt > 1:1968314/1‑91 (MQ=255) cATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTATtgttgtgtt < 1:3242940/91‑1 (MQ=255) cATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTATtgttgtgtt < 1:3094002/91‑1 (MQ=255) cATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTATtgttgtgtt > 1:845895/1‑91 (MQ=255) aTAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTATtgttgtgttg > 1:158963/1‑91 (MQ=255) tAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTATTGTTGTGTTGa > 1:9666/1‑91 (MQ=255) aTGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTATTGTTGTGTTGATg > 1:1492620/1‑91 (MQ=255) tGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTATTGTTGTGTTGATGt < 1:1140709/91‑1 (MQ=255) gATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTATTGTTGTGTTGATGtt < 1:1363120/91‑1 (MQ=255) gATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTATTGTTGTGTTGATGtt > 1:1906233/1‑91 (MQ=255) atatTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTATTGTTGTGTTGATGttt < 1:4043497/91‑1 (MQ=255) tatTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTATTGTTGTGTTGATGTTTc < 1:2802869/91‑1 (MQ=255) atTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTATTGTTGTGTTGATGTTTCg > 1:2637489/1‑91 (MQ=255) atTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTATTGTTGTGTTGATGTTTCg < 1:1617938/91‑1 (MQ=255) tttCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTATTGTTGTGTTGATGTTTCGa < 1:2472000/91‑1 (MQ=255) ttCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTATTGTTGTGTTGATGTTTCGAt < 1:3579380/91‑1 (MQ=255) tAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTATTGTTGTGTTGATGTTTCGATAACGTgg < 1:1660521/91‑1 (MQ=255) tAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTATTGTTGTGTTGATGTTTCGATAACGTgg < 1:242102/91‑1 (MQ=255) tAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTATTGTTGTGTTGATGTTTCGATAACGTgg < 1:1364576/91‑1 (MQ=255) aGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTATTGTTGTGTTGATGTTTCGATAACGTGGt < 1:4110933/91‑1 (MQ=255) aGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTATTGTTGTGTTGATGTTTCGATAACGTGGt > 1:3922785/1‑91 (MQ=255) gAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTATTGTTGTGTTGATGTTTCGATAACGTGGTa < 1:2083016/91‑1 (MQ=255) gAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATCTTATTGTTGTGTTGATGTTTCGATAACGTGGTa > 1:1505825/1‑91 (MQ=255) aaaaaaGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTATTGTTGTGTTGATGTTTCGATAACGTGGTAc > 1:196943/1‑91 (MQ=255) aaaaaaGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTATTGTTGTGTTGATGTTTCGATAACGTGGTAc < 1:2166635/91‑1 (MQ=255) aaaaaaGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTATTGTTGTGTTGATGTTTCGATAACGTGGTAc > 1:2800294/1‑91 (MQ=255) aaaaaaGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTATTGTTGTGTTGATGTTTCGATAACGTGGTAc < 1:2860251/91‑1 (MQ=255) aaaaaaGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTATTGTTGTGTTGATGTTTCGATAACGTGGTAc > 1:1218434/1‑91 (MQ=255) aaaaaaGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTATTGTTGTGTTGATGTTTCGATAACGTGGTAc > 1:1098236/1‑91 (MQ=255) aaaaaGGAAGTTGTGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTATTGTTGTGTTGATGTTTCGATAACGTGGTACa > 1:3202323/1‑91 (MQ=255) aaaaGGAAGTTATGATaggctcaaggccattaaatcataacttccttttttctaatttgaaatatcattatgtagtaaatactcattatat > 1:3477870‑M1/1‑16 (MQ=255) AAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTATTGTTGTGTTGATGTTTCGATAACGTGGTACAt > 1:2945669‑M1/1‑91 (MQ=255) | TTCTAGCTTCATCAGTTATCATATATTCTTTGAAACACTTGTAAGAAAATATAATGAGTATTTACTACATAATGATATTTCAAATTAGAAAAAAGGAAGTTATGATTTAATGGCCTTGAGCCTATCATAACTTCCTTTTATCATTTTATTGTTGTGTTGATGTTTCGATAACGTGGTACAT > USA300TCH1516_ALE/2442716‑2442896 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |