New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | USA300TCH1516_ALE | 2497906 = | 132 (1.340) | 6 (0.070) | 5/138 | NT | 6.7% | intergenic (+11/+75) | USA300HOU_RS12865/treP_2 | hypothetical protein/PTS system trehalose‑specific EIIBC component |
? | USA300TCH1516_ALE | 2497975 = | 54 (0.640) | intergenic (+80/+6) | USA300HOU_RS12865/treP_2 | hypothetical protein/PTS system trehalose‑specific EIIBC component |
Only 100 of 154 total aligned reads displayed.
CTTGGATTATTGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACAACTTCT > USA300TCH1516_ALE/2497816‑2497996 | cTTGGATTATTGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTaaaa > 1:1982229/1‑91 (MQ=255) cTTGGATTATTGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTaaaa < 1:2031466/91‑1 (MQ=255) gtatgacaatatcattcatcattgctataacagttactttaattttatctaaaagaaaagcaaataaagaagttgtagaataaaaaaagag > 1:324155‑M1/90‑91 (MQ=255) tGGATTATTGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAgg > 1:2626128/1‑91 (MQ=255) ggATTATTGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGt < 1:1888891/91‑1 (MQ=255) attattGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTAt > 1:3947314/1‑91 (MQ=255) attattGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTAt > 1:3285555/1‑91 (MQ=255) tattGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAATAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGa > 1:3321971/1‑91 (MQ=255) tattGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGa > 1:871810/1‑91 (MQ=255) tattGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGa < 1:1587804/91‑1 (MQ=255) attGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGAc < 1:1039130/91‑1 (MQ=255) attGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGAc > 1:274798/1‑91 (MQ=255) attGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGAc > 1:3017394/1‑91 (MQ=255) attGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGAc > 1:3883764/1‑91 (MQ=255) ttGTGGTAGATATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGTTATGACa > 1:2084417/1‑91 (MQ=255) tgtgGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAg > 1:1019523/1‑91 (MQ=255) tgtgGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAg < 1:1162540/91‑1 (MQ=255) tatcatttatcattgctataacagttactttaattttatctaaaagaaaagcaaataaagaagttgtagaataaaaaaagAGGTATGACAg > 1:3059308‑M1/81‑91 (MQ=255) tatcattcatcattgctataacagttactttaattttatctaaaagaaaagcaaataaagaagttgtagaataaaaaaagAGGTATGACAg > 1:1962499‑M1/81‑91 (MQ=255) tatcattcatcattgctataacagttactttaattttatctaaaagaaaagcaaataaagaagttgtagaataaaaaaagAGGTATGACAg > 1:1303308‑M1/81‑91 (MQ=255) ggtaggtaTTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCtt > 1:2679706/1‑91 (MQ=255) ggtaggtaTTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCtt > 1:1572155/1‑91 (MQ=255) ggtaggtaTTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCtt > 1:3691377/1‑91 (MQ=255) gtaggtaTTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTa > 1:2737729/1‑91 (MQ=255) gtaggtaTTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTa < 1:1953955/91‑1 (MQ=255) gtaggtaTTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTa < 1:1955314/91‑1 (MQ=255) gtaggtaTTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTa < 1:1955463/91‑1 (MQ=255) tttCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTc > 1:864181/1‑91 (MQ=255) tttCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTc > 1:1192887/1‑91 (MQ=255) tttCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTc > 1:2005111/1‑91 (MQ=255) tCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCAt > 1:2566401/1‑91 (MQ=255) tCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCAt < 1:2510982/91‑1 (MQ=255) tCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCAt > 1:920277/1‑91 (MQ=255) aTTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATcc > 1:2813852/1‑91 (MQ=255) aTTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATcc < 1:3471756/91‑1 (MQ=255) aTTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATcc < 1:3471792/91‑1 (MQ=255) aTTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATcc > 1:3770052/1‑91 (MQ=255) ttAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCt > 1:2000652/1‑91 (MQ=255) ttAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCt < 1:2117444/91‑1 (MQ=255) tAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTa > 1:3943263/1‑91 (MQ=255) aaTTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCGTCCTAt < 1:3232179/91‑1 (MQ=255) aaTTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTAt < 1:1489156/91‑1 (MQ=255) aTTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTAtt < 1:150004/91‑1 (MQ=255) ttCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTg < 1:2822367/91‑1 (MQ=255) ttCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTg < 1:2822607/91‑1 (MQ=255) ttCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTg < 1:1551923/91‑1 (MQ=255) tGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCAtt < 1:3784575/91‑1 (MQ=255) tGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCAtt > 1:4146106/1‑91 (MQ=255) tGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCAtt < 1:3341712/91‑1 (MQ=255) tGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCAtt < 1:3341726/91‑1 (MQ=255) gTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCaaat < 1:2354184/91‑4 (MQ=255) gTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCaaat < 1:606333/91‑4 (MQ=255) gTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCAttt > 1:2094134/1‑91 (MQ=255) tCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTg > 1:2555784/1‑91 (MQ=255) tCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTg > 1:1818456/1‑91 (MQ=255) gTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCa > 1:2117956/1‑91 (MQ=255) ttGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGa < 1:3826524/91‑1 (MQ=255) tGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGAc < 1:477367/91‑1 (MQ=255) gTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAACTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACt > 1:1998705/1‑91 (MQ=255) ttAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTg > 1:3008985/1‑91 (MQ=255) ttAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTg < 1:1953589/91‑1 (MQ=255) tAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGa < 1:4050900/91‑1 (MQ=255) aGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGAt > 1:3563659/1‑91 (MQ=255) aGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGAt > 1:2895001/1‑91 (MQ=255) gTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATa > 1:1305337/1‑91 (MQ=255) aTTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACt < 1:1415760/91‑1 (MQ=255) ttCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTg > 1:2702164/1‑91 (MQ=255) cTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGAt > 1:2874890/1‑91 (MQ=255) cTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGAt > 1:1840700/1‑91 (MQ=255) ttATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGAtt > 1:1865418/1‑91 (MQ=255) tATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTa < 1:1690903/91‑1 (MQ=255) gcaaataaagaagttgtagaataaaaaaagAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTg > 1:1049047‑M1/31‑91 (MQ=255) gCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGt < 1:1519200/91‑1 (MQ=255) gCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGt > 1:2356497/1‑91 (MQ=255) gCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGt < 1:2359192/91‑1 (MQ=255) gCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGt > 1:2664436/1‑91 (MQ=255) gTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCa < 1:1538016/91‑1 (MQ=255) gTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCa > 1:1654996/1‑91 (MQ=255) gTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCa < 1:3357978/91‑1 (MQ=255) gTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCa < 1:1537998/91‑1 (MQ=255) tAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCAt > 1:729649/1‑91 (MQ=255) aaaCAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATa < 1:1790086/91‑1 (MQ=255) aaaCAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATa > 1:1236817/1‑91 (MQ=255) aaagaagttgtagaataaaaaaagAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATAc > 1:1965371‑M1/25‑91 (MQ=255) aCAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATAcc < 1:3435872/91‑1 (MQ=255) aCAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATAcc < 1:4020921/91‑1 (MQ=255) gaagttgtagaataaaaaaagAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACctc > 1:2423447‑M1/22‑91 (MQ=255) gaagttgtagaataaaaaaagAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACctc > 1:2423611‑M1/22‑91 (MQ=255) aGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATAccgc < 1:2538770/91‑3 (MQ=255) aGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACctc < 1:2538698/91‑1 (MQ=255) agttgtagaataaaaaaagAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCtt > 1:1852115‑M1/20‑91 (MQ=255) aaaTTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCtt < 1:2373942/91‑1 (MQ=255) ttATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCttttt < 1:1328881/91‑1 (MQ=255) tataACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCtttttt > 1:2594319/1‑91 (MQ=255) ataACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCttttttt > 1:3581646/1‑91 (MQ=255) ataACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCttttttt < 1:1141360/91‑1 (MQ=255) aaCTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTAt > 1:1232311/1‑91 (MQ=255) aCTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTAtt > 1:2610529/1‑91 (MQ=255) cTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTc < 1:3006889/91‑1 (MQ=255) aaGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACAGcttc < 1:3275038/91‑1 (MQ=255) | CTTGGATTATTGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACAACTTCT > USA300TCH1516_ALE/2497816‑2497996 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |