| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | USA300TCH1516_ALE | = 2588442 | 128 (1.300) | 13 (0.150) | 7/142 | NT | 11.2% | intergenic (+25/+143) | yehR/gltB_2 | putative lipoprotein YehR/Glutamate synthase [NADPH] large chain |
| ? | USA300TCH1516_ALE | = 2588473 | 92 (1.050) | intergenic (+56/+112) | yehR/gltB_2 | putative lipoprotein YehR/Glutamate synthase [NADPH] large chain | |||||
Only 100 of 204 total aligned reads displayed.
GAAAAACTTGAAAAGCAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAAT > USA300TCH1516_ALE/2588352‑2588532 | gAAAAACTTGAAAAGCAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGA > 1:2677156‑M1/1‑91 (MQ=255) aaCTTGAAAAGCAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAg < 1:1359643/91‑1 (MQ=255) ttGAAAAGCAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACt < 1:3005878/91‑1 (MQ=255) ttGAAAAGCAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACt < 1:3570983/91‑1 (MQ=255) ttGAAAAGCAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACt < 1:3569335/91‑1 (MQ=255) ttGAAAAGCAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACt > 1:3104656/1‑91 (MQ=255) tGAAAAGCAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTa < 1:868554/91‑1 (MQ=255) tGAAAAGCAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTa > 1:1386303/1‑91 (MQ=255) gAAAAGCAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTaa < 1:1367302/91‑1 (MQ=255) gAAAAGCAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTaa < 1:2942219/91‑1 (MQ=255) aaaaGCAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAg > 1:631494/1‑91 (MQ=255) aaaGCAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAgg > 1:2863473/1‑91 (MQ=255) aaaGCAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAgg > 1:680400/1‑91 (MQ=255) aaGCAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGt < 1:2296046/91‑1 (MQ=255) aaGCAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGt > 1:2182580/1‑91 (MQ=255) aGCAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGtt < 1:142440/91‑1 (MQ=255) aGCAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGtt < 1:1738778/91‑1 (MQ=255) aaTTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGtttgt < 1:2224061/91‑4 (MQ=255) aaTTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACa < 1:111648/91‑1 (MQ=255) aaTTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACa < 1:816881/91‑1 (MQ=255) aTTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGtttgta < 1:850416/91‑5 (MQ=255) aTTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGtttgta < 1:3327266/91‑5 (MQ=255) aaaGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAAcc < 1:242019/91‑1 (MQ=255) aaaGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAAcc > 1:3455858/1‑91 (MQ=255) gCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTa > 1:1128226/1‑91 (MQ=255) gCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTa > 1:3830140/1‑91 (MQ=255) acaGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAAt > 1:3898556/1‑91 (MQ=255) acaGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGCTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAAt > 1:3588254/1‑91 (MQ=255) agagGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTc > 1:3836598/1‑91 (MQ=255) agagGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTc < 1:1105344/91‑1 (MQ=255) gagGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACGTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCa > 1:3294447/1‑91 (MQ=255) agGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGAatatgaattaaggtttgtaaccttagtct < 1:1882390‑M1/91‑30 (MQ=255) agGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGAatatgaattaaggtttgtaaccttagtct < 1:509461‑M1/91‑30 (MQ=255) agGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGAatatgaattaaggtttgtaaccttagtct < 1:510565‑M1/91‑30 (MQ=255) agGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCat < 1:3311876/91‑1 (MQ=255) ggTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCata < 1:1874046/91‑1 (MQ=255) gTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGAatatgaattaaggtttgtaaccttagtctta < 1:1811087‑M1/91‑32 (MQ=255) gTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCatat > 1:2565522/1‑91 (MQ=255) tttAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATNACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATt > 1:3264217‑M2/1‑90 (MQ=255) tAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATtct < 1:249389‑M2/91‑4 (MQ=255) tAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATACTTTATAACTTAAGAATGCCCTGAGAGAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATtct > 1:3315756‑M2/1‑88 (MQ=255) aaaagaaaaagaTAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATtctg < 1:3017010‑M2/91‑5 (MQ=255) aaagaaaaagaTAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGAatatgaattaaggtttgtaaccttagtcttatctga < 1:4118766‑M1/91‑37 (MQ=255) aaagaaaaagaTAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATtctga < 1:470164‑M2/91‑6 (MQ=255) aaagaaaaagaTAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATgctga < 1:3461269‑M2/91‑6 (MQ=255) aagaaaaagaTAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGtaagactaaggtttgtaaccttagtcttatctgaggg < 1:1925186‑M1/91‑38 (MQ=255) agaaaaagaTAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGAatatgaattaaggtttgtaaccttagtcttatctgagg < 1:2133171‑M1/91‑39 (MQ=255) agaaaaagaTAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATtctgagg > 1:1212484‑M2/1‑84 (MQ=255) aaaaagaTAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATtctgagggc > 1:1478138‑M2/1‑82 (MQ=255) aaaagaTAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCt < 1:619053/91‑1 (MQ=255) aaaagaTAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCt > 1:879304/1‑91 (MQ=255) aaagaTAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCtt > 1:355016/1‑91 (MQ=255) aaagaTAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCtt < 1:556510/91‑1 (MQ=255) aTAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAat > 1:3044160/1‑91 (MQ=255) aTAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAat > 1:159922/1‑91 (MQ=255) aaaTGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATAtt < 1:2802988/91‑1 (MQ=255) tGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGa < 1:1776838/91‑1 (MQ=255) tGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGa < 1:2918739/91‑1 (MQ=255) acgacAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGt < 1:4059271/91‑1 (MQ=255) acgacAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGt > 1:2138395/1‑91 (MQ=255) cgacAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGtt < 1:3647525/91‑1 (MQ=255) cgacAAATAGTTTATAACTTAAAAACGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGtt < 1:3866829/91‑1 (MQ=255) gacAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTc < 1:2715566/91‑1 (MQ=255) cAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCtt > 1:1227207/1‑91 (MQ=255) cAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCtt < 1:2097094/91‑1 (MQ=255) aaaTAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTtg > 1:316548/1‑91 (MQ=255) aaaTAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTtg > 1:3510265/1‑91 (MQ=255) aaTAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTtgt < 1:1301189/91‑1 (MQ=255) aGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTtgtgtg > 1:3370519/1‑91 (MQ=255) tttATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGAc < 1:2893300/91‑1 (MQ=255) ttATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGAcc < 1:1200821/91‑1 (MQ=255) taACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTGATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGc < 1:4145452/91‑1 (MQ=255) aaCTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCa < 1:3755385/91‑1 (MQ=255) aaCTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCa < 1:2741195/91‑1 (MQ=255) aaCTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCa > 1:755351/1‑91 (MQ=255) aaCTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCa < 1:1008731/91‑1 (MQ=255) aaCTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCa > 1:2062947/1‑91 (MQ=255) cTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATc < 1:598482/91‑1 (MQ=255) ttAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATcc < 1:1849005/91‑1 (MQ=255) aaaaaTGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCac < 1:1079760/91‑1 (MQ=255) gCCCTCAGAatatgaattaaggtttgtaaccttagtcttatctgggggcatttttaagttataaactatttgtcgtccattttatcttttt < 1:3293132‑M1/91‑83 (MQ=255) gCCCTCAGAatatgaattaaggtttgtaaccttagtcttatctgggggcatttttaagttataaactatttgtcgtccattttatcttttt < 1:3293023‑M1/91‑83 (MQ=255) gCCCTCAGAatatgaattaaggtttgtaaccttagtcttatctgggggcatttttaagttataaactatttgtcgtccattttatcttttt < 1:3293351‑M1/91‑83 (MQ=255) gCCCTCAGAatatgaattaaggtttgtaaccttagtcttatctgggggcatttttaagttataaactatttgtcgtccattttatcttttt < 1:3293144‑M1/91‑83 (MQ=255) gCCCTCAGAatatgaattaaggtttgtaaccttagtcttatctgagggcatttttaagttataaactatttgtcgtccattttatcttttt < 1:291653‑M1/91‑83 (MQ=255) gCCCTCAGAatatgaattaaggtttgtaaccttagtcttatctgagggcatttttaagttataaactatttgtcgtccattttatcttttt > 1:748570‑M1/1‑9 (MQ=255) gCCCTCAGAatatgaattaaggtttgtaaccttagtcttatctgagggcatttttaagttataaactatttgtcgtccattttatcttttt > 1:748251‑M1/1‑9 (MQ=255) gCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATtctgagggcatttttaagttataaactatttgtcgtccattttatcttttt < 1:3060518‑M2/91‑52 (MQ=255) cccTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATtctgagggcatttttaagttataaactatttgtcgtccattttatctttttc < 1:1169087‑M2/91‑53 (MQ=255) cccTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATtctgagggcatttttaagttataaactatttgtcgtccattttatctttttc < 1:245518‑M2/91‑53 (MQ=255) cccTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATtctgagggcatttttaagttataaacaatttgtcgtccattttatctttttc < 1:1169773‑M2/91‑53 (MQ=255) ccTCAGAatatgaattaaggtttgtaaccttagtcttatctgagggcatttttaagttataaactatttgtcgtccattttatctttttct > 1:878656‑M1/1‑7 (MQ=255) tCAGAatatgaattaaggtttgtaaccttagtcttatctgagggcatttttaagttataaactatttgtcgtccattttatctttttcttt > 1:2998935‑M1/1‑5 (MQ=255) cAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATtctgagggcatttttaagttataaactatttgtcgtccattttatctttttctttt < 1:1599610‑M2/91‑57 (MQ=255) cAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATaa < 1:2950671/91‑1 (MQ=255) cAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATaa < 1:2581406/91‑1 (MQ=255) cAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATaa < 1:3955297/91‑1 (MQ=255) aGAatatgaattaaggtttgtaaccttagtcttatctgagggcatttttaagttataaactatttgtcgtccattttatctttttctttta > 1:3935098‑M1/1‑3 (MQ=255) aGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATaaa < 1:3670521/91‑1 (MQ=255) gATGAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATaaaa < 1:3217007/91‑1 (MQ=255) | GAAAAACTTGAAAAGCAATTAAAGCACAGAGGTTTAAAAGAAAAAGATAAAATGGACGACAAATAGTTTATAACTTAAAAATGCCCTCAGATAAGACTAAGGTTACAAACCTTAATTCATATTCTGAGGGCTTTAATATTTGAAGTTCTTGTGTGACCAGCATCCACTACTAATATAAAAT > USA300TCH1516_ALE/2588352‑2588532 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |